Project measure / variable:   Harrill2   Lt_kidney_ctrl

ID, description, units MPD:44141   Lt_kidney_ctrl   kidney (left) weight   [g]  control  
DB289 study
Data set, strains Harrill2   inbred   34 strains     sex: f     age: 6-8wks
Procedure organ weights
Ontology mappings

  STRAIN COMPARISON PLOT
Dimensions Width:   px    Height:   px
Download Plot   
Visualization Options

Harrill2 - kidney (left) weight control



  MEASURE SUMMARY
Measure Summary Female
Number of strains tested34 strains
Mean of the strain means0.130   g
Median of the strain means0.124   g
SD of the strain means± 0.0273
Coefficient of variation (CV)0.210
Min–max range of strain means0.0960   –   0.236   g
Mean sample size per strain5.0   mice


  ANOVA, Q-Q NORMALITY ASSESSMENT
ANOVA summary      
FactorDFSum of squaresMean sum of squaresF valuep value (Pr>F)
strain 33 0.1222 0.0037 12.6044 < 0.0001
Residuals 134 0.0394 0.0003


Q-Q normality assessment based on residuals

  


  STRAIN MEANS (UNADJUSTED)
  
Select table page:
Strain Sex Mean SD N mice SEM CV Min, Max Z score
129S1/SvImJ f 0.112 0.00447   5 0.002 0.0399 0.11, 0.12 -0.66
A/J f 0.12 0.0122   5 0.00548 0.102 0.11, 0.14 -0.37
AKR/J f 0.138 0.00837   5 0.00374 0.0606 0.13, 0.15 0.29
BALB/cByJ f 0.124 0.0114   5 0.0051 0.0919 0.11, 0.14 -0.22
BTBR T+ Itpr3tf/J f 0.186 0.00894   5 0.004 0.0481 0.18, 0.2 2.05
BUB/BnJ f 0.136 0.0114   5 0.0051 0.0838 0.12, 0.15 0.22
C3H/HeJ f 0.132 0.0192   5 0.0086 0.146 0.11, 0.16 0.07
C57BL/6J f 0.112 0.00837   5 0.00374 0.0747 0.1, 0.12 -0.66
C57BLKS/J f 0.114 0.0182   5 0.00812 0.159 0.09, 0.14 -0.59
C57BR/cdJ f 0.122 0.00837   5 0.00374 0.0686 0.11, 0.13 -0.29
C58/J f 0.108 0.0277   5 0.0124 0.257 0.06, 0.13 -0.81
CBA/J f 0.114 0.00894   5 0.004 0.0785 0.1, 0.12 -0.59
CE/J f 0.114 0.00548   5 0.00245 0.048 0.11, 0.12 -0.59
DBA/2J f 0.132 0.00837   5 0.00374 0.0634 0.12, 0.14 0.07
FVB/NJ f 0.128 0.00837   5 0.00374 0.0654 0.12, 0.14 -0.07
I/LnJ f 0.13 0.0122   5 0.00548 0.0942 0.11, 0.14 0.0
KK/HlJ f 0.136 0.00894   5 0.004 0.0658 0.13, 0.15 0.22
LG/J f 0.16 0.0158   5 0.00707 0.0988 0.14, 0.18 1.1
LP/J f 0.106 0.0114   5 0.0051 0.108 0.09, 0.12 -0.88
MA/MyJ f 0.11 0.00707   5 0.00316 0.0643 0.1, 0.12 -0.73
MRL/MpJ f 0.236 0.00548   5 0.00245 0.0232 0.23, 0.24 3.88
NOD/ShiLtJ f 0.12 0.00707   5 0.00316 0.0589 0.11, 0.13 -0.37
NON/ShiLtJ f 0.126 0.00548   5 0.00245 0.0435 0.12, 0.13 -0.15
NOR/LtJ f 0.128 0.011   5 0.0049 0.0856 0.11, 0.14 -0.07
NZW/LacJ f 0.156 0.00548   5 0.00245 0.0351 0.15, 0.16 0.95
P/J f 0.164 0.0555   5 0.0248 0.338 0.12, 0.26 1.25
PL/J f 0.096 0.00894   5 0.004 0.0932 0.09, 0.11 -1.25
PWK/PhJ f 0.118 0.00447   5 0.002 0.0379 0.11, 0.12 -0.44
RIIIS/J f 0.104 0.00548   5 0.00245 0.0527 0.1, 0.11 -0.95
SEA/GnJ f 0.124 0.0167   5 0.00748 0.135 0.1, 0.14 -0.22
SJL/J f 0.133 0.00957   4 0.00479 0.0723 0.12, 0.14 0.11
SM/J f 0.112 0.00837   5 0.00374 0.0747 0.1, 0.12 -0.66
SWR/J f 0.164 0.0522   5 0.0234 0.319 0.11, 0.22 1.25
WSB/EiJ f 0.105 0.0129   4 0.00645 0.123 0.09, 0.12 -0.92


  LEAST SQUARES MEANS (MODEL-ADJUSTED)
Strain Sex Mean SEM UpperCL LowerCL
129S1/SvImJ f 0.112 0.0077 0.1272 0.0968
A/J f 0.12 0.0077 0.1352 0.1048
AKR/J f 0.138 0.0077 0.1532 0.1228
BALB/cByJ f 0.124 0.0077 0.1392 0.1088
BTBR T+ Itpr3tf/J f 0.186 0.0077 0.2012 0.1708
BUB/BnJ f 0.136 0.0077 0.1512 0.1208
C3H/HeJ f 0.132 0.0077 0.1472 0.1168
C57BL/6J f 0.112 0.0077 0.1272 0.0968
C57BLKS/J f 0.114 0.0077 0.1292 0.0988
C57BR/cdJ f 0.122 0.0077 0.1372 0.1068
C58/J f 0.108 0.0077 0.1232 0.0928
CBA/J f 0.114 0.0077 0.1292 0.0988
CE/J f 0.114 0.0077 0.1292 0.0988
DBA/2J f 0.132 0.0077 0.1472 0.1168
FVB/NJ f 0.128 0.0077 0.1432 0.1128
I/LnJ f 0.13 0.0077 0.1452 0.1148
KK/HlJ f 0.136 0.0077 0.1512 0.1208
LG/J f 0.16 0.0077 0.1752 0.1448
LP/J f 0.106 0.0077 0.1212 0.0908
MA/MyJ f 0.11 0.0077 0.1252 0.0948
MRL/MpJ f 0.236 0.0077 0.2512 0.2208
NOD/ShiLtJ f 0.12 0.0077 0.1352 0.1048
NON/ShiLtJ f 0.126 0.0077 0.1412 0.1108
NOR/LtJ f 0.128 0.0077 0.1432 0.1128
NZW/LacJ f 0.156 0.0077 0.1712 0.1408
P/J f 0.164 0.0077 0.1792 0.1488
PL/J f 0.096 0.0077 0.1112 0.0808
PWK/PhJ f 0.118 0.0077 0.1332 0.1028
RIIIS/J f 0.104 0.0077 0.1192 0.0888
SEA/GnJ f 0.124 0.0077 0.1392 0.1088
SJL/J f 0.1325 0.0086 0.1495 0.1155
SM/J f 0.112 0.0077 0.1272 0.0968
SWR/J f 0.164 0.0077 0.1792 0.1488
WSB/EiJ f 0.105 0.0086 0.122 0.088




  GWAS USING LINEAR MIXED MODELS