Phenotype measure:   Chesler3   immobile_OFT

ID, description, units MPD:43560   immobile_OFT   time spent immobile during first minute, 10 min test   [s]
Data set, strains Chesler3   CC pre w/par   196 strains     sex: both     age: 7-15wks
Procedure open field test
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  STRAIN COMPARISON PLOT
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Chesler3 - time spent immobile during first minute, 10 min test



  MEASURE SUMMARY
Measure Summary FemaleMale
Number of strains tested187 strains196 strains
Mean of the strain means0.981   s 1.81   s
Median of the strain means0   s 0.134   s
SD of the strain means± 3.03 ± 5.31
Coefficient of variation (CV)3.09 2.93
Min–max range of strain means0   –   27.9   s 0   –   48.8   s
Mean sample size per strain1.3   mice 1.3   mice


  STRAIN MEANS (UNADJUSTED)
Strain Sex Mean SD N mice SEM CV Min, Max Z score
129S1/SvImJ f 5.48 0.0   1   0.0 0.0 5.48, 5.48 1.49
PreCCF0003/Ornl m 0.2 0.0   1   0.0 0.0 0.2, 0.2 -0.3
PreCCF0013/Ornl f 0.4 0.0   1   0.0 0.0 0.4, 0.4 -0.19
PreCCF0015/Ornl f 5.81 0.0   1   0.0 0.0 5.81, 5.81 1.59
PreCCF0015/Ornl m 18.6 0.0   1   0.0 0.0 18.6, 18.6 3.16
PreCCF0020/Ornl m 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.34
PreCCF0027/Ornl f 2.67 0.0   1   0.0 0.0 2.67, 2.67 0.56
PreCCF0041/Ornl f 0.0 0.0   2   0.0 0.0 -0.32
PreCCF0041/Ornl m 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.34
PreCCF0063/Ornl f 6.74 6.04   2   4.27 0.896 2.47, 11.0 1.9
PreCCF0070/Ornl f 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.32
PreCCF0070/Ornl m 0.07 0.0   1   0.0 0.0 0.07, 0.07 -0.33
PreCCF0072/Ornl f 0.235 0.332   2   0.235 1.41 -0.25
PreCCF0072/Ornl m 1.2 0.099   2   0.07 0.0825 1.13, 1.27 -0.11
PreCCF0083/Ornl f 0.0 0.0   2   0.0 0.0 -0.32
PreCCF0088/Ornl m 0.27 0.0   1   0.0 0.0 0.27, 0.27 -0.29
PreCCF0091/Ornl f 0.0 0.0   2   0.0 0.0 -0.32
PreCCF0091/Ornl m 0.465 0.658   2   0.465 1.41 -0.25
PreCCF0092/Ornl f 5.81 0.0   1   0.0 0.0 5.81, 5.81 1.59
PreCCF0092/Ornl m 26.8 0.0   1   0.0 0.0 26.8, 26.8 4.7
PreCCF0094/Ornl f 0.27 0.0   1   0.0 0.0 0.27, 0.27 -0.23
PreCCF0094/Ornl m 1.13 0.0   1   0.0 0.0 1.13, 1.13 -0.13
PreCCF0113/Ornl f 1.33 0.0   1   0.0 0.0 1.33, 1.33 0.12
PreCCF0125/Ornl f 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.32
PreCCF0125/Ornl m 1.13 1.79   3 1.03 1.58 0.0667, 3.2 -0.13
PreCCF0134/Ornl f 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.32
PreCCF0134/Ornl m 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.34
PreCCF0147/Ornl f 0.13 0.0   1   0.0 0.0 0.13, 0.13 -0.28
PreCCF0147/Ornl m 0.07 0.0   1   0.0 0.0 0.07, 0.07 -0.33
PreCCF0166/Ornl f 0.5 0.707   2   0.5 1.41 -0.16
PreCCF0166/Ornl m 0.27 0.0   1   0.0 0.0 0.27, 0.27 -0.29
PreCCF0167/Ornl m 0.33 0.0   1   0.0 0.0 0.33, 0.33 -0.28
PreCCF0176/Ornl f 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.32
PreCCF0181/Ornl f 0.0 0.0   2   0.0 0.0 -0.32
PreCCF0181/Ornl m 4.04 4.11   2   2.9 1.02 1.13, 6.94 0.42
PreCCF0189/Ornl m 1.47 0.0   1   0.0 0.0 1.47, 1.47 -0.06
