Phenotype measure:   Zheng1   Rvolume

ID, description, units MPD:29802   Rvolume   outer ear canal equivalent volume, right ear   [mL]
Data set, strains Zheng1   inbred   56 strains     sex: both     age: 5-68wks
Procedure tympanometry
Ontology mappings

  STRAIN COMPARISON PLOT
Dimensions Width:   px    Height:   px
Download Plot   
Visualization Options

Zheng1 - outer ear canal equivalent volume, right ear



  MEASURE SUMMARY
Measure Summary FemaleMale
Number of strains tested54 strains56 strains
Mean of the strain means0.220   mL 0.222   mL
Median of the strain means0.218   mL 0.220   mL
SD of the strain means± 0.0279 ± 0.0264
Coefficient of variation (CV)0.127 0.119
Min–max range of strain means0.156   –   0.325   mL 0.171   –   0.310   mL
Mean sample size per strain4.1   mice 3.6   mice


  ANOVA, Q-Q NORMALITY ASSESSMENT
ANOVA summary      
FactorDFSum of squaresMean sum of squaresF valuep value (Pr>F)
sex 1 0.0001 0.0001 0.0894 0.7651
strain 48 0.2027 0.0042 6.3799 < 0.0001
sex:strain 48 0.06 0.0013 1.8898 0.0009
Residuals 274 0.1813 0.0007


Q-Q normality assessment based on residuals

  


