Project measure / variable:   Crusio1   num_arms_adj_d3_d5

ID, description, units MPD:62029   num_arms_adj_d3_d5   number of different arms visited during first 8 arm choices of a trial minus 5.3 (number expected by chance)   [n]  mean  
Data set, strains Crusio1   BXD w/par   55 strains     sex: both     age: 10-13wks
Procedure radial maze
Ontology mappings

  •   Or, add this measure to your collection.
       
  •     no folder
  •     put it in new folder  

  STRAIN COMPARISON PLOT
Dimensions Width:   px    Height:   px
Download Plot   
Visualization Options

Crusio1 - number of different arms visited during first 8 arm choices of a trial minus 5.3 (number expected by chance) mean



  MEASURE SUMMARY
Measure Summary FemaleMale
Number of strains tested54 strains55 strains
Mean of the strain means0.49259   n 0.51819   n
Median of the strain means0.53333   n 0.5   n
SD of the strain means± 0.29259 ± 0.2535
Coefficient of variation (CV)0.594 0.4892
Min–max range of strain means-0.3   –   1.3667   n -0.09167   –   1.0333   n
Mean sample size per strain8.3   mice 8.4   mice


  ANOVA, Q-Q NORMALITY ASSESSMENT
ANOVA summary      
FactorDFSum of squaresMean sum of squaresF valuep value (Pr>F)
sex 1 0.0583 0.0583 0.1873 0.6653
strain 51 41.1465 0.8068 2.5914 < 0.0001
sex:strain 51 13.594 0.2665 0.8561 0.7525
Residuals 796 247.8276 0.3113


Q-Q normality assessment based on residuals

  


  STRAIN MEANS (UNADJUSTED)
  
