Project measure / variable:   Auwerx1   subcut_adip_wt_CD

ID, description, units MPD:111410   subcut_adip_wt_CD   subcutaneous adipose tissue weight   [g]  CD  
high-fat diet study
Data set, strains Auwerx1   BXD w/par   54 strains     sex: m     age: 29wks
Procedure organ weights
Ontology mappings

  •   Or, add this measure to your collection.
       
  •     no folder
  •     put it in new folder  

  STRAIN COMPARISON PLOT
Dimensions Width:   px    Height:   px
Download Plot   
Visualization Options

Auwerx1 - subcutaneous adipose tissue weight CD



  MEASURE SUMMARY
Measure Summary Male
Number of strains tested54 strains
Mean of the strain means0.66742   g
Median of the strain means0.5735   g
SD of the strain means± 0.34903
Coefficient of variation (CV)0.523
Min–max range of strain means0.164   –   1.5643   g
Mean sample size per strain4.2   mice


  ANOVA, Q-Q NORMALITY ASSESSMENT
ANOVA summary      
FactorDFSum of squaresMean sum of squaresF valuep value (Pr>F)
strain 53 28.2305 0.5327 6.2343 < 0.0001
Residuals 173 14.7809 0.0854


Q-Q normality assessment based on residuals

  


  STRAIN MEANS (UNADJUSTED)
  
