Project measure / variable:   CSNA01   FR1rateD3

ID, description, units MPD:60208   FR1rateD3   fixed ratio 1 (FR1), lever press rate, 8 h test   [n/s]  day 3  
sucrose study
Data set, strains CSNA01   HMDP   91 strains     sex: m     age: 7-22wks
Procedure operant conditioning chamber
Ontology mappings

  •   Or, add this measure to your collection.
       
  •     no folder
  •     put it in new folder  

  STRAIN COMPARISON PLOT
Dimensions Width:   px    Height:   px
Download Plot   
Visualization Options

CSNA01 - fixed ratio 1 (FR1), lever press rate, 8 h test day 3



  MEASURE SUMMARY
Measure Summary Male
Number of strains tested91 strains
Mean of the strain means0.0628   n/s
Median of the strain means0.0630   n/s
SD of the strain means± 0.0472
Coefficient of variation (CV)0.752
Min–max range of strain means0   –   0.00004   n/s
Mean sample size per strain3.5   mice


  ANOVA, Q-Q NORMALITY ASSESSMENT
ANOVA summary      
FactorDFSum of squaresMean sum of squaresF valuep value (Pr>F)
strain 86 0.6487 0.0075 2.4447 < 0.0001
Residuals 230 0.7097 0.0031


Q-Q normality assessment based on residuals

  


  STRAIN MEANS (UNADJUSTED)
  