  STRAIN MEANS (UNADJUSTED)
Strain Sex Mean SD N mice SEM CV Min, Max Z score
129P1/ReJ m 0.219 0.00603   3 0.00348 0.0275 0.213, 0.225 -0.1
129P3/J f 0.257 0.00289   3 0.00167 0.0112 0.255, 0.26 1.33
129P3/J m 0.272 0.0126   3 0.00726 0.0463 0.26, 0.285 1.91
129S1/SvImJ f 0.272 0.0496   6 0.0202 0.183 0.217, 0.347 1.86
129S1/SvImJ m 0.31 0.0353   4 0.0176 0.114 0.28, 0.36 3.35
129T2/SvEmsJ f 0.205 0.00866   5 0.00387 0.0422 0.19, 0.21 -0.54
129T2/SvEmsJ m 0.211 0.00882   5 0.00394 0.0419 0.202, 0.222 -0.4
129X1/SvJ m 0.248 0.0149   4 0.00743 0.06 0.233, 0.265 1.0
A/HeJ f 0.325 0.106   6 0.0433 0.326 0.227, 0.51 3.76
A/HeJ m 0.215 0.01   3 0.00577 0.0465 0.205, 0.225 -0.25
AKR/J f 0.175 0.0113   2   0.008 0.0646 0.167, 0.183 -1.61
AKR/J m 0.177 0.0085   3 0.00491 0.0481 0.167, 0.183 -1.69
A/WySnJ f 0.218 0.0181   6 0.00741 0.0833 0.19, 0.233 -0.07
A/WySnJ m 0.214 0.016   4 0.008 0.0749 0.197, 0.234 -0.29
BALB/cByJ f 0.196 0.00854   4 0.00427 0.0435 0.185, 0.205 -0.86
BALB/cByJ m 0.206 0.00826   4 0.00413 0.0401 0.198, 0.217 -0.59
BALB/cJ f 0.206 0.0184   4 0.0092 0.0894 0.193, 0.233 -0.5
BUB/BnJ f 0.25 0.0306   5 0.0137 0.123 0.21, 0.282 1.08
BUB/BnJ m 0.27 0.0   2   0.0 0.0 0.27, 0.27 1.83
BXA14/PgnJ f 0.17 0.0141   2   0.01 0.0832 0.16, 0.18 -1.79
BXA14/PgnJ m 0.231 0.0262   2   0.0185 0.113 0.213, 0.25 0.35
BXSB/MpJ f 0.2 0.0141   5 0.00632 0.0707 0.19, 0.22 -0.72
BXSB/MpJ m 0.212 0.00671   5 0.003 0.0316 0.205, 0.22 -0.37
C3HeB/FeJ f 0.19 0.0248   5 0.0111 0.13 0.163, 0.23 -1.07
C3HeB/FeJ m 0.203 0.0154   5 0.00688 0.0759 0.18, 0.215 -0.71
C3H/HeJ f 0.203 0.00527   5 0.00236 0.026 0.196, 0.21 -0.61
C3H/HeJ m 0.217 0.0158   6 0.00646 0.0728 0.2, 0.246 -0.18
C3H/HeOuJ m 0.252 0.0707   4 0.0353 0.281 0.193, 0.353 1.15
C3H/HeSnJ f 0.258 0.0293   5 0.0131 0.114 0.235, 0.307 1.36
C3H/HeSnJ m 0.247 0.0247   3 0.0142 0.1 0.23, 0.275 0.96
C57BL/10SnJ m 0.189 0.00755   3 0.00436 0.0399 0.182, 0.197 -1.24
C57BL/6ByJ f 0.228 0.0586   6 0.0239 0.258 0.195, 0.345 0.29
C57BL/6ByJ m 0.227 0.0225   3 0.013 0.0995 0.205, 0.25 0.2
C57BL/6J f 0.223 0.016   6 0.00655 0.0721 0.205, 0.25 0.11
C57BL/6J m 0.224 0.0164   4 0.0082 0.0731 0.21, 0.247 0.09
C57BLKS/J f 0.223 0.00577   3 0.00333 0.0259 0.22, 0.23 0.11
