Project measure / variable:   CSNA01   FR1rate

ID, description, units MPD:60209   FR1rate   fixed ratio 1 (FR1), lever press rate, 8 h test   [n/s]  across 3 days  
sucrose study
Data set, strains CSNA01   HMDP   91 strains     sex: m     age: 7-22wks
Procedure operant conditioning chamber
Ontology mappings

  •   Or, add this measure to your collection.
       
  •     no folder
  •     put it in new folder  

  STRAIN COMPARISON PLOT
Dimensions Width:   px    Height:   px
Download Plot   
Visualization Options

CSNA01 - fixed ratio 1 (FR1), lever press rate, 8 h test across 3 days



  MEASURE SUMMARY
Measure Summary Male
Number of strains tested91 strains
Mean of the strain means0.0384   n/s
Median of the strain means0.0348   n/s
SD of the strain means± 0.0305
Coefficient of variation (CV)0.793
Min–max range of strain means0.000140   –   0.000075   n/s
Mean sample size per strain3.5   mice


  ANOVA, Q-Q NORMALITY ASSESSMENT
ANOVA summary      
FactorDFSum of squaresMean sum of squaresF valuep value (Pr>F)
strain 86 0.2604 0.003 2.888 < 0.0001
Residuals 230 0.2411 0.001


Q-Q normality assessment based on residuals

  


  STRAIN MEANS (UNADJUSTED)
  
