Phenotype measure:   Chesler3   latency_dark_LD

ID, description, units MPD:43566   latency_dark_LD   latency to enter dark compartment, 10 min test   [s]
Data set, strains Chesler3   CC pre w/par   156 strains     sex: both     age: 7-15wks
Procedure light-dark box
Ontology mappings

  STRAIN COMPARISON PLOT
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Chesler3 - latency to enter dark compartment, 10 min test



  MEASURE SUMMARY
Measure Summary FemaleMale
Number of strains tested156 strains155 strains
Mean of the strain means23.6   s 43.1   s
Median of the strain means0.800   s 4.94   s
SD of the strain means± 77.5 ± 112
Coefficient of variation (CV)3.29 2.60
Min–max range of strain means0   –   600   s 0   –   600   s
Mean sample size per strain1.3   mice 1.2   mice


  STRAIN MEANS (UNADJUSTED)
  
Select table page:
Strain Sex Mean SD N mice SEM CV Min, Max Z score
129S1/SvImJ f 0.07 0.0   1   0.0 0.0 0.07, 0.07 -0.3
PreCCF0003/Ornl m 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.38
PreCCF0013/Ornl f 39.8 0.0   1   0.0 0.0 39.8, 39.8 0.21
PreCCF0027/Ornl f 0.5 0.0   1   0.0 0.0 0.5, 0.5 -0.3
PreCCF0041/Ornl f 341.0 367.0   2   259.0 1.08 81.2, 600.0 4.1
PreCCF0041/Ornl m 40.5 0.0   1   0.0 0.0 40.5, 40.5 -0.02
PreCCF0063/Ornl f 0.1 0.141   2   0.1 1.41 -0.3
PreCCF0063/Ornl m 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.38
PreCCF0072/Ornl f 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.3
PreCCF0072/Ornl m 10.7 0.0   1   0.0 0.0 10.7, 10.7 -0.29
PreCCF0079/Ornl m 0.67 0.0   1   0.0 0.0 0.67, 0.67 -0.38
PreCCF0088/Ornl m 12.3 0.0   1   0.0 0.0 12.3, 12.3 -0.27
PreCCF0091/Ornl f 5.07 7.17   2   5.07 1.41 -0.24
PreCCF0091/Ornl m 23.8 33.6   2   23.8 1.41 -0.17
PreCCF0092/Ornl f 4.27 0.0   1   0.0 0.0 4.27, 4.27 -0.25
PreCCF0092/Ornl m 362.0 0.0   1   0.0 0.0 362.0, 362.0 2.85
PreCCF0094/Ornl f 2.4 0.0   1   0.0 0.0 2.4, 2.4 -0.27
PreCCF0094/Ornl m 12.0 0.0   1   0.0 0.0 12.0, 12.0 -0.28
PreCCF0113/Ornl f 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.3
PreCCF0125/Ornl m 11.7 8.45   3 4.88 0.72 2.07, 17.8 -0.28
PreCCF0147/Ornl f 0.93 0.0   1   0.0 0.0 0.93, 0.93 -0.29
PreCCF0157/Ornl f 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.3
PreCCF0157/Ornl m 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.38
PreCCF0166/Ornl f 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.3
PreCCF0167/Ornl m 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.38
PreCCF0176/Ornl f 130.0 0.0   1   0.0 0.0 130.0, 130.0 1.37
PreCCF0176/Ornl m 429.0 0.0   1   0.0 0.0 429.0, 429.0 3.44
PreCCF0181/Ornl f 1.54 1.89   2   1.33 1.23 0.2, 2.87 -0.28
PreCCF0181/Ornl m 0.535 0.757   2   0.535 1.41 -0.38
PreCCF0189/Ornl m 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.38
PreCCF0190/Ornl f 8.18 8.56   3 4.94 1.05 -0.2
PreCCF0190/Ornl m 15.0 19.1   5 8.54 1.27 -0.25
PreCCF0210/Ornl f 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.3
