Project measure / variable:   Lesage1   CD4_neg_CD8_neg_NKT_of_tot

ID, description, units MPD:63514   CD4_neg_CD8_neg_NKT_of_tot   percentage of splenic lymphocytes that are CD4- CD8- NK T cells   [%]  
Data set, strains Lesage1   CC w/par   76 strains     sex: both     age: 5-8wks
Procedure immune cell quantification
Ontology mappings

  •   Or, add this measure to your collection.
       
  •     no folder
  •     put it in new folder  

  STRAIN COMPARISON PLOT
Dimensions Width:   px    Height:   px
Download Plot   
Visualization Options

Lesage1 - percentage of splenic lymphocytes that are CD4- CD8- NK T cells



  MEASURE SUMMARY
Measure Summary FemaleMale
Number of strains tested46 strains65 strains
Mean of the strain means0.16023   % 0.15468   %
Median of the strain means0.096   % 0.09333   %
SD of the strain means± 0.32338 ± 0.32045
Coefficient of variation (CV)2.0182 2.0717
Min–max range of strain means0.006   –   2.12   % 0.00766667   –   2.4   %
Mean sample size per strain2.2   mice 2.4   mice


  ANOVA, Q-Q NORMALITY ASSESSMENT
ANOVA summary      
FactorDFSum of squaresMean sum of squaresF valuep value (Pr>F)
sex 1 0.0003 0.0003 0.8487 0.363
strain 12 0.1788 0.0149 39.8817 < 0.0001
sex:strain 12 0.0046 0.0004 1.0336 0.4409
Residuals 36 0.0134 0.0004


Q-Q normality assessment based on residuals

  


  STRAIN MEANS (UNADJUSTED)
  
