Phenotype measure:   Chesler2   kidneyL_wt

ID, description, units MPD:43496   kidneyL_wt   kidney (left) weight   [g]
Data set, strains Chesler2   CC diallel w/par   40 strains     sex: both     age: 7-15wks
Procedure organ weights
Ontology mappings

  STRAIN COMPARISON PLOT
Dimensions Width:   px    Height:   px
Download Plot   
Visualization Options

Chesler2 - kidney (left) weight



  8-WAY DIALLEL CROSS VIEW
Female animals
129S ♂ A ♂ B6 ♂ CAST ♂ NOD ♂ NZO ♂ PWK ♂ WSB ♂
129S ♀ 0.165 0.229 0.231 0.182 0.267 0.165 0.164
A ♀ 0.182 0.242 0.219 0.251 0.238 0.185
B6 ♀ 0.176 0.206 0.198 0.157 0.221 0.195 0.169
CAST ♀ 0.124 0.207
NOD ♀ 0.235 0.195 0.213 0.171 0.184
NZO ♀ 0.229 0.258 0.234 0.317 0.288 0.756
PWK ♀ 0.181 0.198 0.195 0.132
WSB ♀ 0.166 0.147

Male animals
129S ♂ A ♂ B6 ♂ CAST ♂ NOD ♂ NZO ♂ PWK ♂ WSB ♂
129S ♀ 0.210 0.290 0.258 0.291 0.274 0.240
A ♀ 0.208 0.254 0.314 0.292 0.311 0.272
B6 ♀ 0.236 0.212 0.241 0.239 0.187 0.219
CAST ♀ 0.205 0.147 0.123 0.241
NOD ♀ 0.241 0.304 0.356 0.362 0.223 0.420 0.266 0.292
NZO ♀ 0.314 0.398 0.534 0.409 0.346
PWK ♀ 0.255 0.211 0.255 0.152
WSB ♀ 0.210

Cell coloring is based on strain mean Z-scores.     High-end         Mid         Low-end           Mouse over the cells to see additional info.


  MEASURE SUMMARY
Measure Summary FemaleMale
Number of strains tested39 strains40 strains
Mean of the strain means0.217   g 0.270   g
Median of the strain means0.198   g 0.255   g
SD of the strain means± 0.0977 ± 0.0799
Coefficient of variation (CV)0.450 0.296
Min–max range of strain means0.124   –   0.756   g 0.123   –   0.534   g
Mean sample size per strain3.1   mice 2.4   mice


  ANOVA, Q-Q NORMALITY ASSESSMENT
ANOVA summary      
FactorDFSum of squaresMean sum of squaresF valuep value (Pr>F)
sex 1 0.151 0.151 211.4701 < 0.0001
strain 19 0.4937 0.026 36.3964 < 0.0001
sex:strain 19 0.0828 0.0044 6.1043 < 0.0001
Residuals 106 0.0757 0.0007


Q-Q normality assessment based on residuals

  


