Project measure / variable:   Crusio1   attack_combine

ID, description, units MPD:62044   attack_combine   whether an animal attacks (0=not either day, 1=yes on one or both days)   [score]  
Data set, strains Crusio1   BXD w/par   54 strains     sex: m     age: 12-16wks
Procedure behavior observation
Ontology mappings

  •   Or, add this measure to your collection.
       
  •     no folder
  •     put it in new folder  

  STRAIN COMPARISON PLOT
Dimensions Width:   px    Height:   px
Download Plot   
Visualization Options

Crusio1 - whether an animal attacks (0=not either day, 1=yes on one or both days)



  MEASURE SUMMARY
Measure Summary Male
Number of strains tested54 strains
Mean of the strain means0.46734   score
Median of the strain means0.42222   score
SD of the strain means± 0.30149
Coefficient of variation (CV)0.6451
Min–max range of strain means0.0   –   1.0   score
Mean sample size per strain8.0   mice


  ANOVA, Q-Q NORMALITY ASSESSMENT
ANOVA summary      
FactorDFSum of squaresMean sum of squaresF valuep value (Pr>F)
strain 51 29.1844 0.5722 2.8378 < 0.0001
Residuals 378 76.2226 0.2016


Q-Q normality assessment based on residuals

  


  STRAIN MEANS (UNADJUSTED)
  
Select table page:
Strain Sex Mean SD N mice SEM CV Min, Max Z score
BXD100 m 0.7 0.48305   10 0.15275 0.6901 0.77
BXD101 m 0.66667 0.5164   6 0.21082 0.7746 0.66
BXD102 m 0.2 0.42164   10 0.13333 2.1082 -0.89
BXD11 m 0.85714 0.37796   7 0.14286 0.441 1.29
BXD13 m 0.5 0.52705   10 0.16667 1.0541 0.11
BXD14 m 0.8 0.42164   10 0.13333 0.527 1.1
BXD15 m 0.3 0.48305   10 0.15275 1.6102 -0.56
BXD16 m 0.66667 0.5164   6 0.21082 0.7746 0.66
BXD18 m 1.0 0.0   2   0.0 0.0 1.0, 1.0 1.77
BXD19 m 1.0 0.0   2   0.0 0.0 1.0, 1.0 1.77
BXD2 m 0.25 0.46291   8 0.16366 1.8516 -0.72
BXD21 m 0.33333 0.5   9 0.16667 1.5 -0.44
BXD27 m 0.77778 0.44096   9 0.14699 0.5669 1.03
BXD28 m 0.5 0.52705   10 0.16667 1.0541 0.11
BXD31 m 0.66667 0.5   9 0.16667 0.75 0.66
BXD32 m 0.33333 0.5   9 0.16667 1.5 -0.44
BXD33 m 1.0 0.0   1   0.0 0.0 1.0, 1.0 1.77
BXD34 m 1.0 0.0   1   0.0 0.0 1.0, 1.0 1.77
BXD39 m 0.25 0.46291   8 0.16366 1.8516 -0.72
BXD40 m 0.25 0.46291   8 0.16366 1.8516 -0.72
BXD42 m 0.4 0.5164   10 0.1633 1.291 -0.22
BXD43 m 0.625 0.51755   8 0.18298 0.8281 0.52
BXD44 m 0.6 0.5164   10 0.1633 0.8607 0.44
BXD48 m 0.7 0.48305   10 0.15275 0.6901 0.77
BXD49 m 0.2 0.42164   10 0.13333 2.1082 -0.89
BXD50 m 0.4 0.5164   10 0.1633 1.291 -0.22
BXD51 m 0.3 0.48305   10 0.15275 1.6102 -0.56
BXD6 m 0.2 0.42164   10 0.13333 2.1082 -0.89
BXD61 m 0.0 0.0   9 0.0 None -1.55
BXD62 m 0.4 0.5164   10 0.1633 1.291 -0.22
BXD65 m 0.0 0.0   10 0.0 None -1.55
BXD66 m 0.0 0.0   4 0.0 None -1.55
BXD68 m 0.16667 0.40825   6 0.16667 2.4495 -1.0
BXD69 m 0.25 0.46291   8 0.16366 1.8516 -0.72
BXD70 m 0.5 0.52705   10 0.16667 1.0541 0.11
BXD71 m 1.0 0.0   2   0.0 0.0 1.0, 1.0 1.77
BXD73 m 0.44444 0.52705   9 0.17568 1.1859 -0.08
BXD75 m 0.2 0.42164   10 0.13333 2.1082 -0.89
BXD77 m 0.25 0.5   4 0.25 2.0 -0.72
BXD8 m 0.4 0.5164   10 0.1633 1.291 -0.22
BXD80 m 0.88889 0.33333   9 0.11111 0.375 1.4
BXD81 m 0.6 0.5164   10 0.1633 0.8607 0.44
BXD84 m 0.6 0.5164   10 0.1633 0.8607 0.44
BXD85 m 0.25 0.5   4 0.25 2.0 -0.72
BXD86 m 0.1 0.31623   10 0.1 3.1623 -1.22
BXD87 m 0.2 0.42164   10 0.13333 2.1082 -0.89
BXD89 m 0.0 0.0   10 0.0 None -1.55
BXD90 m 0.0 0.0   4 0.0 None -1.55
BXD92 m 0.66667 0.57735   3 0.33333 0.866 0.66
BXD96 m 1.0 0.0   10 0.0 0.0 1.0, 1.0 1.77
BXD97 m 0.7 0.48305   10 0.15275 0.6901 0.77
BXD98 m 0.14286 0.37796   7 0.14286 2.6458 -1.08
C57BL/6J m 0.5 0.52705   10 0.16667 1.0541 0.11
DBA/2J m 0.5 0.52705   10 0.16667 1.0541 0.11


