Project measure / variable:   CSNA01   VR2rateD3

ID, description, units MPD:60218   VR2rateD3   variable ratio 2 (VR2), lever press rate, 8 h test   [n]  day 3  
sucrose study
Data set, strains CSNA01   HMDP   91 strains     sex: m     age: 7-22wks
Procedure operant conditioning chamber
Ontology mappings

  •   Or, add this measure to your collection.
       
  •     no folder
  •     put it in new folder  

  STRAIN COMPARISON PLOT
Dimensions Width:   px    Height:   px
Download Plot   
Visualization Options

CSNA01 - variable ratio 2 (VR2), lever press rate, 8 h test day 3



  MEASURE SUMMARY
Measure Summary Male
Number of strains tested91 strains
Mean of the strain means0.0665   n
Median of the strain means0.0488   n
SD of the strain means± 0.0644
Coefficient of variation (CV)0.968
Min–max range of strain means0   –   0.265   n
Mean sample size per strain3.5   mice


  ANOVA, Q-Q NORMALITY ASSESSMENT
ANOVA summary      
FactorDFSum of squaresMean sum of squaresF valuep value (Pr>F)
strain 86 1.2097 0.0141 3.3886 < 0.0001
Residuals 230 0.9547 0.0042


Q-Q normality assessment based on residuals

  


  STRAIN MEANS (UNADJUSTED)
  