Select table page:
Strain Sex Mean SD N mice SEM CV Min, Max Z score
129S1/SvImJ m 0.0 0.0   2   0.0 0.0 -1.33
129X1/SvJ m 1.6e-05 0.0   5 0.0 0.0 -1.33
A/J m 0.0903 0.0341   5 0.0153 0.378 0.0534, 0.137 0.58
AKR/J m 0.0551 0.0105   2   0.00745 0.191 0.0476, 0.0625 -0.16
AXB15/PgnJ m 4e-05 5.65685e-05   2   4e-05 1.41 -1.33
AXB19a/PgnJ m 0.00297 0.00414   2   0.00292 1.4 4e-05, 0.00589 -1.27
AXB1/PgnJ m 0.12 0.0147   3 0.0085 0.123 0.103, 0.129 1.21
AXB23/PgnJ m 0.00109 0.00154   2   0.00109 1.41 -1.31
AXB6/PgnJ m 0.0376 0.0   1   0.0 0.0 0.0376, 0.0376 -0.53
AXB8/PgnJ m 0.0175 0.0302   3 0.0174 1.73 -0.96
BALB/cByJ m 0.108 0.028   6 0.0115 0.259 0.0772, 0.149 0.96
BALB/cJ m 0.156 0.0944   7 0.0357 0.606 0.00536, 0.283 1.98
BPL/1J m 0.0783 0.0487   5 0.0218 0.621 0.00035, 0.125 0.33
BTBR T+ Itpr3tf/J m 0.028 0.056   4 0.028 2.0 -0.74
BUB/BnJ m 0.138 0.0564   2   0.0399 0.409 0.0982, 0.178 1.59
BXA13/PgnJ m 0.139 0.0134   2   0.0095 0.097 0.129, 0.148 1.62
BXA14/PgnJ m 0.0164 0.0294   5 0.0132 1.79 -0.98
BXA16/PgnJ m 0.000525 0.000971   4 0.000485 1.85 -1.32
BXA25/PgnJ m 0.000605 0.00101   4 0.000503 1.66 -1.32
BXA4/PgnJ m 0.00028 0.0   1   0.0 0.0 0.00028, 0.00028 -1.32
BXA7/PgnJ m 0.0836 0.0126   3 0.00727 0.151 0.0728, 0.0974 0.44
BXD100/RwwJ m 0.0229 0.0205   3 0.0119 0.897 7e-05, 0.0399 -0.85
BXD1/TyJ m 0.0477 0.0825   3 0.0476 1.73 4e-05, 0.143 -0.32
BXD24/TyJ m 0.0552 0.0275   4 0.0137 0.498 0.0181, 0.0808 -0.16
BXD29/Ty m 0.00311 0.00309   4 0.00155 0.993 -1.26
BXD31/TyJ m 0.0577 0.0874   6 0.0357 1.51 -0.11
BXD32/TyJ m 0.0432 0.0612   2   0.0432 1.41 -0.41
BXD39/TyJ m 0.000718 0.00109   5 0.000486 1.51 -1.32
BXD40/TyJ m 0.0978 0.0708   4 0.0354 0.724 0.74
BXD42/TyJ m 0.102 0.0788   11 0.0238 0.776 0.83
BXD48a/RwwJ m 0.139 0.0634   2   0.0448 0.455 0.0944, 0.184 1.62
BXD48/RwwJ m 0.0515 0.0789   5 0.0353 1.53 -0.24
BXD51/RwwJ m 0.0956 0.032   3 0.0185 0.335 0.0686, 0.131 0.7
BXD60/RwwJ m 0.0578 0.0547   7 0.0207 0.947 -0.11
BXD62/RwwJ m 0.0774 0.0649   3 0.0374 0.838 0.0171, 0.146 0.31
BXD65/RwwJ m 0.0602 0.0627   6 0.0256 1.04 8e-05, 0.153 -0.05
BXD66/RwwJ m 0.0394 0.0572   3 0.033 1.45 4e-05, 0.105 -0.5
BXD68/RwwJ m 0.0241 0.0531   5 0.0237 2.2 -0.82
BXD75/RwwJ m 0.0799 0.0615   6 0.0251 0.77 0.36
BXD77/RwwJ m 0.0215 0.0369   3 0.0213 1.72 8e-05, 0.0641 -0.87
BXD84/RwwJ m 0.0308 0.0601   4 0.0301 1.95 -0.68
BXD90/RwwJ m 0.056 0.0792   2   0.056 1.41 -0.14
BXD95/RwwJ m 0.073 0.103   2   0.073 1.41 0.22
BXD9/TyJ m 0.112 0.0465   5 0.0208 0.415 0.0646, 0.181 1.04
BXH19/TyJ m 0.0422 0.0594   2   0.042 1.41 0.00013, 0.0842 -0.44
BXH22/KccJ m 0.00975 0.0162   8 0.00573 1.66 -1.12
