Project measure / variable:   CSNA01   FR1rateD2

ID, description, units MPD:60207   FR1rateD2   fixed ratio 1 (FR1), lever press rate, 8 h test   [n/s]  day 2  
sucrose study
Data set, strains CSNA01   HMDP   91 strains     sex: m     age: 7-22wks
Procedure operant conditioning chamber
Ontology mappings

  •   Or, add this measure to your collection.
       
  •     no folder
  •     put it in new folder  

  STRAIN COMPARISON PLOT
Dimensions Width:   px    Height:   px
Download Plot   
Visualization Options

CSNA01 - fixed ratio 1 (FR1), lever press rate, 8 h test day 2



  MEASURE SUMMARY
Measure Summary Male
Number of strains tested91 strains
Mean of the strain means0.0452   n/s
Median of the strain means0.0459   n/s
SD of the strain means± 0.0407
Coefficient of variation (CV)0.900
Min–max range of strain means0   –   0.0000775   n/s
Mean sample size per strain3.5   mice


  ANOVA, Q-Q NORMALITY ASSESSMENT
ANOVA summary      
FactorDFSum of squaresMean sum of squaresF valuep value (Pr>F)
strain 86 0.4385 0.0051 2.868 < 0.0001
Residuals 230 0.4089 0.0018


Q-Q normality assessment based on residuals

  


  STRAIN MEANS (UNADJUSTED)
  
