Phenotype measure:   JaxCC1   TBIL

ID, description, units MPD:89179   TBIL   total bilirubin (plasma TBIL)   [mg/dL]
Data set, strains JaxCC1   CC   18 strains     sex: both     age: 17-19wks
Procedure metabolic panel
Ontology mappings

  STRAIN COMPARISON PLOT
Dimensions Width:   px    Height:   px
Download Plot   
Visualization Options

JaxCC1 - total bilirubin (plasma TBIL)



  MEASURE SUMMARY
Measure Summary FemaleMale
Number of strains tested18 strains17 strains
Mean of the strain means0.15149   mg/dL 0.16455   mg/dL
Median of the strain means0.14678   mg/dL 0.16714   mg/dL
SD of the strain means± 0.03106 ± 0.0325
Coefficient of variation (CV)0.205 0.1975
Min–max range of strain means0.106   –   0.228   mg/dL 0.12125   –   0.245   mg/dL
Mean sample size per strain6.1   mice 6.0   mice


  ANOVA, Q-Q NORMALITY ASSESSMENT
ANOVA summary      
FactorDFSum of squaresMean sum of squaresF valuep value (Pr>F)
sex 1 0.0047 0.0047 3.6135 0.059
strain 16 0.1304 0.0082 6.2518 < 0.0001
sex:strain 16 0.0409 0.0026 1.9586 0.0183
Residuals 173 0.2256 0.0013


Q-Q normality assessment based on residuals

  


  STRAIN MEANS (UNADJUSTED)
Strain Sex Mean SD N mice SEM CV Min, Max Z score
CC002/UncJ f 0.1375 0.0324   8 0.01146 0.2357 0.11, 0.21 -0.45
CC002/UncJ m 0.176 0.0503   5 0.02249 0.2858 0.12, 0.23 0.35
CC003/UncJ f 0.228 0.04868   5 0.02177 0.2135 0.15, 0.26 2.46
CC003/UncJ m 0.245 0.02517   4 0.01258 0.1027 0.21, 0.27 2.48
CC004/TauUncJ f 0.16125 0.0439   8 0.01552 0.2722 0.12, 0.23 0.31
CC004/TauUncJ m 0.17286 0.0189   7 0.00714286 0.1093 0.14, 0.2 0.26
CC006/TauUncJ f 0.12333 0.01155   3 0.00666667 0.0936 0.11, 0.13 -0.91
CC006/TauUncJ m 0.16714 0.0269   7 0.01017 0.161 0.14, 0.22 0.08
CC009/UncJ f 0.13 0.02683   6 0.01095 0.2064 0.1, 0.17 -0.69
CC009/UncJ m 0.12125 0.01553   8 0.00548944 0.1281 0.1, 0.14 -1.33
CC010/GeniUncJ f 0.1825 0.07182   4 0.03591 0.3935 0.14, 0.29 1.0
CC013/GeniUncJ f 0.15 0.02582   7 0.009759 0.1721 0.11, 0.18 -0.05
CC013/GeniUncJ m 0.19333 0.03786   3 0.02186 0.1958 0.15, 0.22 0.89
CC017/UncJ f 0.186 0.03975   5 0.01778 0.2137 0.13, 0.22 1.11
CC017/UncJ m 0.152 0.02168   5 0.00969536 0.1426 0.13, 0.18 -0.39
CC018/UncJ f 0.13714 0.01704   7 0.00644179 0.1243 0.12, 0.16 -0.46
CC018/UncJ m 0.184 0.05177   5 0.02315 0.2814 0.13, 0.26 0.6
CC019/TauUncJ f 0.11667 0.02805   6 0.01145 0.2404 0.07, 0.15 -1.12
CC019/TauUncJ m 0.175 0.02928   8 0.01035 0.1673 0.13, 0.21 0.32
CC024/GeniUncJ f 0.15 0.04604   6 0.0188 0.307 0.11, 0.22 -0.05
CC024/GeniUncJ m 0.12571 0.0244   7 0.00922139 0.1941 0.1, 0.16 -1.2
CC025/GeniUncJ f 0.1175 0.04031   4 0.02016 0.3431 0.07, 0.16 -1.09
CC025/GeniUncJ m 0.14778 0.04353   9 0.01451 0.2945 0.09, 0.24 -0.52
CC026/GeniUncJ f 0.14857 0.01215   7 0.00459221 0.0818 0.13, 0.16 -0.09
CC026/GeniUncJ m 0.12857 0.01952   7 0.00737711 0.1518 0.11, 0.16 -1.11
CC032/GeniUncJ f 0.145 0.01975   6 0.00806226 0.1362 0.12, 0.18 -0.21
CC032/GeniUncJ m 0.14667 0.02805   6 0.01145 0.1912 0.11, 0.18 -0.55
CC040/TauUncJ f 0.14143 0.0521   7 0.01969 0.3684 0.09, 0.23 -0.32
CC040/TauUncJ m 0.175 0.01   4 0.005 0.0571 0.16, 0.18 0.32
CC041/TauUncJ f 0.17714 0.09286   7 0.0351 0.5242 0.12, 0.38 0.83
CC041/TauUncJ m 0.14875 0.02748   8 0.00971698 0.1848 0.11, 0.19 -0.49
CC051/TauUncJ f 0.18875 0.02416   8 0.00854348 0.128 0.14, 0.21 1.2
CC051/TauUncJ m 0.20833 0.04021   6 0.01641 0.193 0.16, 0.27 1.35
CC068/TauUncJ f 0.106 0.02702   5 0.01208 0.2549 0.07, 0.14 -1.46
CC068/TauUncJ m 0.13 0.03   3 0.01732 0.2308 0.1, 0.16 -1.06


