Project measure / variable:   CSNA01   VR2rateD2

ID, description, units MPD:60217   VR2rateD2   variable ratio 2 (VR2), lever press rate, 8 h test   [n]  day 2  
sucrose study
Data set, strains CSNA01   HMDP   91 strains     sex: m     age: 7-22wks
Procedure operant conditioning chamber
Ontology mappings

  •   Or, add this measure to your collection.
       
  •     no folder
  •     put it in new folder  

  STRAIN COMPARISON PLOT
Dimensions Width:   px    Height:   px
Download Plot   
Visualization Options

CSNA01 - variable ratio 2 (VR2), lever press rate, 8 h test day 2



  MEASURE SUMMARY
Measure Summary Male
Number of strains tested91 strains
Mean of the strain means0.0566   n
Median of the strain means0.0383   n
SD of the strain means± 0.0597
Coefficient of variation (CV)1.05
Min–max range of strain means0   –   0.262   n
Mean sample size per strain3.5   mice


  ANOVA, Q-Q NORMALITY ASSESSMENT
ANOVA summary      
FactorDFSum of squaresMean sum of squaresF valuep value (Pr>F)
strain 86 1.0484 0.0122 3.7373 < 0.0001
Residuals 230 0.7502 0.0033


Q-Q normality assessment based on residuals

  


  STRAIN MEANS (UNADJUSTED)
  
