Phenotype measure:   Chesler3   GRA

ID, description, units MPD:43518   GRA   granulocyte count (GRA; units per volume x 103)   [n/µL]
Data set, strains Chesler3   CC pre w/par   152 strains     sex: both     age: 7-15wks
Procedure complete blood count
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  STRAIN COMPARISON PLOT
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Chesler3 - granulocyte count (GRA; units per volume x 103)



  MEASURE SUMMARY
Measure Summary FemaleMale
Number of strains tested119 strains152 strains
Mean of the strain means4.76   n/µL 5.55   n/µL
Median of the strain means4.30   n/µL 5.00   n/µL
SD of the strain means± 2.77 ± 3.12
Coefficient of variation (CV)0.582 0.562
Min–max range of strain means1.10   –   18.8   n/µL 0.900   –   21.4   n/µL
Mean sample size per strain1.3   mice 1.3   mice


  STRAIN MEANS (UNADJUSTED)
Strain Sex Mean SD N mice SEM CV Min, Max Z score
129S1/SvImJ f 2.2 0.566   2   0.4 0.257 1.8, 2.6 -0.92
129S1/SvImJ m 4.1 2.12   2   1.5 0.517 2.6, 5.6 -0.46
A/J f 6.6 3.68   2   2.6 0.557 4.0, 9.2 0.66
A/J m 4.22 1.54   6 0.628 0.365 2.3, 6.6 -0.43
C57BL/6J f 2.3 0.967   20 0.216 0.421 1.1, 4.3 -0.89
C57BL/6J m 3.26 1.53   37 0.251 0.469 1.2, 7.3 -0.73
CAST/EiJ f 1.96 0.439   5 0.196 0.224 1.4, 2.4 -1.01
CAST/EiJ m 3.45 0.0707   2   0.05 0.0205 3.4, 3.5 -0.67
NOD/ShiLtJ f 7.53 1.18   3 0.684 0.157 6.8, 8.9 1.0
NOD/ShiLtJ m 5.1 2.79   3 1.61 0.547 2.8, 8.2 -0.14
NZO/HlLtJ m 9.0 0.0   1   0.0 0.0 9.0, 9.0 1.11
PreCCF0003/Ornl f 3.0 0.0   1   0.0 0.0 3.0, 3.0 -0.64
PreCCF0003/Ornl m 4.15 0.212   2   0.15 0.0511 4.0, 4.3 -0.45
PreCCF0020/Ornl m 7.8 0.0   1   0.0 0.0 7.8, 7.8 0.72
PreCCF0027/Ornl f 8.9 0.0   1   0.0 0.0 8.9, 8.9 1.49
PreCCF0041/Ornl f 6.33 0.603   3 0.348 0.0952 5.7, 6.9 0.57
PreCCF0041/Ornl m 5.1 0.0   1   0.0 0.0 5.1, 5.1 -0.14
PreCCF0070/Ornl m 16.9 0.0   1   0.0 0.0 16.9, 16.9 3.64
PreCCF0072/Ornl f 3.8 0.0   1   0.0 0.0 3.8, 3.8 -0.35
PreCCF0072/Ornl m 5.0 0.0   1   0.0 0.0 5.0, 5.0 -0.18
PreCCF0091/Ornl f 1.3 0.0   1   0.0 0.0 1.3, 1.3 -1.25