Select table page:
Strain Sex Mean SD N mice SEM CV Min, Max Z score
129S1/SvImJ f 0.089 0.02121   2   0.015 0.2384 0.074, 0.104 -0.22
129S1/SvImJ m 0.1095 0.02333   2   0.0165 0.2131 0.093, 0.126 -0.14
A/J f 0.045 0.00141421   2   0.001 0.0314 0.044, 0.046 -0.36
A/J m 0.0475 0.00777817   2   0.0055 0.1638 0.042, 0.053 -0.33
C57BL/6J f 0.191 0.04544   4 0.02272 0.2379 0.146, 0.253 0.1
C57BL/6J m 0.152 0.0   1   0.0 0.0 0.152, 0.152 -0.01
CAST/EiJ f 0.0105 0.00212132   2   0.0015 0.202 0.009, 0.012 -0.46
CAST/EiJ m 0.012 0.00848528   2   0.006 0.7071 0.006, 0.018 -0.45
CC008/Geni m 0.06967 0.01845   3 0.01065 0.2648 0.054, 0.09 -0.27
CC010/Geni f 0.115 0.00565685   2   0.004 0.0492 0.111, 0.119 -0.14
CC010/Geni m 0.128 0.0   1   0.0 0.0 0.128, 0.128 -0.08
CC012/Geni f 0.075 0.02263   2   0.016 0.3017 0.059, 0.091 -0.26
CC012/Geni m 0.07533 0.02974   3 0.01717 0.3947 0.041, 0.093 -0.25
CC013/Geni m 0.09867 0.01358   3 0.00783865 0.1376 0.086, 0.113 -0.17
CC016/Geni m 0.358 0.03604   3 0.02081 0.1007 0.323, 0.395 0.63
CC020/Geni f 0.103 0.0   1   0.0 0.0 0.103, 0.103 -0.18
CC020/Geni m 0.1485 0.03606   2   0.0255 0.2428 0.123, 0.174 -0.02
CC023/Geni m 0.12967 0.04708   3 0.02718 0.3631 0.076, 0.164 -0.08
CC024/Geni f 0.146 0.01273   2   0.009 0.0872 0.137, 0.155 -0.04
CC024/Geni m 0.068 0.0   1   0.0 0.0 0.068, 0.068 -0.27
CC025/Geni f 0.00966667 0.00152753   3 0.00088192 0.158 0.008, 0.011 -0.47
CC026/Geni m 0.12067 0.00814453   3 0.00470225 0.0675 0.115, 0.13 -0.11
CC027/Geni f 2.12 0.0   1   0.0 0.0 2.12, 2.12 6.06
CC027/Geni m 2.4 0.2687   2   0.19 0.112 2.21, 2.59 7.01
CC030/Geni f 0.1295 0.01909   2   0.0135 0.1474 0.116, 0.143 -0.1
CC031/Geni f 0.075 0.0   1   0.0 0.0 0.075, 0.075 -0.26
CC031/Geni m 0.08 0.00989949   2   0.007 0.1237 0.073, 0.087 -0.23
CC032/Geni m 0.21267 0.00723418   3 0.00417665 0.034 0.208, 0.221 0.18
CC033/Geni f 0.111 0.006   3 0.0034641 0.0541 0.105, 0.117 -0.15
CC038/Geni f 0.0375 0.00919239   2   0.0065 0.2451 0.031, 0.044 -0.38
CC038/Geni m 0.021 0.0   1   0.0 0.0 0.021, 0.021 -0.42
CC042/Geni m 0.2 0.0072111   3 0.00416333 0.0361 0.194, 0.208 0.14
CC043/Geni m 0.016 0.00360555   3 0.00208167 0.2253 0.013, 0.02 -0.43
CC056/Geni f 0.143 0.0   1   0.0 0.0 0.143, 0.143 -0.05
CC056/Geni m 0.1695 0.00212132   2   0.0015 0.0125 0.168, 0.171 0.05
CC061/Geni m 0.11533 0.03156   3 0.01822 0.2737 0.085, 0.148 -0.12
CIV2_FE f 0.027 0.006245   3 0.00360555 0.2313 0.022, 0.034 -0.41
DET3_GA m 0.04767 0.00404145   3 0.00233333 0.0848 0.044, 0.052 -0.33
DONNELL_HA f 0.1225 0.01626   2   0.0115 0.1328 0.111, 0.134 -0.12
DONNELL_HA m 0.11367 0.0343   3 0.0198 0.3017 0.09, 0.153 -0.13
FIV_AC m 0.014 0.0034641   4 0.00173205 0.2474 0.011, 0.019 -0.44
FUF_HE f 0.04933 0.00723418   3 0.00417665 0.1466 0.041, 0.054 -0.34
GALASUPREME_CE m 0.09367 0.00945163   3 0.0054569 0.1009 0.083, 0.101 -0.19
GIT_GC f 0.313 0.0   1   0.0 0.0 0.313, 0.313 0.47
GIT_GC m 0.193 0.00141421   2   0.001 0.0073 0.192, 0.194 0.12
HAX2_EF f 0.05233 0.00305505   3 0.00176383 0.0584 0.049, 0.055 -0.33
HAZ_FE f 0.061 0.0   1   0.0 0.0 0.061, 0.061 -0.31
HAZ_FE m 0.056 0.0297   2   0.021 0.5303 0.035, 0.077 -0.31
HIP_GA f 0.178 0.0   1   0.0 0.0 0.178, 0.178 0.05
HIP_GA m 0.1975 0.03323   2   0.0235 0.1683 0.174, 0.221 0.13
HOE_GC f 0.463 0.0   1   0.0 0.0 0.463, 0.463 0.94
HOE_GC m 0.469 0.02546   2   0.018 0.0543 0.451, 0.487 0.98
JUD_EF m 0.16975 0.03825   4 0.01912 0.2253 0.13, 0.214 0.05
KAV_AF f 0.1085 0.02758   2   0.0195 0.2542 0.089, 0.128 -0.16