Select table page:
Strain Sex Mean SD N mice SEM CV Min, Max Z score
BXD1 f 0.7 0.4714   2   0.33333 0.6734 0.366666667, 1.033333333 0.71
BXD1 m 0.2 0.70711   2   0.5 3.5355 -0.3, 0.7 -1.26
BXD100 f 0.7 0.52116   10 0.1648 0.7445 -0.3, 1.366666667 0.71
BXD100 m 1.0333 0.56656   10 0.17916 0.5483 0.033333333, 2.033333333 2.03
BXD101 f 0.53333 0.62361   6 0.25459 1.1693 0.033333333, 1.7 0.14
BXD101 m 0.28333 0.46291   8 0.16366 1.6338 -0.633333333, 0.7 -0.93
BXD102 f 0.16667 0.61262   10 0.19373 3.6757 -0.633333333, 1.033333333 -1.11
BXD102 m -0.03333 0.43885   10 0.13878 -13.1656 -0.633333333, 0.7 -2.18
BXD11 f 0.66667 0.45677   10 0.14444 0.6852 0.033333333, 1.366666667 0.59
BXD11 m 0.83333 0.42164   10 0.13333 0.506 0.033333333, 1.366666667 1.24
BXD13 f 0.4 0.55444   10 0.17533 1.3861 -0.633333333, 1.033333333 -0.32
BXD13 m 0.56667 0.50185   10 0.1587 0.8856 -0.3, 1.033333333 0.19
BXD14 f 0.7 0.54433   10 0.17213 0.7776 0.033333333, 1.366666667 0.71
BXD14 m 0.43333 0.53978   10 0.17069 1.2456 0.033333333, 1.7 -0.33
BXD15 f 0.66667 0.67495   10 0.21344 1.0124 -0.633333333, 1.7 0.59
BXD15 m 0.63333 0.46614   10 0.14741 0.736 0.033333333, 1.7 0.45
BXD16 f 0.03333 0.73703   10 0.23307 22.1108 -0.633333333, 1.366666667 -1.57
BXD16 m 0.6 0.64884   10 0.20518 1.0814 -0.633333333, 1.7 0.32
BXD18 f -0.3 0.0   1   0.0 0.0 -0.3, -0.3 -2.71
BXD18 m 0.53333 0.70711   2   0.5 1.3258 0.033333333, 1.033333333 0.06
BXD19 f 0.36667 0.4714   2   0.33333 1.2856 0.033333333, 0.7 -0.43
BXD19 m 0.7 0.0   2   0.0 0.0 0.7, 0.7 0.72
BXD2 f 0.03333 0.72008   10 0.22771 21.6025 -0.966666667, 1.033333333 -1.57
BXD2 m -0.03333 0.40976   10 0.12958 -12.2927 -0.633333333, 0.7 -2.18
BXD21 f -0.16667 0.54885   10 0.17356 -3.2931 -0.966666667, 0.7 -2.25
BXD21 m -0.09167 0.90742   8 0.32082 -9.8991 -1.966666667, 0.7 -2.41
BXD27 f 0.4 0.67495   10 0.21344 1.6874 -0.966666667, 1.366666667 -0.32
BXD27 m 0.43333 0.60451   10 0.19116 1.395 -0.633333333, 1.366666667 -0.33
BXD28 f 0.56667 0.67036   10 0.21199 1.183 -0.966666667, 1.366666667 0.25
BXD28 m 0.4 0.693   10 0.21915 1.7325 -0.633333333, 1.366666667 -0.47
BXD31 f 0.66667 0.39907   10 0.1262 0.5986 0.033333333, 1.366666667 0.59
BXD31 m 0.5 0.80431   10 0.25434 1.6086 -0.633333333, 2.033333333 -0.07
BXD32 f 0.4 0.24595   10 0.07778 0.6149 0.033333333, 0.7 -0.32
BXD32 m 0.36667 0.4969   10 0.15713 1.3552 -0.633333333, 1.033333333 -0.6
BXD33 f -0.3 0.0   1   0.0 0.0 -0.3, -0.3 -2.71
BXD33 m 0.36667 0.0   1   0.0 0.0 0.366666667, 0.366666667 -0.6