C57BLKS/J m 0.238 0.00577   3 0.00333 0.0242 0.235, 0.245 0.62
C57BR/cdJ f 0.188 0.00764   3 0.00441 0.0406 0.18, 0.195 -1.15
C57BR/cdJ m 0.195 0.035   3 0.0202 0.179 0.17, 0.235 -1.01
C57L/J m 0.222 0.0129   6 0.00527 0.0582 0.2, 0.235 0.01
C58/J f 0.224 0.0125   3 0.00722 0.0557 0.21, 0.233 0.14
C58/J m 0.233 0.0371   3 0.0214 0.159 0.2, 0.273 0.43
CAST/EiJ f 0.229 0.032   5 0.0143 0.14 0.208, 0.285 0.32
CAST/EiJ m 0.224 0.0229   4 0.0115 0.102 0.203, 0.25 0.09
CBA/CaGnLeJ f 0.207 0.00645   4 0.00323 0.0311 0.2, 0.215 -0.46
CBA/CaGnLeJ m 0.21 0.005   3 0.00289 0.0238 0.205, 0.215 -0.44
CBA/CaH-T(14;15)6Ca/J f 0.203 0.0104   3 0.00601 0.0512 0.195, 0.215 -0.61
CBA/CaH-T(14;15)6Ca/J m 0.205 0.0132   3 0.00764 0.0645 0.19, 0.215 -0.63
CBA/CaJ f 0.225 0.0   3 0.0 0.0 0.225, 0.225 0.18
CBA/CaJ m 0.204 0.00874   4 0.00437 0.0429 0.197, 0.216 -0.67
CBA/J f 0.223 0.0317   6 0.013 0.142 0.175, 0.27 0.11
CBA/J m 0.175 0.00866   3 0.005 0.0495 0.17, 0.185 -1.77
CE/J f 0.217 0.0293   3 0.0169 0.135 0.195, 0.25 -0.11
CE/J m 0.244 0.0246   3 0.0142 0.101 0.217, 0.265 0.85
DBA/1J f 0.217 0.015   4 0.0075 0.069 0.205, 0.235 -0.11
DBA/1LacJ f 0.206 0.00919   6 0.00375 0.0446 0.198, 0.22 -0.5
DBA/1LacJ m 0.21 0.0346   3 0.02 0.165 0.19, 0.25 -0.44
DBA/2J f 0.199 0.0121   6 0.00495 0.0608 0.188, 0.215 -0.75
DBA/2J m 0.228 0.0548   3 0.0317 0.24 0.185, 0.29 0.24
EL/SuzSeyFrkJ f 0.217 0.00351   3 0.00203 0.0162 0.213, 0.22 -0.11
EL/SuzSeyFrkJ m 0.18 0.00921   5 0.00412 0.0513 0.17, 0.19 -1.58
FVB/NJ f 0.156 0.0105   5 0.00468 0.0672 0.14, 0.163 -2.29
I/LnJ f 0.245 0.005   3 0.00289 0.0204 0.24, 0.25 0.9
I/LnJ m 0.243 0.00577   3 0.00333 0.0237 0.24, 0.25 0.81
KK/HlJ f 0.238 0.0252   3 0.0145 0.106 0.215, 0.265 0.65
KK/HlJ m 0.232 0.00876   6 0.00357 0.0378 0.22, 0.245 0.39
LP/J f 0.225 0.0132   6 0.0054 0.0588 0.211, 0.245 0.18
LP/J m 0.235 0.0176   5 0.00787 0.0749 0.22, 0.265 0.51
MA/MyJ f 0.24 0.00707   2   0.005 0.0295 0.235, 0.245 0.72
MA/MyJ m 0.254 0.00629   4 0.00315 0.0248 0.245, 0.26 1.22
MOLD/RkJ f 0.242 0.00577   3 0.00333 0.0239 0.235, 0.245 0.79
MOLD/RkJ m 0.203 0.0176   3 0.0101 0.0864 0.185, 0.22 -0.71
MOLF/EiJ f 0.194 0.00603   3 0.00348 0.031 0.188, 0.2 -0.93