Select table page:
Strain Sex Mean SD N mice SEM CV Min, Max Z score
129S1/SvImJ m 0.0 0.0   2   0.0 0.0 -1.03
129X1/SvJ m 0.0 0.0   5 0.0 0.0 -1.03
A/J m 0.0918 0.0455   5 0.0203 0.496 0.0237, 0.138 0.39
AKR/J m 0.00743 0.00407   2   0.00287 0.548 0.00455, 0.0103 -0.92
AXB15/PgnJ m 0.0 0.0   2   0.0 0.0 -1.03
AXB19a/PgnJ m 0.0 0.0   2   0.0 0.0 -1.03
AXB1/PgnJ m 0.0475 0.0647   3 0.0373 1.36 0.00599, 0.122 -0.3
AXB23/PgnJ m 0.0 0.0   2   0.0 0.0 -1.03
AXB6/PgnJ m 0.006 0.0   1   0.0 0.0 0.006, 0.006 -0.94
AXB8/PgnJ m 0.00657 0.0114   3 0.00657 1.73 -0.93
BALB/cByJ m 0.205 0.0778   6 0.0318 0.38 0.138, 0.339 2.15
BALB/cJ m 0.21 0.0959   7 0.0362 0.457 0.0682, 0.331 2.23
BPL/1J m 0.0431 0.0343   5 0.0154 0.796 -0.36
BTBR T+ Itpr3tf/J m 0.0323 0.0645   4 0.0323 2.0 -0.53
BUB/BnJ m 0.129 0.00141   2   0.001 0.011 0.128, 0.13 0.97
BXA13/PgnJ m 0.248 0.0827   2   0.0585 0.333 0.19, 0.307 2.82
BXA14/PgnJ m 0.013 0.0126   5 0.00564 0.971 -0.83
BXA16/PgnJ m 0.0114 0.0227   4 0.0114 2.0 -0.86
BXA25/PgnJ m 0.0 0.0   4 0.0 0.0 -1.03
BXA4/PgnJ m 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -1.03
BXA7/PgnJ m 0.132 0.0442   3 0.0255 0.335 0.0975, 0.182 1.02
BXD100/RwwJ m 0.0166 0.0231   3 0.0133 1.39 -0.78
BXD1/TyJ m 0.013 0.0226   3 0.013 1.73 -0.83
BXD24/TyJ m 0.0178 0.0142   4 0.00709 0.799 0.00631, 0.0379 -0.76
BXD29/Ty m 0.0422 0.0736   4 0.0368 1.74 -0.38
BXD31/TyJ m 0.0644 0.0925   6 0.0378 1.44 -0.03
BXD32/TyJ m 0.0575 0.0813   2   0.0575 1.41 -0.14
BXD39/TyJ m 0.0 0.0   5 0.0 0.0 -1.03
BXD40/TyJ m 0.0711 0.0481   4 0.024 0.676 0.07
BXD42/TyJ m 0.0824 0.0716   11 0.0216 0.869 0.25
BXD48a/RwwJ m 0.102 0.024   2   0.0169 0.235 0.0851, 0.119 0.55
BXD48/RwwJ m 0.0646 0.0898   5 0.0401 1.39 -0.03
BXD51/RwwJ m 0.159 0.0495   3 0.0286 0.311 0.109, 0.208 1.44
BXD60/RwwJ m 0.0311 0.0304   7 0.0115 0.977 -0.55
BXD62/RwwJ m 0.0357 0.0204   3 0.0118 0.572 0.013, 0.0526 -0.48
BXD65/RwwJ m 0.0531 0.0749   6 0.0306 1.41 -0.21
BXD66/RwwJ m 0.0193 0.0335   3 0.0193 1.73 -0.73
BXD68/RwwJ m 0.0278 0.0622   5 0.0278 2.24 -0.6
BXD75/RwwJ m 0.0687 0.0775   6 0.0316 1.13 0.03
BXD77/RwwJ m 0.0116 0.0201   3 0.0116 1.73 -0.85
BXD84/RwwJ m 0.0488 0.0606   4 0.0303 1.24 -0.28
BXD90/RwwJ m 0.0246 0.0349   2   0.0246 1.41 -0.65
BXD95/RwwJ m 0.0815 0.115   2   0.0815 1.41 0.23
BXD9/TyJ m 0.0657 0.0259   5 0.0116 0.394 0.04, 0.0995 -0.01
BXH19/TyJ m 0.0123 0.0175   2   0.0123 1.41 -0.84
BXH22/KccJ m 0.00266 0.00753   8 0.00266 2.83 -0.99