Select table page:
Strain Sex Mean SD N mice SEM CV Min, Max Z score
129S1/SvImJ m 0.0 0.0   2   0.0 0.0 -0.95
129X1/SvJ m 0.0 0.0   5 0.0 0.0 -0.95
A/J m 0.0584 0.0665   5 0.0297 1.14 0.00684, 0.158 0.03
AKR/J m 0.0197 0.00962   2   0.0068 0.488 0.0129, 0.0265 -0.62
AXB15/PgnJ m 0.0 0.0   2   0.0 0.0 -0.95
AXB19a/PgnJ m 0.0 0.0   2   0.0 0.0 -0.95
AXB1/PgnJ m 0.0214 0.0193   3 0.0111 0.901 0.00681, 0.0432 -0.59
AXB23/PgnJ m 0.0 0.0   2   0.0 0.0 -0.95
AXB6/PgnJ m 0.101 0.0   1   0.0 0.0 0.101, 0.101 0.74
AXB8/PgnJ m 0.0056 0.0097   3 0.0056 1.73 -0.86
BALB/cByJ m 0.128 0.0518   6 0.0211 0.404 0.0333, 0.169 1.2
BALB/cJ m 0.185 0.0982   7 0.0371 0.53 2.15
BPL/1J m 0.0605 0.0437   5 0.0195 0.722 0.06
BTBR T+ Itpr3tf/J m 0.0169 0.0338   4 0.0169 2.0 -0.67
BUB/BnJ m 0.102 0.0117   2   0.00825 0.115 0.0935, 0.11 0.76
BXA13/PgnJ m 0.262 0.0601   2   0.0425 0.23 0.219, 0.304 3.44
BXA14/PgnJ m 0.0025 0.00559   5 0.0025 2.24 -0.91
BXA16/PgnJ m 0.0 0.0   4 0.0 0.0 -0.95
BXA25/PgnJ m 0.0 0.0   4 0.0 0.0 -0.95
BXA4/PgnJ m 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.95
BXA7/PgnJ m 0.125 0.0147   3 0.0085 0.118 0.112, 0.141 1.15
BXD100/RwwJ m 0.0245 0.0365   3 0.0211 1.49 -0.54
BXD1/TyJ m 0.00593 0.0103   3 0.00593 1.73 -0.85
BXD24/TyJ m 0.0257 0.0258   4 0.0129 1.0 -0.52
BXD29/Ty m 0.0 0.0   4 0.0 0.0 -0.95
BXD31/TyJ m 0.049 0.0771   6 0.0315 1.57 -0.13
BXD32/TyJ m 0.0535 0.0757   2   0.0535 1.41 -0.05
BXD39/TyJ m 0.0 0.0   5 0.0 0.0 -0.95
BXD40/TyJ m 0.0527 0.048   4 0.024 0.911 -0.07
BXD42/TyJ m 0.0851 0.074   11 0.0223 0.87 0.48
BXD48a/RwwJ m 0.0789 0.0223   2   0.0158 0.283 0.0631, 0.0947 0.37
BXD48/RwwJ m 0.0229 0.0318   5 0.0142 1.39 -0.57
BXD51/RwwJ m 0.0868 0.0698   3 0.0403 0.804 0.0139, 0.153 0.51
BXD60/RwwJ m 0.0185 0.0267   7 0.0101 1.45 -0.64
BXD62/RwwJ m 0.0193 0.0177   3 0.0102 0.916 -0.63
BXD65/RwwJ m 0.0469 0.0585   6 0.0239 1.25 -0.16
BXD66/RwwJ m 0.0081 0.014   3 0.0081 1.73 -0.81
BXD68/RwwJ m 0.0336 0.0751   5 0.0336 2.24 -0.39
BXD75/RwwJ m 0.0822 0.0582   6 0.0238 0.708 0.43
BXD77/RwwJ m 0.00793 0.0137   3 0.00793 1.73 -0.82
BXD84/RwwJ m 0.0227 0.0454   4 0.0227 2.0 -0.57
BXD90/RwwJ m 0.0365 0.0515   2   0.0365 1.41 -0.34
BXD95/RwwJ m 0.0462 0.0654   2   0.0462 1.41 -0.17
BXD9/TyJ m 0.0688 0.0273   5 0.0122 0.397 0.0378, 0.102 0.2
BXH19/TyJ m 0.0115 0.0163   2   0.0115 1.41 -0.76
BXH22/KccJ m 0.000584 0.00165   8 0.000584 2.83 -0.94