Select table page:
Strain Sex Mean SD N mice SEM CV Min, Max Z score
BXD1 m 0.27984 0.23478   5 0.105 0.839 0.055, 0.6713 -1.11
BXD100 m 1.0894 0.7674   3 0.44306 0.7045 0.5145, 1.9608 1.21
BXD101 m 0.69647 0.21216   4 0.10608 0.3046 0.439, 0.9399 0.08
BXD11 m 0.5653 0.23971   2   0.1695 0.424 0.3958, 0.7348 -0.29
BXD12 m 0.33556 0.08172   5 0.03655 0.2435 0.2717, 0.435 -0.95
BXD16 m 1.1945 0.25838   4 0.12919 0.2163 0.819, 1.406 1.51
BXD2 m 0.9709 0.29263   3 0.16895 0.3014 0.723, 1.2937 0.87
BXD27 m 0.58458 0.21435   5 0.09586 0.3667 0.4477, 0.9547 -0.24
BXD32 m 0.4208 0.13556   5 0.06062 0.3221 0.315, 0.655 -0.71
BXD34 m 0.5078 0.15604   4 0.07802 0.3073 0.3985, 0.7378 -0.46
BXD39 m 1.2246 0.50568   5 0.22615 0.4129 0.3961, 1.672 1.6
BXD40 m 0.164 0.04504   3 0.02601 0.2747 0.112, 0.191 -1.44
BXD43 m 0.2644 0.10328   3 0.05963 0.3906 0.1722, 0.376 -1.15
BXD44 m 1.0371 0.41778   9 0.13926 0.4028 0.4116, 1.8 1.06
BXD45 m 0.26106 0.07681   5 0.03435 0.2942 0.1834, 0.357 -1.16
BXD48 m 0.77782 0.21225   5 0.09492 0.2729 0.521, 1.084 0.32
BXD48a m 0.83458 0.29599   5 0.13237 0.3547 0.4844, 1.1099 0.48
BXD49 m 0.63172 0.15556   4 0.07778 0.2462 0.438, 0.8149 -0.1
BXD50 m 0.612 0.1547   4 0.07735 0.2528 0.402, 0.765 -0.16
BXD51 m 0.40123 0.11663   3 0.06734 0.2907 0.2904, 0.5229 -0.76
BXD53 m 0.3194 0.20643   5 0.09232 0.6463 0.168, 0.669 -1.0
BXD55 m 0.33078 0.13097   5 0.05857 0.3959 0.131, 0.4729 -0.96
BXD56 m 0.29927 0.05447   3 0.03145 0.182 0.2504, 0.358 -1.05
BXD6 m 0.5084 0.18159   5 0.08121 0.3572 0.29, 0.769 -0.46
BXD60 m 1.1732 0.31264   4 0.15632 0.2665 0.908, 1.597 1.45
BXD61 m 0.47443 0.124   3 0.07159 0.2614 0.3908, 0.6169 -0.55
BXD62 m 0.32808 0.14545   4 0.07272 0.4433 0.1531, 0.4718 -0.97
BXD63 m 0.54643 0.19276   3 0.11129 0.3528 0.4003, 0.7649 -0.35
BXD64 m 0.59797 0.18198   4 0.09099 0.3043 0.451, 0.8632 -0.2
BXD65 m 1.4174 0.11194   4 0.05597 0.079 1.3318, 1.569 2.15
BXD65a m 0.8454 0.13164   5 0.05887 0.1557 0.724, 1.041 0.51
BXD65b m 1.4034 0.1995   4 0.09975 0.1422 1.2476, 1.6706 2.11
BXD66 m 1.5643 0.56462   5 0.25251 0.361 0.902, 2.4221 2.57
BXD67 m 0.82 0.48302   5 0.21601 0.5891 0.4, 1.594 0.44
BXD68 m 0.871 0.50984   3 0.29435 0.5853 0.283, 1.19 0.58
BXD69 m 1.2598 0.10351   5 0.04629 0.0822 1.1638, 1.404 1.7
BXD70 m 0.65933 0.669   4 0.3345 1.0147 0.2725, 1.6583 -0.02
BXD71 m 0.88635 0.2953   4 0.14765 0.3332 0.4917, 1.2074 0.63
BXD73 m 0.3377 0.30034   4 0.15017 0.8894 0.0698, 0.7683 -0.94
BXD73b m 1.146 0.58013   5 0.25944 0.5062 0.5483, 1.798 1.37
BXD75 m 0.55766 0.23266   5 0.10405 0.4172 0.2978, 0.9037 -0.31
BXD77 m 0.42 0.22677   5 0.10141 0.5399 0.186, 0.79 -0.71
BXD79 m 0.688 0.155   2   0.1096 0.2253 0.5784, 0.7976 0.06
BXD8 m 0.29087 0.0918   4 0.0459 0.3156 0.1964, 0.4168 -1.08
BXD81 m 0.5817 0.36346   4 0.18173 0.6248 0.1915, 1.0357 -0.25
BXD83 m 0.288 0.04382   3 0.0253 0.1522 0.2486, 0.3352 -1.09
BXD84 m 0.5154 0.29927   3 0.17279 0.5807 0.17, 0.6975 -0.44
BXD85 m 1.044 0.19762   5 0.08838 0.1893 0.8173, 1.2607 1.08
BXD87 m 0.26072 0.0667   5 0.02983 0.2558 0.1819, 0.3233 -1.17
BXD89 m 0.4366 0.24026   4 0.12013 0.5503 0.1352, 0.7232 -0.66
BXD90 m 0.52542 0.27406   4 0.13703 0.5216 0.263, 0.9043 -0.41
BXD95 m 0.52825 0.24182   4 0.12091 0.4578 0.166, 0.658 -0.4
BXD98 m 0.77775 0.2737   4 0.13685 0.3519 0.37, 0.954 0.32
BXD99 m 0.4838 0.16656   5 0.07449 0.3443 0.2766, 0.685 -0.53