Select table page:
Strain Sex Mean SD N mice SEM CV Min, Max Z score
129S1/SvImJ m 3.5e-05 4.94975e-05   2   3.5e-05 1.41 -1.11
129X1/SvJ m 0.0 0.0   5 0.0 0.0 -1.11
A/J m 0.0404 0.0344   5 0.0154 0.85 0.00372, 0.0955 -0.12
AKR/J m 0.0247 0.0323   2   0.0228 1.31 0.00186, 0.0475 -0.5
AXB15/PgnJ m 0.000315 0.00029   2   0.000205 0.92 0.00011, 0.00052 -1.1
AXB19a/PgnJ m 4.5e-05 6.36396e-05   2   4.5e-05 1.41 -1.11
AXB1/PgnJ m 0.0398 0.0162   3 0.00936 0.408 0.0257, 0.0575 -0.13
AXB23/PgnJ m 7e-05 9.89949e-05   2   7e-05 1.41 -1.11
AXB6/PgnJ m 0.0675 0.0   1   0.0 0.0 0.0675, 0.0675 0.55
AXB8/PgnJ m 0.00903 0.0156   3 0.00903 1.73 -0.89
BALB/cByJ m 0.0735 0.0458   6 0.0187 0.623 0.00208, 0.146 0.7
BALB/cJ m 0.0972 0.0695   7 0.0263 0.715 0.00025, 0.18 1.28
BPL/1J m 0.0772 0.0478   5 0.0214 0.619 0.00075, 0.133 0.79
BTBR T+ Itpr3tf/J m 0.0224 0.0428   4 0.0214 1.91 -0.56
BUB/BnJ m 0.0665 0.0053   2   0.00375 0.0797 0.0628, 0.0703 0.52
BXA13/PgnJ m 0.134 0.041   2   0.029 0.306 0.105, 0.163 2.18
BXA14/PgnJ m 0.0167 0.0347   5 0.0155 2.07 0.00011, 0.0787 -0.7
BXA16/PgnJ m 7.75e-05 0.000113   4 5.66238e-05 1.46 -1.11
BXA25/PgnJ m 1.25e-05 0.0   4 0.0 0.0 -1.11
BXA4/PgnJ m 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -1.11
BXA7/PgnJ m 0.0781 0.0117   3 0.00677 0.15 0.0649, 0.0874 0.81
BXD100/RwwJ m 0.0162 0.0143   3 0.00828 0.884 0.00129, 0.0299 -0.71
BXD1/TyJ m 0.0306 0.0374   3 0.0216 1.22 -0.36
BXD24/TyJ m 0.0382 0.0271   4 0.0136 0.71 0.00156, 0.0669 -0.17
BXD29/Ty m 0.0001 8.28654e-05   4 4.14327e-05 0.829 -1.11
BXD31/TyJ m 0.0459 0.0698   6 0.0285 1.52 0.02
BXD32/TyJ m 0.0517 0.0725   2   0.0513 1.4 0.00046, 0.103 0.16
BXD39/TyJ m 0.000126 9.76217e-05   5 4.36578e-05 0.775 -1.11
BXD40/TyJ m 0.0516 0.0347   4 0.0174 0.672 7e-05, 0.0756 0.16
BXD42/TyJ m 0.0792 0.0683   11 0.0206 0.862 0.84
BXD48a/RwwJ m 0.111 0.0106   2   0.0075 0.0951 0.104, 0.119 1.62
BXD48/RwwJ m 0.0356 0.05   5 0.0223 1.4 -0.24
BXD51/RwwJ m 0.0711 0.0279   3 0.0161 0.393 0.0457, 0.101 0.64
BXD60/RwwJ m 0.0316 0.033   7 0.0125 1.05 5e-05, 0.0864 -0.33
BXD62/RwwJ m 0.0518 0.0565   3 0.0326 1.09 0.16
BXD65/RwwJ m 0.0477 0.0578   6 0.0236 1.21 9e-05, 0.143 0.06
BXD66/RwwJ m 0.01 0.0159   3 0.0092 1.59 0.00014, 0.0284 -0.87
BXD68/RwwJ m 0.0238 0.0341   5 0.0153 1.43 -0.53
BXD75/RwwJ m 0.0674 0.0486   6 0.0199 0.721 0.55
BXD77/RwwJ m 0.0203 0.0308   3 0.0178 1.52 -0.61
BXD84/RwwJ m 0.0208 0.0412   4 0.0206 1.99 -0.6
BXD90/RwwJ m 0.0145 0.0197   2   0.0139 1.36 0.0006, 0.0284 -0.75
BXD95/RwwJ m 0.0302 0.0427   2   0.0302 1.41 -0.37
BXD9/TyJ m 0.0986 0.0354   5 0.0158 0.359 0.049, 0.134 1.31
BXH19/TyJ m 0.0259 0.0362   2   0.0256 1.4 0.00024, 0.0515 -0.47