PreCCF0091/Ornl m 3.4 0.0   1   0.0 0.0 3.4, 3.4 -0.69
PreCCF0113/Ornl f 4.8 0.0   1   0.0 0.0 4.8, 4.8 0.01
PreCCF0125/Ornl f 9.7 0.0   1   0.0 0.0 9.7, 9.7 1.78
PreCCF0125/Ornl m 3.85 0.0707   2   0.05 0.0184 3.8, 3.9 -0.54
PreCCF0134/Ornl f 5.7 0.0   1   0.0 0.0 5.7, 5.7 0.34
PreCCF0147/Ornl f 6.5 0.0   1   0.0 0.0 6.5, 6.5 0.63
PreCCF0147/Ornl m 12.0 0.0   1   0.0 0.0 12.0, 12.0 2.07
PreCCF0157/Ornl f 3.6 0.0   1   0.0 0.0 3.6, 3.6 -0.42
PreCCF0166/Ornl f 7.7 0.0   1   0.0 0.0 7.7, 7.7 1.06
PreCCF0166/Ornl m 4.6 0.566   2   0.4 0.123 4.2, 5.0 -0.3
PreCCF0176/Ornl f 9.0 0.0   1   0.0 0.0 9.0, 9.0 1.53
PreCCF0181/Ornl f 5.4 0.849   2   0.6 0.157 4.8, 6.0 0.23
PreCCF0181/Ornl m 3.4 0.0   1   0.0 0.0 3.4, 3.4 -0.69
PreCCF0189/Ornl m 4.3 0.0   1   0.0 0.0 4.3, 4.3 -0.4
PreCCF0190/Ornl f 8.0 1.49   3 0.862 0.187 6.3, 9.1 1.17
PreCCF0190/Ornl m 6.53 1.33   4 0.666 0.204 5.2, 8.3 0.31
PreCCF0205/Ornl m 3.3 0.0   1   0.0 0.0 3.3, 3.3 -0.72
PreCCF0210/Ornl f 5.6 0.0   1   0.0 0.0 5.6, 5.6 0.3
PreCCF0220/Ornl f 5.1 0.0   1   0.0 0.0 5.1, 5.1 0.12
PreCCF0220/Ornl m 5.6 0.0   1   0.0 0.0 5.6, 5.6 0.02
PreCCF0232/Ornl f 3.8 0.0   1   0.0 0.0 3.8, 3.8 -0.35
PreCCF0232/Ornl m 4.95 1.91   2   1.35 0.386 3.6, 6.3 -0.19
PreCCF0289/Ornl f 2.6 0.0   1   0.0 0.0 2.6, 2.6 -0.78
PreCCF0289/Ornl m 3.2 0.0   1   0.0 0.0 3.2, 3.2 -0.75
PreCCF0305/Ornl m 11.3 0.0   1   0.0 0.0 11.3, 11.3 1.84
PreCCF0363/Ornl f 2.6 0.0   1   0.0 0.0 2.6, 2.6 -0.78
PreCCF0380/Ornl f 6.1 0.0   1   0.0 0.0 6.1, 6.1 0.48
PreCCF0381/Ornl f 5.7 1.7   2   1.2 0.298 4.5, 6.9 0.34
PreCCF0388/Ornl f 5.2 0.0   1   0.0 0.0 5.2, 5.2 0.16
PreCCF0388/Ornl m 9.3 0.0   1   0.0 0.0 9.3, 9.3 1.2
PreCCF0449/Ornl m 21.4 0.0   1   0.0 0.0 21.4, 21.4 5.08
PreCCF0477/Ornl f 7.1 0.0   1   0.0 0.0 7.1, 7.1 0.84
PreCCF0477/Ornl m 5.2 1.27   2   0.9 0.245 4.3, 6.1 -0.11
PreCCF0481/Ornl f 3.9 0.0   1   0.0 0.0 3.9, 3.9 -0.31
PreCCF0481/Ornl m 6.7 0.0   1   0.0 0.0 6.7, 6.7 0.37
PreCCF0489/Ornl m 5.0 0.0   1   0.0 0.0 5.0, 5.0 -0.18
PreCCF0491/Ornl f 4.3 0.0   1   0.0 0.0 4.3, 4.3 -0.17
