Project measure / variable:   Berndt2   expiratory_saline

ID, description, units MPD:35121   expiratory_saline   expiratory phase   [s]  saline  
methacholine study
Data set, strains Berndt2   inbred   29 strains     sex: both     age: 9-12wks
Procedure plethysmography
Ontology mappings

  •   Or, add this measure to your collection.
       
  •     no folder
  •     put it in new folder  

  STRAIN COMPARISON PLOT
Dimensions Width:   px    Height:   px
Download Plot   
Visualization Options

Berndt2 - expiratory phase saline



  MEASURE SUMMARY
Measure Summary FemaleMale
Number of strains tested29 strains29 strains
Mean of the strain means0.211   s 0.200   s
Median of the strain means0.214   s 0.206   s
SD of the strain means± 0.0380 ± 0.0353
Coefficient of variation (CV)0.180 0.176
Min–max range of strain means0.125   –   0.274   s 0.138   –   0.262   s
Mean sample size per strain8.0   mice 8.1   mice


  ANOVA, Q-Q NORMALITY ASSESSMENT
ANOVA summary      
FactorDFSum of squaresMean sum of squaresF valuep value (Pr>F)
sex 1 0.0158 0.0158 6.2159 0.0131
strain 28 0.513 0.0183 7.1952 < 0.0001
sex:strain 28 0.0907 0.0032 1.2721 0.1634
Residuals 412 1.0492 0.0025


Q-Q normality assessment based on residuals

  


  STRAIN MEANS (UNADJUSTED)
  
Select table page:
Strain Sex Mean SD N mice SEM CV Min, Max Z score
129S1/SvImJ f 0.239 0.0806   8 0.0285 0.338 0.148, 0.381 0.73
129S1/SvImJ m 0.206 0.0556   8 0.0197 0.27 0.151, 0.296 0.17
A/J f 0.19 0.0323   8 0.0114 0.17 0.141, 0.235 -0.56
A/J m 0.174 0.0245   8 0.00866 0.141 0.143, 0.205 -0.74
AKR/J f 0.219 0.0873   8 0.0308 0.398 0.0999, 0.392 0.21
AKR/J m 0.262 0.0686   8 0.0242 0.262 0.168, 0.37 1.76
BALB/cByJ f 0.2 0.0356   8 0.0126 0.179 0.148, 0.253 -0.29
BALB/cByJ m 0.17 0.032   8 0.0113 0.188 0.125, 0.212 -0.85
BALB/cJ f 0.173 0.0542   10 0.0171 0.313 0.0829, 0.266 -1.0
BALB/cJ m 0.157 0.0411   10 0.013 0.263 0.106, 0.254 -1.22
BTBR T+ Itpr3tf/J f 0.164 0.0476   8 0.0168 0.29 0.111, 0.263 -1.24
BTBR T+ Itpr3tf/J m 0.138 0.0262   8 0.00927 0.19 0.109, 0.183 -1.76
BUB/BnJ f 0.23 0.075   7 0.0283 0.326 0.126, 0.331 0.5
BUB/BnJ m 0.232 0.0514   8 0.0182 0.221 0.156, 0.304 0.91
C3H/HeJ f 0.242 0.0612   8 0.0216 0.253 0.157, 0.342 0.81
C3H/HeJ m 0.262 0.0529   8 0.0187 0.202 0.193, 0.324 1.76
C57BL/10J f 0.185 0.0277   8 0.00979 0.15 0.12, 0.204 -0.69
C57BL/10J m 0.151 0.0137   7 0.00518 0.091 0.128, 0.171 -1.39
C57BL/6J f 0.195 0.0447   7 0.0169 0.229 0.128, 0.257 -0.43
C57BL/6J m 0.191 0.049   13 0.0136 0.257 0.129, 0.283 -0.25
C57BLKS/J f 0.198 0.0605   11 0.0183 0.306 0.124, 0.317 -0.35
C57BLKS/J m 0.212 0.0469   8 0.0166 0.221 0.15, 0.299 0.34
C57BR/cdJ f 0.179 0.0627   6 0.0256 0.351 0.102, 0.27 -0.85
C57BR/cdJ m 0.156 0.0261   8 0.00923 0.167 0.122, 0.201 -1.25
C57L/J f 0.202 0.0456   8 0.0161 0.226 0.137, 0.258 -0.24
C57L/J m 0.221 0.0391   8 0.0138 0.177 0.158, 0.285 0.6
CBA/J f 0.237 0.0434   8 0.0153 0.183 0.175, 0.293 0.68
CBA/J m 0.22 0.0494   8 0.0175 0.225 0.145, 0.282 0.57
CE/J f 0.166 0.0675   8 0.0238 0.406 0.122, 0.328 -1.19
CE/J m 0.178 0.0334   9 0.0111 0.188 0.138, 0.23 -0.62
DBA/1J f 0.214 0.0562   10 0.0178 0.263 0.123, 0.317 0.07
DBA/1J m 0.218 0.06   8 0.0212 0.276 0.142, 0.301 0.51
DBA/2J f 0.181 0.0392   8 0.0139 0.216 0.139, 0.239 -0.79
DBA/2J m 0.17 0.0246   10 0.00777 0.144 0.129, 0.203 -0.85
FVB/NJ f 0.226 0.0549   8 0.0194 0.243 0.143, 0.3 0.39
FVB/NJ m 0.197 0.0403   7 0.0152 0.204 0.151, 0.268 -0.08
I/LnJ f 0.247 0.0419   7 0.0158 0.169 0.182, 0.289 0.94
I/LnJ m 0.207 0.0322   5 0.0144 0.155 0.169, 0.243 0.2
KK/HlJ f 0.238 0.0531   8 0.0188 0.224 0.152, 0.323 0.71
KK/HlJ m 0.225 0.0344   6 0.014 0.153 0.159, 0.251 0.71
LP/J f 0.267 0.0888   8 0.0314 0.333 0.17, 0.457 1.47
LP/J m 0.213 0.0515   8 0.0182 0.242 0.143, 0.282 0.37
NOD/ShiLtJ f 0.274 0.0659   8 0.0233 0.24 0.171, 0.376 1.65
NOD/ShiLtJ m 0.239 0.0556   8 0.0197 0.233 0.149, 0.322 1.11
NON/ShiLtJ f 0.274 0.0975   8 0.0345 0.356 0.183, 0.423 1.65
NON/ShiLtJ m 0.173 0.0288   8 0.0102 0.166 0.124, 0.217 -0.76
NZW/LacJ f 0.254 0.0539   8 0.0191 0.212 0.179, 0.327 1.13
NZW/LacJ m 0.251 0.0369   8 0.0131 0.147 0.204, 0.301 1.45
PL/J f 0.232 0.0745   8 0.0263 0.321 0.118, 0.362 0.55
PL/J m 0.24 0.0643   8 0.0227 0.267 0.103, 0.304 1.14
RIIIS/J f 0.144 0.0327   8 0.0116 0.228 0.102, 0.183 -1.77
RIIIS/J m 0.162 0.0348   8 0.0123 0.215 0.14, 0.243 -1.08
SJL/J f 0.195 0.025   8 0.00883 0.128 0.163, 0.244 -0.43
SJL/J m 0.188 0.0273   8 0.00965 0.145 0.156, 0.22 -0.34
SM/J f 0.125 0.0131   8 0.00464 0.105 0.107, 0.142 -2.27
SM/J m 0.156 0.0264   8 0.00932 0.169 0.109, 0.196 -1.25
SWR/J f 0.234 0.0403   8 0.0142 0.172 0.171, 0.279 0.6
SWR/J m 0.229 0.0315   9 0.0105 0.137 0.195, 0.284 0.82