BXH4/TyJ m 0.0 0.0   3 0.0 0.0 -0.95
BXH6/TyJ m 0.119 0.116   3 0.0671 0.973 1.05
BXH8/TyJ m 0.0421 0.0595   2   0.0421 1.41 -0.24
BXH9/TyJ m 0.0406 0.017   4 0.0085 0.419 0.0272, 0.064 -0.27
C3HeB/FeJ m 0.0423 0.0599   2   0.0423 1.41 -0.24
C3H/HeJ m 0.0184 0.0412   5 0.0184 2.24 -0.64
C57BL/10J m 0.117 0.0113   2   0.008 0.0967 0.109, 0.125 1.01
C57BL/6J m 0.0236 0.0472   9 0.0157 2.0 -0.55
C57BLKS/J m 0.0603 0.052   2   0.0368 0.863 0.0235, 0.0971 0.06
C57BR/cdJ m 0.125 0.0922   3 0.0532 0.736 0.0195, 0.189 1.15
C57L/J m 0.0898 0.02   2   0.0141 0.223 0.0757, 0.104 0.56
C58/J m 0.0844 0.102   4 0.0509 1.21 0.47
CAST/EiJ m 0.011 0.00391   3 0.00226 0.356 0.00684, 0.0146 -0.76
CBA/J m 0.0357 0.071   7 0.0268 1.99 -0.35
CE/J m 0.176 0.121   2   0.0857 0.687 0.0907, 0.262 2.0
CXB11/HiAJ m 0.0958 0.0589   4 0.0295 0.615 0.0201, 0.145 0.66
CXB1/ByJ m 0.0195 0.0478   6 0.0195 2.45 -0.62
CXB8/HiAJ m 0.128 0.0482   2   0.0341 0.377 0.0938, 0.162 1.2
CXB9/HiAJ m 0.229 0.162   2   0.115 0.709 0.114, 0.343 2.89
DBA/1J m 0.0 0.0   2   0.0 0.0 -0.95
DBA/2J m 0.0335 0.0454   5 0.0203 1.35 -0.39
DDY/JclSidSeyFrkJ m 0.0359 0.0508   2   0.0359 1.41 -0.35
FVB/NJ m 0.0942 0.134   6 0.0548 1.42 0.63
I/LnJ m 0.183 0.111   5 0.0495 0.605 2.12
ILS/IbgTejJ m 0.0686 0.0353   4 0.0176 0.514 0.0341, 0.105 0.2
KK/HlJ m 0.123 0.0523   2   0.037 0.425 0.086, 0.16 1.11
LG/J m 0.122 0.07   4 0.035 0.571 0.0403, 0.198 1.1
LP/J m 0.0327 0.0567   3 0.0327 1.73 -0.4
MA/MyJ m 0.0383 0.0664   3 0.0383 1.73 -0.31
MOLF/EiJ m 0.0 0.0   2   0.0 0.0 -0.95
MRL/MpJ m 0.213 0.0113   2   0.008 0.0531 0.205, 0.221 2.62
NOD/ShiLtJ m 0.237 0.0925   5 0.0414 0.391 0.124, 0.372 3.02
NON/ShiLtJ m 0.0826 0.00707   2   0.005 0.0856 0.0776, 0.0876 0.44
NOR/LtJ m 0.0887 0.0556   2   0.0393 0.628 0.0493, 0.128 0.54
NZB/BlNJ m 0.0582 0.0162   2   0.0115 0.278 0.0468, 0.0697 0.03
NZW/LacJ m 0.0912 0.116   2   0.0818 1.27 0.00947, 0.173 0.58
P/J m 0.018 0.00247   2   0.00175 0.138 0.0162, 0.0197 -0.65
PL/J m 0.0131 0.0185   2   0.0131 1.41 -0.73
PWD/PhJ m 0.0304 0.0   1   0.0 0.0 0.0304, 0.0304 -0.44
RIIIS/J m 0.0434 0.0179   5 0.00802 0.413 0.0228, 0.07 -0.22
SEA/GnJ m 0.04 0.0107   2   0.0076 0.269 0.0324, 0.0476 -0.28
SJL/J m 0.0118 0.0185   5 0.00828 1.57 -0.75
SM/J m 0.0616 0.0407   3 0.0235 0.66 0.0158, 0.0935 0.08
SWR/J m 0.0 0.0   2   0.0 0.0 -0.95
ZALENDE/EiJ m 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.95


