Project measure / variable:   Lesage1   pre_mNK_of_tot

ID, description, units MPD:63509   pre_mNK_of_tot   percentage of splenic lymphocytes that are pre-mNK (B220+ CD11c+)   [%]  
Data set, strains Lesage1   CC w/par   76 strains     sex: both     age: 5-8wks
Procedure immune cell quantification
Ontology mappings

  •   Or, add this measure to your collection.
       
  •     no folder
  •     put it in new folder  

  STRAIN COMPARISON PLOT
Dimensions Width:   px    Height:   px
Download Plot   
Visualization Options

Lesage1 - percentage of splenic lymphocytes that are pre-mNK (B220+ CD11c+)



  MEASURE SUMMARY
Measure Summary FemaleMale
Number of strains tested47 strains64 strains
Mean of the strain means0.15109   % 0.16113   %
Median of the strain means0.099   % 0.13292   %
SD of the strain means± 0.13032 ± 0.12669
Coefficient of variation (CV)0.8626 0.7862
Min–max range of strain means0.02433   –   0.673   % 0.0325   –   0.648   %
Mean sample size per strain2.3   mice 2.5   mice


  ANOVA, Q-Q NORMALITY ASSESSMENT
ANOVA summary      
FactorDFSum of squaresMean sum of squaresF valuep value (Pr>F)
sex 1 0.0018 0.0018 1.9122 0.1752
strain 11 0.5859 0.0533 56.1148 < 0.0001
sex:strain 11 0.0081 0.0007 0.7793 0.658
Residuals 36 0.0342 0.0009


Q-Q normality assessment based on residuals

  


  STRAIN MEANS (UNADJUSTED)
  