BXD34 f 1.3667 0.4714   2   0.33333 0.3449 1.033333333, 1.7 2.99
BXD34 m 0.36667 1.4142   2   1.0 3.8569 -0.633333333, 1.366666667 -0.6
BXD39 f 0.53333 0.45134   10 0.14272 0.8463 -0.3, 1.366666667 0.14
BXD39 m 0.5 0.42164   10 0.13333 0.8433 -0.3, 1.033333333 -0.07
BXD40 f 0.76667 0.58373   10 0.18459 0.7614 0.033333333, 2.033333333 0.94
BXD40 m 0.4 0.63732   10 0.20154 1.5933 -0.966666667, 1.366666667 -0.47
BXD42 f 0.33333 0.72776   10 0.23014 2.1833 -0.966666667, 1.033333333 -0.54
BXD42 m 0.5 0.54885   10 0.17356 1.0977 -0.3, 1.366666667 -0.07
BXD43 f 0.43333 0.58373   10 0.18459 1.3471 -0.633333333, 1.366666667 -0.2
BXD43 m 0.46667 0.81725   10 0.25844 1.7513 -0.633333333, 2.033333333 -0.2
BXD44 f 0.6 0.58899   10 0.18626 0.9817 -0.633333333, 1.7 0.37
BXD44 m 1.0 0.45677   10 0.14444 0.4568 0.366666667, 1.7 1.9
BXD48 f 0.63333 0.53978   10 0.17069 0.8523 0.033333333, 1.7 0.48
BXD48 m 0.63333 0.34427   10 0.10887 0.5436 0.366666667, 1.366666667 0.45
BXD49 f 0.7 0.52116   10 0.1648 0.7445 -0.3, 1.366666667 0.71
BXD49 m 0.83333 0.68853   10 0.21773 0.8262 -0.633333333, 1.7 1.24
BXD50 f 0.4 0.45677   10 0.14444 1.1419 -0.3, 1.366666667 -0.32
BXD50 m 0.5 0.68853   10 0.21773 1.3771 -0.966666667, 1.366666667 -0.07
BXD51 f 0.7 0.44444   10 0.14055 0.6349 0.033333333, 1.366666667 0.71
BXD51 m 0.83333 0.32203   10 0.10184 0.3864 0.366666667, 1.366666667 1.24
BXD6 f 0.5 0.47661   10 0.15072 0.9532 -0.3, 1.033333333 0.03
BXD6 m 0.6 0.49814   10 0.15753 0.8302 -0.3, 1.7 0.32
BXD61 f 0.6 0.56765   10 0.17951 0.9461 -0.3, 1.366666667 0.37
BXD61 m 0.63333 0.6246   10 0.19752 0.9862 -0.633333333, 1.366666667 0.45
BXD62 f 0.5 0.42164   10 0.13333 0.8433 0.033333333, 1.033333333 0.03
BXD62 m 0.93333 0.60959   10 0.19277 0.6531 0.033333333, 2.033333333 1.64
BXD65 f 0.53333 0.27889   6 0.11386 0.5229 0.366666667, 1.033333333 0.14
BXD65 m 0.66667 0.50796   10 0.16063 0.7619 -0.3, 1.366666667 0.59
BXD66 f 0.7 0.27217   4 0.13608 0.3888 0.366666667, 1.033333333 0.71
BXD66 m 0.61667 0.31914   4 0.15957 0.5175 0.366666667, 1.033333333 0.39
BXD68 f 0.45 0.83333   4 0.41667 1.8519 -0.633333333, 1.366666667 -0.15
BXD68 m 0.86667 0.96032   6 0.39205 1.1081 -0.966666667, 1.7 1.37
BXD69 f 0.43333 0.68132   10 0.21545 1.5723 -0.633333333, 1.033333333 -0.2
BXD69 m 0.3 0.58373   10 0.18459 1.9458 -0.633333333, 1.366666667 -0.86
BXD70 f 0.13333 0.47271   10 0.14948 3.5453 -0.3, 0.7 -1.23
BXD70 m 0.36667 0.44444   10 0.14055 1.2121 -0.633333333, 1.033333333 -0.6
BXD71 m 0.86667 0.2357   2   0.16667 0.272 0.7, 1.033333333 1.37