  LEAST SQUARES MEANS (MODEL-ADJUSTED)
Strain Sex Mean SEM UpperCL LowerCL
BXD1 m 0.27984 0.130720039 0.537851466 0.021828534
BXD100 m 1.0893666667 0.1687588446 1.422458037 0.7562752963
BXD101 m 0.696475 0.1461494466 0.9849405885 0.4080094115
BXD11 m 0.5653 0.2066865295 0.9732519476 0.1573480524
BXD12 m 0.33556 0.130720039 0.593571466 0.077548534
BXD16 m 1.1945 0.1461494466 1.4829655885 0.9060344115
BXD2 m 0.9709 0.1687588446 1.3039913704 0.6378086296
BXD27 m 0.58458 0.130720039 0.842591466 0.326568534
BXD32 m 0.4208 0.130720039 0.678811466 0.162788534
BXD34 m 0.5078 0.1461494466 0.7962655885 0.2193344115
BXD39 m 1.22462 0.130720039 1.482631466 0.966608534
BXD40 m 0.164 0.1687588446 0.4970913704 -0.1690913704
BXD43 m 0.2644 0.1687588446 0.5974913704 -0.0686913704
BXD44 m 1.0371 0.0974329644 1.2294103923 0.8447896077
BXD45 m 0.26106 0.130720039 0.519071466 0.003048534
BXD48 m 0.77782 0.130720039 1.035831466 0.519808534
BXD48a m 0.83458 0.130720039 1.092591466 0.576568534
BXD49 m 0.631725 0.1461494466 0.9201905885 0.3432594115
BXD50 m 0.612 0.1461494466 0.9004655885 0.3235344115
BXD51 m 0.4012333333 0.1687588446 0.7343247037 0.068141963
BXD53 m 0.3194 0.130720039 0.577411466 0.061388534
BXD55 m 0.33078 0.130720039 0.588791466 0.072768534
BXD56 m 0.2992666667 0.1687588446 0.632358037 -0.0338247037
BXD6 m 0.5084 0.130720039 0.766411466 0.250388534
BXD60 m 1.17325 0.1461494466 1.4617155885 0.8847844115
BXD61 m 0.4744333333 0.1687588446 0.8075247037 0.141341963
BXD62 m 0.328075 0.1461494466 0.6165405885 0.0396094115
BXD63 m 0.5464333333 0.1687588446 0.8795247037 0.213341963
BXD64 m 0.597975 0.1461494466 0.8864405885 0.3095094115
BXD65 m 1.417425 0.1461494466 1.7058905885 1.1289594115
BXD65a m 0.8454 0.130720039 1.103411466 0.587388534
BXD65b m 1.403425 0.1461494466 1.6918905885 1.1149594115
BXD66 m 1.56426 0.130720039 1.822271466 1.306248534
BXD67 m 0.82 0.130720039 1.078011466 0.561988534
BXD68 m 0.871 0.1687588446 1.2040913704 0.5379086296
BXD69 m 1.25976 0.130720039 1.517771466 1.001748534
BXD70 m 0.659325 0.1461494466 0.9477905885 0.3708594115
BXD71 m 0.88635 0.1461494466 1.1748155885 0.5978844115
BXD73 m 0.3377 0.1461494466 0.6261655885 0.0492344115
BXD73b m 1.14596 0.130720039 1.403971466 0.887948534
BXD75 m 0.55766 0.130720039 0.815671466 0.299648534
BXD77 m 0.42 0.130720039 0.678011466 0.161988534
BXD79 m 0.688 0.2066865295 1.0959519476 0.2800480524
BXD8 m 0.290875 0.1461494466 0.5793405885 0.0024094115
BXD81 m 0.5817 0.1461494466 0.8701655885 0.2932344115
BXD83 m 0.288 0.1687588446 0.6210913704 -0.0450913704
BXD84 m 0.5154 0.1687588446 0.8484913704 0.1823086296
BXD85 m 1.04404 0.130720039 1.302051466 0.786028534
BXD87 m 0.26072 0.130720039 0.518731466 0.002708534
BXD89 m 0.4366 0.1461494466 0.7250655885 0.1481344115
BXD90 m 0.525425 0.1461494466 0.8138905885 0.2369594115
BXD95 m 0.52825 0.1461494466 0.8167155885 0.2397844115
BXD98 m 0.77775 0.1461494466 1.0662155885 0.4892844115
BXD99 m 0.4838 0.130720039 0.741811466 0.225788534




  GWAS USING LINEAR MIXED MODELS