BXH22/KccJ m 0.00347 0.00682   8 0.00241 1.96 -1.03
BXH4/TyJ m 0.000163 0.000196   3 0.000113 1.2 -1.11
BXH6/TyJ m 0.086 0.075   3 0.0433 0.872 5e-05, 0.138 1.0
BXH8/TyJ m 0.00312 0.00441   2   0.00311 1.41 -1.03
BXH9/TyJ m 0.0652 0.00829   4 0.00415 0.127 0.0536, 0.0721 0.49
C3HeB/FeJ m 0.000975 0.00122   2   0.000865 1.25 0.00011, 0.00184 -1.09
C3H/HeJ m 0.018 0.0331   5 0.0148 1.84 -0.67
C57BL/10J m 0.14 0.0226   2   0.016 0.162 0.124, 0.156 2.33
C57BL/6J m 0.0202 0.0394   9 0.0131 1.95 -0.61
C57BLKS/J m 0.104 0.0435   2   0.0307 0.417 0.0735, 0.135 1.45
C57BR/cdJ m 0.0691 0.0444   3 0.0256 0.642 0.0179, 0.0961 0.59
C57L/J m 0.115 0.0198   2   0.014 0.172 0.101, 0.129 1.72
C58/J m 0.0698 0.0701   4 0.0351 1.0 4e-05, 0.142 0.61
CAST/EiJ m 0.0311 0.0257   3 0.0148 0.826 0.00243, 0.052 -0.35
CBA/J m 0.0295 0.0546   7 0.0206 1.85 0.00011, 0.144 -0.39
CE/J m 0.137 0.0634   2   0.0448 0.462 0.0924, 0.182 2.26
CXB11/HiAJ m 0.0588 0.0253   4 0.0126 0.43 0.0255, 0.0801 0.34
CXB1/ByJ m 0.0084 0.0203   6 0.0083 2.42 -0.9
CXB8/HiAJ m 0.0872 0.0209   2   0.0147 0.239 0.0725, 0.102 1.03
CXB9/HiAJ m 0.166 0.0764   2   0.054 0.46 0.112, 0.22 2.97
DBA/1J m 0.00021 0.000141   2   0.0001 0.673 0.00011, 0.00031 -1.11
DBA/2J m 0.0231 0.0369   5 0.0165 1.6 -0.54
DDY/JclSidSeyFrkJ m 0.0337 0.0462   2   0.0327 1.37 0.00107, 0.0664 -0.28
FVB/NJ m 0.0647 0.0705   6 0.0288 1.09 0.48
I/LnJ m 0.104 0.0814   5 0.0364 0.779 0.00039, 0.177 1.45
ILS/IbgTejJ m 0.0647 0.0256   4 0.0128 0.395 0.0325, 0.0936 0.48
KK/HlJ m 0.0623 0.014   2   0.0099 0.225 0.0524, 0.0722 0.42
LG/J m 0.077 0.00983   4 0.00491 0.128 0.0649, 0.0887 0.78
LP/J m 0.0313 0.054   3 0.0312 1.72 -0.34
MA/MyJ m 0.0234 0.0404   3 0.0233 1.73 3e-05, 0.07 -0.54
MOLF/EiJ m 0.00556 0.00756   2   0.00534 1.36 0.00021, 0.0109 -0.97
MRL/MpJ m 0.15 0.0403   2   0.0285 0.268 0.122, 0.179 2.58
NOD/ShiLtJ m 0.13 0.0427   5 0.0191 0.329 0.0705, 0.178 2.09
NON/ShiLtJ m 0.0573 0.00297   2   0.0021 0.0518 0.0552, 0.0594 0.3
NOR/LtJ m 0.0751 0.0395   2   0.0279 0.527 0.0471, 0.103 0.74
NZB/BlNJ m 0.0497 0.0666   2   0.0471 1.34 0.00259, 0.0968 0.11
NZW/LacJ m 0.0611 0.0734   2   0.0519 1.2 0.00921, 0.113 0.39
P/J m 0.0144 0.0126   2   0.00893 0.879 0.00544, 0.0233 -0.76
PL/J m 0.021 0.0296   2   0.021 1.41 7e-05, 0.042 -0.59
PWD/PhJ m 0.00915 0.0   1   0.0 0.0 0.00915, 0.00915 -0.89
RIIIS/J m 0.0398 0.0139   5 0.00622 0.35 0.0256, 0.0628 -0.13
SEA/GnJ m 0.0161 0.00346   2   0.00245 0.215 0.0137, 0.0186 -0.72
SJL/J m 0.00757 0.0136   5 0.0061 1.8 0.00017, 0.0319 -0.93
SM/J m 0.0551 0.051   3 0.0295 0.926 0.00298, 0.105 0.24
SWR/J m 6.5e-05 4.94975e-05   2   3.5e-05 0.761 3e-05, 0.0001 -1.11
ZALENDE/EiJ m 0.00046 0.0   1   0.0 0.0 0.00046, 0.00046 -1.1