MOLF/EiJ m 0.23 0.0328   3 0.0189 0.143 0.2, 0.265 0.32
MRL/MpJ f 0.209 0.0335   6 0.0137 0.16 0.17, 0.27 -0.39
MRL/MpJ m 0.221 0.0106   5 0.00474 0.0479 0.21, 0.235 -0.03
NON/ShiLtJ f 0.227 0.00764   3 0.00441 0.0337 0.22, 0.235 0.25
NON/ShiLtJ m 0.216 0.0148   5 0.00663 0.0685 0.205, 0.235 -0.21
NOR/LtJ f 0.236 0.0131   4 0.00657 0.0557 0.225, 0.255 0.57
NOR/LtJ m 0.255 0.0212   2   0.015 0.0832 0.24, 0.27 1.26
NZB/BlNJ m 0.171 0.00583   5 0.00261 0.0341 0.163, 0.177 -1.92
NZO/HlLtJ f 0.204 0.00754   5 0.00337 0.0369 0.195, 0.215 -0.57
NZO/HlLtJ m 0.22 0.00707   2   0.005 0.0321 0.215, 0.225 -0.06
NZW/LacJ f 0.255 0.0168   4 0.00842 0.066 0.245, 0.28 1.25
PERA/EiJ f 0.207 0.019   4 0.00948 0.0916 0.193, 0.235 -0.46
PERA/EiJ m 0.23 0.0495   2   0.035 0.215 0.195, 0.265 0.32
P/J f 0.258 0.0416   3 0.024 0.161 0.225, 0.305 1.36
P/J m 0.23 0.005   3 0.00289 0.0217 0.225, 0.235 0.32
PL/J f 0.226 0.0174   3 0.01 0.0768 0.213, 0.246 0.22
PL/J m 0.232 0.0119   3 0.00689 0.0515 0.218, 0.24 0.39
RBF/DnJ f 0.203 0.00645   4 0.00323 0.0319 0.195, 0.21 -0.61
RBF/DnJ m 0.202 0.0115   3 0.00666 0.0571 0.193, 0.215 -0.74
RF/J f 0.181 0.0208   3 0.012 0.115 0.157, 0.193 -1.4
RF/J m 0.19 0.0115   3 0.00667 0.0609 0.183, 0.203 -1.2
RIIIS/J f 0.209 0.0259   3 0.015 0.124 0.18, 0.23 -0.39
RIIIS/J m 0.211 0.00907   6 0.0037 0.0429 0.196, 0.22 -0.4
SEA/GnJ f 0.198 0.00577   3 0.00333 0.0291 0.195, 0.205 -0.79
SEA/GnJ m 0.205 0.015   3 0.00866 0.0732 0.19, 0.22 -0.63
SJL/Bm f 0.248 0.0369   3 0.0213 0.148 0.22, 0.29 1.0
SJL/Bm m 0.205 0.0108   3 0.00623 0.0527 0.197, 0.217 -0.63
SJL/J f 0.242 0.0104   5 0.00464 0.0428 0.225, 0.25 0.79
SM/J m 0.194 0.00418   5 0.00187 0.0216 0.19, 0.2 -1.05
SPRET/EiJ f 0.228 0.00289   3 0.00167 0.0126 0.225, 0.23 0.29
SPRET/EiJ m 0.258 0.0106   2   0.0075 0.0412 0.25, 0.265 1.38
SWR/J f 0.203 0.0227   6 0.00928 0.112 0.175, 0.23 -0.61
SWR/J m 0.208 0.0197   6 0.00804 0.0949 0.185, 0.23 -0.52
WSB/EiJ f 0.218 0.0191   3 0.011 0.0874 0.207, 0.24 -0.07
WSB/EiJ m 0.194 0.00231   3 0.00133 0.0119 0.193, 0.197 -1.05
YBR/EiJ f 0.233 0.0161   3 0.00928 0.0689 0.215, 0.245 0.47
YBR/EiJ m 0.262 0.0404   3 0.0233 0.154 0.225, 0.305 1.53


