Project measure / variable:   CSNA01   VR2rate

ID, description, units MPD:60219   VR2rate   variable ratio 2 (VR2), lever press rate, 8 h test   [n]  across 3 days  
sucrose study
Data set, strains CSNA01   HMDP   91 strains     sex: m     age: 7-22wks
Procedure operant conditioning chamber
Ontology mappings

  •   Or, add this measure to your collection.
       
  •     no folder
  •     put it in new folder  

  STRAIN COMPARISON PLOT
Dimensions Width:   px    Height:   px
Download Plot   
Visualization Options

CSNA01 - variable ratio 2 (VR2), lever press rate, 8 h test across 3 days



  MEASURE SUMMARY
Measure Summary Male
Number of strains tested91 strains
Mean of the strain means0.0545   n
Median of the strain means0.0358   n
SD of the strain means± 0.0541
Coefficient of variation (CV)0.992
Min–max range of strain means0   –   0.233   n
Mean sample size per strain3.5   mice


  ANOVA, Q-Q NORMALITY ASSESSMENT
ANOVA summary      
FactorDFSum of squaresMean sum of squaresF valuep value (Pr>F)
strain 86 0.8385 0.0097 4.1584 < 0.0001
Residuals 230 0.5392 0.0023


Q-Q normality assessment based on residuals

  


  STRAIN MEANS (UNADJUSTED)
  