Select table page:
Strain Sex Mean SD N mice SEM CV Min, Max Z score
129S1/SvImJ f 0.0785 0.04172   2   0.0295 0.5315 0.049, 0.108 -0.56
129S1/SvImJ m 0.087 0.01697   2   0.012 0.1951 0.075, 0.099 -0.59
A/J f 0.152 0.04667   2   0.033 0.307 0.119, 0.185 0.01
A/J m 0.161 0.00565685   2   0.004 0.0351 0.157, 0.165 0.0
C57BL/6J f 0.1745 0.04425   4 0.02213 0.2536 0.114, 0.22 0.18
C57BL/6J m 0.153 0.0   1   0.0 0.0 0.153, 0.153 -0.06
CAST/EiJ f 0.075 0.02121   2   0.015 0.2828 0.06, 0.09 -0.58
CAST/EiJ m 0.112 0.00282843   2   0.002 0.0253 0.11, 0.114 -0.39
CC008/Geni m 0.122 0.00282843   2   0.002 0.0232 0.12, 0.124 -0.31
CC010/Geni f 0.308 0.06223   2   0.044 0.202 0.264, 0.352 1.2
CC010/Geni m 0.171 0.0   1   0.0 0.0 0.171, 0.171 0.08
CC012/Geni f 0.05967 0.01137   3 0.00656591 0.1906 0.047, 0.069 -0.7
CC012/Geni m 0.0522 0.00637966   5 0.00285307 0.1222 0.045, 0.062 -0.86
CC013/Geni m 0.648 0.15085   3 0.08709 0.2328 0.554, 0.822 3.84
CC016/Geni m 0.457 0.11337   3 0.06545 0.2481 0.366, 0.584 2.34
CC020/Geni f 0.058 0.0   1   0.0 0.0 0.058, 0.058 -0.71
CC020/Geni m 0.0495 0.00777817   2   0.0055 0.1571 0.044, 0.055 -0.88
CC023/Geni m 0.47033 0.04267   3 0.02463 0.0907 0.424, 0.508 2.44
CC024/Geni f 0.094 0.00707107   2   0.005 0.0752 0.089, 0.099 -0.44
CC024/Geni m 0.199 0.0   1   0.0 0.0 0.199, 0.199 0.3
CC025/Geni f 0.04733 0.00680686   3 0.00392994 0.1438 0.042, 0.055 -0.8
CC026/Geni m 0.18033 0.02775   3 0.01602 0.1539 0.155, 0.21 0.15
CC027/Geni f 0.123 0.0   1   0.0 0.0 0.123, 0.123 -0.22
CC027/Geni m 0.174 0.0198   2   0.014 0.1138 0.16, 0.188 0.1
CC030/Geni f 0.0745 0.00636396   2   0.0045 0.0854 0.07, 0.079 -0.59
CC031/Geni f 0.147 0.0   1   0.0 0.0 0.147, 0.147 -0.03
CC031/Geni m 0.183 0.00141421   2   0.001 0.0077 0.182, 0.184 0.17
CC032/Geni m 0.29633 0.00472582   3 0.00272845 0.0159 0.291, 0.3 1.07
CC033/Geni f 0.673 0.28173   3 0.16265 0.4186 0.478, 0.996 4.0
CC038/Geni f 0.286 0.04101   2   0.029 0.1434 0.257, 0.315 1.04
CC038/Geni m 0.339 0.0   1   0.0 0.0 0.339, 0.339 1.4
CC042/Geni m 0.13133 0.02491   3 0.01438 0.1896 0.115, 0.16 -0.24
CC043/Geni m 0.22167 0.02369   3 0.01368 0.1069 0.207, 0.249 0.48
CC056/Geni f 0.229 0.0   1   0.0 0.0 0.229, 0.229 0.6
CC056/Geni m 0.1725 0.00070711   2   0.0005 0.0041 0.172, 0.173 0.09
CC061/Geni m 0.07933 0.0051316   3 0.00296273 0.0647 0.075, 0.085 -0.65
CIV2_FE f 0.09633 0.01909   3 0.01102 0.1981 0.082, 0.118 -0.42
DET3_GA m 0.061 0.01114   3 0.0064291 0.1825 0.051, 0.073 -0.79
DONNELL_HA f 0.3075 0.04879   2   0.0345 0.1587 0.273, 0.342 1.2
DONNELL_HA m 0.28567 0.08208   3 0.04739 0.2873 0.197, 0.359 0.98
FIV_AC m 0.0825 0.03367   4 0.01683 0.4081 0.054, 0.122 -0.62
FUF_HE f 0.04467 0.00907377   3 0.00523874 0.2031 0.035, 0.053 -0.82
GALASUPREME_CE m 0.09467 0.00929157   3 0.00536449 0.0982 0.087, 0.105 -0.52
GIT_GC f 0.122 0.0   1   0.0 0.0 0.122, 0.122 -0.22
GIT_GC m 0.1475 0.02051   2   0.0145 0.139 0.133, 0.162 -0.11
HAX2_EF f 0.02433 0.00378594   3 0.00218581 0.1556 0.02, 0.027 -0.97
HAZ_FE f 0.2 0.0   1   0.0 0.0 0.2, 0.2 0.38
HAZ_FE m 0.119 0.01414   2   0.01 0.1188 0.109, 0.129 -0.33
HIP_GA f 0.086 0.0   1   0.0 0.0 0.086, 0.086 -0.5
HIP_GA m 0.087 0.00848528   2   0.006 0.0975 0.081, 0.093 -0.59
HOE_GC f 0.08 0.0   1   0.0 0.0 0.08, 0.08 -0.55
HOE_GC m 0.1265 0.02758   2   0.0195 0.218 0.107, 0.146 -0.27
JUD_EF m 0.1375 0.01266   4 0.00633114 0.0921 0.125, 0.152 -0.19
KAV_AF f 0.099 0.01131   2   0.008 0.1143 0.091, 0.107 -0.4