BXD73 f 0.6 0.56765   10 0.17951 0.9461 0.033333333, 1.366666667 0.37
BXD73 m 0.46667 0.56765   10 0.17951 1.2164 -0.3, 1.7 -0.2
BXD75 f 0.53333 0.68943   10 0.21802 1.2927 -0.633333333, 1.366666667 0.14
BXD75 m 0.5 0.44997   10 0.14229 0.8999 0.033333333, 1.366666667 -0.07
BXD77 f 0.28333 0.31914   4 0.15957 1.1264 0.033333333, 0.7 -0.72
BXD77 m 0.61667 0.68718   4 0.34359 1.1144 -0.3, 1.366666667 0.39
BXD8 f 1.0333 0.44444   10 0.14055 0.4301 0.366666667, 1.7 1.85
BXD8 m 0.73333 0.33148   10 0.10482 0.452 0.033333333, 1.033333333 0.85
BXD80 f 0.46667 0.56765   10 0.17951 1.2164 -0.633333333, 1.033333333 -0.09
BXD80 m 9.999997496734636e-11 0.76093   10 0.24063 7609287979.9638 -0.966666667, 1.366666667 -2.04
BXD81 f 0.7 0.68493   10 0.2166 0.9785 -0.3, 1.7 0.71
BXD81 m 0.26667 0.47271   10 0.14948 1.7727 -0.633333333, 0.7 -0.99
BXD84 f 0.56667 0.50185   10 0.1587 0.8856 -0.3, 1.366666667 0.25
BXD84 m 0.8 0.54546   10 0.17249 0.6818 -0.3, 1.366666667 1.11
BXD85 f 0.7 0.3849   4 0.19245 0.5499 0.366666667, 1.033333333 0.71
BXD85 m 0.45 0.5   4 0.25 1.1111 0.033333333, 1.033333333 -0.27
BXD86 f 0.63333 0.6246   10 0.19752 0.9862 0.033333333, 1.7 0.48
BXD86 m 0.43333 0.53978   10 0.17069 1.2456 0.033333333, 1.7 -0.33
BXD87 f 0.96667 0.34427   10 0.10887 0.3561 0.366666667, 1.366666667 1.62
BXD87 m 0.8 0.81725   10 0.25844 1.0216 -0.966666667, 1.7 1.11
BXD89 f 0.43333 0.40976   10 0.12958 0.9456 0.033333333, 1.366666667 -0.2
BXD89 m 0.53333 0.45134   10 0.14272 0.8463 -0.3, 1.366666667 0.06
BXD90 f 0.36667 0.4714   6 0.19245 1.2856 -0.3, 1.033333333 -0.43
BXD90 m 0.42222 0.71233   6 0.29081 1.6871 -0.3, 1.7 -0.38
BXD92 f 0.7 0.4714   2   0.33333 0.6734 0.366666667, 1.033333333 0.71
BXD92 m 0.25556 0.19245   3 0.11111 0.7531 0.033333333, 0.366666667 -1.04
BXD96 f 0.43333 0.43885   10 0.13878 1.0127 -0.3, 1.033333333 -0.2
BXD96 m 0.43333 0.5164   10 0.1633 1.1917 -0.633333333, 1.366666667 -0.33
BXD97 f 0.36667 0.56656   10 0.17916 1.5452 -0.3, 1.366666667 -0.43
BXD97 m 0.73333 0.45677   10 0.14444 0.6229 0.033333333, 1.366666667 0.85
BXD98 f 0.58889 0.54433   6 0.22222 0.9243 0.033333333, 1.366666667 0.33
BXD98 m 0.74762 0.52453   7 0.19825 0.7016 0.033333333, 1.366666667 0.91
C57BL/6J f 0.47778 0.50185   6 0.20488 1.0504 0.033333333, 1.033333333 -0.05
C57BL/6J m 0.26667 0.35312   10 0.11167 1.3242 -0.3, 1.033333333 -0.99
DBA/2J f 0.2 0.4231   10 0.1338 2.1155 -0.633333333, 0.7 -1.0
DBA/2J m 0.43333 0.30631   10 0.09686 0.7069 0.033333333, 1.033333333 -0.33