BXH4/TyJ m 0.00022 0.000381   3 0.00022 1.73 -1.33
BXH6/TyJ m 0.112 0.098   3 0.0566 0.872 0.00502, 0.197 1.04
BXH8/TyJ m 0.0439 0.0598   2   0.0423 1.36 0.00164, 0.0862 -0.4
BXH9/TyJ m 0.0949 0.017   4 0.00849 0.179 0.0723, 0.113 0.68
C3HeB/FeJ m 0.0442 0.0623   2   0.0441 1.41 0.00018, 0.0883 -0.39
C3H/HeJ m 0.029 0.0621   5 0.0278 2.14 0.00021, 0.14 -0.72
C57BL/10J m 0.115 0.000707   2   0.0005 0.00618 0.114, 0.115 1.11
C57BL/6J m 0.034 0.0501   9 0.0167 1.47 -0.61
C57BLKS/J m 0.0669 0.0453   2   0.032 0.676 0.0349, 0.0989 0.09
C57BR/cdJ m 0.131 0.0213   3 0.0123 0.162 0.108, 0.15 1.45
C57L/J m 0.0865 0.0136   2   0.0096 0.157 0.0769, 0.0961 0.5
C58/J m 0.104 0.0844   4 0.0422 0.809 0.00288, 0.207 0.87
CAST/EiJ m 0.0649 0.0135   3 0.00779 0.208 0.0494, 0.0742 0.05
CBA/J m 0.0379 0.0554   7 0.0209 1.46 -0.53
CE/J m 0.127 0.0983   2   0.0695 0.777 0.057, 0.196 1.36
CXB11/HiAJ m 0.0833 0.0267   4 0.0133 0.32 0.0504, 0.111 0.44
CXB1/ByJ m 0.0256 0.061   6 0.0249 2.38 -0.79
CXB8/HiAJ m 0.117 0.0   2   0.0 0.0 0.117, 0.117 1.15
CXB9/HiAJ m 0.157 0.00283   2   0.002 0.018 0.155, 0.159 2.0
DBA/1J m 0.000775 9.19239e-05   2   6.5e-05 0.119 0.00071, 0.00084 -1.31
DBA/2J m 0.0784 0.087   5 0.0389 1.11 0.00059, 0.205 0.33
DDY/JclSidSeyFrkJ m 0.0548 0.0724   2   0.0512 1.32 0.00365, 0.106 -0.17
FVB/NJ m 0.11 0.12   6 0.049 1.09 0.00024, 0.25 1.0
I/LnJ m 0.127 0.0736   5 0.0329 0.58 1.36
ILS/IbgTejJ m 0.0973 0.0234   4 0.0117 0.24 0.0685, 0.122 0.73
KK/HlJ m 0.113 0.0099   2   0.007 0.0876 0.106, 0.12 1.06
LG/J m 0.0799 0.0339   4 0.017 0.424 0.0426, 0.112 0.36
LP/J m 0.026 0.0431   3 0.0249 1.66 8e-05, 0.0758 -0.78
MA/MyJ m 0.037 0.0641   3 0.037 1.73 -0.55
MOLF/EiJ m 0.000985 0.00134   2   0.000945 1.36 4e-05, 0.00193 -1.31
MRL/MpJ m 0.199 0.0849   2   0.06 0.426 0.139, 0.259 2.89
NOD/ShiLtJ m 0.16 0.0656   5 0.0293 0.409 0.0712, 0.231 2.06
NON/ShiLtJ m 0.0813 0.0024   2   0.0017 0.0296 0.0796, 0.083 0.39
NOR/LtJ m 0.129 0.0509   2   0.036 0.395 0.093, 0.165 1.4
NZB/BlNJ m 0.063 0.0319   2   0.0225 0.506 0.0405, 0.0856 0.0
NZW/LacJ m 0.0863 0.0787   2   0.0556 0.911 0.0307, 0.142 0.5
P/J m 0.0163 0.00396   2   0.0028 0.243 0.0135, 0.0191 -0.98
PL/J m 0.0283 0.04   2   0.0283 1.41 4e-05, 0.0566 -0.73
PWD/PhJ m 0.0328 0.0   1   0.0 0.0 0.0328, 0.0328 -0.64
RIIIS/J m 0.0706 0.0181   5 0.0081 0.257 0.0533, 0.0937 0.17
SEA/GnJ m 0.0646 0.0176   2   0.0125 0.272 0.0522, 0.0771 0.04
SJL/J m 0.0187 0.0242   5 0.0108 1.29 7e-05, 0.0538 -0.93
SM/J m 0.0855 0.0335   3 0.0193 0.391 0.0532, 0.12 0.48
SWR/J m 3.5e-05 4.94975e-05   2   3.5e-05 1.41 -1.33
ZALENDE/EiJ m 0.00365 0.0   1   0.0 0.0 0.00365, 0.00365 -1.25


