Phenotype measure:   Jentsch1   acq_latency_reward


  STRAIN COMPARISON PLOT
Dimensions Width:   px    Height:   px
Download Plot   
Visualization Options

Jentsch1 - average latency to retrieve food reward, acquisition phase



  MEASURE SUMMARY
Measure Summary Male
Number of strains tested53 strains
Mean of the strain means0.330   s
Median of the strain means0.325   s
SD of the strain means± 0.0648
Coefficient of variation (CV)0.197
Min–max range of strain means0.233   –   0.500   s
Mean sample size per strain3.3   mice


  ANOVA, Q-Q NORMALITY ASSESSMENT
ANOVA summary      
FactorDFSum of squaresMean sum of squaresF valuep value (Pr>F)
strain 52 0.6575 0.0126 2.2579 0.0001
Residuals 123 0.6888 0.0056


Q-Q normality assessment based on residuals

  


  STRAIN MEANS (UNADJUSTED)
Strain Sex Mean SD N mice SEM CV Min, Max Z score
BXD100/RwwJ m 0.36 0.0894   5 0.04 0.248 0.3, 0.5 0.47
BXD102/RwwJ m 0.34 0.0548   5 0.0245 0.161 0.3, 0.4 0.16
BXD12/TyJ m 0.45 0.0707   2   0.05 0.157 0.4, 0.5 1.86
BXD13/TyJ m 0.25 0.0707   2   0.05 0.283 0.2, 0.3 -1.23
BXD14/TyJ m 0.4 0.141   2   0.1 0.354 0.3, 0.5 1.08
BXD16/TyJ m 0.25 0.0707   2   0.05 0.283 0.2, 0.3 -1.23
BXD18/TyJ m 0.3 0.141   2   0.1 0.471 0.2, 0.4 -0.46
BXD1/TyJ m 0.44 0.0548   5 0.0245 0.124 0.4, 0.5 1.7
BXD22/TyJ m 0.25 0.0707   2   0.05 0.283 0.2, 0.3 -1.23
BXD24/TyJ m 0.46 0.114   5 0.051 0.248 0.3, 0.6 2.01
BXD25/TyJ m 0.4 0.141   2   0.1 0.354 0.3, 0.5 1.08
BXD29-Tlr4lps-2J/J m 0.35 0.0707   2   0.05 0.202 0.3, 0.4 0.31
BXD2/TyJ m 0.5 0.141   2   0.1 0.283 0.4, 0.6 2.63
BXD31/TyJ m 0.35 0.1   4 0.05 0.286 0.3, 0.5 0.31
BXD32/TyJ m 0.35 0.0577   4 0.0289 0.165 0.3, 0.4 0.31
BXD34/TyJ m 0.267 0.0516   6 0.0211 0.194 0.2, 0.3 -0.97
BXD36/TyJ m 0.45 0.0707   2   0.05 0.157 0.4, 0.5 1.86
BXD38/TyJ m 0.25 0.0577   4 0.0289 0.231 0.2, 0.3 -1.23
BXD39/TyJ m 0.433 0.0577   3 0.0333 0.133 0.4, 0.5 1.59
BXD40/TyJ m 0.38 0.0837   5 0.0374 0.22 0.3, 0.5 0.78
BXD42/TyJ m 0.24 0.0548   5 0.0245 0.228 0.2, 0.3 -1.38
BXD43/RwwJ m 0.3 0.0   4 0.0 0.0 0.3, 0.3 -0.46
BXD44/RwwJ m 0.35 0.212   2   0.15 0.606 0.2, 0.5 0.31
BXD45/RwwJ m 0.3 0.141   2   0.1 0.471 0.2, 0.4 -0.46
BXD48a/RwwJ m 0.325 0.0957   4 0.0479 0.295 0.2, 0.4 -0.07
BXD49/RwwJ m 0.3 0.0   2   0.0 0.0 0.3, 0.3 -0.46
BXD50/RwwJ m 0.375 0.05   4 0.025 0.133 0.3, 0.4 0.7
BXD51/RwwJ m 0.233 0.0577   3 0.0333 0.247 0.2, 0.3 -1.49
BXD55/RwwJ m 0.267 0.0577   3 0.0333 0.217 0.2, 0.3 -0.97
BXD56/RwwJ m 0.3 0.0   2   0.0 0.0 0.3, 0.3 -0.46
BXD60/RwwJ m 0.25 0.0707   2   0.05 0.283 0.2, 0.3 -1.23
BXD61/RwwJ m 0.3 0.0   3 0.0 0.0 0.3, 0.3 -0.46
BXD62/RwwJ m 0.32 0.0447   5 0.02 0.14 0.3, 0.4 -0.15
BXD65/RwwJ m 0.3 0.0   2   0.0 0.0 0.3, 0.3 -0.46
BXD66/RwwJ m 0.3 0.0   2   0.0 0.0 0.3, 0.3 -0.46
BXD68/RwwJ m 0.3 0.0894   6 0.0365 0.298 0.2, 0.4 -0.46
BXD70/RwwJ m 0.333 0.0577   3 0.0333 0.173 0.3, 0.4 0.05
BXD71/RwwJ m 0.3 0.0816   4 0.0408 0.272 0.2, 0.4 -0.46
BXD73a/RwwJ m 0.34 0.0548   5 0.0245 0.161 0.3, 0.4 0.16
BXD73b/RwwJ m 0.325 0.05   4 0.025 0.154 0.3, 0.4 -0.07
BXD73/RwwJ m 0.4 0.141   2   0.1 0.354 0.3, 0.5 1.08
BXD75/RwwJ m 0.34 0.0548   5 0.0245 0.161 0.3, 0.4 0.16
BXD77/RwwJ m 0.3 0.0   2   0.0 0.0 0.3, 0.3 -0.46
BXD83/RwwJ m 0.375 0.05   4 0.025 0.133 0.3, 0.4 0.7
BXD84/RwwJ m 0.333 0.0577   3 0.0333 0.173 0.3, 0.4 0.05
BXD85/RwwJ m 0.3 0.0707   5 0.0316 0.236 0.2, 0.4 -0.46
BXD86/RwwJ m 0.375 0.0957   4 0.0479 0.255 0.3, 0.5 0.7
BXD89/RwwJ m 0.333 0.115   3 0.0667 0.346 0.2, 0.4 0.05
BXD90/RwwJ m 0.4 0.0   2   0.0 0.0 0.4, 0.4 1.08
BXD95/RwwJ m 0.25 0.0707   2   0.05 0.283 0.2, 0.3 -1.23
BXD98/RwwJ m 0.25 0.0707   2   0.05 0.283 0.2, 0.3 -1.23
C57BL/6J m 0.28 0.0447   5 0.02 0.16 0.2, 0.3 -0.77
DBA/2J m 0.25 0.0577   4 0.0289 0.231 0.2, 0.3 -1.23