Select table page:
Strain Sex Mean SD N mice SEM CV Min, Max Z score
129S1/SvImJ m 6.5e-05 0.0   2   0.0 0.0 5e-05, 8e-05 -1.26
129X1/SvJ m 0.000452 0.000564   5 0.000252 1.25 -1.25
A/J m 0.0457 0.0223   5 0.00998 0.488 0.0265, 0.0818 0.24
AKR/J m 0.0269 0.00764   2   0.0054 0.284 0.0215, 0.0323 -0.38
AXB15/PgnJ m 0.000175 4.94975e-05   2   3.5e-05 0.283 0.00014, 0.00021 -1.26
AXB19a/PgnJ m 0.00104 0.00146   2   0.00103 1.4 1e-05, 0.00207 -1.23
AXB1/PgnJ m 0.0553 0.0104   3 0.00602 0.189 0.047, 0.067 0.55
AXB23/PgnJ m 0.00056 0.00075   2   0.00053 1.34 3e-05, 0.00109 -1.24
AXB6/PgnJ m 0.0389 0.0   1   0.0 0.0 0.0389, 0.0389 0.02
AXB8/PgnJ m 0.0106 0.018   3 0.0104 1.7 2e-05, 0.0314 -0.91
BALB/cByJ m 0.0622 0.0141   6 0.00574 0.226 0.0454, 0.0845 0.78
BALB/cJ m 0.0876 0.05   7 0.0189 0.57 0.00193, 0.151 1.61
BPL/1J m 0.0574 0.0351   5 0.0157 0.612 0.00044, 0.0958 0.62
BTBR T+ Itpr3tf/J m 0.0181 0.0354   4 0.0177 1.96 4e-05, 0.0712 -0.67
BUB/BnJ m 0.0779 0.0181   2   0.0128 0.232 0.0651, 0.0907 1.3
BXA13/PgnJ m 0.0936 0.0161   2   0.0114 0.172 0.0822, 0.105 1.81
BXA14/PgnJ m 0.0115 0.0223   5 0.00996 1.93 0.00011, 0.0513 -0.88
BXA16/PgnJ m 0.00027 0.000325   4 0.000163 1.2 4e-05, 0.00075 -1.25
BXA25/PgnJ m 0.00025 0.000328   4 0.000164 1.31 4e-05, 0.00074 -1.25
BXA4/PgnJ m 0.00014 0.0   1   0.0 0.0 0.00014, 0.00014 -1.26
BXA7/PgnJ m 0.0593 0.0061   3 0.00352 0.103 0.0528, 0.0649 0.69
BXD100/RwwJ m 0.0148 0.0129   3 0.00743 0.87 0.00056, 0.0256 -0.78
BXD1/TyJ m 0.0265 0.0401   3 0.0232 1.51 9e-05, 0.0727 -0.39
BXD24/TyJ m 0.0319 0.0148   4 0.00741 0.465 0.0181, 0.0499 -0.21
BXD29/Ty m 0.00127 0.000877   4 0.000438 0.689 0.00067, 0.00254 -1.22
BXD31/TyJ m 0.0362 0.0549   6 0.0224 1.51 0.00016, 0.111 -0.07
BXD32/TyJ m 0.0321 0.0451   2   0.0319 1.41 0.0002, 0.064 -0.21
BXD39/TyJ m 0.000438 0.000422   5 0.000189 0.962 4e-05, 0.00113 -1.25
BXD40/TyJ m 0.0533 0.0362   4 0.0181 0.68 7e-05, 0.0783 0.49
BXD42/TyJ m 0.0621 0.0495   11 0.0149 0.797 0.78
BXD48a/RwwJ m 0.0889 0.027   2   0.0191 0.304 0.0698, 0.108 1.66
BXD48/RwwJ m 0.0303 0.0447   5 0.02 1.47 -0.27
BXD51/RwwJ m 0.0577 0.0215   3 0.0124 0.372 0.0388, 0.0811 0.63
BXD60/RwwJ m 0.031 0.03   7 0.0113 0.967 7e-05, 0.0749 -0.24
BXD62/RwwJ m 0.0442 0.0406   3 0.0235 0.92 0.00591, 0.0868 0.19
BXD65/RwwJ m 0.04 0.0438   6 0.0179 1.1 0.00056, 0.107 0.05
BXD66/RwwJ m 0.0168 0.0243   3 0.014 1.44 0.00023, 0.0447 -0.71
BXD68/RwwJ m 0.0164 0.0294   5 0.0132 1.8 6e-05, 0.0685 -0.72
BXD75/RwwJ m 0.0526 0.0359   6 0.0147 0.683 0.00052, 0.089 0.47
BXD77/RwwJ m 0.0142 0.0229   3 0.0132 1.61 5e-05, 0.0406 -0.8
BXD84/RwwJ m 0.0184 0.0359   4 0.018 1.95 2e-05, 0.0723 -0.66
BXD90/RwwJ m 0.024 0.0337   2   0.0238 1.4 0.0002, 0.0478 -0.47
BXD95/RwwJ m 0.0348 0.049   2   0.0346 1.41 0.00012, 0.0694 -0.12
BXD9/TyJ m 0.0735 0.0258   5 0.0116 0.352 0.0443, 0.108 1.15
BXH19/TyJ m 0.0232 0.0324   2   0.0229 1.4 0.00024, 0.0461 -0.5