  LEAST SQUARES MEANS (MODEL-ADJUSTED)
Strain Sex Mean SEM UpperCL LowerCL
129S1/SvImJ m 0.0 0.0393 0.0774 -0.0774
129X1/SvJ m 0.0 0.0248 0.049 -0.0489
A/J m 0.0903 0.0248 0.1392 0.0414
AKR/J m 0.0551 0.0393 0.1324 -0.0223
AXB15/PgnJ m 0.0 0.0393 0.0774 -0.0774
AXB19a/PgnJ m 0.003 0.0393 0.0804 -0.0744
AXB1/PgnJ m 0.12 0.0321 0.1832 0.0568
AXB23/PgnJ m 0.0011 0.0393 0.0785 -0.0763
AXB8/PgnJ m 0.0175 0.0321 0.0807 -0.0457
BALB/cByJ m 0.1083 0.0227 0.153 0.0636
BALB/cJ m 0.1559 0.021 0.1973 0.1145
BPL/1J m 0.0783 0.0248 0.1273 0.0294
BTBR T+ Itpr3tf/J m 0.028 0.0278 0.0828 -0.0267
BUB/BnJ m 0.1381 0.0393 0.2155 0.0607
BXA13/PgnJ m 0.1385 0.0393 0.2159 0.0611
BXA14/PgnJ m 0.0164 0.0248 0.0653 -0.0325
BXA16/PgnJ m 0.0005 0.0278 0.0552 -0.0542
BXA25/PgnJ m 0.0006 0.0278 0.0553 -0.0541
BXA7/PgnJ m 0.0836 0.0321 0.1468 0.0204
BXD100/RwwJ m 0.0229 0.0321 0.0861 -0.0403
BXD1/TyJ m 0.0477 0.0321 0.1109 -0.0155
BXD24/TyJ m 0.0552 0.0278 0.1099 0.0005
BXD29/Ty m 0.0031 0.0278 0.0578 -0.0516
BXD31/TyJ m 0.0577 0.0227 0.1024 0.0131
BXD32/TyJ m 0.0433 0.0393 0.1206 -0.0341
BXD39/TyJ m 0.0007 0.0248 0.0497 -0.0482
BXD40/TyJ m 0.0979 0.0278 0.1526 0.0431
BXD42/TyJ m 0.1015 0.0167 0.1345 0.0685
BXD48a/RwwJ m 0.1392 0.0393 0.2166 0.0618
BXD48/RwwJ m 0.0515 0.0248 0.1005 0.0026
BXD51/RwwJ m 0.0956 0.0321 0.1588 0.0324
BXD60/RwwJ m 0.0578 0.021 0.0992 0.0164
BXD62/RwwJ m 0.0774 0.0321 0.1406 0.0142
BXD65/RwwJ m 0.0602 0.0227 0.1048 0.0155
BXD66/RwwJ m 0.0394 0.0321 0.1026 -0.0237
BXD68/RwwJ m 0.0241 0.0248 0.073 -0.0248
BXD75/RwwJ m 0.0799 0.0227 0.1246 0.0353
BXD77/RwwJ m 0.0215 0.0321 0.0846 -0.0417
BXD84/RwwJ m 0.0308 0.0278 0.0856 -0.0239
BXD90/RwwJ m 0.056 0.0393 0.1334 -0.0214
BXD95/RwwJ m 0.073 0.0393 0.1504 -0.0044
BXD9/TyJ m 0.112 0.0248 0.161 0.0631
BXH19/TyJ m 0.0422 0.0393 0.1196 -0.0352
BXH22/KccJ m 0.0097 0.0196 0.0484 -0.0289
BXH4/TyJ m 0.0002 0.0321 0.0634 -0.063
BXH6/TyJ m 0.1123 0.0321 0.1755 0.0492
BXH8/TyJ m 0.0439 0.0393 0.1213 -0.0335
BXH9/TyJ m 0.0949 0.0278 0.1496 0.0402
C3HeB/FeJ m 0.0442 0.0393 0.1216 -0.0332
C3H/HeJ m 0.029 0.0248 0.078 -0.0199
C57BL/10J m 0.1145 0.0393 0.1919 0.0371
C57BL/6J m 0.034 0.0185 0.0705 -0.0025
C57BLKS/J m 0.0669 0.0393 0.1443 -0.0105
C57BR/cdJ m 0.131 0.0321 0.1942 0.0678
C57L/J m 0.0865 0.0393 0.1639 0.0091
C58/J m 0.1043 0.0278 0.159 0.0496
CAST/EiJ m 0.0649 0.0321 0.1281 0.0017
CBA/J m 0.0379 0.021 0.0792 -0.0035
CE/J m 0.1265 0.0393 0.2039 0.0491
CXB11/HiAJ m 0.0834 0.0278 0.1381 0.0286
CXB1/ByJ m 0.0256 0.0227 0.0703 -0.0191
CXB8/HiAJ m 0.117 0.0393 0.1944 0.0396
CXB9/HiAJ m 0.157 0.0393 0.2344 0.0796
DBA/1J m 0.0008 0.0393 0.0782 -0.0766
DBA/2J m 0.0784 0.0248 0.1274 0.0295
DDY/JclSidSeyFrkJ m 0.0548 0.0393 0.1322 -0.0226
FVB/NJ m 0.1104 0.0227 0.155 0.0657
I/LnJ m 0.127 0.0248 0.1759 0.0781
ILS/IbgTejJ m 0.0973 0.0278 0.152 0.0426
KK/HlJ m 0.113 0.0393 0.1904 0.0356
LG/J m 0.0799 0.0278 0.1346 0.0252
LP/J m 0.026 0.0321 0.0892 -0.0371
MA/MyJ m 0.037 0.0321 0.1002 -0.0262
MOLF/EiJ m 0.001 0.0393 0.0784 -0.0764
MRL/MpJ m 0.199 0.0393 0.2764 0.1216
NOD/ShiLtJ m 0.1604 0.0248 0.2094 0.1115
NON/ShiLtJ m 0.0813 0.0393 0.1587 0.0039
NOR/LtJ m 0.129 0.0393 0.2064 0.0516
NZB/BlNJ m 0.0631 0.0393 0.1404 -0.0143
NZW/LacJ m 0.0864 0.0393 0.1637 0.009
P/J m 0.0163 0.0393 0.0937 -0.0611
PL/J m 0.0283 0.0393 0.1057 -0.0491
RIIIS/J m 0.0706 0.0248 0.1195 0.0216
SEA/GnJ m 0.0647 0.0393 0.142 -0.0127
SJL/J m 0.0187 0.0248 0.0677 -0.0302
SM/J m 0.0855 0.0321 0.1487 0.0223
SWR/J m 0.0 0.0393 0.0774 -0.0774




  GWAS USING LINEAR MIXED MODELS