  LEAST SQUARES MEANS (MODEL-ADJUSTED)
Strain Sex Mean SEM UpperCL LowerCL
BXD1 f 0.7 0.3946 1.4745 -0.0745
BXD1 m 0.2 0.3946 0.9745 -0.5745
BXD100 f 0.7 0.1764 1.0464 0.3536
BXD100 m 1.0333 0.1764 1.3797 0.687
BXD101 f 0.5333 0.2278 0.9805 0.0862
BXD101 m 0.2833 0.1973 0.6706 -0.1039
BXD102 f 0.1667 0.1764 0.513 -0.1797
BXD102 m -0.0333 0.1764 0.313 -0.3797
BXD11 f 0.6667 0.1764 1.013 0.3203
BXD11 m 0.8333 0.1764 1.1797 0.487
BXD13 f 0.4 0.1764 0.7464 0.0536
BXD13 m 0.5667 0.1764 0.913 0.2203
BXD14 f 0.7 0.1764 1.0464 0.3536
BXD14 m 0.4333 0.1764 0.7797 0.087
BXD15 f 0.6667 0.1764 1.013 0.3203
BXD15 m 0.6333 0.1764 0.9797 0.287
BXD16 f 0.0333 0.1764 0.3797 -0.313
BXD16 m 0.6 0.1764 0.9464 0.2536
BXD19 f 0.3667 0.3946 1.1412 -0.4078
BXD19 m 0.7 0.3946 1.4745 -0.0745
BXD2 f 0.0333 0.1764 0.3797 -0.313
BXD2 m -0.0333 0.1764 0.313 -0.3797
BXD21 f -0.1667 0.1764 0.1797 -0.513
BXD21 m -0.0917 0.1973 0.2956 -0.4789
BXD27 f 0.4 0.1764 0.7464 0.0536
BXD27 m 0.4333 0.1764 0.7797 0.087
BXD28 f 0.5667 0.1764 0.913 0.2203
BXD28 m 0.4 0.1764 0.7464 0.0536
BXD31 f 0.6667 0.1764 1.013 0.3203
BXD31 m 0.5 0.1764 0.8464 0.1536
BXD32 f 0.4 0.1764 0.7464 0.0536
BXD32 m 0.3667 0.1764 0.713 0.0203
BXD34 f 1.3667 0.3946 2.1412 0.5922
BXD34 m 0.3667 0.3946 1.1412 -0.4078
BXD39 f 0.5333 0.1764 0.8797 0.187
BXD39 m 0.5 0.1764 0.8464 0.1536
BXD40 f 0.7667 0.1764 1.113 0.4203
BXD40 m 0.4 0.1764 0.7464 0.0536
BXD42 f 0.3333 0.1764 0.6797 -0.013
BXD42 m 0.5 0.1764 0.8464 0.1536
BXD43 f 0.4333 0.1764 0.7797 0.087
BXD43 m 0.4667 0.1764 0.813 0.1203
BXD44 f 0.6 0.1764 0.9464 0.2536
BXD44 m 1.0 0.1764 1.3464 0.6536
BXD48 f 0.6333 0.1764 0.9797 0.287
BXD48 m 0.6333 0.1764 0.9797 0.287
BXD49 f 0.7 0.1764 1.0464 0.3536
BXD49 m 0.8333 0.1764 1.1797 0.487
BXD50 f 0.4 0.1764 0.7464 0.0536
BXD50 m 0.5 0.1764 0.8464 0.1536
BXD51 f 0.7 0.1764 1.0464 0.3536
BXD51 m 0.8333 0.1764 1.1797 0.487
BXD6 f 0.5 0.1764 0.8464 0.1536
BXD6 m 0.6 0.1764 0.9464 0.2536
BXD61 f 0.6 0.1764 0.9464 0.2536
BXD61 m 0.6333 0.1764 0.9797 0.287
BXD62 f 0.5 0.1764 0.8464 0.1536
BXD62 m 0.9333 0.1764 1.2797 0.587
BXD65 f 0.5333 0.2278 0.9805 0.0862
BXD65 m 0.6667 0.1764 1.013 0.3203
BXD66 f 0.7 0.279 1.2476 0.1524
BXD66 m 0.6167 0.279 1.1643 0.069
BXD68 f 0.45 0.279 0.9976 -0.0976
BXD68 m 0.8667 0.2278 1.3138 0.4195
BXD69 f 0.4333 0.1764 0.7797 0.087
BXD69 m 0.3 0.1764 0.6464 -0.0464
BXD70 f 0.1333 0.1764 0.4797 -0.213
BXD70 m 0.3667 0.1764 0.713 0.0203
BXD73 f 0.6 0.1764 0.9464 0.2536
BXD73 m 0.4667 0.1764 0.813 0.1203
BXD75 f 0.5333 0.1764 0.8797 0.187
BXD75 m 0.5 0.1764 0.8464 0.1536
BXD77 f 0.2833 0.279 0.831 -0.2643
BXD77 m 0.6167 0.279 1.1643 0.069
BXD8 f 1.0333 0.1764 1.3797 0.687
BXD8 m 0.7333 0.1764 1.0797 0.387
BXD80 f 0.4667 0.1764 0.813 0.1203
BXD80 m 1e-10 0.1764 0.3464 -0.3464
BXD81 f 0.7 0.1764 1.0464 0.3536
BXD81 m 0.2667 0.1764 0.613 -0.0797
BXD84 f 0.5667 0.1764 0.913 0.2203
BXD84 m 0.8 0.1764 1.1464 0.4536
BXD85 f 0.7 0.279 1.2476 0.1524
BXD85 m 0.45 0.279 0.9976 -0.0976
BXD86 f 0.6333 0.1764 0.9797 0.287
BXD86 m 0.4333 0.1764 0.7797 0.087
BXD87 f 0.9667 0.1764 1.313 0.6203
BXD87 m 0.8 0.1764 1.1464 0.4536
BXD89 f 0.4333 0.1764 0.7797 0.087
BXD89 m 0.5333 0.1764 0.8797 0.187
BXD90 f 0.3667 0.2278 0.8138 -0.0805
BXD90 m 0.4222 0.2278 0.8694 -0.0249
BXD92 f 0.7 0.3946 1.4745 -0.0745
BXD92 m 0.2556 0.3221 0.8879 -0.3768
BXD96 f 0.4333 0.1764 0.7797 0.087
BXD96 m 0.4333 0.1764 0.7797 0.087
BXD97 f 0.3667 0.1764 0.713 0.0203
BXD97 m 0.7333 0.1764 1.0797 0.387
BXD98 f 0.5889 0.2278 1.036 0.1417
BXD98 m 0.7476 0.2109 1.1616 0.3336
C57BL/6J f 0.4778 0.2278 0.9249 0.0306
C57BL/6J m 0.2667 0.1764 0.613 -0.0797
DBA/2J f 0.2 0.1764 0.5464 -0.1464
DBA/2J m 0.4333 0.1764 0.7797 0.087