KAV_AF m 0.066 0.0   1   0.0 0.0 0.066, 0.066 -0.75
LAM_DC f 0.393 0.0   1   0.0 0.0 0.393, 0.393 1.86
LAM_DC m 0.4705 0.08273   2   0.0585 0.1758 0.412, 0.529 2.44
LAT_HD f 0.05 0.00932738   5 0.00417133 0.1865 0.039, 0.059 -0.78
LAT_HD m 0.0865 0.01768   2   0.0125 0.2044 0.074, 0.099 -0.59
LAX_FC f 0.042 0.0   1   0.0 0.0 0.042, 0.042 -0.84
LAX_FC m 0.049 0.0   1   0.0 0.0 0.049, 0.049 -0.89
LEL_FH m 0.135 0.01414   2   0.01 0.1048 0.125, 0.145 -0.21
LIP_BG f 0.09475 0.03012   4 0.01506 0.3178 0.067, 0.126 -0.43
LIP_BG m 0.166 0.0   1   0.0 0.0 0.166, 0.166 0.04
LIV_DA f 0.115 0.0   1   0.0 0.0 0.115, 0.115 -0.28
LIV_DA m 0.1345 0.04031   2   0.0285 0.2997 0.106, 0.163 -0.21
LOD_AE f 0.46967 0.05829   3 0.03365 0.1241 0.415, 0.531 2.44
LOM_BG m 0.06533 0.01266   3 0.00731057 0.1938 0.051, 0.075 -0.76
LOT_FC f 0.049 0.01233   6 0.00503322 0.2516 0.037, 0.065 -0.78
LOX_GF m 0.15933 0.02079   3 0.012 0.1305 0.144, 0.183 -0.01
LUF_AD m 0.1656 0.01397   5 0.0062498 0.0844 0.147, 0.181 0.04
LUG_EH m 0.091 0.01114   3 0.0064291 0.1224 0.079, 0.101 -0.55
LUS_AH f 0.167 0.0072111   3 0.00416333 0.0432 0.161, 0.175 0.12
LUV_DG m 0.0555 0.01794   4 0.00896753 0.3232 0.032, 0.07 -0.83
LUZ_FH f 0.063 0.01214   4 0.00606905 0.1927 0.052, 0.074 -0.68
LUZ_FH m 0.059 0.0   1   0.0 0.0 0.059, 0.059 -0.81
MERCURI_HF m 0.472 0.008544   3 0.00493288 0.0181 0.464, 0.481 2.45
NOD/ShiLtJ f 0.052 0.0198   2   0.014 0.3807 0.038, 0.066 -0.76
NOD/ShiLtJ m 0.07 0.00141421   2   0.001 0.0202 0.069, 0.071 -0.72
NZO/HlLtJ f 0.4025 0.05869   2   0.0415 0.1458 0.361, 0.444 1.93
NZO/HlLtJ m 0.357 0.03253   2   0.023 0.0911 0.334, 0.38 1.55
PAT_CD m 0.066 0.01153   3 0.00665833 0.1747 0.055, 0.078 -0.75
PEF_EC f 0.197 0.02066   3 0.01193 0.1049 0.18, 0.22 0.35
PEF_EC m 0.19033 0.04055   3 0.02341 0.213 0.151, 0.232 0.23
POH_DC f 0.16733 0.03288   3 0.01899 0.1965 0.13, 0.192 0.12
PWK/PhJ f 0.1235 0.04172   2   0.0295 0.3378 0.094, 0.153 -0.21
PWK/PhJ m 0.137 0.03536   2   0.025 0.2581 0.112, 0.162 -0.19
SEH_AH f 0.123 0.0   1   0.0 0.0 0.123, 0.123 -0.22
SEH_AH m 0.1785 0.02294   4 0.01147 0.1285 0.155, 0.209 0.14
STUCKY_HF f 0.09833 0.03723   3 0.0215 0.3786 0.056, 0.126 -0.4
STUCKY_HF m 0.073 0.0   1   0.0 0.0 0.073, 0.073 -0.7
VIT_ED f 0.048 0.01493   3 0.00862168 0.3111 0.037, 0.065 -0.79
VUX2_HF m 0.083 0.05828   3 0.03365 0.7022 0.044, 0.15 -0.62
WAD f 0.27667 0.01498   3 0.00864741 0.0541 0.26, 0.289 0.96
WSB/EiJ f 0.0585 0.01909   2   0.0135 0.3264 0.045, 0.072 -0.71
WSB/EiJ m 0.0325 0.00070711   2   0.0005 0.0218 0.032, 0.033 -1.02
XAD8_BG f 0.141 0.0   1   0.0 0.0 0.141, 0.141 -0.08
XAD8_BG m 0.197 0.00556776   3 0.00321455 0.0283 0.192, 0.203 0.28
XAH3_GH m 0.18933 0.01804   3 0.01041 0.0953 0.172, 0.208 0.22
XAS4_AF m 0.07267 0.01504   3 0.00868588 0.207 0.057, 0.087 -0.7
XAV_AH m 0.035 0.00556776   3 0.00321455 0.1591 0.03, 0.041 -1.0
XAW2_CD m 0.0705 0.01061   2   0.0075 0.1504 0.063, 0.078 -0.72
XEB2_AG f 0.04067 0.00602771   3 0.0034801 0.1482 0.035, 0.047 -0.85
XEB2_AG m 0.06533 0.00585947   3 0.00338296 0.0897 0.061, 0.072 -0.76
XEB_AF f 0.08 0.00989949   2   0.007 0.1237 0.073, 0.087 -0.55
XEB_AF m 0.045 0.0   1   0.0 0.0 0.045, 0.045 -0.92
XEQ_EH m 0.04133 0.00416333   3 0.0024037 0.1007 0.038, 0.046 -0.95
XXEN2_DC m 0.098 0.0346   3 0.01997 0.353 0.062, 0.131 -0.5
XXEN3_DC f 0.21 0.0   1   0.0 0.0 0.21, 0.21 0.45
XXEN3_DC m 0.214 0.0   1   0.0 0.0 0.214, 0.214 0.42
YOX_DE m 0.321 0.08661   3 0.05 0.2698 0.232, 0.405 1.26


