Phenotype measure:   Harrill2   both_kidney_trt


  STRAIN COMPARISON PLOT
Dimensions Width:   px    Height:   px
Download Plot   
Visualization Options

Harrill2 - kidney (both) weight DB289



  MEASURE SUMMARY
Measure Summary Female
Number of strains tested34 strains
Mean of the strain means0.229   g
Median of the strain means0.212   g
SD of the strain means± 0.0443
Coefficient of variation (CV)0.194
Min–max range of strain means0.160   –   0.390   g
Mean sample size per strain5.0   mice


  ANOVA, Q-Q NORMALITY ASSESSMENT
ANOVA summary      
FactorDFSum of squaresMean sum of squaresF valuep value (Pr>F)
strain 33 0.3231 0.0098 19.1551 < 0.0001
Residuals 134 0.0685 0.0005


Q-Q normality assessment based on residuals

  


  STRAIN MEANS (UNADJUSTED)
Strain Sex Mean SD N mice SEM CV Min, Max Z score
129S1/SvImJ f 0.208 0.0164   5 0.00735 0.079 0.18, 0.22 -0.47
A/J f 0.202 0.013   5 0.00583 0.0645 0.19, 0.22 -0.61
AKR/J f 0.234 0.0182   5 0.00812 0.0776 0.21, 0.25 0.12
BALB/cByJ f 0.206 0.0219   5 0.0098 0.106 0.18, 0.24 -0.51
BTBR T+ Itpr3tf/J f 0.314 0.0134   5 0.006 0.0427 0.3, 0.33 1.92
BUB/BnJ f 0.236 0.0207   5 0.00927 0.0879 0.2, 0.25 0.16
C3H/HeJ f 0.214 0.0329   5 0.0147 0.154 0.19, 0.25 -0.33
C57BL/6J f 0.206 0.027   5 0.0121 0.131 0.18, 0.25 -0.51
C57BLKS/J f 0.24 0.0158   5 0.00707 0.0659 0.22, 0.26 0.25
C57BR/cdJ f 0.225 0.0173   4 0.00866 0.077 0.2, 0.24 -0.09
C58/J f 0.2 0.0224   5 0.01 0.112 0.17, 0.23 -0.65
CBA/J f 0.196 0.0134   5 0.006 0.0685 0.18, 0.21 -0.74
CE/J f 0.208 0.0259   5 0.0116 0.124 0.18, 0.24 -0.47
DBA/2J f 0.236 0.0114   5 0.0051 0.0483 0.22, 0.25 0.16
FVB/NJ f 0.272 0.0217   5 0.0097 0.0797 0.24, 0.29 0.98
I/LnJ f 0.23 0.0141   5 0.00632 0.0615 0.21, 0.24 0.03
KK/HlJ f 0.27 0.048   5 0.0214 0.178 0.22, 0.34 0.93
LG/J f 0.296 0.0336   5 0.015 0.114 0.26, 0.33 1.52
LP/J f 0.21 0.0141   5 0.00632 0.0673 0.2, 0.23 -0.42
MA/MyJ f 0.212 0.00837   5 0.00374 0.0395 0.2, 0.22 -0.38
MRL/MpJ f 0.39 0.0346   5 0.0155 0.0888 0.33, 0.42 3.64
NOD/ShiLtJ f 0.21 0.0187   5 0.00837 0.0891 0.19, 0.24 -0.42
NON/ShiLtJ f 0.238 0.013   5 0.00583 0.0548 0.22, 0.25 0.21
NOR/LtJ f 0.2 0.0224   5 0.01 0.112 0.17, 0.23 -0.65
NZW/LacJ f 0.294 0.0195   5 0.00872 0.0663 0.27, 0.32 1.47
P/J f 0.236 0.0207   5 0.00927 0.0879 0.2, 0.25 0.16
PL/J f 0.174 0.0344   5 0.0154 0.197 0.14, 0.23 -1.24
PWK/PhJ f 0.212 0.0217   5 0.0097 0.102 0.18, 0.24 -0.38
RIIIS/J f 0.198 0.0164   5 0.00735 0.083 0.18, 0.22 -0.7
SEA/GnJ f 0.204 0.0336   5 0.015 0.165 0.18, 0.26 -0.56
SJL/J f 0.25 0.0212   5 0.00949 0.0849 0.22, 0.27 0.48
SM/J f 0.186 0.0207   5 0.00927 0.111 0.15, 0.2 -0.97
SWR/J f 0.212 0.005   4 0.0025 0.0235 0.21, 0.22 -0.38
WSB/EiJ f 0.16 0.0122   5 0.00548 0.0765 0.15, 0.18 -1.55


  LEAST SQUARES MEANS (MODEL-ADJUSTED)
Strain Sex Mean SEM UpperCL LowerCL
129S1/SvImJ f 0.208 0.0101 0.228 0.188
A/J f 0.202 0.0101 0.222 0.182
AKR/J f 0.234 0.0101 0.254 0.214
BALB/cByJ f 0.206 0.0101 0.226 0.186
BTBR T+ Itpr3tf/J f 0.314 0.0101 0.334 0.294
BUB/BnJ f 0.236 0.0101 0.256 0.216
C3H/HeJ f 0.214 0.0101 0.234 0.194
C57BL/6J f 0.206 0.0101 0.226 0.186
C57BLKS/J f 0.24 0.0101 0.26 0.22
C57BR/cdJ f 0.225 0.0113 0.2474 0.2026
C58/J f 0.2 0.0101 0.22 0.18
CBA/J f 0.196 0.0101 0.216 0.176
CE/J f 0.208 0.0101 0.228 0.188
DBA/2J f 0.236 0.0101 0.256 0.216
FVB/NJ f 0.272 0.0101 0.292 0.252
I/LnJ f 0.23 0.0101 0.25 0.21
KK/HlJ f 0.27 0.0101 0.29 0.25
LG/J f 0.296 0.0101 0.316 0.276
LP/J f 0.21 0.0101 0.23 0.19
MA/MyJ f 0.212 0.0101 0.232 0.192
MRL/MpJ f 0.39 0.0101 0.41 0.37
NOD/ShiLtJ f 0.21 0.0101 0.23 0.19
NON/ShiLtJ f 0.238 0.0101 0.258 0.218
NOR/LtJ f 0.2 0.0101 0.22 0.18
NZW/LacJ f 0.294 0.0101 0.314 0.274
P/J f 0.236 0.0101 0.256 0.216
PL/J f 0.174 0.0101 0.194 0.154
PWK/PhJ f 0.212 0.0101 0.232 0.192
RIIIS/J f 0.198 0.0101 0.218 0.178
SEA/GnJ f 0.204 0.0101 0.224 0.184
SJL/J f 0.25 0.0101 0.27 0.23
SM/J f 0.186 0.0101 0.206 0.166
SWR/J f 0.2125 0.0113 0.2349 0.1901
WSB/EiJ f 0.16 0.0101 0.18 0.14




  GWAS USING LINEAR MIXED MODELS