Project measure / variable:   Harrill2   Rt_kidney_ctrl

ID, description, units MPD:44144   Rt_kidney_ctrl   kidney (right) weight   [g]  control  
DB289 study
Data set, strains Harrill2   inbred   34 strains     sex: f     age: 6-8wks
Procedure organ weights
Ontology mappings

  STRAIN COMPARISON PLOT
Dimensions Width:   px    Height:   px
Download Plot   
Visualization Options

Harrill2 - kidney (right) weight control



  MEASURE SUMMARY
Measure Summary Female
Number of strains tested34 strains
Mean of the strain means0.133   g
Median of the strain means0.130   g
SD of the strain means± 0.0256
Coefficient of variation (CV)0.192
Min–max range of strain means0.104   –   0.232   g
Mean sample size per strain5.0   mice


  ANOVA, Q-Q NORMALITY ASSESSMENT
ANOVA summary      
FactorDFSum of squaresMean sum of squaresF valuep value (Pr>F)
strain 33 0.1076 0.0033 15.61 < 0.0001
Residuals 134 0.028 0.0002


Q-Q normality assessment based on residuals

  


  STRAIN MEANS (UNADJUSTED)
  
Select table page:
Strain Sex Mean SD N mice SEM CV Min, Max Z score
129S1/SvImJ f 0.12 0.0   5 0.0 0.0 0.12, 0.12 -0.51
A/J f 0.114 0.00548   5 0.00245 0.048 0.11, 0.12 -0.75
AKR/J f 0.148 0.00447   5 0.002 0.0302 0.14, 0.15 0.58
BALB/cByJ f 0.13 0.0122   5 0.00548 0.0942 0.11, 0.14 -0.12
BTBR T+ Itpr3tf/J f 0.19 0.0141   5 0.00632 0.0744 0.18, 0.21 2.22
BUB/BnJ f 0.14 0.01   5 0.00447 0.0714 0.13, 0.15 0.27
C3H/HeJ f 0.14 0.0245   5 0.011 0.175 0.11, 0.17 0.27
C57BL/6J f 0.116 0.0134   5 0.006 0.116 0.1, 0.13 -0.67
C57BLKS/J f 0.13 0.00707   5 0.00316 0.0544 0.12, 0.14 -0.12
C57BR/cdJ f 0.13 0.0141   5 0.00632 0.109 0.11, 0.14 -0.12
C58/J f 0.13 0.0235   5 0.0105 0.18 0.11, 0.17 -0.12
CBA/J f 0.124 0.00548   5 0.00245 0.0442 0.12, 0.13 -0.35
CE/J f 0.12 0.00707   5 0.00316 0.0589 0.11, 0.13 -0.51
DBA/2J f 0.126 0.00894   5 0.004 0.071 0.12, 0.14 -0.28
FVB/NJ f 0.14 0.00707   5 0.00316 0.0505 0.13, 0.15 0.27
I/LnJ f 0.134 0.0167   5 0.00748 0.125 0.12, 0.16 0.04
KK/HlJ f 0.132 0.011   5 0.0049 0.083 0.12, 0.14 -0.04
LG/J f 0.16 0.01   5 0.00447 0.0625 0.15, 0.17 1.05
LP/J f 0.114 0.0134   5 0.006 0.118 0.1, 0.13 -0.75
MA/MyJ f 0.11 0.00707   5 0.00316 0.0643 0.1, 0.12 -0.9
MRL/MpJ f 0.232 0.00447   5 0.002 0.0193 0.23, 0.24 3.86
NOD/ShiLtJ f 0.114 0.0114   5 0.0051 0.1 0.1, 0.13 -0.75
NON/ShiLtJ f 0.13 0.0187   5 0.00837 0.144 0.1, 0.15 -0.12
NOR/LtJ f 0.122 0.011   5 0.0049 0.0898 0.11, 0.14 -0.43
NZW/LacJ f 0.156 0.0114   5 0.0051 0.0731 0.14, 0.17 0.89
P/J f 0.152 0.034   4 0.017 0.223 0.12, 0.2 0.74
PL/J f 0.104 0.0114   5 0.0051 0.11 0.09, 0.12 -1.14
PWK/PhJ f 0.114 0.0114   5 0.0051 0.1 0.1, 0.13 -0.75
RIIIS/J f 0.104 0.0114   5 0.0051 0.11 0.09, 0.12 -1.14
SEA/GnJ f 0.118 0.0148   5 0.00663 0.126 0.1, 0.14 -0.59
SJL/J f 0.166 0.0378   5 0.0169 0.228 0.13, 0.23 1.29
SM/J f 0.112 0.00837   5 0.00374 0.0747 0.1, 0.12 -0.82
SWR/J f 0.136 0.0114   5 0.0051 0.0838 0.12, 0.15 0.11
WSB/EiJ f 0.117 0.0126   4 0.00629 0.107 0.1, 0.13 -0.63


  LEAST SQUARES MEANS (MODEL-ADJUSTED)
Strain Sex Mean SEM UpperCL LowerCL
129S1/SvImJ f 0.12 0.0065 0.1328 0.1072
A/J f 0.114 0.0065 0.1268 0.1012
AKR/J f 0.148 0.0065 0.1608 0.1352
BALB/cByJ f 0.13 0.0065 0.1428 0.1172
BTBR T+ Itpr3tf/J f 0.19 0.0065 0.2028 0.1772
BUB/BnJ f 0.14 0.0065 0.1528 0.1272
C3H/HeJ f 0.14 0.0065 0.1528 0.1272
C57BL/6J f 0.116 0.0065 0.1288 0.1032
C57BLKS/J f 0.13 0.0065 0.1428 0.1172
C57BR/cdJ f 0.13 0.0065 0.1428 0.1172
C58/J f 0.13 0.0065 0.1428 0.1172
CBA/J f 0.124 0.0065 0.1368 0.1112
CE/J f 0.12 0.0065 0.1328 0.1072
DBA/2J f 0.126 0.0065 0.1388 0.1132
FVB/NJ f 0.14 0.0065 0.1528 0.1272
I/LnJ f 0.134 0.0065 0.1468 0.1212
KK/HlJ f 0.132 0.0065 0.1448 0.1192
LG/J f 0.16 0.0065 0.1728 0.1472
LP/J f 0.114 0.0065 0.1268 0.1012
MA/MyJ f 0.11 0.0065 0.1228 0.0972
MRL/MpJ f 0.232 0.0065 0.2448 0.2192
NOD/ShiLtJ f 0.114 0.0065 0.1268 0.1012
NON/ShiLtJ f 0.13 0.0065 0.1428 0.1172
NOR/LtJ f 0.122 0.0065 0.1348 0.1092
NZW/LacJ f 0.156 0.0065 0.1688 0.1432
P/J f 0.1525 0.0072 0.1668 0.1382
PL/J f 0.104 0.0065 0.1168 0.0912
PWK/PhJ f 0.114 0.0065 0.1268 0.1012
RIIIS/J f 0.104 0.0065 0.1168 0.0912
SEA/GnJ f 0.118 0.0065 0.1308 0.1052
SJL/J f 0.166 0.0065 0.1788 0.1532
SM/J f 0.112 0.0065 0.1248 0.0992
SWR/J f 0.136 0.0065 0.1488 0.1232
WSB/EiJ f 0.1175 0.0072 0.1318 0.1032




  GWAS USING LINEAR MIXED MODELS