  LEAST SQUARES MEANS (MODEL-ADJUSTED)
Strain Sex Mean SEM UpperCL LowerCL
129P3/J f 0.2567 0.0149 0.2859 0.2274
129P3/J m 0.2717 0.0149 0.3009 0.2424
129S1/SvImJ f 0.2715 0.0105 0.2922 0.2508
129S1/SvImJ m 0.31 0.0129 0.3353 0.2847
129T2/SvEmsJ f 0.205 0.0115 0.2276 0.1824
129T2/SvEmsJ m 0.2106 0.0115 0.2332 0.188
A/HeJ f 0.3253 0.0105 0.346 0.3047
A/HeJ m 0.215 0.0149 0.2442 0.1858
AKR/J f 0.175 0.0182 0.2108 0.1392
AKR/J m 0.1767 0.0149 0.2059 0.1474
A/WySnJ f 0.2177 0.0105 0.2383 0.197
A/WySnJ m 0.2137 0.0129 0.2391 0.1884
BALB/cByJ f 0.1962 0.0129 0.2216 0.1709
BALB/cByJ m 0.2062 0.0129 0.2316 0.1809
BUB/BnJ f 0.2496 0.0115 0.2722 0.227
BUB/BnJ m 0.27 0.0182 0.3058 0.2342
BXA14/PgnJ f 0.17 0.0182 0.2058 0.1342
BXA14/PgnJ m 0.2315 0.0182 0.2673 0.1957
BXSB/MpJ f 0.2 0.0115 0.2226 0.1774
BXSB/MpJ m 0.212 0.0115 0.2346 0.1894
C3HeB/FeJ f 0.1902 0.0115 0.2128 0.1676
C3HeB/FeJ m 0.2028 0.0115 0.2254 0.1802
C3H/HeJ f 0.2026 0.0115 0.2252 0.18
C3H/HeJ m 0.2175 0.0105 0.2382 0.1968
C3H/HeSnJ f 0.2578 0.0115 0.2804 0.2352
C3H/HeSnJ m 0.2467 0.0149 0.2759 0.2174
C57BL/6ByJ f 0.2275 0.0105 0.2482 0.2068
C57BL/6ByJ m 0.2267 0.0149 0.2559 0.1974
C57BL/6J f 0.2225 0.0105 0.2432 0.2018
C57BL/6J m 0.2242 0.0129 0.2496 0.1989
C57BLKS/J f 0.2233 0.0149 0.2526 0.1941
C57BLKS/J m 0.2383 0.0149 0.2676 0.2091
C57BR/cdJ f 0.1883 0.0149 0.2176 0.1591
C57BR/cdJ m 0.195 0.0149 0.2242 0.1658
C58/J f 0.2243 0.0149 0.2536 0.1951
C58/J m 0.2327 0.0149 0.2619 0.2034
CAST/EiJ f 0.2286 0.0115 0.2512 0.206
CAST/EiJ m 0.2243 0.0129 0.2496 0.1989
CBA/CaGnLeJ f 0.2075 0.0129 0.2328 0.1822
CBA/CaGnLeJ m 0.21 0.0149 0.2392 0.1808
CBA/CaH-T(14;15)6Ca/J f 0.2033 0.0149 0.2326 0.1741
CBA/CaH-T(14;15)6Ca/J m 0.205 0.0149 0.2342 0.1758
CBA/CaJ f 0.225 0.0149 0.2542 0.1958
CBA/CaJ m 0.2035 0.0129 0.2288 0.1782
CBA/J f 0.2233 0.0105 0.244 0.2027
CBA/J m 0.175 0.0149 0.2042 0.1458
CE/J f 0.2167 0.0149 0.2459 0.1874
CE/J m 0.244 0.0149 0.2732 0.2148
DBA/1LacJ f 0.206 0.0105 0.2267 0.1853
DBA/1LacJ m 0.21 0.0149 0.2392 0.1808
DBA/2J f 0.1993 0.0105 0.22 0.1787
DBA/2J m 0.2283 0.0149 0.2576 0.1991
EL/SuzSeyFrkJ f 0.2167 0.0149 0.2459 0.1874
EL/SuzSeyFrkJ m 0.1796 0.0115 0.2022 0.157
I/LnJ f 0.245 0.0149 0.2742 0.2158
I/LnJ m 0.2433 0.0149 0.2726 0.2141
KK/HlJ f 0.2383 0.0149 0.2676 0.2091
KK/HlJ m 0.2317 0.0105 0.2523 0.211
LP/J f 0.225 0.0105 0.2457 0.2043
LP/J m 0.235 0.0115 0.2576 0.2124
MA/MyJ f 0.24 0.0182 0.2758 0.2042
MA/MyJ m 0.2537 0.0129 0.2791 0.2284
MOLD/RkJ f 0.2417 0.0149 0.2709 0.2124
MOLD/RkJ m 0.2033 0.0149 0.2326 0.1741
MOLF/EiJ f 0.1943 0.0149 0.2236 0.1651
MOLF/EiJ m 0.23 0.0149 0.2592 0.2008
MRL/MpJ f 0.2092 0.0105 0.2298 0.1885
MRL/MpJ m 0.2214 0.0115 0.244 0.1988
NON/ShiLtJ f 0.2267 0.0149 0.2559 0.1974
NON/ShiLtJ m 0.2164 0.0115 0.239 0.1938
NOR/LtJ f 0.2362 0.0129 0.2616 0.2109
NOR/LtJ m 0.255 0.0182 0.2908 0.2192
NZO/HlLtJ f 0.2044 0.0115 0.227 0.1818
NZO/HlLtJ m 0.22 0.0182 0.2558 0.1842
PERA/EiJ f 0.207 0.0129 0.2323 0.1817
PERA/EiJ m 0.23 0.0182 0.2658 0.1942
P/J f 0.2583 0.0149 0.2876 0.2291
P/J m 0.23 0.0149 0.2592 0.2008
PL/J f 0.2263 0.0149 0.2556 0.1971
PL/J m 0.2317 0.0149 0.2609 0.2024
RBF/DnJ f 0.2025 0.0129 0.2278 0.1772
RBF/DnJ m 0.202 0.0149 0.2312 0.1728
RF/J f 0.181 0.0149 0.2102 0.1518
RF/J m 0.1897 0.0149 0.2189 0.1604
RIIIS/J f 0.209 0.0149 0.2382 0.1798
RIIIS/J m 0.2115 0.0105 0.2322 0.1908
SEA/GnJ f 0.1983 0.0149 0.2276 0.1691
SEA/GnJ m 0.205 0.0149 0.2342 0.1758
SJL/Bm f 0.2483 0.0149 0.2776 0.2191
SJL/Bm m 0.2047 0.0149 0.2339 0.1754
SPRET/EiJ f 0.2283 0.0149 0.2576 0.1991
SPRET/EiJ m 0.2575 0.0182 0.2933 0.2217
SWR/J f 0.2033 0.0105 0.224 0.1827
SWR/J m 0.2075 0.0105 0.2282 0.1868
WSB/EiJ f 0.218 0.0149 0.2472 0.1888
WSB/EiJ m 0.1943 0.0149 0.2236 0.1651
YBR/EiJ f 0.2333 0.0149 0.2626 0.2041
YBR/EiJ m 0.2617 0.0149 0.2909 0.2324