PreCCF0210/Ornl m 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.38
PreCCF0220/Ornl f 0.07 0.0   1   0.0 0.0 0.07, 0.07 -0.3
PreCCF0220/Ornl m 46.9 18.2   2   12.9 0.388 34.0, 59.8 0.03
PreCCF0232/Ornl f 109.0 154.0   2   109.0 1.41 1.1
PreCCF0232/Ornl m 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.38
PreCCF0237/Ornl m 32.0 0.0   1   0.0 0.0 32.0, 32.0 -0.1
PreCCF0289/Ornl f 9.88 0.0   1   0.0 0.0 9.88, 9.88 -0.18
PreCCF0289/Ornl m 10.1 14.2   2   10.1 1.41 -0.29
PreCCF0305/Ornl f 14.3 0.0   1   0.0 0.0 14.3, 14.3 -0.12
PreCCF0305/Ornl m 4.14 0.0   1   0.0 0.0 4.14, 4.14 -0.35
PreCCF0334/Ornl m 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.38
PreCCF0353/Ornl m 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.38
PreCCF0363/Ornl f 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.3
PreCCF0363/Ornl m 7.14 0.0   1   0.0 0.0 7.14, 7.14 -0.32
PreCCF0377/Ornl f 52.2 0.0   1   0.0 0.0 52.2, 52.2 0.37
PreCCF0377/Ornl m 424.0 0.0   1   0.0 0.0 424.0, 424.0 3.4
PreCCF0380/Ornl f 12.2 17.3   2   12.2 1.41 -0.15
PreCCF0380/Ornl m 17.8 0.0   1   0.0 0.0 17.8, 17.8 -0.23
PreCCF0381/Ornl f 4.74 0.0   1   0.0 0.0 4.74, 4.74 -0.24
PreCCF0381/Ornl m 4.94 6.99   2   4.94 1.41 -0.34
PreCCF0388/Ornl f 6.94 0.0   1   0.0 0.0 6.94, 6.94 -0.21
PreCCF0388/Ornl m 134.0 0.0   1   0.0 0.0 134.0, 134.0 0.81
PreCCF0391/Ornl m 1.53 0.0   1   0.0 0.0 1.53, 1.53 -0.37
PreCCF0409/Ornl f 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.3
PreCCF0409/Ornl m 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.38
PreCCF0477/Ornl f 0.8 1.13   2   0.8 1.41 -0.29
PreCCF0477/Ornl m 20.5 0.0   1   0.0 0.0 20.5, 20.5 -0.2
PreCCF0481/Ornl f 0.2 0.0   1   0.0 0.0 0.2, 0.2 -0.3
PreCCF0489/Ornl m 83.3 0.0   1   0.0 0.0 83.3, 83.3 0.36
PreCCF0491/Ornl f 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.3
PreCCF0491/Ornl m 59.0 0.0   1   0.0 0.0 59.0, 59.0 0.14
PreCCF0495/Ornl f 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.3
PreCCF0495/Ornl m 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.38
PreCCF0518/Ornl m 91.9 0.0   1   0.0 0.0 91.9, 91.9 0.44
PreCCF0538/Ornl f 7.01 0.0   1   0.0 0.0 7.01, 7.01 -0.21
PreCCF0538/Ornl m 22.2 31.3   2   22.2 1.41 -0.19
PreCCF0555/Ornl f 42.1 34.5   3 19.9 0.819 4.94, 73.0 0.24
PreCCF0555/Ornl m 40.0 0.0   1   0.0 0.0 40.0, 40.0 -0.03
PreCCF0559/Ornl f 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.3
PreCCF0559/Ornl m 14.5 0.566   2   0.4 0.0391 14.1, 14.9 -0.25
PreCCF0600/Ornl f 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.3
PreCCF0611/Ornl f 30.0 0.0   1   0.0 0.0 30.0, 30.0 0.08
PreCCF0611/Ornl m 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.38
PreCCF0618/Ornl f 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.3
PreCCF0652/Ornl f 39.2 0.0   1   0.0 0.0 39.2, 39.2 0.2
PreCCF0652/Ornl m 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.38
PreCCF0667/Ornl f 0.1 0.141   2   0.1 1.41 -0.3
PreCCF0667/Ornl m 14.9 15.8   2   11.1 1.06 3.74, 26.0 -0.25