KAV_AF m 0.116 0.0   1   0.0 0.0 0.116, 0.116 -0.12
LAM_DC f 0.051 0.0   1   0.0 0.0 0.051, 0.051 -0.34
LAM_DC m 0.062 0.0   1   0.0 0.0 0.062, 0.062 -0.29
LAT_HD f 0.0196 0.0031305   5 0.0014 0.1597 0.015, 0.023 -0.43
LAT_HD m 0.022 0.00424264   2   0.003 0.1928 0.019, 0.025 -0.41
LAX_FC m 0.0555 0.00636396   2   0.0045 0.1147 0.051, 0.06 -0.31
LEL_FH m 0.157 0.0297   2   0.021 0.1892 0.136, 0.178 0.01
LIP_BG f 0.177 0.02753   4 0.01377 0.1555 0.149, 0.204 0.05
LIP_BG m 0.154 0.0   1   0.0 0.0 0.154, 0.154 0.0
LIV_DA f 0.076 0.0   1   0.0 0.0 0.076, 0.076 -0.26
LIV_DA m 0.053 0.0   2   0.0 0.0 0.053, 0.053 -0.32
LOD_AE f 0.12733 0.01834   3 0.01059 0.144 0.113, 0.148 -0.1
LOM_BG m 0.023 0.002   3 0.0011547 0.087 0.021, 0.025 -0.41
LOT_FC f 0.11267 0.01361   3 0.00785988 0.1208 0.102, 0.128 -0.15
LOT_FC m 0.069 0.02263   2   0.016 0.3279 0.053, 0.085 -0.27
LOX_GF m 0.097 0.01253   3 0.00723418 0.1292 0.084, 0.109 -0.18
LUF_AD m 0.1784 0.02937   5 0.01314 0.1646 0.15, 0.215 0.07
LUG_EH m 0.09267 0.01674   3 0.00966667 0.1807 0.083, 0.112 -0.19
LUS_AH f 0.006 0.001   3 0.00057735 0.1667 0.005, 0.007 -0.48
LUV_DG m 0.07125 0.02434   4 0.01217 0.3416 0.049, 0.097 -0.26
LUZ_FH f 0.2235 0.00070711   2   0.0005 0.0032 0.223, 0.224 0.2
LUZ_FH m 0.24 0.0   1   0.0 0.0 0.24, 0.24 0.27
MERCURI_HF m 0.10567 0.0125   3 0.0072188 0.1183 0.093, 0.118 -0.15
NOD/ShiLtJ f 0.1325 0.01202   2   0.0085 0.0907 0.124, 0.141 -0.09
NOD/ShiLtJ m 0.1145 0.00353553   2   0.0025 0.0309 0.112, 0.117 -0.13
NZO/HlLtJ f 0.19 0.05515   2   0.039 0.2903 0.151, 0.229 0.09
NZO/HlLtJ m 0.198 0.03677   2   0.026 0.1857 0.172, 0.224 0.14
PAT_CD m 0.089 0.00953939   3 0.00550757 0.1072 0.08, 0.099 -0.2
PEF_EC f 0.066 0.01808   3 0.01044 0.274 0.049, 0.085 -0.29
PEF_EC m 0.09333 0.01582   3 0.00913479 0.1695 0.076, 0.107 -0.19
POH_DC f 0.12767 0.02303   3 0.0133 0.1804 0.104, 0.15 -0.1
PWK/PhJ f 0.0085 0.00070711   2   0.0005 0.0832 0.008, 0.009 -0.47
PWK/PhJ m 0.015 0.0   2   0.0 0.0 0.015, 0.015 -0.44
SEH_AH f 0.785 0.0   1   0.0 0.0 0.785, 0.785 1.93
SEH_AH m 1.13 0.0   1   0.0 0.0 1.13, 1.13 3.04
STUCKY_HF f 0.04667 0.01504   3 0.00868588 0.3224 0.037, 0.064 -0.35
STUCKY_HF m 0.035 0.0   1   0.0 0.0 0.035, 0.035 -0.37
VIT_ED f 0.048 0.0043589   3 0.00251661 0.0908 0.045, 0.053 -0.35
VUX2_HF m 0.055 0.0087178   3 0.00503322 0.1585 0.049, 0.065 -0.31
WAD f 0.02333 0.00550757   3 0.0031798 0.236 0.017, 0.027 -0.42
WSB/EiJ f 0.161 0.02546   2   0.018 0.1581 0.143, 0.179 0.0
WSB/EiJ m 0.149 0.00565685   2   0.004 0.038 0.145, 0.153 -0.02
XAD8_BG f 0.056 0.0   1   0.0 0.0 0.056, 0.056 -0.32
XAD8_BG m 0.05133 0.00585947   3 0.00338296 0.1141 0.047, 0.058 -0.32
XAH3_GH m 0.038 0.00781025   3 0.00450925 0.2055 0.033, 0.047 -0.36
XAS4_AF m 0.13633 0.01343   3 0.00775314 0.0985 0.121, 0.146 -0.06
XAV_AH m 0.00766667 0.00152753   3 0.00088192 0.1992 0.006, 0.009 -0.46
XAW2_CD m 0.0775 0.04313   2   0.0305 0.5566 0.047, 0.108 -0.24
XEB2_AG f 0.026 0.006245   3 0.00360555 0.2402 0.021, 0.033 -0.42
XEB2_AG m 0.01567 0.00251661   3 0.00145297 0.1606 0.013, 0.018 -0.43
XEB_AF f 0.016 0.00424264   2   0.003 0.2652 0.013, 0.019 -0.45
XEB_AF m 0.017 0.0   1   0.0 0.0 0.017, 0.017 -0.43
XEQ_EH m 0.09933 0.01041   3 0.00600925 0.1048 0.091, 0.111 -0.17
XXEN2_DC m 0.06167 0.01301   3 0.00751295 0.211 0.049, 0.075 -0.29
XXEN3_DC f 0.116 0.0   1   0.0 0.0 0.116, 0.116 -0.14
XXEN3_DC m 0.046 0.0   1   0.0 0.0 0.046, 0.046 -0.34
YOX_DE m 0.042 0.00655744   3 0.00378594 0.1561 0.035, 0.048 -0.35


