Phenotype measure

ID, description, units MPD:41815   creatinine   serum creatinine   [mg/dL]
Data set, strains Donahue9   B6.PWD consomic w/par   25 strains     sex: both     age: 11wks
Procedure metabolic panel
Ontology mappings


  STRAIN COMPARISON PLOT
width:   ×  height:  pixels

Donahue9 - serum creatinine



  MEASURE SUMMARY
Measure Summary FemaleMale
Number of strains tested23 strains25 strains
Mean of the strain means0.162   mg/dL 0.167   mg/dL
Median of the strain means0.162   mg/dL 0.162   mg/dL
SD of the strain means± 0.0365 ± 0.0258
Coefficient of variation (CV)0.225 0.155
Min–max range of strain means0.0788   –   0.225   mg/dL 0.111   –   0.213   mg/dL
Mean sample size per strain8.3   mice 8.0   mice


  ANOVA, Q-Q NORMALITY ASSESSMENT
ANOVA summary      
FactorDFSum of squaresMean sum of squaresF valuep value (Pr>F)
sex 1 0.0017 0.0017 0.5325 0.4661
strain 22 0.2726 0.0124 3.8389 < 0.0001
sex:strain 22 0.1199 0.0055 1.6891 0.0285
Residuals 328 1.0585 0.0032


Q-Q normality assessment based on residuals

  


  STRAIN MEANS (UNADJUSTED)
Strain Sex Mean SD N mice SEM CV Min, Max Z score
B6.PWD-Chr1 f 0.17 0.0404   8 0.0143 0.237 0.11, 0.22 0.22
B6.PWD-Chr1 m 0.145 0.0707   8 0.025 0.488 0.01, 0.24 -0.84
B6.PWD-Chr10.1 f 0.128 0.0388   8 0.0137 0.304 0.06, 0.19 -0.93
B6.PWD-Chr10.1 m 0.154 0.05   7 0.0189 0.324 0.07, 0.22 -0.49
B6.PWD-Chr10.2 f 0.143 0.0403   11 0.0121 0.282 0.08, 0.2 -0.52
B6.PWD-Chr10.2 m 0.138 0.0365   10 0.0115 0.264 0.08, 0.2 -1.11
B6.PWD-Chr10.3 f 0.18 0.0697   8 0.0246 0.387 0.11, 0.31 0.49
B6.PWD-Chr10.3 m 0.171 0.0236   8 0.00833 0.138 0.15, 0.22 0.17
B6.PWD-Chr11.1 f 0.203 0.0377   12 0.0109 0.186 0.13, 0.26 1.12
B6.PWD-Chr11.1 m 0.206 0.0315   12 0.00908 0.153 0.17, 0.27 1.53
B6.PWD-Chr11.2 f 0.15 0.0377   10 0.0119 0.251 0.09, 0.23 -0.33
B6.PWD-Chr11.2 m 0.213 0.0856   10 0.0271 0.402 0.1, 0.33 1.8
B6.PWD-Chr11.3 f 0.106 0.0272   10 0.00859 0.256 0.07, 0.15 -1.54
B6.PWD-Chr11.3 m 0.12 0.0583   8 0.0206 0.486 0.0, 0.18 -1.81
B6.PWD-Chr12 f 0.141 0.0259   8 0.00915 0.183 0.11, 0.17 -0.58
B6.PWD-Chr12 m 0.181 0.03   8 0.0106 0.165 0.14, 0.21 0.56
B6.PWD-Chr14 f 0.22 0.05   9 0.0167 0.227 0.17, 0.33 1.59
B6.PWD-Chr14 m 0.174 0.0461   9 0.0154 0.264 0.09, 0.26 0.29
B6.PWD-Chr15 f 0.15 0.0487   8 0.0172 0.325 0.09, 0.24 -0.33
B6.PWD-Chr15 m 0.111 0.0702   8 0.0248 0.631 0.0, 0.21 -2.15
B6.PWD-Chr16 f 0.225 0.189   10 0.0596 0.838 0.1, 0.66 1.72
B6.PWD-Chr16 m 0.157 0.0197   6 0.00803 0.126 0.13, 0.18 -0.37
B6.PWD-Chr17 f 0.118 0.0349   8 0.0124 0.297 0.07, 0.16 -1.21
B6.PWD-Chr17 m 0.17 0.0469   4 0.0235 0.276 0.11, 0.22 0.13
B6.PWD-Chr18 f 0.163 0.0345   8 0.0122 0.213 0.1, 0.2 0.03
B6.PWD-Chr18 m 0.142 0.0483   8 0.0171 0.339 0.1, 0.24 -0.95
B6.PWD-Chr19 f 0.206 0.037   8 0.0131 0.179 0.15, 0.25 1.2
B6.PWD-Chr19 m 0.199 0.139   8 0.049 0.697 0.13, 0.54 1.26
B6.PWD-Chr3 m 0.154 0.0631   9 0.021 0.408 0.04, 0.25 -0.49
B6.PWD-Chr5 f 0.195 0.0278   8 0.00982 0.142 0.15, 0.23 0.9
B6.PWD-Chr5 m 0.194 0.0403   8 0.0143 0.208 0.15, 0.26 1.06
B6.PWD-Chr6 f 0.157 0.0748   8 0.0264 0.475 0.08, 0.3 -0.14
B6.PWD-Chr6 m 0.191 0.0624   8 0.0221 0.326 0.1, 0.32 0.95
B6.PWD-Chr9 f 0.148 0.0222   4 0.0111 0.15 0.12, 0.17 -0.39
B6.PWD-Chr9 m 0.153 0.032   7 0.0121 0.209 0.11, 0.19 -0.53
B6.PWD-ChrX.1 f 0.162 0.0259   5 0.0116 0.16 0.13, 0.19 0.0
B6.PWD-ChrX.1 m 0.162 0.0299   6 0.0122 0.185 0.12, 0.2 -0.18
B6.PWD-ChrX.2 m 0.191 0.0271   9 0.00904 0.142 0.15, 0.22 0.95
B6.PWD-ChrX.3 f 0.133 0.0648   8 0.0229 0.489 0.03, 0.23 -0.8
B6.PWD-ChrX.3 m 0.185 0.0214   8 0.00756 0.116 0.15, 0.21 0.71
B6.PWD-ChrY f 0.172 0.0345   8 0.0122 0.2 0.11, 0.21 0.27
B6.PWD-ChrY m 0.156 0.0257   7 0.00972 0.165 0.11, 0.19 -0.41
B6.PWD-mt f 0.189 0.029   8 0.0103 0.154 0.15, 0.24 0.74
B6.PWD-mt m 0.188 0.0341   8 0.0121 0.182 0.14, 0.24 0.83
C57BL/6J f 0.0788 0.0164   8 0.00581 0.209 0.06, 0.1 -2.28
C57BL/6J m 0.156 0.032   8 0.0113 0.205 0.1, 0.2 -0.41
PWD/PhJ f 0.19 0.0151   8 0.00535 0.0796 0.17, 0.21 0.76
PWD/PhJ m 0.153 0.0397   9 0.0132 0.259 0.08, 0.2 -0.53