  LEAST SQUARES MEANS (MODEL-ADJUSTED)
Strain Sex Mean SEM UpperCL LowerCL
129S1/SvImJ f 0.2386 0.0178 0.2737 0.2036
129S1/SvImJ m 0.2061 0.0178 0.2412 0.1711
A/J f 0.1895 0.0178 0.2246 0.1544
A/J m 0.1739 0.0178 0.2089 0.1388
AKR/J f 0.219 0.0178 0.2541 0.1839
AKR/J m 0.2617 0.0178 0.2968 0.2267
BALB/cByJ f 0.1995 0.0178 0.2346 0.1644
BALB/cByJ m 0.1702 0.0178 0.2053 0.1352
BALB/cJ f 0.1731 0.016 0.2045 0.1417
BALB/cJ m 0.1566 0.016 0.188 0.1252
BTBR T+ Itpr3tf/J f 0.1641 0.0178 0.1992 0.1291
BTBR T+ Itpr3tf/J m 0.1382 0.0178 0.1733 0.1032
BUB/BnJ f 0.23 0.0191 0.2675 0.1925
BUB/BnJ m 0.2321 0.0178 0.2672 0.1971
C3H/HeJ f 0.242 0.0178 0.2771 0.2069
C3H/HeJ m 0.262 0.0178 0.2971 0.2269
C57BL/10J f 0.1847 0.0178 0.2198 0.1497
C57BL/10J m 0.1507 0.0191 0.1882 0.1132
C57BL/6J f 0.1954 0.0191 0.2329 0.1579
C57BL/6J m 0.1908 0.014 0.2184 0.1633
C57BLKS/J f 0.1975 0.0152 0.2275 0.1676
C57BLKS/J m 0.2121 0.0178 0.2472 0.1771
C57BR/cdJ f 0.1788 0.0206 0.2193 0.1383
C57BR/cdJ m 0.1561 0.0178 0.1912 0.1211
C57L/J f 0.2019 0.0178 0.2369 0.1668
C57L/J m 0.2207 0.0178 0.2558 0.1857
CBA/J f 0.2371 0.0178 0.2722 0.2021
CBA/J m 0.2201 0.0178 0.2552 0.1851
CE/J f 0.1661 0.0178 0.2012 0.1311
CE/J m 0.1778 0.0168 0.2108 0.1447
DBA/1J f 0.2138 0.016 0.2452 0.1824
DBA/1J m 0.2176 0.0178 0.2527 0.1826
DBA/2J f 0.1815 0.0178 0.2166 0.1464
DBA/2J m 0.1703 0.016 0.2017 0.1389
FVB/NJ f 0.2256 0.0178 0.2607 0.1906
FVB/NJ m 0.1974 0.0191 0.2349 0.1599
I/LnJ f 0.247 0.0191 0.2845 0.2095
I/LnJ m 0.2074 0.0226 0.2518 0.163
KK/HlJ f 0.2376 0.0178 0.2727 0.2026
KK/HlJ m 0.2252 0.0206 0.2657 0.1847
LP/J f 0.2668 0.0178 0.3018 0.2317
LP/J m 0.2133 0.0178 0.2483 0.1782
NOD/ShiLtJ f 0.2741 0.0178 0.3092 0.2391
NOD/ShiLtJ m 0.2386 0.0178 0.2737 0.2036
NON/ShiLtJ f 0.2735 0.0178 0.3086 0.2384
NON/ShiLtJ m 0.173 0.0178 0.2081 0.1379
NZW/LacJ f 0.2541 0.0178 0.2892 0.2191
NZW/LacJ m 0.2505 0.0178 0.2856 0.2154
PL/J f 0.2317 0.0178 0.2668 0.1967
PL/J m 0.2402 0.0178 0.2753 0.2052
RIIIS/J f 0.1437 0.0178 0.1788 0.1087
RIIIS/J m 0.1621 0.0178 0.1972 0.1271
SJL/J f 0.195 0.0178 0.2301 0.1599
SJL/J m 0.1882 0.0178 0.2233 0.1532
SM/J f 0.1247 0.0178 0.1598 0.0897
SM/J m 0.1564 0.0178 0.1914 0.1213
SWR/J f 0.2341 0.0178 0.2692 0.1991
SWR/J m 0.2292 0.0168 0.2623 0.1962