  LEAST SQUARES MEANS (MODEL-ADJUSTED)
Strain Sex Mean SEM UpperCL LowerCL
129S1/SvImJ f 0.0785 0.0218 0.1227 0.0343
129S1/SvImJ m 0.087 0.0218 0.1312 0.0428
A/J f 0.152 0.0218 0.1962 0.1078
A/J m 0.161 0.0218 0.2052 0.1168
CAST/EiJ f 0.075 0.0218 0.1192 0.0308
CAST/EiJ m 0.112 0.0218 0.1562 0.0678
CC012/Geni f 0.0597 0.0178 0.0957 0.0236
CC012/Geni m 0.0522 0.0138 0.0801 0.0243
DONNELL_HA f 0.3075 0.0218 0.3517 0.2633
DONNELL_HA m 0.2857 0.0178 0.3217 0.2496
LAT_HD f 0.05 0.0138 0.0779 0.0221
LAT_HD m 0.0865 0.0218 0.1307 0.0423
NOD/ShiLtJ f 0.052 0.0218 0.0962 0.0078
NOD/ShiLtJ m 0.07 0.0218 0.1142 0.0258
NZO/HlLtJ f 0.4025 0.0218 0.4467 0.3583
NZO/HlLtJ m 0.357 0.0218 0.4012 0.3128
PEF_EC f 0.197 0.0178 0.2331 0.1609
PEF_EC m 0.1903 0.0178 0.2264 0.1543
PWK/PhJ f 0.1235 0.0218 0.1677 0.0793
PWK/PhJ m 0.137 0.0218 0.1812 0.0928
WSB/EiJ f 0.0585 0.0218 0.1027 0.0143
WSB/EiJ m 0.0325 0.0218 0.0767 -0.0117
XEB2_AG f 0.0407 0.0178 0.0767 0.0046
XEB2_AG m 0.0653 0.0178 0.1014 0.0293


  LEAST SQUARES MEANS (MODEL-ADJUSTED), SEXES COMBINED
Strain Sex Mean SEM UpperCL LowerCL
129S1/SvImJ both 0.0827 0.0154 0.114 0.0515
A/J both 0.1565 0.0154 0.1877 0.1253
CAST/EiJ both 0.0935 0.0154 0.1247 0.0623
CC012/Geni both 0.0559 0.0112 0.0787 0.0331
DONNELL_HA both 0.2966 0.0141 0.3251 0.2681
LAT_HD both 0.0682 0.0129 0.0944 0.0421
NOD/ShiLtJ both 0.061 0.0154 0.0922 0.0298
NZO/HlLtJ both 0.3797 0.0154 0.411 0.3485
PEF_EC both 0.1937 0.0126 0.2192 0.1682
PWK/PhJ both 0.1302 0.0154 0.1615 0.099
WSB/EiJ both 0.0455 0.0154 0.0767 0.0143
XEB2_AG both 0.053 0.0126 0.0785 0.0275




GWAS analysis not available: Strain panel must be either Inbred, HMDP, BXD, BXH, CXB, or AXB/BXA