BXH4/TyJ m 0.0 0.0   3 0.0 0.0 -1.03
BXH6/TyJ m 0.115 0.0678   3 0.0391 0.587 0.0374, 0.159 0.75
BXH8/TyJ m 0.0615 0.087   2   0.0615 1.41 -0.08
BXH9/TyJ m 0.0626 0.0579   4 0.029 0.926 0.0214, 0.146 -0.06
C3HeB/FeJ m 0.0464 0.0657   2   0.0464 1.41 -0.31
C3H/HeJ m 0.0529 0.0657   5 0.0294 1.24 -0.21
C57BL/10J m 0.151 0.0375   2   0.0265 0.247 0.125, 0.178 1.31
C57BL/6J m 0.0407 0.0553   9 0.0184 1.36 -0.4
C57BLKS/J m 0.0387 0.0332   2   0.0234 0.858 0.0152, 0.0621 -0.43
C57BR/cdJ m 0.212 0.0512   3 0.0296 0.241 0.157, 0.258 2.26
C57L/J m 0.118 0.0383   2   0.0271 0.325 0.0908, 0.145 0.8
C58/J m 0.0688 0.0679   4 0.0339 0.986 0.00466, 0.128 0.04
CAST/EiJ m 0.0136 0.00974   3 0.00563 0.715 0.00692, 0.0248 -0.82
CBA/J m 0.0596 0.069   7 0.0261 1.16 -0.11
CE/J m 0.113 0.0853   2   0.0603 0.758 0.0523, 0.173 0.72
CXB11/HiAJ m 0.0934 0.037   4 0.0185 0.396 0.0521, 0.142 0.42
CXB1/ByJ m 0.0238 0.0488   6 0.0199 2.05 -0.66
CXB8/HiAJ m 0.132 0.0276   2   0.0195 0.21 0.112, 0.151 1.02
CXB9/HiAJ m 0.209 0.0304   2   0.0215 0.146 0.187, 0.23 2.21
DBA/1J m 0.0 0.0   2   0.0 0.0 -1.03
DBA/2J m 0.0563 0.05   5 0.0223 0.887 -0.16
DDY/JclSidSeyFrkJ m 0.129 0.155   2   0.109 1.2 0.0191, 0.238 0.97
FVB/NJ m 0.187 0.181   6 0.0739 0.969 1.87
I/LnJ m 0.184 0.109   5 0.0486 0.59 1.83
ILS/IbgTejJ m 0.0708 0.0349   4 0.0174 0.493 0.0401, 0.102 0.07
KK/HlJ m 0.123 0.0705   2   0.0498 0.572 0.0733, 0.173 0.88
LG/J m 0.0948 0.103   4 0.0513 1.08 0.00776, 0.212 0.44
LP/J m 0.0296 0.0297   3 0.0171 1.0 -0.57
MA/MyJ m 0.0294 0.0509   3 0.0294 1.73 -0.58
MOLF/EiJ m 0.0118 0.0168   2   0.0118 1.41 -0.85
MRL/MpJ m 0.265 0.0537   2   0.038 0.203 0.227, 0.303 3.08
NOD/ShiLtJ m 0.173 0.115   5 0.0514 0.664 0.0393, 0.336 1.65
NON/ShiLtJ m 0.145 0.0311   2   0.022 0.215 0.123, 0.167 1.22
NOR/LtJ m 0.143 0.00283   2   0.002 0.0198 0.141, 0.145 1.19
NZB/BlNJ m 0.0978 0.118   2   0.0832 1.2 0.0146, 0.181 0.49
NZW/LacJ m 0.0674 0.0814   2   0.0576 1.21 0.00988, 0.125 0.01
P/J m 0.0143 0.00764   2   0.0054 0.534 0.0089, 0.0197 -0.81
PL/J m 0.0066 0.00933   2   0.0066 1.41 -0.93
PWD/PhJ m 0.0243 0.0   1   0.0 0.0 0.0243, 0.0243 -0.66
RIIIS/J m 0.042 0.0305   5 0.0136 0.725 0.0095, 0.0769 -0.38
SEA/GnJ m 0.0482 0.0139   2   0.0098 0.288 0.0384, 0.058 -0.28
SJL/J m 0.0812 0.0739   5 0.0331 0.91 0.23
SM/J m 0.062 0.0234   3 0.0135 0.377 0.0438, 0.0884 -0.07
SWR/J m 0.0 0.0   2   0.0 0.0 -1.03
ZALENDE/EiJ m 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -1.03