  LEAST SQUARES MEANS (MODEL-ADJUSTED), SEXES COMBINED
Strain Sex Mean SEM UpperCL LowerCL
129S1/SvImJ both 0.2224 0.0126 0.2472 0.1976
A/J both 0.1817 0.0126 0.2065 0.1569
AKR/J both 0.2404 0.0126 0.2652 0.2156
BALB/cByJ both 0.1849 0.0126 0.2097 0.1601
BALB/cJ both 0.1648 0.0113 0.187 0.1427
BTBR T+ Itpr3tf/J both 0.1512 0.0126 0.176 0.1264
BUB/BnJ both 0.2311 0.0131 0.2567 0.2054
C3H/HeJ both 0.252 0.0126 0.2768 0.2272
C57BL/10J both 0.1677 0.0131 0.1934 0.1421
C57BL/6J both 0.1931 0.0118 0.2164 0.1699
C57BLKS/J both 0.2048 0.0117 0.2279 0.1818
C57BR/cdJ both 0.1675 0.0136 0.1943 0.1407
C57L/J both 0.2113 0.0126 0.2361 0.1865
CBA/J both 0.2286 0.0126 0.2534 0.2038
CE/J both 0.172 0.0123 0.1961 0.1479
DBA/1J both 0.2157 0.012 0.2392 0.1922
DBA/2J both 0.1759 0.012 0.1994 0.1524
FVB/NJ both 0.2115 0.0131 0.2372 0.1859
I/LnJ both 0.2272 0.0148 0.2562 0.1982
KK/HlJ both 0.2314 0.0136 0.2582 0.2046
LP/J both 0.24 0.0126 0.2648 0.2152
NOD/ShiLtJ both 0.2564 0.0126 0.2812 0.2316
NON/ShiLtJ both 0.2233 0.0126 0.248 0.1985
NZW/LacJ both 0.2523 0.0126 0.2771 0.2275
PL/J both 0.236 0.0126 0.2608 0.2112
RIIIS/J both 0.1529 0.0126 0.1777 0.1281
SJL/J both 0.1916 0.0126 0.2164 0.1668
SM/J both 0.1406 0.0126 0.1654 0.1158
SWR/J both 0.2317 0.0123 0.2558 0.2076




  GWAS USING LINEAR MIXED MODELS