PreCCF0672/Ornl f 0.07 0.0   1   0.0 0.0 0.07, 0.07 -0.3
PreCCF0672/Ornl m 7.67 0.0   1   0.0 0.0 7.67, 7.67 -0.32
PreCCF0691/Ornl f 2.6 3.68   2   2.6 1.41 -0.27
PreCCF0691/Ornl m 25.0 31.4   2   22.2 1.26 2.8, 47.2 -0.16
PreCCF0692/Ornl f 2.74 3.87   2   2.74 1.41 -0.27
PreCCF0692/Ornl m 0.0 0.0   3 0.0 0.0 -0.38
PreCCF0699/Ornl f 25.0 0.0   1   0.0 0.0 25.0, 25.0 0.02
PreCCF0699/Ornl m 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.38
PreCCF0717/Ornl f 3.74 0.0   1   0.0 0.0 3.74, 3.74 -0.26
PreCCF0717/Ornl m 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.38
PreCCF0718/Ornl f 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.3
PreCCF0718/Ornl m 0.2 0.0   1   0.0 0.0 0.2, 0.2 -0.38
PreCCF0739/Ornl f 4.87 8.44   3 4.87 1.73 -0.24
PreCCF0739/Ornl m 11.9 11.1   3 6.42 0.934 -0.28
PreCCF0749/Ornl f 26.6 0.0   1   0.0 0.0 26.6, 26.6 0.04
PreCCF0754/Ornl m 160.0 0.0   1   0.0 0.0 160.0, 160.0 1.04
PreCCF0773/Ornl f 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.3
PreCCF0792/Ornl f 0.53 0.0   1   0.0 0.0 0.53, 0.53 -0.3
PreCCF0792/Ornl m 26.5 0.0   1   0.0 0.0 26.5, 26.5 -0.15
PreCCF0799/Ornl f 20.1 0.0   1   0.0 0.0 20.1, 20.1 -0.04
PreCCF0799/Ornl m 49.8 0.0   1   0.0 0.0 49.8, 49.8 0.06
PreCCF0801/Ornl m 600.0 0.0   1   0.0 0.0 600.0, 600.0 4.97
PreCCF0820/Ornl f 0.0667 0.115   3 0.0667 1.73 -0.3
PreCCF0820/Ornl m 0.0 0.0   2   0.0 0.0 -0.38
PreCCF0821/Ornl f 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.3
PreCCF0827/Ornl f 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.3
PreCCF0866/Ornl f 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.3
PreCCF0873/Ornl m 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.38
PreCCF0878/Ornl f 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.3
PreCCF0878/Ornl m 0.165 0.233   2   0.165 1.41 -0.38
PreCCF0888/Ornl m 0.07 0.0   1   0.0 0.0 0.07, 0.07 -0.38
PreCCF0896/Ornl f 6.61 9.34   2   6.6 1.41 -0.22
PreCCF0896/Ornl m 0.0 0.0   2   0.0 0.0 -0.38
PreCCF0900/Ornl f 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.3
PreCCF0914/Ornl f 14.3 0.0   1   0.0 0.0 14.3, 14.3 -0.12
PreCCF0916/Ornl f 94.6 0.0   1   0.0 0.0 94.6, 94.6 0.92
PreCCF0929/Ornl f 14.2 0.0   1   0.0 0.0 14.2, 14.2 -0.12
PreCCF0940/Ornl f 5.34 0.0   1   0.0 0.0 5.34, 5.34 -0.24
PreCCF0940/Ornl m 29.9 0.0   1   0.0 0.0 29.9, 29.9 -0.12
PreCCF0993/Ornl m 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.38
PreCCF1009/Ornl f 4.65 4.06   3 2.34 0.873 -0.24
PreCCF1009/Ornl m 10.4 13.4   2   9.44 1.28 1.0, 19.9 -0.29
PreCCF1018/Ornl f 63.0 0.0   1   0.0 0.0 63.0, 63.0 0.51
PreCCF1018/Ornl m 25.0 0.0   1   0.0 0.0 25.0, 25.0 -0.16
PreCCF1082/Ornl f 52.7 0.0   1   0.0 0.0 52.7, 52.7 0.38
PreCCF1112/Ornl f 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.3
PreCCF1112/Ornl m 11.0 0.0   1   0.0 0.0 11.0, 11.0 -0.29
PreCCF1114/Ornl f 0.0 0.0   3 0.0 0.0 -0.3
PreCCF1114/Ornl m 154.0 297.0   4 149.0 1.92 0.99