PreCCF0491/Ornl m 3.1 0.0   1   0.0 0.0 3.1, 3.1 -0.79
PreCCF0509/Ornl m 7.4 0.0   1   0.0 0.0 7.4, 7.4 0.59
PreCCF0538/Ornl f 7.1 0.0   1   0.0 0.0 7.1, 7.1 0.84
PreCCF0538/Ornl m 4.15 0.212   2   0.15 0.0511 4.0, 4.3 -0.45
PreCCF0555/Ornl f 3.9 2.25   3 1.3 0.578 2.5, 6.5 -0.31
PreCCF0555/Ornl m 4.8 0.0   1   0.0 0.0 4.8, 4.8 -0.24
PreCCF0559/Ornl f 3.0 0.0   1   0.0 0.0 3.0, 3.0 -0.64
PreCCF0600/Ornl f 2.3 0.0   1   0.0 0.0 2.3, 2.3 -0.89
PreCCF0611/Ornl f 4.6 0.0   1   0.0 0.0 4.6, 4.6 -0.06
PreCCF0611/Ornl m 6.4 0.0   1   0.0 0.0 6.4, 6.4 0.27
PreCCF0618/Ornl m 6.2 0.0   1   0.0 0.0 6.2, 6.2 0.21
PreCCF0638/Ornl f 5.4 0.0   1   0.0 0.0 5.4, 5.4 0.23
PreCCF0652/Ornl f 7.1 0.0   1   0.0 0.0 7.1, 7.1 0.84
PreCCF0652/Ornl m 3.2 1.98   2   1.4 0.619 1.8, 4.6 -0.75
PreCCF0667/Ornl m 5.7 0.0   1   0.0 0.0 5.7, 5.7 0.05
PreCCF0680/Ornl m 2.3 0.0   1   0.0 0.0 2.3, 2.3 -1.04
PreCCF0690/Ornl f 4.6 0.0   1   0.0 0.0 4.6, 4.6 -0.06
PreCCF0690/Ornl m 13.2 0.0   1   0.0 0.0 13.2, 13.2 2.45
PreCCF0691/Ornl f 3.25 0.0707   2   0.05 0.0218 3.2, 3.3 -0.55
PreCCF0691/Ornl m 5.95 0.778   2   0.55 0.131 5.4, 6.5 0.13
PreCCF0692/Ornl f 4.4 1.37   3 0.794 0.312 2.9, 5.6 -0.13
PreCCF0692/Ornl m 4.43 1.25   3 0.722 0.282 3.2, 5.7 -0.36
PreCCF0699/Ornl f 2.5 0.0   1   0.0 0.0 2.5, 2.5 -0.82
PreCCF0699/Ornl m 3.6 0.0   1   0.0 0.0 3.6, 3.6 -0.63
PreCCF0705/Ornl f 3.9 0.0   1   0.0 0.0 3.9, 3.9 -0.31
PreCCF0717/Ornl f 5.7 0.0   1   0.0 0.0 5.7, 5.7 0.34
PreCCF0739/Ornl f 3.8 2.4   2   1.7 0.633 2.1, 5.5 -0.35
PreCCF0739/Ornl m 6.83 5.0   3 2.89 0.732 2.3, 12.2 0.41
PreCCF0749/Ornl f 1.4 0.0   1   0.0 0.0 1.4, 1.4 -1.21
PreCCF0749/Ornl m 6.0 0.0   1   0.0 0.0 6.0, 6.0 0.14
PreCCF0754/Ornl f 6.6 0.0   1   0.0 0.0 6.6, 6.6 0.66
PreCCF0754/Ornl m 4.2 0.0   1   0.0 0.0 4.2, 4.2 -0.43
PreCCF0779/Ornl m 10.1 0.0   1   0.0 0.0 10.1, 10.1 1.46
PreCCF0780/Ornl m 8.0 0.0   1   0.0 0.0 8.0, 8.0 0.79
PreCCF0792/Ornl f 3.2 0.0   1   0.0 0.0 3.2, 3.2 -0.56
PreCCF0792/Ornl m 3.9 0.0   1   0.0 0.0 3.9, 3.9 -0.53
PreCCF0820/Ornl f 2.8 2.17   3 1.25 0.775 1.4, 5.3 -0.71