  STRAIN MEANS (UNADJUSTED)
Strain Sex Mean SD N mice SEM CV Min, Max Z score
129S1/SvImJ f 0.165 0.024   5 0.0107 0.145 0.148, 0.206 -0.53
129S1/SvImJ m 0.21 0.0297   5 0.0133 0.141 0.178, 0.243 -0.75
129SAF1 f 0.229 0.00919   2   0.0065 0.0401 0.223, 0.236 0.12
129SAF1 m 0.29 0.0151   5 0.00676 0.0521 0.27, 0.311 0.25
129SB6F1 f 0.231 0.0   1   0.0 0.0 0.231, 0.231 0.14
129SB6F1 m 0.258 0.0497   3 0.0287 0.193 0.227, 0.315 -0.15
129SNODF1 f 0.182 0.0   1   0.0 0.0 0.182, 0.182 -0.36
129SNZOF1 f 0.267 0.0   1   0.0 0.0 0.267, 0.267 0.51
129SNZOF1 m 0.291 0.0408   3 0.0236 0.14 0.256, 0.336 0.26
129SPWKF1 f 0.165 0.0355   3 0.0205 0.216 0.138, 0.205 -0.53
129SPWKF1 m 0.274 0.122   2   0.0865 0.446 0.188, 0.361 0.05
129SWSBF1 f 0.164 0.0232   4 0.0116 0.142 0.139, 0.189 -0.54
129SWSBF1 m 0.24 0.00424   2   0.003 0.0177 0.237, 0.243 -0.38
AB6F1 f 0.242 0.0346   2   0.0245 0.143 0.218, 0.267 0.25
AB6F1 m 0.254 0.0   1   0.0 0.0 0.254, 0.254 -0.2
ACASTF1 f 0.219 0.0163   4 0.00815 0.0745 0.205, 0.24 0.02
ACASTF1 m 0.314 0.0209   4 0.0105 0.0666 0.295, 0.341 0.55
A/J f 0.182 0.0151   3 0.00874 0.0831 0.17, 0.199 -0.36
A/J m 0.208 0.00707   2   0.005 0.034 0.203, 0.213 -0.78
ANODF1 f 0.251 0.0   1   0.0 0.0 0.251, 0.251 0.35
ANODF1 m 0.292 0.00141   2   0.001 0.00484 0.291, 0.293 0.27
ANZOF1 f 0.238 0.0197   11 0.00594 0.0826 0.215, 0.274 0.21
ANZOF1 m 0.311 0.0   1   0.0 0.0 0.311, 0.311 0.51
APWKF1 f 0.185 0.0389   2   0.0275 0.21 0.158, 0.213 -0.33
APWKF1 m 0.272 0.0197   3 0.0113 0.0722 0.25, 0.287 0.02
B6129SF1/J f 0.176 0.0   1   0.0 0.0 0.176, 0.176 -0.42
B6AF1/J m 0.236 0.024   2   0.017 0.102 0.219, 0.253 -0.43
B6CASTF1 f 0.198 0.0159   4 0.00793 0.0803 0.187, 0.221 -0.2
B6CASTF1 m 0.241 0.0283   2   0.02 0.117 0.221, 0.261 -0.37
B6NODF1 f 0.157 0.0   1   0.0 0.0 0.157, 0.157 -0.62
B6NZOF1 f 0.221 0.0113   3 0.00651 0.051 0.214, 0.234 0.04
B6NZOF1 m 0.239 0.0   1   0.0 0.0 0.239, 0.239 -0.39
B6PWKF1 f 0.195 0.0   1   0.0 0.0 0.195, 0.195 -0.23
B6PWKF1 m 0.187 0.00737   3 0.00426 0.0395 0.181, 0.195 -1.04
B6WSBF1 f 0.169 0.0157   8 0.00555 0.093 0.144, 0.192 -0.49
B6WSBF1 m 0.219 0.0166   3 0.00956 0.0755 0.202, 0.235 -0.64
C57BL/6J f 0.206 0.019   5 0.00851 0.0924 0.183, 0.225 -0.11
C57BL/6J m 0.212 0.00566   2   0.004 0.0267 0.208, 0.216 -0.73
CAST129SF1 m 0.205 0.0216   4 0.0108 0.105 0.185, 0.235 -0.82
CASTB6F1 m 0.147 0.0   1   0.0 0.0 0.147, 0.147 -1.54
CAST/EiJ f 0.124 0.00778   2   0.0055 0.0625 0.119, 0.13 -0.95
CAST/EiJ m 0.123 0.00924   3 0.00533 0.0753 0.112, 0.128 -1.84
CASTNODF1 f 0.207 0.022   3 0.0127 0.106 0.193, 0.232 -0.1
CASTNODF1 m 0.241 0.0147   5 0.00658 0.0611 0.222, 0.262 -0.37
NOD129SF1 m 0.241 0.0   1   0.0 0.0 0.241, 0.241 -0.37
NODAF1 m 0.304 0.0219   2   0.0155 0.072 0.289, 0.32 0.42
NODB6F1 f 0.235 0.0   1   0.0 0.0 0.235, 0.235 0.18
NODB6F1 m 0.356 0.0255   2   0.018 0.0715 0.338, 0.374 1.07
NODCASTF1 f 0.195 0.0129   7 0.00486 0.0659 0.175, 0.211 -0.23
NODCASTF1 m 0.362 0.017   2   0.012 0.0469 0.35, 0.374 1.15
NODNZOF1 m 0.42 0.0   1   0.0 0.0 0.42, 0.42 1.87
NODPWKF1 f 0.171 0.00778   2   0.0055 0.0454 0.166, 0.177 -0.47
NODPWKF1 m 0.266 0.0324   8 0.0114 0.121 0.216, 0.308 -0.05
NOD/ShiLtJ f 0.213 0.000707   2   0.0005 0.00331 0.213, 0.214 -0.04
NOD/ShiLtJ m 0.223 0.0   1   0.0 0.0 0.223, 0.223 -0.59
NODWSBF1 f 0.184 0.0136   5 0.00607 0.0736 0.172, 0.206 -0.34
NODWSBF1 m 0.292 0.00707   2   0.005 0.0242 0.287, 0.297 0.27
NZO129SF1 f 0.229 0.0197   3 0.0113 0.086 0.214, 0.251 0.12
NZO129SF1 m 0.314 0.0615   2   0.0435 0.196 0.27, 0.357 0.55
NZOAF1 f 0.258 0.0247   3 0.0143 0.0956 0.232, 0.281 0.42
NZOB6F1 f 0.234 0.019   8 0.00671 0.0812 0.213, 0.269 0.17
NZOB6F1 m 0.398 0.0   1   0.0 0.0 0.398, 0.398 1.6
NZO/HlLtJ f 0.288 0.0428   4 0.0214 0.149 0.233, 0.337 0.72
NZO/HlLtJ m 0.409 0.0726   3 0.0419 0.177 0.345, 0.488 1.74
NZONODF1 f 0.317 0.0184   4 0.0092 0.0581 0.301, 0.343 1.02
NZONODF1 m 0.534 0.0665   2   0.047 0.124 0.487, 0.581 3.3
NZOWSBF1 f 0.756 0.0   1   0.0 0.0 0.756, 0.756 5.52
NZOWSBF1 m 0.346 0.0   1   0.0 0.0 0.346, 0.346 0.95
PWK129SF1 f 0.181 0.0155   4 0.00773 0.0852 0.164, 0.195 -0.37
PWKAF1 f 0.198 0.0   1   0.0 0.0 0.198, 0.198 -0.2
PWKAF1 m 0.255 0.0   1   0.0 0.0 0.255, 0.255 -0.19
PWKB6F1 f 0.195 0.0   1   0.0 0.0 0.195, 0.195 -0.23
PWKB6F1 m 0.211 0.0127   2   0.009 0.0603 0.202, 0.22 -0.74
PWKNODF1 m 0.255 0.0354   2   0.025 0.139 0.23, 0.28 -0.19
PWK/PhJ f 0.132 0.00841   5 0.00376 0.0636 0.123, 0.145 -0.87
PWK/PhJ m 0.152 0.0151   5 0.00674 0.0994 0.132, 0.168 -1.48
WSB129SF1 f 0.166 0.00988   4 0.00494 0.0597 0.158, 0.18 -0.52
WSB129SF1 m 0.21 0.011   5 0.00494 0.0526 0.192, 0.222 -0.75
WSB/EiJ f 0.147 0.0207   5 0.00927 0.141 0.128, 0.179 -0.72