  LEAST SQUARES MEANS (MODEL-ADJUSTED)
Strain Sex Mean SEM UpperCL LowerCL
BXD100/RwwJ m 0.36 0.0335 0.4262 0.2938
BXD102/RwwJ m 0.34 0.0335 0.4062 0.2738
BXD12/TyJ m 0.45 0.0529 0.5547 0.3453
BXD13/TyJ m 0.25 0.0529 0.3547 0.1453
BXD14/TyJ m 0.4 0.0529 0.5047 0.2953
BXD16/TyJ m 0.25 0.0529 0.3547 0.1453
BXD18/TyJ m 0.3 0.0529 0.4047 0.1953
BXD1/TyJ m 0.44 0.0335 0.5062 0.3738
BXD22/TyJ m 0.25 0.0529 0.3547 0.1453
BXD24/TyJ m 0.46 0.0335 0.5262 0.3938
BXD25/TyJ m 0.4 0.0529 0.5047 0.2953
BXD29-Tlr4lps-2J/J m 0.35 0.0529 0.4547 0.2453
BXD2/TyJ m 0.5 0.0529 0.6047 0.3953
BXD31/TyJ m 0.35 0.0374 0.4241 0.2759
BXD32/TyJ m 0.35 0.0374 0.4241 0.2759
BXD34/TyJ m 0.2667 0.0306 0.3271 0.2062
BXD36/TyJ m 0.45 0.0529 0.5547 0.3453
BXD38/TyJ m 0.25 0.0374 0.3241 0.1759
BXD39/TyJ m 0.4333 0.0432 0.5189 0.3478
BXD40/TyJ m 0.38 0.0335 0.4462 0.3138
BXD42/TyJ m 0.24 0.0335 0.3062 0.1738
BXD43/RwwJ m 0.3 0.0374 0.3741 0.2259
BXD44/RwwJ m 0.35 0.0529 0.4547 0.2453
BXD45/RwwJ m 0.3 0.0529 0.4047 0.1953
BXD48a/RwwJ m 0.325 0.0374 0.3991 0.2509
BXD49/RwwJ m 0.3 0.0529 0.4047 0.1953
BXD50/RwwJ m 0.375 0.0374 0.4491 0.3009
BXD51/RwwJ m 0.2333 0.0432 0.3189 0.1478
BXD55/RwwJ m 0.2667 0.0432 0.3522 0.1811
BXD56/RwwJ m 0.3 0.0529 0.4047 0.1953
BXD60/RwwJ m 0.25 0.0529 0.3547 0.1453
BXD61/RwwJ m 0.3 0.0432 0.3855 0.2145
BXD62/RwwJ m 0.32 0.0335 0.3862 0.2538
BXD65/RwwJ m 0.3 0.0529 0.4047 0.1953
BXD66/RwwJ m 0.3 0.0529 0.4047 0.1953
BXD68/RwwJ m 0.3 0.0306 0.3605 0.2395
BXD70/RwwJ m 0.3333 0.0432 0.4189 0.2478
BXD71/RwwJ m 0.3 0.0374 0.3741 0.2259
BXD73a/RwwJ m 0.34 0.0335 0.4062 0.2738
BXD73b/RwwJ m 0.325 0.0374 0.3991 0.2509
BXD73/RwwJ m 0.4 0.0529 0.5047 0.2953
BXD75/RwwJ m 0.34 0.0335 0.4062 0.2738
BXD77/RwwJ m 0.3 0.0529 0.4047 0.1953
BXD83/RwwJ m 0.375 0.0374 0.4491 0.3009
BXD84/RwwJ m 0.3333 0.0432 0.4189 0.2478
BXD85/RwwJ m 0.3 0.0335 0.3662 0.2338
BXD86/RwwJ m 0.375 0.0374 0.4491 0.3009
BXD89/RwwJ m 0.3333 0.0432 0.4189 0.2478
BXD90/RwwJ m 0.4 0.0529 0.5047 0.2953
BXD95/RwwJ m 0.25 0.0529 0.3547 0.1453
BXD98/RwwJ m 0.25 0.0529 0.3547 0.1453
C57BL/6J m 0.28 0.0335 0.3462 0.2138
DBA/2J m 0.25 0.0374 0.3241 0.1759




  GWAS USING LINEAR MIXED MODELS