  LEAST SQUARES MEANS (MODEL-ADJUSTED), SEXES COMBINED
Strain Sex Mean SEM UpperCL LowerCL
BXD1 both 0.45 0.279 0.9976 -0.0976
BXD100 both 0.8667 0.1248 1.1116 0.6218
BXD101 both 0.4083 0.1507 0.7041 0.1126
BXD102 both 0.0667 0.1248 0.3116 -0.1782
BXD11 both 0.75 0.1248 0.9949 0.5051
BXD13 both 0.4833 0.1248 0.7282 0.2384
BXD14 both 0.5667 0.1248 0.8116 0.3218
BXD15 both 0.65 0.1248 0.8949 0.4051
BXD16 both 0.3167 0.1248 0.5616 0.0718
BXD19 both 0.5333 0.279 1.081 -0.0143
BXD2 both 0.0 0.1248 0.2449 -0.2449
BXD21 both -0.1292 0.1323 0.1306 -0.3889
BXD27 both 0.4167 0.1248 0.6616 0.1718
BXD28 both 0.4833 0.1248 0.7282 0.2384
BXD31 both 0.5833 0.1248 0.8282 0.3384
BXD32 both 0.3833 0.1248 0.6282 0.1384
BXD34 both 0.8667 0.279 1.4143 0.319
BXD39 both 0.5167 0.1248 0.7616 0.2718
BXD40 both 0.5833 0.1248 0.8282 0.3384
BXD42 both 0.4167 0.1248 0.6616 0.1718
BXD43 both 0.45 0.1248 0.6949 0.2051
BXD44 both 0.8 0.1248 1.0449 0.5551
BXD48 both 0.6333 0.1248 0.8782 0.3884
BXD49 both 0.7667 0.1248 1.0116 0.5218
BXD50 both 0.45 0.1248 0.6949 0.2051
BXD51 both 0.7667 0.1248 1.0116 0.5218
BXD6 both 0.55 0.1248 0.7949 0.3051
BXD61 both 0.6167 0.1248 0.8616 0.3718
BXD62 both 0.7167 0.1248 0.9616 0.4718
BXD65 both 0.6 0.1441 0.8828 0.3172
BXD66 both 0.6583 0.1973 1.0456 0.2711
BXD68 both 0.6583 0.1801 1.0118 0.3048
BXD69 both 0.3667 0.1248 0.6116 0.1218
BXD70 both 0.25 0.1248 0.4949 0.0051
BXD73 both 0.5333 0.1248 0.7782 0.2884
BXD75 both 0.5167 0.1248 0.7616 0.2718
BXD77 both 0.45 0.1973 0.8372 0.0628
BXD8 both 0.8833 0.1248 1.1282 0.6384
BXD80 both 0.2333 0.1248 0.4782 -0.0116
BXD81 both 0.4833 0.1248 0.7282 0.2384
BXD84 both 0.6833 0.1248 0.9282 0.4384
BXD85 both 0.575 0.1973 0.9622 0.1878
BXD86 both 0.5333 0.1248 0.7782 0.2884
BXD87 both 0.8833 0.1248 1.1282 0.6384
BXD89 both 0.4833 0.1248 0.7282 0.2384
BXD90 both 0.3944 0.1611 0.7106 0.0783
BXD92 both 0.4778 0.2547 0.9777 -0.0221
BXD96 both 0.4333 0.1248 0.6782 0.1884
BXD97 both 0.55 0.1248 0.7949 0.3051
BXD98 both 0.6683 0.1552 0.9729 0.3636
C57BL/6J both 0.3722 0.1441 0.655 0.0894
DBA/2J both 0.3167 0.1248 0.5616 0.0718




  GWAS USING LINEAR MIXED MODELS