  LEAST SQUARES MEANS (MODEL-ADJUSTED)
Strain Sex Mean SEM UpperCL LowerCL
129S1/SvImJ f 0.1654 0.0119 0.1891 0.1417
129S1/SvImJ m 0.2102 0.0119 0.2339 0.1865
129SAF1 f 0.2295 0.0189 0.267 0.192
129SAF1 m 0.29 0.0119 0.3137 0.2663
129SPWKF1 f 0.1647 0.0154 0.1952 0.1341
129SPWKF1 m 0.2745 0.0189 0.312 0.237
129SWSBF1 f 0.1637 0.0134 0.1902 0.1373
129SWSBF1 m 0.24 0.0189 0.2775 0.2025
ACASTF1 f 0.2187 0.0134 0.2452 0.1923
ACASTF1 m 0.3137 0.0134 0.3402 0.2873
A/J f 0.182 0.0154 0.2126 0.1514
A/J m 0.208 0.0189 0.2455 0.1705
APWKF1 f 0.1855 0.0189 0.223 0.148
APWKF1 m 0.2723 0.0154 0.3029 0.2418
B6CASTF1 f 0.1975 0.0134 0.224 0.171
B6CASTF1 m 0.241 0.0189 0.2785 0.2035
B6WSBF1 f 0.1689 0.0094 0.1876 0.1501
B6WSBF1 m 0.2193 0.0154 0.2499 0.1888
C57BL/6J f 0.2058 0.0119 0.2295 0.1821
C57BL/6J m 0.212 0.0189 0.2495 0.1745
CAST/EiJ f 0.1245 0.0189 0.162 0.087
CAST/EiJ m 0.1227 0.0154 0.1532 0.0921
CASTNODF1 f 0.2067 0.0154 0.2372 0.1761
CASTNODF1 m 0.2408 0.0119 0.2645 0.2171
NODCASTF1 f 0.1953 0.0101 0.2153 0.1753
NODCASTF1 m 0.362 0.0189 0.3995 0.3245
NODPWKF1 f 0.1715 0.0189 0.209 0.134
NODPWKF1 m 0.2664 0.0094 0.2851 0.2476
NODWSBF1 f 0.1844 0.0119 0.2081 0.1607
NODWSBF1 m 0.292 0.0189 0.3295 0.2545
NZO129SF1 f 0.2287 0.0154 0.2592 0.1981
NZO129SF1 m 0.3135 0.0189 0.351 0.276
NZO/HlLtJ f 0.2885 0.0134 0.315 0.262
NZO/HlLtJ m 0.4093 0.0154 0.4399 0.3788
NZONODF1 f 0.3167 0.0134 0.3432 0.2903
NZONODF1 m 0.534 0.0189 0.5715 0.4965
PWK/PhJ f 0.1324 0.0119 0.1561 0.1087
PWK/PhJ m 0.1516 0.0119 0.1753 0.1279
WSB129SF1 f 0.1655 0.0134 0.192 0.139
WSB129SF1 m 0.21 0.0119 0.2337 0.1863