PreCCF0190/Ornl f 0.0 0.0   3 0.0 0.0 -0.32
PreCCF0190/Ornl m 0.0 0.0   4 0.0 0.0 -0.34
PreCCF0205/Ornl f 0.13 0.0   1   0.0 0.0 0.13, 0.13 -0.28
PreCCF0205/Ornl m 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.34
PreCCF0210/Ornl f 0.13 0.0   1   0.0 0.0 0.13, 0.13 -0.28
PreCCF0210/Ornl m 1.0 0.0   1   0.0 0.0 1.0, 1.0 -0.15
PreCCF0220/Ornl f 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.32
PreCCF0220/Ornl m 0.635 0.615   2   0.435 0.969 0.2, 1.07 -0.22
PreCCF0232/Ornl f 0.265 0.375   2   0.265 1.41 -0.24
PreCCF0232/Ornl m 26.3 37.2   2   26.3 1.41 4.61
PreCCF0237/Ornl m 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.34
PreCCF0238/Ornl m 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.34
PreCCF0289/Ornl f 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.32
PreCCF0289/Ornl m 0.365 0.516   2   0.365 1.41 -0.27
PreCCF0305/Ornl f 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.32
PreCCF0353/Ornl m 1.67 0.0   1   0.0 0.0 1.67, 1.67 -0.03
PreCCF0363/Ornl f 9.27 0.0   1   0.0 0.0 9.27, 9.27 2.74
PreCCF0363/Ornl m 0.2 0.0   1   0.0 0.0 0.2, 0.2 -0.3
PreCCF0377/Ornl f 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.32
PreCCF0377/Ornl m 7.87 0.0   1   0.0 0.0 7.87, 7.87 1.14
PreCCF0380/Ornl f 0.065 0.0919   2   0.065 1.41 -0.3
PreCCF0380/Ornl m 0.13 0.0   1   0.0 0.0 0.13, 0.13 -0.32
PreCCF0381/Ornl f 0.065 0.0919   2   0.065 1.41 -0.3
PreCCF0381/Ornl m 0.135 0.191   2   0.135 1.41 -0.32
PreCCF0388/Ornl f 1.53 0.0   1   0.0 0.0 1.53, 1.53 0.18
PreCCF0388/Ornl m 0.133 0.0   1   0.0 0.0 0.133, 0.133 -0.32
PreCCF0391/Ornl m 0.035 0.0495   2   0.035 1.41 -0.33
PreCCF0409/Ornl f 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.32
PreCCF0409/Ornl m 4.2 0.0   1   0.0 0.0 4.2, 4.2 0.45
PreCCF0449/Ornl m 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.34
PreCCF0457/Ornl m 0.07 0.0   1   0.0 0.0 0.07, 0.07 -0.33
PreCCF0477/Ornl f 7.41 10.5   2   7.41 1.41 2.12
PreCCF0477/Ornl m 0.37 0.141   2   0.1 0.382 0.27, 0.47 -0.27
PreCCF0481/Ornl f 0.1 0.141   2   0.1 1.41 -0.29
PreCCF0481/Ornl m 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.34
PreCCF0489/Ornl m 1.67 2.36   2   1.67 1.41 -0.03
PreCCF0491/Ornl f 0.2 0.0   1   0.0 0.0 0.2, 0.2 -0.26
PreCCF0491/Ornl m 1.4 0.0   1   0.0 0.0 1.4, 1.4 -0.08
PreCCF0495/Ornl f 0.27 0.0   1   0.0 0.0 0.27, 0.27 -0.23
PreCCF0495/Ornl m 0.8 0.0   1   0.0 0.0 0.8, 0.8 -0.19
PreCCF0509/Ornl m 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.34
PreCCF0538/Ornl f 2.0 0.0   1   0.0 0.0 2.0, 2.0 0.34
PreCCF0538/Ornl m 2.04 2.13   2   1.5 1.05 0.53, 3.54 0.04
PreCCF0555/Ornl f 0.177 0.306   3 0.177 1.73 -0.27
PreCCF0555/Ornl m 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.34
PreCCF0559/Ornl f 0.13 0.0   1   0.0 0.0 0.13, 0.13 -0.28
PreCCF0559/Ornl m 0.233 0.236   2   0.167 1.01 0.0667, 0.4 -0.3
PreCCF0600/Ornl f 0.334 0.0   1   0.0 0.0 0.334, 0.334 -0.21
PreCCF0611/Ornl f 0.33 0.0   1   0.0 0.0 0.33, 0.33 -0.22
PreCCF0611/Ornl m 10.8 0.0   1   0.0 0.0 10.8, 10.8 1.69