PreCCF0820/Ornl m 3.5 2.97   2   2.1 0.849 1.4, 5.6 -0.66
PreCCF0821/Ornl m 6.9 0.0   1   0.0 0.0 6.9, 6.9 0.43
PreCCF0822/Ornl m 3.5 0.0   1   0.0 0.0 3.5, 3.5 -0.66
PreCCF0827/Ornl f 4.5 0.0   1   0.0 0.0 4.5, 4.5 -0.09
PreCCF0829/Ornl m 8.2 0.0   1   0.0 0.0 8.2, 8.2 0.85
PreCCF0863/Ornl f 4.9 0.0   1   0.0 0.0 4.9, 4.9 0.05
PreCCF0866/Ornl f 4.9 0.0   1   0.0 0.0 4.9, 4.9 0.05
PreCCF0878/Ornl f 3.4 0.0   1   0.0 0.0 3.4, 3.4 -0.49
PreCCF0878/Ornl m 2.95 0.354   2   0.25 0.12 2.7, 3.2 -0.83
PreCCF0881/Ornl f 4.0 0.0   1   0.0 0.0 4.0, 4.0 -0.27
PreCCF0881/Ornl m 6.9 0.0   1   0.0 0.0 6.9, 6.9 0.43
PreCCF0896/Ornl f 2.5 0.0   1   0.0 0.0 2.5, 2.5 -0.82
PreCCF0896/Ornl m 5.1 0.0   1   0.0 0.0 5.1, 5.1 -0.14
PreCCF0912/Ornl m 7.2 0.0   1   0.0 0.0 7.2, 7.2 0.53
PreCCF0914/Ornl f 2.2 0.0   1   0.0 0.0 2.2, 2.2 -0.92
PreCCF0916/Ornl f 4.9 0.0   1   0.0 0.0 4.9, 4.9 0.05
PreCCF0923/Ornl f 7.7 0.0   1   0.0 0.0 7.7, 7.7 1.06
PreCCF0923/Ornl m 6.8 0.0   1   0.0 0.0 6.8, 6.8 0.4
PreCCF0940/Ornl f 3.0 0.0   1   0.0 0.0 3.0, 3.0 -0.64
PreCCF0940/Ornl m 7.0 0.0   1   0.0 0.0 7.0, 7.0 0.47
PreCCF0941/Ornl f 6.1 0.0   1   0.0 0.0 6.1, 6.1 0.48
PreCCF0941/Ornl m 7.3 0.0   1   0.0 0.0 7.3, 7.3 0.56
PreCCF0942/Ornl f 8.8 0.0   1   0.0 0.0 8.8, 8.8 1.46
PreCCF1009/Ornl f 7.15 3.18   2   2.25 0.445 4.9, 9.4 0.86
PreCCF1009/Ornl m 4.3 1.84   2   1.3 0.428 3.0, 5.6 -0.4
PreCCF1082/Ornl f 5.2 0.0   1   0.0 0.0 5.2, 5.2 0.16
PreCCF1112/Ornl f 1.6 0.0   1   0.0 0.0 1.6, 1.6 -1.14
PreCCF1114/Ornl f 3.87 1.07   3 0.617 0.277 2.7, 4.8 -0.32
PreCCF1114/Ornl m 2.35 1.12   4 0.561 0.477 1.5, 4.0 -1.03
PreCCF1119/Ornl f 1.7 0.0   1   0.0 0.0 1.7, 1.7 -1.1
PreCCF1122/Ornl m 2.5 0.0   1   0.0 0.0 2.5, 2.5 -0.98
PreCCF1136/Ornl f 1.9 0.0   1   0.0 0.0 1.9, 1.9 -1.03
PreCCF1141/Ornl f 1.1 0.0   1   0.0 0.0 1.1, 1.1 -1.32
PreCCF1141/Ornl m 3.3 0.0   1   0.0 0.0 3.3, 3.3 -0.72
PreCCF1200/Ornl m 5.1 0.0   1   0.0 0.0 5.1, 5.1 -0.14
PreCCF1207/Ornl f 4.9 0.0   1   0.0 0.0 4.9, 4.9 0.05
PreCCF1237/Ornl f 4.8 0.0   1   0.0 0.0 4.8, 4.8 0.01