BXH22/KccJ m 0.00501 0.00634   8 0.00224 1.26 0.00034, 0.0196 -1.1
BXH4/TyJ m 0.000227 0.000323   3 0.000187 1.43 4e-05, 0.0006 -1.25
BXH6/TyJ m 0.07 0.0602   3 0.0348 0.86 0.00187, 0.116 1.04
BXH8/TyJ m 0.0157 0.0214   2   0.0152 1.36 0.00058, 0.0309 -0.75
BXH9/TyJ m 0.057 0.00418   4 0.00209 0.0733 0.0518, 0.0618 0.61
C3HeB/FeJ m 0.0152 0.0213   2   0.0151 1.4 0.00014, 0.0303 -0.76
C3H/HeJ m 0.016 0.032   5 0.0143 2.0 0.00016, 0.0731 -0.74
C57BL/10J m 0.0906 0.0112   2   0.00795 0.124 0.0827, 0.0986 1.71
C57BL/6J m 0.0188 0.0305   9 0.0102 1.62 0.0001, 0.0811 -0.64
C57BLKS/J m 0.0601 0.0324   2   0.0229 0.539 0.0372, 0.083 0.71
C57BR/cdJ m 0.0715 0.0189   3 0.0109 0.264 0.0512, 0.0886 1.09
C57L/J m 0.0754 0.0142   2   0.0101 0.189 0.0653, 0.0854 1.21
C58/J m 0.0644 0.0558   4 0.0279 0.867 0.00142, 0.126 0.85
CAST/EiJ m 0.0329 0.00567   3 0.00327 0.172 0.0266, 0.0376 -0.18
CBA/J m 0.0234 0.0369   7 0.0139 1.58 0.001, 0.0925 -0.49
CE/J m 0.101 0.0576   2   0.0407 0.568 0.0606, 0.142 2.05
CXB11/HiAJ m 0.05 0.0178   4 0.00891 0.356 0.0267, 0.0648 0.38
CXB1/ByJ m 0.0117 0.0275   6 0.0112 2.35 5e-05, 0.0678 -0.88
CXB8/HiAJ m 0.0769 0.00742   2   0.00525 0.0966 0.0716, 0.0821 1.26
CXB9/HiAJ m 0.116 0.0281   2   0.0198 0.242 0.0963, 0.136 2.55
DBA/1J m 0.000395 0.0   2   0.0 0.0 0.00038, 0.00041 -1.25
DBA/2J m 0.0356 0.0423   5 0.0189 1.19 0.00029, 0.104 -0.09
DDY/JclSidSeyFrkJ m 0.031 0.0412   2   0.0291 1.33 0.00181, 0.0601 -0.24
FVB/NJ m 0.0618 0.0605   6 0.0247 0.978 0.00074, 0.134 0.77
I/LnJ m 0.0873 0.0586   5 0.0262 0.671 0.00015, 0.135 1.61
ILS/IbgTejJ m 0.0568 0.0171   4 0.00853 0.3 0.0351, 0.0768 0.6
KK/HlJ m 0.0653 0.000283   2   0.0002 0.00433 0.0651, 0.0655 0.88
LG/J m 0.0598 0.012   4 0.00602 0.201 0.0474, 0.0722 0.7
LP/J m 0.0195 0.0328   3 0.0189 1.68 0.00025, 0.0574 -0.62
MA/MyJ m 0.0207 0.0357   3 0.0206 1.72 7e-05, 0.062 -0.58
MOLF/EiJ m 0.00234 0.00195   2   0.00138 0.834 0.00096, 0.00372 -1.18
MRL/MpJ m 0.12 0.0421   2   0.0298 0.35 0.0905, 0.15 2.68
NOD/ShiLtJ m 0.101 0.034   5 0.0152 0.336 0.0697, 0.139 2.05
NON/ShiLtJ m 0.05 0.000424   2   0.0003 0.00849 0.0497, 0.0503 0.38
NOR/LtJ m 0.0718 0.0339   2   0.024 0.473 0.0478, 0.0958 1.1
NZB/BlNJ m 0.0406 0.0366   2   0.0259 0.902 0.0147, 0.0665 0.07
NZW/LacJ m 0.0502 0.0513   2   0.0363 1.02 0.0139, 0.0865 0.39
P/J m 0.0112 0.00634   2   0.00448 0.566 0.00673, 0.0157 -0.89
PL/J m 0.0181 0.0255   2   0.0181 1.41 9e-05, 0.0362 -0.67
PWD/PhJ m 0.0149 0.0   1   0.0 0.0 0.0149, 0.0149 -0.77
RIIIS/J m 0.0405 0.01   5 0.00449 0.248 0.0312, 0.0564 0.07
SEA/GnJ m 0.0284 0.00368   2   0.0026 0.129 0.0258, 0.031 -0.33
SJL/J m 0.00887 0.00793   5 0.00354 0.894 0.00015, 0.0187 -0.97
SM/J m 0.0482 0.0287   3 0.0166 0.596 0.0192, 0.0766 0.32
SWR/J m 7.5e-05 0.0   2   0.0 0.0 6e-05, 9e-05 -1.26
ZALENDE/EiJ m 0.00711 0.0   1   0.0 0.0 0.00711, 0.00711 -1.03