  LEAST SQUARES MEANS (MODEL-ADJUSTED)
Strain Sex Mean SEM UpperCL LowerCL
129S1/SvImJ m 0.0 0.0456 0.0898 -0.0898
129X1/SvJ m 0.0 0.0288 0.0568 -0.0568
A/J m 0.0918 0.0288 0.1485 0.035
AKR/J m 0.0074 0.0456 0.0972 -0.0823
AXB15/PgnJ m 0.0 0.0456 0.0898 -0.0898
AXB19a/PgnJ m 0.0 0.0456 0.0898 -0.0898
AXB1/PgnJ m 0.0475 0.0372 0.1208 -0.0258
AXB23/PgnJ m 0.0 0.0456 0.0898 -0.0898
AXB8/PgnJ m 0.0066 0.0372 0.0799 -0.0667
BALB/cByJ m 0.2047 0.0263 0.2565 0.1528
BALB/cJ m 0.21 0.0244 0.258 0.162
BPL/1J m 0.0431 0.0288 0.0999 -0.0137
BTBR T+ Itpr3tf/J m 0.0322 0.0322 0.0957 -0.0312
BUB/BnJ m 0.129 0.0456 0.2188 0.0392
BXA13/PgnJ m 0.2485 0.0456 0.3383 0.1587
BXA14/PgnJ m 0.013 0.0288 0.0698 -0.0438
BXA16/PgnJ m 0.0114 0.0322 0.0748 -0.0521
BXA25/PgnJ m 0.0 0.0322 0.0635 -0.0635
BXA7/PgnJ m 0.1322 0.0372 0.2055 0.0589
BXD100/RwwJ m 0.0166 0.0372 0.0899 -0.0567
BXD1/TyJ m 0.013 0.0372 0.0863 -0.0603
BXD24/TyJ m 0.0178 0.0322 0.0812 -0.0457
BXD29/Ty m 0.0422 0.0322 0.1057 -0.0213
BXD31/TyJ m 0.0644 0.0263 0.1162 0.0126
BXD32/TyJ m 0.0575 0.0456 0.1473 -0.0323
BXD39/TyJ m 0.0 0.0288 0.0568 -0.0568
BXD40/TyJ m 0.0711 0.0322 0.1346 0.0077
BXD42/TyJ m 0.0824 0.0194 0.1207 0.0441
BXD48a/RwwJ m 0.1021 0.0456 0.1918 0.0123
BXD48/RwwJ m 0.0646 0.0288 0.1214 0.0078
BXD51/RwwJ m 0.159 0.0372 0.2323 0.0857
BXD60/RwwJ m 0.0311 0.0244 0.0791 -0.0169
BXD62/RwwJ m 0.0357 0.0372 0.109 -0.0376
BXD65/RwwJ m 0.0531 0.0263 0.1049 0.0013
BXD66/RwwJ m 0.0193 0.0372 0.0926 -0.054
BXD68/RwwJ m 0.0278 0.0288 0.0846 -0.029
BXD75/RwwJ m 0.0687 0.0263 0.1205 0.0169
BXD77/RwwJ m 0.0116 0.0372 0.0849 -0.0617
BXD84/RwwJ m 0.0488 0.0322 0.1123 -0.0147
BXD90/RwwJ m 0.0246 0.0456 0.1144 -0.0651
BXD95/RwwJ m 0.0815 0.0456 0.1713 -0.0083
BXD9/TyJ m 0.0657 0.0288 0.1225 0.0089
BXH19/TyJ m 0.0124 0.0456 0.1021 -0.0774
BXH22/KccJ m 0.0027 0.0228 0.0475 -0.0422
BXH4/TyJ m 0.0 0.0372 0.0733 -0.0733
BXH6/TyJ m 0.1155 0.0372 0.1888 0.0422
BXH8/TyJ m 0.0615 0.0456 0.1513 -0.0283
BXH9/TyJ m 0.0626 0.0322 0.126 -0.0009
C3HeB/FeJ m 0.0465 0.0456 0.1362 -0.0433
C3H/HeJ m 0.0529 0.0288 0.1097 -0.0039
C57BL/10J m 0.1515 0.0456 0.2413 0.0617
C57BL/6J m 0.0407 0.0215 0.083 -0.0016
C57BLKS/J m 0.0387 0.0456 0.1284 -0.0511
C57BR/cdJ m 0.2123 0.0372 0.2856 0.139
C57L/J m 0.1179 0.0456 0.2077 0.0281
C58/J m 0.0688 0.0322 0.1323 0.0054
CAST/EiJ m 0.0136 0.0372 0.0869 -0.0597
CBA/J m 0.0596 0.0244 0.1076 0.0116
CE/J m 0.1126 0.0456 0.2024 0.0229
CXB11/HiAJ m 0.0934 0.0322 0.1568 0.0299
CXB1/ByJ m 0.0238 0.0263 0.0757 -0.028
CXB8/HiAJ m 0.1315 0.0456 0.2213 0.0417
CXB9/HiAJ m 0.2085 0.0456 0.2983 0.1187
DBA/1J m 0.0 0.0456 0.0898 -0.0898
DBA/2J m 0.0563 0.0288 0.1131 -0.0005
DDY/JclSidSeyFrkJ m 0.1285 0.0456 0.2183 0.0388
FVB/NJ m 0.1868 0.0263 0.2386 0.1349
I/LnJ m 0.1842 0.0288 0.241 0.1274
ILS/IbgTejJ m 0.0708 0.0322 0.1343 0.0073
KK/HlJ m 0.1231 0.0456 0.2129 0.0334
LG/J m 0.0948 0.0322 0.1583 0.0313
LP/J m 0.0296 0.0372 0.1029 -0.0437
MA/MyJ m 0.0294 0.0372 0.1027 -0.0439
MOLF/EiJ m 0.0118 0.0456 0.1016 -0.0779
MRL/MpJ m 0.265 0.0456 0.3548 0.1752
NOD/ShiLtJ m 0.1729 0.0288 0.2296 0.1161
NON/ShiLtJ m 0.145 0.0456 0.2348 0.0552
NOR/LtJ m 0.143 0.0456 0.2328 0.0532
NZB/BlNJ m 0.0978 0.0456 0.1876 0.008
NZW/LacJ m 0.0674 0.0456 0.1572 -0.0223
P/J m 0.0143 0.0456 0.1041 -0.0755
PL/J m 0.0066 0.0456 0.0964 -0.0832
RIIIS/J m 0.042 0.0288 0.0988 -0.0148
SEA/GnJ m 0.0482 0.0456 0.138 -0.0416
SJL/J m 0.0812 0.0288 0.138 0.0244
SM/J m 0.062 0.0372 0.1353 -0.0113
SWR/J m 0.0 0.0456 0.0898 -0.0898




  GWAS USING LINEAR MIXED MODELS