PreCCF1237/Ornl m 1.9 0.0   1   0.0 0.0 1.9, 1.9 -1.17
PreCCF1246/Ornl f 2.9 0.707   2   0.5 0.244 2.4, 3.4 -0.67
PreCCF1246/Ornl m 6.8 0.0   1   0.0 0.0 6.8, 6.8 0.4
PreCCF1258/Ornl f 18.7 0.0   1   0.0 0.0 18.7, 18.7 5.03
PreCCF1258/Ornl m 4.9 0.0   1   0.0 0.0 4.9, 4.9 -0.21
PreCCF1264/Ornl f 4.7 0.0   1   0.0 0.0 4.7, 4.7 -0.02
PreCCF1279/Ornl f 4.1 0.0   1   0.0 0.0 4.1, 4.1 -0.24
PreCCF1288/Ornl m 6.7 0.424   2   0.3 0.0633 6.4, 7.0 0.37
PreCCF1309/Ornl m 5.8 0.0   1   0.0 0.0 5.8, 5.8 0.08
PreCCF1339/Ornl f 3.8 0.0   1   0.0 0.0 3.8, 3.8 -0.35
PreCCF1401/Ornl f 8.7 0.0   1   0.0 0.0 8.7, 8.7 1.42
PreCCF1401/Ornl m 6.0 0.0   1   0.0 0.0 6.0, 6.0 0.14
PreCCF1491/Ornl m 14.6 0.0   1   0.0 0.0 14.6, 14.6 2.9
PreCCF1508/Ornl f 6.6 0.0   1   0.0 0.0 6.6, 6.6 0.66
PreCCF1515/Ornl f 6.95 0.919   2   0.65 0.132 6.3, 7.6 0.79
PreCCF1516/Ornl f 2.6 0.0   1   0.0 0.0 2.6, 2.6 -0.78
PreCCF1516/Ornl m 4.05 2.19   2   1.55 0.541 2.5, 5.6 -0.48
PreCCF1519/Ornl f 3.1 0.0   1   0.0 0.0 3.1, 3.1 -0.6
PreCCF1524/Ornl f 2.0 0.0   1   0.0 0.0 2.0, 2.0 -1.0
PreCCF1524/Ornl m 6.4 0.0   1   0.0 0.0 6.4, 6.4 0.27
PreCCF1566/Ornl f 4.7 0.0   1   0.0 0.0 4.7, 4.7 -0.02
PreCCF1566/Ornl m 4.8 0.0   1   0.0 0.0 4.8, 4.8 -0.24
PreCCF1605/Ornl m 7.1 0.0   1   0.0 0.0 7.1, 7.1 0.5
PreCCF1608/Ornl f 2.8 0.0   1   0.0 0.0 2.8, 2.8 -0.71
PreCCF1611/Ornl m 2.7 0.0   1   0.0 0.0 2.7, 2.7 -0.91
PreCCF1635/Ornl f 1.6 0.141   2   0.1 0.0884 1.5, 1.7 -1.14
PreCCF1635/Ornl m 3.03 1.46   3 0.845 0.483 1.7, 4.6 -0.81
PreCCF1639/Ornl f 3.8 0.0   1   0.0 0.0 3.8, 3.8 -0.35
PreCCF1639/Ornl m 4.25 1.06   2   0.75 0.25 3.5, 5.0 -0.42
PreCCF2001/Ornl m 4.9 0.0   1   0.0 0.0 4.9, 4.9 -0.21
PreCCF2020/Ornl f 2.1 0.0   1   0.0 0.0 2.1, 2.1 -0.96
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PreCCF4410/Ornl m 4.85 4.88   2   3.45 1.01 1.4, 8.3 -0.22
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WSB/EiJ m 5.4 0.0   1   0.0 0.0 5.4, 5.4 -0.05




  GENOME-WIDE ASSOCIATION (GWAS) STATIC PLOT
Plot generated with EMMA / pyLMM using 132K SNP array. Click on plot to view at larger size.