  LEAST SQUARES MEANS (MODEL-ADJUSTED), SEXES COMBINED
Strain Sex Mean SEM UpperCL LowerCL
129P3/J both 0.2642 0.0105 0.2848 0.2435
129S1/SvImJ both 0.2908 0.0083 0.3071 0.2744
129T2/SvEmsJ both 0.2078 0.0081 0.2238 0.1918
A/HeJ both 0.2702 0.0091 0.2881 0.2523
AKR/J both 0.1758 0.0117 0.1989 0.1527
A/WySnJ both 0.2157 0.0083 0.2321 0.1994
BALB/cByJ both 0.2012 0.0091 0.2192 0.1833
BUB/BnJ both 0.2598 0.0108 0.281 0.2386
BXA14/PgnJ both 0.2007 0.0129 0.2261 0.1754
BXSB/MpJ both 0.206 0.0081 0.222 0.19
C3HeB/FeJ both 0.1965 0.0081 0.2125 0.1805
C3H/HeJ both 0.2101 0.0078 0.2254 0.1947
C3H/HeSnJ both 0.2522 0.0094 0.2707 0.2337
C57BL/6ByJ both 0.2271 0.0091 0.245 0.2092
C57BL/6J both 0.2234 0.0083 0.2397 0.207
C57BLKS/J both 0.2308 0.0105 0.2515 0.2102
C57BR/cdJ both 0.1917 0.0105 0.2123 0.171
C58/J both 0.2285 0.0105 0.2492 0.2078
CAST/EiJ both 0.2264 0.0086 0.2434 0.2094
CBA/CaGnLeJ both 0.2087 0.0098 0.2281 0.1894
CBA/CaH-T(14;15)6Ca/J both 0.2042 0.0105 0.2248 0.1835
CBA/CaJ both 0.2142 0.0098 0.2336 0.1949
CBA/J both 0.1992 0.0091 0.2171 0.1813
CE/J both 0.2303 0.0105 0.251 0.2097
DBA/1LacJ both 0.208 0.0091 0.2259 0.1901
DBA/2J both 0.2138 0.0091 0.2317 0.1959
EL/SuzSeyFrkJ both 0.1981 0.0094 0.2166 0.1796
I/LnJ both 0.2442 0.0105 0.2648 0.2235
KK/HlJ both 0.235 0.0091 0.2529 0.2171
LP/J both 0.23 0.0078 0.2453 0.2147
MA/MyJ both 0.2469 0.0111 0.2688 0.2249
MOLD/RkJ both 0.2225 0.0105 0.2432 0.2018
MOLF/EiJ both 0.2122 0.0105 0.2328 0.1915
MRL/MpJ both 0.2153 0.0078 0.2306 0.1999
NON/ShiLtJ both 0.2215 0.0094 0.24 0.203
NOR/LtJ both 0.2456 0.0111 0.2676 0.2237
NZO/HlLtJ both 0.2122 0.0108 0.2334 0.191
PERA/EiJ both 0.2185 0.0111 0.2404 0.1966
P/J both 0.2442 0.0105 0.2648 0.2235
PL/J both 0.229 0.0105 0.2497 0.2083
RBF/DnJ both 0.2022 0.0098 0.2216 0.1829
RF/J both 0.1853 0.0105 0.206 0.1647
RIIIS/J both 0.2102 0.0091 0.2282 0.1923
SEA/GnJ both 0.2017 0.0105 0.2223 0.181
SJL/Bm both 0.2265 0.0105 0.2472 0.2058
SPRET/EiJ both 0.2429 0.0117 0.266 0.2198
SWR/J both 0.2054 0.0074 0.22 0.1908
WSB/EiJ both 0.2062 0.0105 0.2268 0.1855
YBR/EiJ both 0.2475 0.0105 0.2682 0.2268




  GWAS USING LINEAR MIXED MODELS