  LEAST SQUARES MEANS (MODEL-ADJUSTED)
Strain Sex Mean SEM UpperCL LowerCL
129S1/SvImJ m 0.0 0.0298 0.0588 -0.0587
129X1/SvJ m 0.0 0.0189 0.0372 -0.0372
A/J m 0.0404 0.0189 0.0776 0.0033
AKR/J m 0.0247 0.0298 0.0834 -0.0341
AXB15/PgnJ m 0.0003 0.0298 0.0591 -0.0584
AXB19a/PgnJ m 0.0 0.0298 0.0588 -0.0587
AXB1/PgnJ m 0.0398 0.0243 0.0877 -0.0082
AXB23/PgnJ m 0.0001 0.0298 0.0588 -0.0587
AXB8/PgnJ m 0.009 0.0243 0.057 -0.0389
BALB/cByJ m 0.0735 0.0172 0.1074 0.0396
BALB/cJ m 0.0972 0.0159 0.1286 0.0658
BPL/1J m 0.0772 0.0189 0.1144 0.0401
BTBR T+ Itpr3tf/J m 0.0224 0.0211 0.064 -0.0191
BUB/BnJ m 0.0666 0.0298 0.1253 0.0078
BXA13/PgnJ m 0.134 0.0298 0.1927 0.0753
BXA14/PgnJ m 0.0167 0.0189 0.0539 -0.0204
BXA16/PgnJ m 0.0001 0.0211 0.0416 -0.0415
BXA25/PgnJ m 0.0 0.0211 0.0416 -0.0415
BXA7/PgnJ m 0.0781 0.0243 0.126 0.0301
BXD100/RwwJ m 0.0162 0.0243 0.0642 -0.0317
BXD1/TyJ m 0.0306 0.0243 0.0785 -0.0174
BXD24/TyJ m 0.0382 0.0211 0.0797 -0.0034
BXD29/Ty m 0.0001 0.0211 0.0416 -0.0414
BXD31/TyJ m 0.0459 0.0172 0.0799 0.012
BXD32/TyJ m 0.0517 0.0298 0.1105 -0.007
BXD39/TyJ m 0.0001 0.0189 0.0373 -0.037
BXD40/TyJ m 0.0516 0.0211 0.0932 0.0101
BXD42/TyJ m 0.0792 0.0127 0.1042 0.0541
BXD48a/RwwJ m 0.1115 0.0298 0.1702 0.0528
BXD48/RwwJ m 0.0356 0.0189 0.0728 -0.0016
BXD51/RwwJ m 0.0711 0.0243 0.1191 0.0231
BXD60/RwwJ m 0.0316 0.0159 0.063 0.0002
BXD62/RwwJ m 0.0518 0.0243 0.0998 0.0038
BXD65/RwwJ m 0.0477 0.0172 0.0817 0.0138
BXD66/RwwJ m 0.01 0.0243 0.058 -0.038
BXD68/RwwJ m 0.0238 0.0189 0.061 -0.0133
BXD75/RwwJ m 0.0674 0.0172 0.1014 0.0335
BXD77/RwwJ m 0.0203 0.0243 0.0683 -0.0276
BXD84/RwwJ m 0.0208 0.0211 0.0623 -0.0208
BXD90/RwwJ m 0.0145 0.0298 0.0732 -0.0442
BXD95/RwwJ m 0.0302 0.0298 0.0889 -0.0285
BXD9/TyJ m 0.0986 0.0189 0.1357 0.0614
BXH19/TyJ m 0.0259 0.0298 0.0846 -0.0329
BXH22/KccJ m 0.0035 0.0149 0.0328 -0.0259
BXH4/TyJ m 0.0002 0.0243 0.0481 -0.0478
BXH6/TyJ m 0.086 0.0243 0.134 0.038
BXH8/TyJ m 0.0031 0.0298 0.0619 -0.0556
BXH9/TyJ m 0.0652 0.0211 0.1068 0.0237
C3HeB/FeJ m 0.001 0.0298 0.0597 -0.0578
C3H/HeJ m 0.018 0.0189 0.0551 -0.0192
C57BL/10J m 0.14 0.0298 0.1987 0.0813
C57BL/6J m 0.0202 0.0141 0.0479 -0.0075
C57BLKS/J m 0.1042 0.0298 0.163 0.0455
C57BR/cdJ m 0.0691 0.0243 0.1171 0.0211
C57L/J m 0.115 0.0298 0.1737 0.0563
C58/J m 0.0698 0.0211 0.1114 0.0283
CAST/EiJ m 0.0311 0.0243 0.079 -0.0169
CBA/J m 0.0295 0.0159 0.0609 -0.0019
CE/J m 0.1372 0.0298 0.1959 0.0785
CXB11/HiAJ m 0.0588 0.0211 0.1003 0.0173
CXB1/ByJ m 0.0084 0.0172 0.0423 -0.0255
CXB8/HiAJ m 0.0873 0.0298 0.146 0.0285
CXB9/HiAJ m 0.166 0.0298 0.2247 0.1073
DBA/1J m 0.0002 0.0298 0.059 -0.0585
DBA/2J m 0.0231 0.0189 0.0602 -0.0141
DDY/JclSidSeyFrkJ m 0.0337 0.0298 0.0925 -0.025
FVB/NJ m 0.0647 0.0172 0.0987 0.0308
I/LnJ m 0.1045 0.0189 0.1417 0.0673
ILS/IbgTejJ m 0.0647 0.0211 0.1062 0.0232
KK/HlJ m 0.0623 0.0298 0.121 0.0036
LG/J m 0.077 0.0211 0.1185 0.0354
LP/J m 0.0313 0.0243 0.0793 -0.0167
MA/MyJ m 0.0234 0.0243 0.0713 -0.0246
MOLF/EiJ m 0.0056 0.0298 0.0643 -0.0532
MRL/MpJ m 0.1505 0.0298 0.2092 0.0918
NOD/ShiLtJ m 0.1299 0.0189 0.1671 0.0927
NON/ShiLtJ m 0.0573 0.0298 0.116 -0.0014
NOR/LtJ m 0.075 0.0298 0.1338 0.0163
NZB/BlNJ m 0.0497 0.0298 0.1084 -0.0091
NZW/LacJ m 0.0611 0.0298 0.1199 0.0024
P/J m 0.0144 0.0298 0.0731 -0.0444
PL/J m 0.021 0.0298 0.0798 -0.0377
RIIIS/J m 0.0398 0.0189 0.0769 0.0026
SEA/GnJ m 0.0162 0.0298 0.0749 -0.0426
SJL/J m 0.0076 0.0189 0.0447 -0.0296
SM/J m 0.0551 0.0243 0.1031 0.0072
SWR/J m 0.0001 0.0298 0.0588 -0.0587




  GWAS USING LINEAR MIXED MODELS