  LEAST SQUARES MEANS (MODEL-ADJUSTED)
Strain Sex Mean SEM UpperCL LowerCL
BXD100 m 0.7 0.142 0.9792 0.4208
BXD101 m 0.6667 0.1833 1.0271 0.3062
BXD102 m 0.2 0.142 0.4792 -0.0792
BXD11 m 0.8571 0.1697 1.1909 0.5234
BXD13 m 0.5 0.142 0.7792 0.2208
BXD14 m 0.8 0.142 1.0792 0.5208
BXD15 m 0.3 0.142 0.5792 0.0208
BXD16 m 0.6667 0.1833 1.0271 0.3062
BXD18 m 1.0 0.3175 1.6243 0.3757
BXD19 m 1.0 0.3175 1.6243 0.3757
BXD2 m 0.25 0.1588 0.5622 -0.0622
BXD21 m 0.3333 0.1497 0.6277 0.039
BXD27 m 0.7778 0.1497 1.0721 0.4835
BXD28 m 0.5 0.142 0.7792 0.2208
BXD31 m 0.6667 0.1497 0.961 0.3723
BXD32 m 0.3333 0.1497 0.6277 0.039
BXD39 m 0.25 0.1588 0.5622 -0.0622
BXD40 m 0.25 0.1588 0.5622 -0.0622
BXD42 m 0.4 0.142 0.6792 0.1208
BXD43 m 0.625 0.1588 0.9372 0.3128
BXD44 m 0.6 0.142 0.8792 0.3208
BXD48 m 0.7 0.142 0.9792 0.4208
BXD49 m 0.2 0.142 0.4792 -0.0792
BXD50 m 0.4 0.142 0.6792 0.1208
BXD51 m 0.3 0.142 0.5792 0.0208
BXD6 m 0.2 0.142 0.4792 -0.0792
BXD61 m 0.0 0.1497 0.2943 -0.2943
BXD62 m 0.4 0.142 0.6792 0.1208
BXD65 m 0.0 0.142 0.2792 -0.2792
BXD66 m 0.0 0.2245 0.4415 -0.4415
BXD68 m 0.1667 0.1833 0.5271 -0.1938
BXD69 m 0.25 0.1588 0.5622 -0.0622
BXD70 m 0.5 0.142 0.7792 0.2208
BXD71 m 1.0 0.3175 1.6243 0.3757
BXD73 m 0.4444 0.1497 0.7388 0.1501
BXD75 m 0.2 0.142 0.4792 -0.0792
BXD77 m 0.25 0.2245 0.6915 -0.1915
BXD8 m 0.4 0.142 0.6792 0.1208
BXD80 m 0.8889 0.1497 1.1832 0.5946
BXD81 m 0.6 0.142 0.8792 0.3208
BXD84 m 0.6 0.142 0.8792 0.3208
BXD85 m 0.25 0.2245 0.6915 -0.1915
BXD86 m 0.1 0.142 0.3792 -0.1792
BXD87 m 0.2 0.142 0.4792 -0.0792
BXD89 m 0.0 0.142 0.2792 -0.2792
BXD90 m 0.0 0.2245 0.4415 -0.4415
BXD92 m 0.6667 0.2593 1.1764 0.1569
BXD96 m 1.0 0.142 1.2792 0.7208
BXD97 m 0.7 0.142 0.9792 0.4208
BXD98 m 0.1429 0.1697 0.4766 -0.1909
C57BL/6J m 0.5 0.142 0.7792 0.2208
DBA/2J m 0.5 0.142 0.7792 0.2208




  GWAS USING LINEAR MIXED MODELS