Select table page:
Strain Sex Mean SD N mice SEM CV Min, Max Z score
129S1/SvImJ m 0.0 0.0   2   0.0 0.0 -1.01
129X1/SvJ m 0.0 0.0   5 0.0 0.0 -1.01
A/J m 0.0563 0.0371   5 0.0166 0.659 0.0218, 0.111 0.03
AKR/J m 0.0197 0.0105   2   0.0074 0.531 0.0123, 0.0271 -0.64
AXB15/PgnJ m 0.0 0.0   2   0.0 0.0 -1.01
AXB19a/PgnJ m 0.0 0.0   2   0.0 0.0 -1.01
AXB1/PgnJ m 0.0259 0.0263   3 0.0152 1.02 0.00427, 0.0552 -0.53
AXB23/PgnJ m 0.0 0.0   2   0.0 0.0 -1.01
AXB6/PgnJ m 0.0402 0.0   1   0.0 0.0 0.0402, 0.0402 -0.27
AXB8/PgnJ m 0.006 0.0104   3 0.006 1.73 -0.9
BALB/cByJ m 0.145 0.0575   6 0.0235 0.397 0.0678, 0.228 1.67
BALB/cJ m 0.177 0.0978   7 0.037 0.553 0.0227, 0.336 2.26
BPL/1J m 0.0467 0.0339   5 0.0152 0.726 -0.14
BTBR T+ Itpr3tf/J m 0.0216 0.0432   4 0.0216 2.0 -0.61
BUB/BnJ m 0.108 0.0173   2   0.0123 0.161 0.0955, 0.12 0.99
BXA13/PgnJ m 0.233 0.0198   2   0.014 0.085 0.219, 0.247 3.3
BXA14/PgnJ m 0.00631 0.00786   5 0.00352 1.25 -0.89
BXA16/PgnJ m 0.00378 0.00755   4 0.00377 2.0 -0.94
BXA25/PgnJ m 0.0 0.0   4 0.0 0.0 -1.01
BXA4/PgnJ m 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -1.01
BXA7/PgnJ m 0.126 0.0262   3 0.0151 0.207 0.0969, 0.147 1.32
BXD100/RwwJ m 0.0153 0.0203   3 0.0117 1.32 -0.73
BXD1/TyJ m 0.00917 0.0159   3 0.00917 1.73 -0.84
BXD24/TyJ m 0.0287 0.0243   4 0.0122 0.849 0.00321, 0.0575 -0.48
BXD29/Ty m 0.0141 0.0245   4 0.0123 1.74 -0.75
BXD31/TyJ m 0.047 0.0688   6 0.0281 1.46 -0.14
BXD32/TyJ m 0.0433 0.0613   2   0.0433 1.41 -0.21
BXD39/TyJ m 0.0 0.0   5 0.0 0.0 -1.01
BXD40/TyJ m 0.0736 0.0524   4 0.0262 0.713 0.35
BXD42/TyJ m 0.0711 0.0616   11 0.0186 0.866 0.31
BXD48a/RwwJ m 0.101 0.0112   2   0.0079 0.111 0.0932, 0.109 0.86
BXD48/RwwJ m 0.0352 0.0494   5 0.0221 1.4 -0.36
BXD51/RwwJ m 0.0989 0.0499   3 0.0288 0.504 0.0531, 0.152 0.82
BXD60/RwwJ m 0.0297 0.028   7 0.0106 0.942 -0.46
BXD62/RwwJ m 0.0224 0.0157   3 0.00906 0.699 0.00432, 0.0316 -0.59
BXD65/RwwJ m 0.0414 0.0548   6 0.0224 1.32 -0.24
BXD66/RwwJ m 0.00913 0.0158   3 0.00913 1.73 -0.84
BXD68/RwwJ m 0.0288 0.0644   5 0.0288 2.24 -0.48
BXD75/RwwJ m 0.0629 0.0513   6 0.0209 0.816 0.15
BXD77/RwwJ m 0.0146 0.0253   3 0.0146 1.73 -0.74
BXD84/RwwJ m 0.0284 0.0426   4 0.0213 1.5 -0.48
BXD90/RwwJ m 0.0206 0.0291   2   0.0206 1.41 -0.63
BXD95/RwwJ m 0.0425 0.0602   2   0.0425 1.41 -0.22
BXD9/TyJ m 0.0569 0.0127   5 0.00568 0.223 0.0445, 0.0758 0.04
BXH19/TyJ m 0.0126 0.0179   2   0.0126 1.41 -0.78
BXH22/KccJ m 0.00125 0.00354   8 0.00125 2.83 -0.99