PreCCF1119/Ornl f 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.3
PreCCF1119/Ornl m 12.0 0.0   1   0.0 0.0 12.0, 12.0 -0.28
PreCCF1122/Ornl f 4.14 0.0   1   0.0 0.0 4.14, 4.14 -0.25
PreCCF1136/Ornl f 182.0 0.0   1   0.0 0.0 182.0, 182.0 2.04
PreCCF1136/Ornl m 1.13 0.0   1   0.0 0.0 1.13, 1.13 -0.37
PreCCF1141/Ornl f 1.2 0.0   1   0.0 0.0 1.2, 1.2 -0.29
PreCCF1141/Ornl m 76.3 0.0   1   0.0 0.0 76.3, 76.3 0.3
PreCCF1200/Ornl f 8.41 0.0   1   0.0 0.0 8.41, 8.41 -0.2
PreCCF1200/Ornl m 5.54 5.09   2   3.6 0.919 1.94, 9.14 -0.33
PreCCF1237/Ornl f 1.57 0.24   2   0.17 0.153 1.4, 1.74 -0.28
PreCCF1237/Ornl m 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.38
PreCCF1246/Ornl f 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.3
PreCCF1246/Ornl m 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.38
PreCCF1254/Ornl f 4.34 0.0   1   0.0 0.0 4.34, 4.34 -0.25
PreCCF1254/Ornl m 26.3 37.2   2   26.3 1.41 -0.15
PreCCF1258/Ornl f 600.0 0.0   1   0.0 0.0 600.0, 600.0 7.44
PreCCF1264/Ornl f 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.3
PreCCF1279/Ornl f 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.3
PreCCF1288/Ornl f 10.6 9.96   2   7.04 0.936 3.6, 17.7 -0.17
PreCCF1288/Ornl m 38.7 0.0   1   0.0 0.0 38.7, 38.7 -0.04
PreCCF1339/Ornl f 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.3
PreCCF1359/Ornl f 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.3
PreCCF1400/Ornl f 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.3
PreCCF1400/Ornl m 75.1 0.0   1   0.0 0.0 75.1, 75.1 0.29
PreCCF1401/Ornl f 0.1 0.141   2   0.1 1.41 -0.3
PreCCF1401/Ornl m 6.01 0.0   1   0.0 0.0 6.01, 6.01 -0.33
PreCCF1478/Ornl m 6.61 0.0   1   0.0 0.0 6.61, 6.61 -0.33
PreCCF1489/Ornl m 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.38
PreCCF1515/Ornl f 69.6 90.3   3 52.2 1.3 0.27, 172.0 0.59
PreCCF1515/Ornl m 8.04 10.9   2   7.71 1.36 0.33, 15.8 -0.31
PreCCF1516/Ornl m 32.0 0.0   1   0.0 0.0 32.0, 32.0 -0.1
PreCCF1519/Ornl f 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.3
PreCCF1519/Ornl m 37.8 0.0   1   0.0 0.0 37.8, 37.8 -0.05
PreCCF1524/Ornl f 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.3
PreCCF1524/Ornl m 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.38
PreCCF1566/Ornl f 3.2 0.0   1   0.0 0.0 3.2, 3.2 -0.26
PreCCF1566/Ornl m 168.0 177.0   2   125.0 1.06 42.3, 293.0 1.12
PreCCF1587/Ornl f 8.68 0.0   1   0.0 0.0 8.68, 8.68 -0.19
PreCCF1587/Ornl m 0.33 0.0   1   0.0 0.0 0.33, 0.33 -0.38
PreCCF1605/Ornl f 0.4 0.0   1   0.0 0.0 0.4, 0.4 -0.3
PreCCF1605/Ornl m 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.38
PreCCF1608/Ornl f 36.5 0.0   1   0.0 0.0 36.5, 36.5 0.17
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PreCCF1635/Ornl f 0.0433 0.0751   3 0.0433 1.73 -0.3
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WSB/EiJ f 0.2 0.283   2   0.2 1.41 -0.3




GWAS analysis not available: Strain panel must be either Inbred, HMDP, BXD, BXH, CXB, or AXB/BXA