  LEAST SQUARES MEANS (MODEL-ADJUSTED)
Strain Sex Mean SEM UpperCL LowerCL
129S1/SvImJ m 0.0001 0.0229 0.0452 0.0
129X1/SvJ m 0.0005 0.0145 0.029 0.0
A/J m 0.0457 0.0145 0.0742 0.0172
AKR/J m 0.0269 0.0229 0.072 0.0
AXB15/PgnJ m 0.0002 0.0229 0.0453 0.0
AXB19a/PgnJ m 0.001 0.0229 0.0461 0.0
AXB1/PgnJ m 0.0553 0.0187 0.0921 0.0185
AXB23/PgnJ m 0.0006 0.0229 0.0457 0.0
AXB8/PgnJ m 0.0106 0.0187 0.0474 0.0
BALB/cByJ m 0.0622 0.0132 0.0883 0.0362
BALB/cJ m 0.0876 0.0122 0.1117 0.0635
BPL/1J m 0.0574 0.0145 0.0859 0.0289
BTBR T+ Itpr3tf/J m 0.0181 0.0162 0.05 0.0
BUB/BnJ m 0.0779 0.0229 0.123 0.0328
BXA13/PgnJ m 0.0936 0.0229 0.1387 0.0485
BXA14/PgnJ m 0.0115 0.0145 0.04 0.0
BXA16/PgnJ m 0.0003 0.0162 0.0322 0.0
BXA25/PgnJ m 0.0003 0.0162 0.0321 0.0
BXA7/PgnJ m 0.0593 0.0187 0.0961 0.0225
BXD100/RwwJ m 0.0148 0.0187 0.0516 0.0
BXD1/TyJ m 0.0265 0.0187 0.0634 0.0
BXD24/TyJ m 0.0319 0.0162 0.0637 0.0
BXD29/Ty m 0.0013 0.0162 0.0332 0.0
BXD31/TyJ m 0.0362 0.0132 0.0623 0.0102
BXD32/TyJ m 0.0321 0.0229 0.0772 0.0
BXD39/TyJ m 0.0004 0.0145 0.029 0.0
BXD40/TyJ m 0.0533 0.0162 0.0852 0.0214
BXD42/TyJ m 0.0621 0.0098 0.0813 0.0429
BXD48a/RwwJ m 0.0889 0.0229 0.134 0.0438
BXD48/RwwJ m 0.0303 0.0145 0.0589 0.0018
BXD51/RwwJ m 0.0577 0.0187 0.0946 0.0209
BXD60/RwwJ m 0.031 0.0122 0.0551 0.0069
BXD62/RwwJ m 0.0442 0.0187 0.081 0.0073
BXD65/RwwJ m 0.04 0.0132 0.066 0.0139
BXD66/RwwJ m 0.0168 0.0187 0.0537 0.0
BXD68/RwwJ m 0.0164 0.0145 0.0449 0.0
BXD75/RwwJ m 0.0526 0.0132 0.0786 0.0265
BXD77/RwwJ m 0.0142 0.0187 0.051 0.0
BXD84/RwwJ m 0.0184 0.0162 0.0503 0.0
BXD90/RwwJ m 0.024 0.0229 0.0691 0.0
BXD95/RwwJ m 0.0348 0.0229 0.0799 0.0
BXD9/TyJ m 0.0735 0.0145 0.102 0.045
BXH19/TyJ m 0.0232 0.0229 0.0683 0.0
BXH22/KccJ m 0.005 0.0114 0.0276 0.0
BXH4/TyJ m 0.0002 0.0187 0.0371 0.0
BXH6/TyJ m 0.07 0.0187 0.1069 0.0332
BXH8/TyJ m 0.0157 0.0229 0.0608 0.0
BXH9/TyJ m 0.057 0.0162 0.0889 0.0251
C3HeB/FeJ m 0.0152 0.0229 0.0603 0.0
C3H/HeJ m 0.016 0.0145 0.0445 0.0
C57BL/10J m 0.0906 0.0229 0.1358 0.0455
C57BL/6J m 0.0188 0.0108 0.0401 0.0
C57BLKS/J m 0.0601 0.0229 0.1052 0.015
C57BR/cdJ m 0.0715 0.0187 0.1084 0.0347
C57L/J m 0.0754 0.0229 0.1205 0.0302
C58/J m 0.0644 0.0162 0.0963 0.0325
CAST/EiJ m 0.0329 0.0187 0.0697 0.0
CBA/J m 0.0234 0.0122 0.0475 0.0
CE/J m 0.1013 0.0229 0.1464 0.0562
CXB11/HiAJ m 0.05 0.0162 0.0819 0.0181
CXB1/ByJ m 0.0117 0.0132 0.0377 0.0
CXB8/HiAJ m 0.0768 0.0229 0.122 0.0317
CXB9/HiAJ m 0.1161 0.0229 0.1613 0.071
DBA/1J m 0.0004 0.0229 0.0455 0.0
DBA/2J m 0.0356 0.0145 0.0641 0.007
DDY/JclSidSeyFrkJ m 0.031 0.0229 0.0761 0.0
FVB/NJ m 0.0618 0.0132 0.0878 0.0357
I/LnJ m 0.0873 0.0145 0.1158 0.0588
ILS/IbgTejJ m 0.0568 0.0162 0.0887 0.025
KK/HlJ m 0.0653 0.0229 0.1104 0.0202
LG/J m 0.0598 0.0162 0.0917 0.0279
LP/J m 0.0195 0.0187 0.0563 0.0
MA/MyJ m 0.0207 0.0187 0.0576 0.0
MOLF/EiJ m 0.0023 0.0229 0.0474 0.0
MRL/MpJ m 0.1202 0.0229 0.1654 0.0751
NOD/ShiLtJ m 0.1011 0.0145 0.1296 0.0726
NON/ShiLtJ m 0.05 0.0229 0.0951 0.0049
NOR/LtJ m 0.0718 0.0229 0.1169 0.0267
NZB/BlNJ m 0.0406 0.0229 0.0857 0.0
NZW/LacJ m 0.0502 0.0229 0.0953 0.0051
P/J m 0.0112 0.0229 0.0563 0.0
PL/J m 0.0181 0.0229 0.0633 0.0
RIIIS/J m 0.0405 0.0145 0.069 0.0119
SEA/GnJ m 0.0284 0.0229 0.0735 0.0
SJL/J m 0.0089 0.0145 0.0374 0.0
SM/J m 0.0482 0.0187 0.085 0.0113
SWR/J m 0.0001 0.0229 0.0452 0.0




  GWAS USING LINEAR MIXED MODELS