Phenotype measure:   JaxCC1   fat_adj

ID, description, units MPD:89162   fat_adj   fat tissue mass to body weight ratio   [ratio]
Data set, strains JaxCC1   CC   18 strains     sex: both     age: 13-15wks
Procedure DXA
Ontology mappings

  STRAIN COMPARISON PLOT
Dimensions Width:   px    Height:   px
Download Plot   
Visualization Options

JaxCC1 - fat tissue mass to body weight ratio



  MEASURE SUMMARY
Measure Summary FemaleMale
Number of strains tested18 strains17 strains
Mean of the strain means0.1709   ratio 0.16479   ratio
Median of the strain means0.16298   ratio 0.15708   ratio
SD of the strain means± 0.05241 ± 0.03974
Coefficient of variation (CV)0.3067 0.2412
Min–max range of strain means0.10872   –   0.3144   ratio 0.1091   –   0.22205   ratio
Mean sample size per strain6.8   mice 7.3   mice


  ANOVA, Q-Q NORMALITY ASSESSMENT
ANOVA summary      
FactorDFSum of squaresMean sum of squaresF valuep value (Pr>F)
sex 1 0.0001 0.0001 0.1601 0.6895
strain 16 0.426 0.0266 48.5637 < 0.0001
sex:strain 16 0.0606 0.0038 6.9138 < 0.0001
Residuals 208 0.114 0.0005


Q-Q normality assessment based on residuals

  


  STRAIN MEANS (UNADJUSTED)
Strain Sex Mean SD N mice SEM CV Min, Max Z score
CC002/UncJ f 0.14016 0.01395   8 0.00493103 0.0995 0.12243, 0.16866 -0.59
CC002/UncJ m 0.12281 0.01367   7 0.00516577 0.1113 0.10903, 0.14916 -1.06
CC003/UncJ f 0.119 0.00892416   5 0.00399101 0.075 0.10552, 0.13054 -0.99
CC003/UncJ m 0.14761 0.01249   4 0.00624304 0.0846 0.13144, 0.16 -0.43
CC004/TauUncJ f 0.15837 0.02511   8 0.00887936 0.1586 0.12016, 0.20045 -0.24
CC004/TauUncJ m 0.20216 0.02866   8 0.01013 0.1418 0.16213, 0.2364 0.94
CC006/TauUncJ f 0.16758 0.01785   4 0.00892689 0.1065 0.14566, 0.18408 -0.06
CC006/TauUncJ m 0.13856 0.02698   8 0.00953773 0.1947 0.11024, 0.1819 -0.66
CC009/UncJ f 0.18021 0.01865   8 0.00659544 0.1035 0.15547, 0.21887 0.18
CC009/UncJ m 0.14813 0.0101   8 0.0035701 0.0682 0.13515, 0.16325 -0.42
CC010/GeniUncJ f 0.2382 0.05685   5 0.02542 0.2387 0.1457, 0.2931 1.28
CC013/GeniUncJ f 0.10872 0.00835978   8 0.00295563 0.0769 0.09331, 0.1195 -1.19
CC013/GeniUncJ m 0.1091 0.00409901   4 0.0020495 0.0376 0.10454, 0.1133 -1.4
CC017/UncJ f 0.2211 0.02878   6 0.01175 0.1302 0.19228, 0.27361 0.96
CC017/UncJ m 0.22205 0.03942   5 0.01763 0.1775 0.1777, 0.26996 1.44
CC018/UncJ f 0.12519 0.0135   7 0.00510292 0.1078 0.11179, 0.14482 -0.87
CC018/UncJ m 0.11158 0.01004   7 0.00379315 0.0899 0.09819, 0.12595 -1.34
CC019/TauUncJ f 0.11558 0.0059898   7 0.00226393 0.0518 0.10276, 0.11967 -1.06
CC019/TauUncJ m 0.11988 0.00669323   8 0.00236642 0.0558 0.11025, 0.1276 -1.13
CC024/GeniUncJ f 0.17251 0.01338   7 0.00505611 0.0775 0.14985, 0.18985 0.03
CC024/GeniUncJ m 0.20108 0.02834   8 0.01002 0.141 0.16786, 0.2505 0.91
CC025/GeniUncJ f 0.1964 0.03072   5 0.01374 0.1564 0.15512, 0.23949 0.49
CC025/GeniUncJ m 0.19728 0.02825   10 0.00893441 0.1432 0.16406, 0.25412 0.82
CC026/GeniUncJ f 0.22083 0.0247   8 0.00873437 0.1119 0.1853, 0.2656 0.95
CC026/GeniUncJ m 0.21047 0.02988   8 0.01056 0.142 0.16577, 0.24866 1.15
CC032/GeniUncJ f 0.13171 0.0137   8 0.00484492 0.104 0.11646, 0.15343 -0.75
CC032/GeniUncJ m 0.15708 0.0446   8 0.01577 0.284 0.11311, 0.26038 -0.19
CC040/TauUncJ f 0.3144 0.03493   8 0.01235 0.1111 0.26304, 0.37005 2.74
CC040/TauUncJ m 0.2188 0.03089   7 0.01167 0.1412 0.16374, 0.24784 1.36
CC041/TauUncJ f 0.14543 0.01713   8 0.00605607 0.1178 0.12467, 0.18424 -0.49
CC041/TauUncJ m 0.15918 0.02032   8 0.00718267 0.1276 0.1372, 0.18805 -0.14
CC051/TauUncJ f 0.17768 0.03482   8 0.01231 0.196 0.13305, 0.22933 0.13
CC051/TauUncJ m 0.20053 0.0247   8 0.00873193 0.1232 0.14798, 0.22752 0.9
CC068/TauUncJ f 0.14307 0.02401   5 0.01074 0.1678 0.11351, 0.17284 -0.53
CC068/TauUncJ m 0.13511 0.00916328   8 0.00323971 0.0678 0.12419, 0.14969 -0.75