BXH4/TyJ m 0.0 0.0   3 0.0 0.0 -1.01
BXH6/TyJ m 0.107 0.0838   3 0.0484 0.78 0.0125, 0.171 0.97
BXH8/TyJ m 0.0345 0.0489   2   0.0345 1.41 -0.37
BXH9/TyJ m 0.0476 0.0211   4 0.0105 0.443 0.022, 0.0736 -0.13
C3HeB/FeJ m 0.0296 0.0419   2   0.0296 1.41 -0.46
C3H/HeJ m 0.0284 0.0449   5 0.0201 1.58 -0.48
C57BL/10J m 0.121 0.0127   2   0.009 0.105 0.112, 0.13 1.23
C57BL/6J m 0.0258 0.0423   9 0.0141 1.64 -0.53
C57BLKS/J m 0.0499 0.0407   2   0.0288 0.816 0.0211, 0.0787 -0.09
C57BR/cdJ m 0.141 0.0719   3 0.0415 0.509 0.0587, 0.19 1.6
C57L/J m 0.0986 0.00615   2   0.00435 0.0624 0.0943, 0.103 0.81
C58/J m 0.0572 0.061   4 0.0305 1.07 0.00525, 0.129 0.05
CAST/EiJ m 0.0159 0.00216   3 0.00125 0.135 0.0144, 0.0184 -0.71
CBA/J m 0.044 0.0657   7 0.0248 1.49 -0.19
CE/J m 0.127 0.0804   2   0.0569 0.632 0.0703, 0.184 1.34
CXB11/HiAJ m 0.0804 0.0382   4 0.0191 0.475 0.0284, 0.12 0.48
CXB1/ByJ m 0.018 0.0336   6 0.0137 1.87 -0.68
CXB8/HiAJ m 0.11 0.0345   2   0.0244 0.315 0.0852, 0.134 1.02
CXB9/HiAJ m 0.182 0.075   2   0.053 0.412 0.129, 0.235 2.36
DBA/1J m 0.0 0.0   2   0.0 0.0 -1.01
DBA/2J m 0.0358 0.0376   5 0.0168 1.05 -0.35
DDY/JclSidSeyFrkJ m 0.0832 0.109   2   0.0768 1.31 0.00636, 0.16 0.53
FVB/NJ m 0.112 0.119   6 0.0487 1.07 1.06
I/LnJ m 0.139 0.0851   5 0.0381 0.612 1.56
ILS/IbgTejJ m 0.0639 0.0322   4 0.0161 0.504 0.0345, 0.102 0.17
KK/HlJ m 0.12 0.0127   2   0.009 0.106 0.111, 0.129 1.21
LG/J m 0.0918 0.0695   4 0.0347 0.757 0.0173, 0.152 0.69
LP/J m 0.0257 0.0364   3 0.021 1.41 -0.53
MA/MyJ m 0.0274 0.0475   3 0.0274 1.73 -0.5
MOLF/EiJ m 0.00396 0.0056   2   0.00396 1.41 -0.93
MRL/MpJ m 0.22 0.0205   2   0.0145 0.0934 0.205, 0.234 3.06
NOD/ShiLtJ m 0.191 0.0622   5 0.0278 0.326 0.135, 0.268 2.52
NON/ShiLtJ m 0.106 0.0182   2   0.0128 0.171 0.0933, 0.119 0.95
NOR/LtJ m 0.136 0.000707   2   0.0005 0.00522 0.135, 0.136 1.51
NZB/BlNJ m 0.0678 0.0668   2   0.0472 0.986 0.0205, 0.115 0.24
NZW/LacJ m 0.0783 0.0704   2   0.0497 0.899 0.0285, 0.128 0.44
P/J m 0.0153 0.00481   2   0.0034 0.314 0.0119, 0.0187 -0.73
PL/J m 0.00845 0.012   2   0.00845 1.41 -0.85
PWD/PhJ m 0.0261 0.0   1   0.0 0.0 0.0261, 0.0261 -0.53
RIIIS/J m 0.04 0.0178   5 0.00795 0.444 0.0131, 0.0585 -0.27
SEA/GnJ m 0.0496 0.028   2   0.0198 0.565 0.0298, 0.0694 -0.09
SJL/J m 0.031 0.0288   5 0.0129 0.929 -0.44
SM/J m 0.0486 0.0235   3 0.0135 0.483 0.0232, 0.0695 -0.11
SWR/J m 0.0 0.0   2   0.0 0.0 -1.01
ZALENDE/EiJ m 0.00074 0.0   1   0.0 0.0 0.00074, 0.00074 -0.99