  LEAST SQUARES MEANS (MODEL-ADJUSTED)
Strain Sex Mean SEM UpperCL LowerCL
129S1/SvImJ f 0.089 0.0137 0.1167 0.0613
129S1/SvImJ m 0.1095 0.0137 0.1372 0.0818
A/J f 0.045 0.0137 0.0727 0.0173
A/J m 0.0475 0.0137 0.0752 0.0198
CAST/EiJ f 0.0105 0.0137 0.0382 -0.0172
CAST/EiJ m 0.012 0.0137 0.0397 -0.0157
CC012/Geni f 0.075 0.0137 0.1027 0.0473
CC012/Geni m 0.0753 0.0112 0.098 0.0527
DONNELL_HA f 0.1225 0.0137 0.1502 0.0948
DONNELL_HA m 0.1137 0.0112 0.1363 0.091
LAT_HD f 0.0196 0.0086 0.0371 0.0021
LAT_HD m 0.022 0.0137 0.0497 -0.0057
LOT_FC f 0.1127 0.0112 0.1353 0.09
LOT_FC m 0.069 0.0137 0.0967 0.0413
NOD/ShiLtJ f 0.1325 0.0137 0.1602 0.1048
NOD/ShiLtJ m 0.1145 0.0137 0.1422 0.0868
NZO/HlLtJ f 0.19 0.0137 0.2177 0.1623
NZO/HlLtJ m 0.198 0.0137 0.2257 0.1703
PEF_EC f 0.066 0.0112 0.0886 0.0434
PEF_EC m 0.0933 0.0112 0.116 0.0707
PWK/PhJ f 0.0085 0.0137 0.0362 -0.0192
PWK/PhJ m 0.015 0.0137 0.0427 -0.0127
WSB/EiJ f 0.161 0.0137 0.1887 0.1333
WSB/EiJ m 0.149 0.0137 0.1767 0.1213
XEB2_AG f 0.026 0.0112 0.0486 0.0034
XEB2_AG m 0.0157 0.0112 0.0383 -0.007


  LEAST SQUARES MEANS (MODEL-ADJUSTED), SEXES COMBINED
Strain Sex Mean SEM UpperCL LowerCL
129S1/SvImJ both 0.0993 0.0097 0.1188 0.0797
A/J both 0.0463 0.0097 0.0658 0.0267
CAST/EiJ both 0.0113 0.0097 0.0308 -0.0083
CC012/Geni both 0.0752 0.0088 0.0931 0.0573
DONNELL_HA both 0.1181 0.0088 0.136 0.1002
LAT_HD both 0.0208 0.0081 0.0372 0.0044
LOT_FC both 0.0908 0.0088 0.1087 0.0729
NOD/ShiLtJ both 0.1235 0.0097 0.1431 0.1039
NZO/HlLtJ both 0.194 0.0097 0.2136 0.1744
PEF_EC both 0.0797 0.0079 0.0957 0.0637
PWK/PhJ both 0.0118 0.0097 0.0313 -0.0078
WSB/EiJ both 0.155 0.0097 0.1746 0.1354
XEB2_AG both 0.0208 0.0079 0.0368 0.0048




GWAS analysis not available: Strain panel must be either Inbred, HMDP, BXD, BXH, CXB, or AXB/BXA