PreCCF0618/Ornl f 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.32
PreCCF0618/Ornl m 0.0 0.0   2   0.0 0.0 -0.34
PreCCF0638/Ornl f 0.67 0.0   1   0.0 0.0 0.67, 0.67 -0.1
PreCCF0652/Ornl f 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.32
PreCCF0652/Ornl m 0.0667 0.0   1   0.0 0.0 0.0667, 0.0667 -0.33
PreCCF0667/Ornl f 0.0 0.0   2   0.0 0.0 -0.32
PreCCF0667/Ornl m 0.035 0.0495   2   0.035 1.41 -0.33
PreCCF0672/Ornl f 0.93 0.0   1   0.0 0.0 0.93, 0.93 -0.02
PreCCF0672/Ornl m 0.4 0.0   1   0.0 0.0 0.4, 0.4 -0.27
PreCCF0680/Ornl f 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.32
PreCCF0680/Ornl m 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.34
PreCCF0690/Ornl m 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.34
PreCCF0691/Ornl f 0.165 0.233   2   0.165 1.41 -0.27
PreCCF0691/Ornl m 1.8 2.36   2   1.67 1.31 0.13, 3.47 0.0
PreCCF0692/Ornl f 0.0 0.0   2   0.0 0.0 -0.32
PreCCF0692/Ornl m 0.533 0.924   3 0.533 1.73 -0.24
PreCCF0695/Ornl m 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.34
PreCCF0699/Ornl f 0.267 0.0   1   0.0 0.0 0.267, 0.267 -0.24
PreCCF0699/Ornl m 1.33 0.0   1   0.0 0.0 1.33, 1.33 -0.09
PreCCF0717/Ornl f 12.9 0.0   1   0.0 0.0 12.9, 12.9 3.94
PreCCF0717/Ornl m 0.33 0.0   1   0.0 0.0 0.33, 0.33 -0.28
PreCCF0718/Ornl f 0.07 0.0   1   0.0 0.0 0.07, 0.07 -0.3
PreCCF0718/Ornl m 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.34
PreCCF0739/Ornl f 0.0 0.0   3 0.0 0.0 -0.32
PreCCF0739/Ornl m 0.0 0.0   3 0.0 0.0 -0.34
PreCCF0749/Ornl f 4.04 1.65   2   1.17 0.41 2.87, 5.21 1.01
PreCCF0749/Ornl m 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.34
PreCCF0754/Ornl m 3.0 0.0   1   0.0 0.0 3.0, 3.0 0.22
PreCCF0773/Ornl f 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.32
PreCCF0779/Ornl m 0.07 0.0   1   0.0 0.0 0.07, 0.07 -0.33
PreCCF0780/Ornl m 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.34
PreCCF0792/Ornl f 0.53 0.0   1   0.0 0.0 0.53, 0.53 -0.15
PreCCF0792/Ornl m 1.33 0.0   1   0.0 0.0 1.33, 1.33 -0.09
PreCCF0799/Ornl f 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.32
PreCCF0799/Ornl m 4.07 0.0   1   0.0 0.0 4.07, 4.07 0.43
PreCCF0801/Ornl m 8.41 0.0   1   0.0 0.0 8.41, 8.41 1.24
PreCCF0820/Ornl f 0.0 0.0   3 0.0 0.0 -0.32
PreCCF0820/Ornl m 0.0 0.0   2   0.0 0.0 -0.34
PreCCF0821/Ornl f 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.32
PreCCF0821/Ornl m 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.34
PreCCF0827/Ornl f 0.4 0.566   2   0.4 1.41 -0.19
PreCCF0827/Ornl m 4.33 0.0   1   0.0 0.0 4.33, 4.33 0.47
PreCCF0829/Ornl f 27.9 0.0   1   0.0 0.0 27.9, 27.9 8.89
PreCCF0829/Ornl m 0.87 0.0   1   0.0 0.0 0.87, 0.87 -0.18
PreCCF0863/Ornl f 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.32
PreCCF0863/Ornl m 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.34
PreCCF0866/Ornl f 1.07 0.0   1   0.0 0.0 1.07, 1.07 0.03
PreCCF0873/Ornl m 48.8 0.0   1   0.0 0.0 48.8, 48.8 8.85
PreCCF0878/Ornl f 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.32
PreCCF0878/Ornl m 1.73 0.94   2   0.665 0.542 1.07, 2.4 -0.02