  LEAST SQUARES MEANS (MODEL-ADJUSTED)
Strain Sex Mean SEM UpperCL LowerCL
129S1/SvImJ m 0.0 0.0342 0.0675 -0.0675
129X1/SvJ m 0.0 0.0217 0.0427 -0.0427
A/J m 0.0563 0.0217 0.0989 0.0136
AKR/J m 0.0197 0.0342 0.0872 -0.0478
AXB15/PgnJ m 0.0 0.0342 0.0675 -0.0675
AXB19a/PgnJ m 0.0 0.0342 0.0675 -0.0675
AXB1/PgnJ m 0.0259 0.028 0.081 -0.0292
AXB23/PgnJ m 0.0 0.0342 0.0675 -0.0675
AXB8/PgnJ m 0.006 0.028 0.0611 -0.0491
BALB/cByJ m 0.1448 0.0198 0.1838 0.1059
BALB/cJ m 0.177 0.0183 0.213 0.1409
BPL/1J m 0.0467 0.0217 0.0893 0.004
BTBR T+ Itpr3tf/J m 0.0216 0.0242 0.0693 -0.0261
BUB/BnJ m 0.1077 0.0342 0.1752 0.0403
BXA13/PgnJ m 0.233 0.0342 0.3005 0.1655
BXA14/PgnJ m 0.0063 0.0217 0.049 -0.0364
BXA16/PgnJ m 0.0038 0.0242 0.0515 -0.0439
BXA25/PgnJ m 0.0 0.0242 0.0477 -0.0477
BXA7/PgnJ m 0.1263 0.028 0.1814 0.0712
BXD100/RwwJ m 0.0153 0.028 0.0704 -0.0398
BXD1/TyJ m 0.0092 0.028 0.0642 -0.0459
BXD24/TyJ m 0.0287 0.0242 0.0764 -0.019
BXD29/Ty m 0.0141 0.0242 0.0618 -0.0336
BXD31/TyJ m 0.047 0.0198 0.086 0.0081
BXD32/TyJ m 0.0434 0.0342 0.1108 -0.0241
BXD39/TyJ m 0.0 0.0217 0.0427 -0.0427
BXD40/TyJ m 0.0735 0.0242 0.1213 0.0258
BXD42/TyJ m 0.0711 0.0146 0.0999 0.0423
BXD48a/RwwJ m 0.1011 0.0342 0.1686 0.0336
BXD48/RwwJ m 0.0352 0.0217 0.0779 -0.0075
BXD51/RwwJ m 0.0989 0.028 0.1539 0.0438
BXD60/RwwJ m 0.0297 0.0183 0.0658 -0.0063
BXD62/RwwJ m 0.0224 0.028 0.0775 -0.0326
BXD65/RwwJ m 0.0414 0.0198 0.0803 0.0024
BXD66/RwwJ m 0.0091 0.028 0.0642 -0.0459
BXD68/RwwJ m 0.0288 0.0217 0.0715 -0.0139
BXD75/RwwJ m 0.0629 0.0198 0.1018 0.0239
BXD77/RwwJ m 0.0146 0.028 0.0697 -0.0405
BXD84/RwwJ m 0.0284 0.0242 0.0761 -0.0193
BXD90/RwwJ m 0.0206 0.0342 0.0881 -0.0469
BXD95/RwwJ m 0.0426 0.0342 0.11 -0.0249
BXD9/TyJ m 0.0569 0.0217 0.0996 0.0143
BXH19/TyJ m 0.0127 0.0342 0.0801 -0.0548
BXH22/KccJ m 0.0013 0.0171 0.035 -0.0325
BXH4/TyJ m 0.0 0.028 0.0551 -0.0551
BXH6/TyJ m 0.1075 0.028 0.1626 0.0524
BXH8/TyJ m 0.0346 0.0342 0.102 -0.0329
BXH9/TyJ m 0.0476 0.0242 0.0953 -0.0001
C3HeB/FeJ m 0.0296 0.0342 0.0971 -0.0379
C3H/HeJ m 0.0284 0.0217 0.071 -0.0143
C57BL/10J m 0.121 0.0342 0.1885 0.0535
C57BL/6J m 0.0258 0.0161 0.0576 -0.006
C57BLKS/J m 0.0499 0.0342 0.1174 -0.0176
C57BR/cdJ m 0.1412 0.028 0.1963 0.0862
C57L/J m 0.0986 0.0342 0.1661 0.0312
C58/J m 0.0572 0.0242 0.1049 0.0095
CAST/EiJ m 0.0159 0.028 0.071 -0.0391
CBA/J m 0.044 0.0183 0.0801 0.0079
CE/J m 0.1271 0.0342 0.1946 0.0597
CXB11/HiAJ m 0.0804 0.0242 0.1281 0.0327
CXB1/ByJ m 0.018 0.0198 0.0569 -0.0209
CXB8/HiAJ m 0.1096 0.0342 0.1771 0.0421
CXB9/HiAJ m 0.182 0.0342 0.2495 0.1145
DBA/1J m 0.0 0.0342 0.0675 -0.0675
DBA/2J m 0.0358 0.0217 0.0784 -0.0069
DDY/JclSidSeyFrkJ m 0.0832 0.0342 0.1506 0.0157
FVB/NJ m 0.1116 0.0198 0.1506 0.0727
I/LnJ m 0.1392 0.0217 0.1819 0.0965
ILS/IbgTejJ m 0.0638 0.0242 0.1116 0.0161
KK/HlJ m 0.12 0.0342 0.1875 0.0525
LG/J m 0.0918 0.0242 0.1395 0.0441
LP/J m 0.0257 0.028 0.0808 -0.0294
MA/MyJ m 0.0274 0.028 0.0825 -0.0277
MOLF/EiJ m 0.004 0.0342 0.0714 -0.0635
MRL/MpJ m 0.2195 0.0342 0.287 0.152
NOD/ShiLtJ m 0.1906 0.0217 0.2333 0.1479
NON/ShiLtJ m 0.1061 0.0342 0.1736 0.0387
NOR/LtJ m 0.1355 0.0342 0.203 0.068
NZB/BlNJ m 0.0677 0.0342 0.1352 0.0003
NZW/LacJ m 0.0783 0.0342 0.1457 0.0108
P/J m 0.0153 0.0342 0.0828 -0.0522
PL/J m 0.0084 0.0342 0.0759 -0.059
RIIIS/J m 0.04 0.0217 0.0827 -0.0026
SEA/GnJ m 0.0496 0.0342 0.1171 -0.0179
SJL/J m 0.031 0.0217 0.0737 -0.0117
SM/J m 0.0486 0.028 0.1036 -0.0065
SWR/J m 0.0 0.0342 0.0675 -0.0675




  GWAS USING LINEAR MIXED MODELS