  LEAST SQUARES MEANS (MODEL-ADJUSTED), SEXES COMBINED
Strain Sex Mean SEM UpperCL LowerCL
129S1/SvImJ both 0.1878 0.0084 0.2046 0.171
129SAF1 both 0.2597 0.0112 0.2819 0.2376
129SPWKF1 both 0.2196 0.0122 0.2438 0.1954
129SWSBF1 both 0.2019 0.0116 0.2248 0.1789
ACASTF1 both 0.2662 0.0094 0.285 0.2475
A/J both 0.195 0.0122 0.2192 0.1708
APWKF1 both 0.2289 0.0122 0.2531 0.2047
B6CASTF1 both 0.2192 0.0116 0.2422 0.1963
B6WSBF1 both 0.1941 0.009 0.212 0.1762
C57BL/6J both 0.2089 0.0112 0.2311 0.1867
CAST/EiJ both 0.1236 0.0122 0.1478 0.0994
CASTNODF1 both 0.2237 0.0098 0.2431 0.2044
NODCASTF1 both 0.2786 0.0107 0.2999 0.2574
NODPWKF1 both 0.2189 0.0106 0.2399 0.198
NODWSBF1 both 0.2382 0.0112 0.2604 0.216
NZO129SF1 both 0.2711 0.0122 0.2953 0.2469
NZO/HlLtJ both 0.3489 0.0102 0.3691 0.3287
NZONODF1 both 0.4254 0.0116 0.4483 0.4024
PWK/PhJ both 0.142 0.0084 0.1588 0.1252
WSB129SF1 both 0.1877 0.009 0.2055 0.17




GWAS analysis not available: Strain panel must be either Inbred, HMDP, BXD, BXH, CXB, or AXB/BXA