  LEAST SQUARES MEANS (MODEL-ADJUSTED)
Strain Sex Mean SEM UpperCL LowerCL
129S1/SvImJ m 0.0 0.0404 0.0796 -0.0796
129X1/SvJ m 0.0 0.0255 0.0503 -0.0503
A/J m 0.0584 0.0255 0.1087 0.0081
AKR/J m 0.0197 0.0404 0.0993 -0.0599
AXB15/PgnJ m 0.0 0.0404 0.0796 -0.0796
AXB19a/PgnJ m 0.0 0.0404 0.0796 -0.0796
AXB1/PgnJ m 0.0214 0.033 0.0863 -0.0436
AXB23/PgnJ m 0.0 0.0404 0.0796 -0.0796
AXB8/PgnJ m 0.0056 0.033 0.0706 -0.0594
BALB/cByJ m 0.128 0.0233 0.174 0.0821
BALB/cJ m 0.1851 0.0216 0.2277 0.1426
BPL/1J m 0.0605 0.0255 0.1108 0.0102
BTBR T+ Itpr3tf/J m 0.0169 0.0286 0.0731 -0.0394
BUB/BnJ m 0.1018 0.0404 0.1813 0.0222
BXA13/PgnJ m 0.2615 0.0404 0.3411 0.1819
BXA14/PgnJ m 0.0025 0.0255 0.0528 -0.0478
BXA16/PgnJ m 0.0 0.0286 0.0563 -0.0563
BXA25/PgnJ m 0.0 0.0286 0.0563 -0.0563
BXA7/PgnJ m 0.125 0.033 0.19 0.06
BXD100/RwwJ m 0.0245 0.033 0.0895 -0.0405
BXD1/TyJ m 0.0059 0.033 0.0709 -0.059
BXD24/TyJ m 0.0257 0.0286 0.082 -0.0305
BXD29/Ty m 0.0 0.0286 0.0563 -0.0563
BXD31/TyJ m 0.049 0.0233 0.0949 0.0031
BXD32/TyJ m 0.0535 0.0404 0.1331 -0.0261
BXD39/TyJ m 0.0 0.0255 0.0503 -0.0503
BXD40/TyJ m 0.0527 0.0286 0.109 -0.0035
BXD42/TyJ m 0.0851 0.0172 0.119 0.0512
BXD48a/RwwJ m 0.0789 0.0404 0.1585 -0.0007
BXD48/RwwJ m 0.0229 0.0255 0.0733 -0.0274
BXD51/RwwJ m 0.0868 0.033 0.1518 0.0219
BXD60/RwwJ m 0.0185 0.0216 0.061 -0.0241
BXD62/RwwJ m 0.0193 0.033 0.0843 -0.0457
BXD65/RwwJ m 0.0469 0.0233 0.0929 0.001
BXD66/RwwJ m 0.0081 0.033 0.0731 -0.0569
BXD68/RwwJ m 0.0336 0.0255 0.0839 -0.0167
BXD75/RwwJ m 0.0822 0.0233 0.1282 0.0363
BXD77/RwwJ m 0.0079 0.033 0.0729 -0.057
BXD84/RwwJ m 0.0227 0.0286 0.079 -0.0335
BXD90/RwwJ m 0.0365 0.0404 0.116 -0.0431
BXD95/RwwJ m 0.0463 0.0404 0.1258 -0.0333
BXD9/TyJ m 0.0688 0.0255 0.1191 0.0185
BXH19/TyJ m 0.0116 0.0404 0.0911 -0.068
BXH22/KccJ m 0.0006 0.0202 0.0404 -0.0392
BXH4/TyJ m 0.0 0.033 0.065 -0.065
BXH6/TyJ m 0.1193 0.033 0.1843 0.0544
BXH8/TyJ m 0.0421 0.0404 0.1217 -0.0375
BXH9/TyJ m 0.0406 0.0286 0.0968 -0.0157
C3HeB/FeJ m 0.0424 0.0404 0.1219 -0.0372
C3H/HeJ m 0.0184 0.0255 0.0688 -0.0319
C57BL/10J m 0.117 0.0404 0.1966 0.0374
C57BL/6J m 0.0236 0.019 0.0611 -0.0139
C57BLKS/J m 0.0603 0.0404 0.1399 -0.0193
C57BR/cdJ m 0.1252 0.033 0.1901 0.0602
C57L/J m 0.0899 0.0404 0.1694 0.0103
C58/J m 0.0844 0.0286 0.1406 0.0281
CAST/EiJ m 0.011 0.033 0.076 -0.054
CBA/J m 0.0357 0.0216 0.0783 -0.0068
CE/J m 0.1763 0.0404 0.2559 0.0968
CXB11/HiAJ m 0.0958 0.0286 0.152 0.0395
CXB1/ByJ m 0.0195 0.0233 0.0654 -0.0264
CXB8/HiAJ m 0.1279 0.0404 0.2075 0.0483
CXB9/HiAJ m 0.2285 0.0404 0.3081 0.1489
DBA/1J m 0.0 0.0404 0.0796 -0.0796
DBA/2J m 0.0335 0.0255 0.0838 -0.0168
DDY/JclSidSeyFrkJ m 0.0359 0.0404 0.1155 -0.0437
FVB/NJ m 0.0942 0.0233 0.1401 0.0483
I/LnJ m 0.1828 0.0255 0.2331 0.1325
ILS/IbgTejJ m 0.0686 0.0286 0.1249 0.0124
KK/HlJ m 0.123 0.0404 0.2026 0.0434
LG/J m 0.1224 0.0286 0.1787 0.0662
LP/J m 0.0327 0.033 0.0977 -0.0322
MA/MyJ m 0.0383 0.033 0.1033 -0.0266
MOLF/EiJ m 0.0 0.0404 0.0796 -0.0796
MRL/MpJ m 0.213 0.0404 0.2926 0.1334
NOD/ShiLtJ m 0.2366 0.0255 0.2869 0.1863
NON/ShiLtJ m 0.0826 0.0404 0.1622 0.003
NOR/LtJ m 0.0886 0.0404 0.1682 0.0091
NZB/BlNJ m 0.0582 0.0404 0.1378 -0.0213
NZW/LacJ m 0.0912 0.0404 0.1708 0.0117
P/J m 0.018 0.0404 0.0975 -0.0616
PL/J m 0.0131 0.0404 0.0927 -0.0665
RIIIS/J m 0.0434 0.0255 0.0937 -0.0069
SEA/GnJ m 0.04 0.0404 0.1196 -0.0396
SJL/J m 0.0118 0.0255 0.0621 -0.0386
SM/J m 0.0616 0.033 0.1266 -0.0033
SWR/J m 0.0 0.0404 0.0796 -0.0796




  GWAS USING LINEAR MIXED MODELS