  LEAST SQUARES MEANS (MODEL-ADJUSTED)
Strain Sex Mean SEM UpperCL LowerCL
CC002/UncJ f 0.1402 0.0083 0.1565 0.1238
CC002/UncJ m 0.1228 0.0088 0.1403 0.1054
CC003/UncJ f 0.119 0.0105 0.1396 0.0984
CC003/UncJ m 0.1476 0.0117 0.1707 0.1245
CC004/TauUncJ f 0.1584 0.0083 0.1747 0.142
CC004/TauUncJ m 0.2022 0.0083 0.2185 0.1858
CC006/TauUncJ f 0.1676 0.0117 0.1907 0.1445
CC006/TauUncJ m 0.1386 0.0083 0.1549 0.1222
CC009/UncJ f 0.1802 0.0083 0.1965 0.1639
CC009/UncJ m 0.1481 0.0083 0.1645 0.1318
CC013/GeniUncJ f 0.1087 0.0083 0.125 0.0924
CC013/GeniUncJ m 0.1091 0.0117 0.1322 0.086
CC017/UncJ f 0.2211 0.0096 0.2399 0.2023
CC017/UncJ m 0.2221 0.0105 0.2427 0.2014
CC018/UncJ f 0.1252 0.0088 0.1426 0.1077
CC018/UncJ m 0.1116 0.0088 0.129 0.0941
CC019/TauUncJ f 0.1156 0.0088 0.133 0.0981
CC019/TauUncJ m 0.1199 0.0083 0.1362 0.1036
CC024/GeniUncJ f 0.1725 0.0088 0.19 0.1551
CC024/GeniUncJ m 0.2011 0.0083 0.2174 0.1848
CC025/GeniUncJ f 0.1964 0.0105 0.217 0.1758
CC025/GeniUncJ m 0.1973 0.0074 0.2119 0.1827
CC026/GeniUncJ f 0.2208 0.0083 0.2372 0.2045
CC026/GeniUncJ m 0.2105 0.0083 0.2268 0.1941
CC032/GeniUncJ f 0.1317 0.0083 0.148 0.1154
CC032/GeniUncJ m 0.1571 0.0083 0.1734 0.1408
CC040/TauUncJ f 0.3144 0.0083 0.3307 0.2981
CC040/TauUncJ m 0.2188 0.0088 0.2363 0.2014
CC041/TauUncJ f 0.1454 0.0083 0.1617 0.1291
CC041/TauUncJ m 0.1592 0.0083 0.1755 0.1429
CC051/TauUncJ f 0.1777 0.0083 0.194 0.1614
CC051/TauUncJ m 0.2005 0.0083 0.2168 0.1842
CC068/TauUncJ f 0.1431 0.0105 0.1637 0.1224
CC068/TauUncJ m 0.1351 0.0083 0.1514 0.1188


  LEAST SQUARES MEANS (MODEL-ADJUSTED), SEXES COMBINED
Strain Sex Mean SEM UpperCL LowerCL
CC002/UncJ both 0.1315 0.0061 0.1434 0.1195
CC003/UncJ both 0.1333 0.0079 0.1488 0.1178
CC004/TauUncJ both 0.1803 0.0059 0.1918 0.1687
CC006/TauUncJ both 0.1531 0.0072 0.1672 0.1389
CC009/UncJ both 0.1642 0.0059 0.1757 0.1526
CC013/GeniUncJ both 0.1089 0.0072 0.123 0.0948
CC017/UncJ both 0.2216 0.0071 0.2355 0.2076
CC018/UncJ both 0.1184 0.0063 0.1307 0.1061
CC019/TauUncJ both 0.1177 0.0061 0.1297 0.1058
CC024/GeniUncJ both 0.1868 0.0061 0.1987 0.1749
CC025/GeniUncJ both 0.1968 0.0064 0.2095 0.1842
CC026/GeniUncJ both 0.2157 0.0059 0.2272 0.2041
CC032/GeniUncJ both 0.1444 0.0059 0.1559 0.1329
CC040/TauUncJ both 0.2666 0.0061 0.2785 0.2547
CC041/TauUncJ both 0.1523 0.0059 0.1638 0.1408
CC051/TauUncJ both 0.1891 0.0059 0.2006 0.1776
CC068/TauUncJ both 0.1391 0.0067 0.1522 0.1259




GWAS analysis not available: Strain panel must be either Inbred, HMDP, BXD, BXH, CXB, or AXB/BXA