PreCCF0881/Ornl f 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.32
PreCCF0881/Ornl m 0.47 0.0   1   0.0 0.0 0.47, 0.47 -0.25
PreCCF0888/Ornl m 2.94 0.0   1   0.0 0.0 2.94, 2.94 0.21
PreCCF0896/Ornl f 1.0 1.04   2   0.735 1.03 0.27, 1.74 0.01
PreCCF0896/Ornl m 0.165 0.0495   2   0.035 0.3 0.13, 0.2 -0.31
PreCCF0900/Ornl f 2.94 0.0   1   0.0 0.0 2.94, 2.94 0.65
PreCCF0912/Ornl m 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.34
PreCCF0914/Ornl f 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.32
PreCCF0916/Ornl f 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.32
PreCCF0923/Ornl f 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.32
PreCCF0923/Ornl m 0.4 0.0   1   0.0 0.0 0.4, 0.4 -0.27
PreCCF0929/Ornl f 0.27 0.0   1   0.0 0.0 0.27, 0.27 -0.23
PreCCF0940/Ornl f 1.4 1.98   2   1.4 1.41 0.14
PreCCF0940/Ornl m 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.34
PreCCF0941/Ornl f 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.32
PreCCF0941/Ornl m 0.0 0.0   2   0.0 0.0 -0.34
PreCCF0942/Ornl f 2.0 0.0   1   0.0 0.0 2.0, 2.0 0.34
PreCCF0993/Ornl m 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.34
PreCCF1009/Ornl f 1.56 1.72   3 0.992 1.1 0.19
PreCCF1009/Ornl m 4.81 6.24   2   4.41 1.3 0.4, 9.22 0.56
PreCCF1018/Ornl f 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.32
PreCCF1018/Ornl m 21.4 0.0   1   0.0 0.0 21.4, 21.4 3.69
PreCCF1023/Ornl f 0.07 0.0   1   0.0 0.0 0.07, 0.07 -0.3
PreCCF1082/Ornl f 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.32
PreCCF1112/Ornl f 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.32
PreCCF1112/Ornl m 0.27 0.0   1   0.0 0.0 0.27, 0.27 -0.29
PreCCF1114/Ornl f 9.6 9.01   3 5.2 0.938 2.85
PreCCF1114/Ornl m 5.37 10.3   4 5.13 1.91 0.67
PreCCF1119/Ornl f 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.32
PreCCF1119/Ornl m 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.34
PreCCF1122/Ornl f 0.53 0.0   1   0.0 0.0 0.53, 0.53 -0.15
PreCCF1136/Ornl f 0.6 0.0   1   0.0 0.0 0.6, 0.6 -0.13
PreCCF1136/Ornl m 0.6 0.0   1   0.0 0.0 0.6, 0.6 -0.23
PreCCF1141/Ornl f 0.33 0.0   1   0.0 0.0 0.33, 0.33 -0.22
PreCCF1141/Ornl m 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.34
PreCCF1200/Ornl f 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.32
PreCCF1200/Ornl m 0.0 0.0   2   0.0 0.0 -0.34
PreCCF1207/Ornl f 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.32
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PreCCF5513/Ornl m 2.13 0.0   1   0.0 0.0 2.13, 2.13 0.06
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PreCCF5515/Ornl m 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.34
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PreCCF5549/Ornl m 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.34
PreCCF5612/Ornl f 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.32
PreCCF5612/Ornl m 0.47 0.0   1   0.0 0.0 0.47, 0.47 -0.25
WSB/EiJ f 0.735 1.04   2   0.735 1.41 -0.08




GWAS analysis not available: Strain panel must be either Inbred, HMDP, BXD, BXH, CKB, or AXBBXA