  LEAST SQUARES MEANS (MODEL-ADJUSTED)
Strain Sex Mean SEM UpperCL LowerCL
CC002/UncJ f 0.1375 0.0128 0.1627 0.1123
CC002/UncJ m 0.176 0.0161 0.2079 0.1441
CC003/UncJ f 0.228 0.0161 0.2599 0.1961
CC003/UncJ m 0.245 0.0181 0.2806 0.2094
CC004/TauUncJ f 0.1612 0.0128 0.1865 0.136
CC004/TauUncJ m 0.1729 0.0136 0.1998 0.1459
CC006/TauUncJ f 0.1233 0.0208 0.1645 0.0822
CC006/TauUncJ m 0.1671 0.0136 0.1941 0.1402
CC009/UncJ f 0.13 0.0147 0.1591 0.1009
CC009/UncJ m 0.1212 0.0128 0.1465 0.096
CC013/GeniUncJ f 0.15 0.0136 0.1769 0.1231
CC013/GeniUncJ m 0.1933 0.0208 0.2345 0.1522
CC017/UncJ f 0.186 0.0161 0.2179 0.1541
CC017/UncJ m 0.152 0.0161 0.1839 0.1201
CC018/UncJ f 0.1371 0.0136 0.1641 0.1102
CC018/UncJ m 0.184 0.0161 0.2159 0.1521
CC019/TauUncJ f 0.1167 0.0147 0.1458 0.0876
CC019/TauUncJ m 0.175 0.0128 0.2002 0.1498
CC024/GeniUncJ f 0.15 0.0147 0.1791 0.1209
CC024/GeniUncJ m 0.1257 0.0136 0.1527 0.0988
CC025/GeniUncJ f 0.1175 0.0181 0.1531 0.0819
CC025/GeniUncJ m 0.1478 0.012 0.1715 0.124
CC026/GeniUncJ f 0.1486 0.0136 0.1755 0.1216
CC026/GeniUncJ m 0.1286 0.0136 0.1555 0.1016
CC032/GeniUncJ f 0.145 0.0147 0.1741 0.1159
CC032/GeniUncJ m 0.1467 0.0147 0.1758 0.1176
CC040/TauUncJ f 0.1414 0.0136 0.1684 0.1145
CC040/TauUncJ m 0.175 0.0181 0.2106 0.1394
CC041/TauUncJ f 0.1771 0.0136 0.2041 0.1502
CC041/TauUncJ m 0.1488 0.0128 0.174 0.1235
CC051/TauUncJ f 0.1888 0.0128 0.214 0.1635
CC051/TauUncJ m 0.2083 0.0147 0.2374 0.1792
CC068/TauUncJ f 0.106 0.0161 0.1379 0.0741
CC068/TauUncJ m 0.13 0.0208 0.1712 0.0888


  LEAST SQUARES MEANS (MODEL-ADJUSTED), SEXES COMBINED
Strain Sex Mean SEM UpperCL LowerCL
CC002/UncJ both 0.1567 0.0103 0.1771 0.1364
CC003/UncJ both 0.2365 0.0121 0.2604 0.2126
CC004/TauUncJ both 0.1671 0.0093 0.1855 0.1486
CC006/TauUncJ both 0.1452 0.0125 0.1698 0.1206
CC009/UncJ both 0.1256 0.0098 0.1449 0.1064
CC013/GeniUncJ both 0.1717 0.0125 0.1963 0.1471
CC017/UncJ both 0.169 0.0114 0.1915 0.1465
CC018/UncJ both 0.1606 0.0106 0.1814 0.1397
CC019/TauUncJ both 0.1458 0.0098 0.1651 0.1266
CC024/GeniUncJ both 0.1379 0.01 0.1577 0.118
CC025/GeniUncJ both 0.1326 0.0109 0.1541 0.1112
CC026/GeniUncJ both 0.1386 0.0097 0.1576 0.1195
CC032/GeniUncJ both 0.1458 0.0104 0.1664 0.1253
CC040/TauUncJ both 0.1582 0.0113 0.1806 0.1359
CC041/TauUncJ both 0.1629 0.0093 0.1814 0.1445
CC051/TauUncJ both 0.1985 0.0098 0.2178 0.1793
CC068/TauUncJ both 0.118 0.0132 0.144 0.092




GWAS analysis not available: Strain panel must be either Inbred, HMDP, BXD, BXH, CXB, or AXB/BXA