  LEAST SQUARES MEANS (ADJUSTED)
Strain Sex Mean SEM UpperCL LowerCL
B6.PWD-Chr1 f 0.17 0.0201 0.2095 0.1305
B6.PWD-Chr1 m 0.145 0.0201 0.1845 0.1055
B6.PWD-Chr10.1 f 0.1275 0.0201 0.167 0.088
B6.PWD-Chr10.1 m 0.1543 0.0215 0.1965 0.112
B6.PWD-Chr10.2 f 0.1427 0.0171 0.1764 0.109
B6.PWD-Chr10.2 m 0.138 0.018 0.1733 0.1027
B6.PWD-Chr10.3 f 0.18 0.0201 0.2195 0.1405
B6.PWD-Chr10.3 m 0.1713 0.0201 0.2108 0.1317
B6.PWD-Chr11.1 f 0.2025 0.0164 0.2348 0.1702
B6.PWD-Chr11.1 m 0.2058 0.0164 0.2381 0.1736
B6.PWD-Chr11.2 f 0.15 0.018 0.1853 0.1147
B6.PWD-Chr11.2 m 0.213 0.018 0.2483 0.1777
B6.PWD-Chr11.3 f 0.106 0.018 0.1413 0.0707
B6.PWD-Chr11.3 m 0.12 0.0201 0.1595 0.0805
B6.PWD-Chr12 f 0.1413 0.0201 0.1808 0.1017
B6.PWD-Chr12 m 0.1813 0.0201 0.2208 0.1417
B6.PWD-Chr14 f 0.22 0.0189 0.2573 0.1827
B6.PWD-Chr14 m 0.1744 0.0189 0.2117 0.1372
B6.PWD-Chr15 f 0.15 0.0201 0.1895 0.1105
B6.PWD-Chr15 m 0.1112 0.0201 0.1508 0.0717
B6.PWD-Chr16 f 0.225 0.018 0.2603 0.1897
B6.PWD-Chr16 m 0.1567 0.0232 0.2023 0.111
B6.PWD-Chr17 f 0.1175 0.0201 0.157 0.078
B6.PWD-Chr17 m 0.17 0.0284 0.2259 0.1141
B6.PWD-Chr18 f 0.1625 0.0201 0.202 0.123
B6.PWD-Chr18 m 0.1425 0.0201 0.182 0.103
B6.PWD-Chr19 f 0.2062 0.0201 0.2458 0.1667
B6.PWD-Chr19 m 0.1988 0.0201 0.2383 0.1592
B6.PWD-Chr5 f 0.195 0.0201 0.2345 0.1555
B6.PWD-Chr5 m 0.1937 0.0201 0.2333 0.1542
B6.PWD-Chr6 f 0.1575 0.0201 0.197 0.118
B6.PWD-Chr6 m 0.1913 0.0201 0.2308 0.1517
B6.PWD-Chr9 f 0.1475 0.0284 0.2034 0.0916
B6.PWD-Chr9 m 0.1529 0.0215 0.1951 0.1106
B6.PWD-ChrX.1 f 0.162 0.0254 0.212 0.112
B6.PWD-ChrX.1 m 0.1617 0.0232 0.2073 0.116
B6.PWD-ChrX.3 f 0.1325 0.0201 0.172 0.093
B6.PWD-ChrX.3 m 0.185 0.0201 0.2245 0.1455
B6.PWD-ChrY f 0.1725 0.0201 0.212 0.133
B6.PWD-ChrY m 0.1557 0.0215 0.198 0.1135
B6.PWD-mt f 0.1888 0.0201 0.2283 0.1492
B6.PWD-mt m 0.1875 0.0201 0.227 0.148
C57BL/6J f 0.0788 0.0201 0.1183 0.0392
C57BL/6J m 0.1563 0.0201 0.1958 0.1167
PWD/PhJ f 0.19 0.0201 0.2295 0.1505
PWD/PhJ m 0.1533 0.0189 0.1906 0.1161


  LEAST SQUARES MEANS (ADJUSTED), SEXES COMBINED
Strain Sex Mean SEM UpperCL LowerCL
B6.PWD-Chr1 both 0.1575 0.0142 0.1854 0.1296
B6.PWD-Chr10.1 both 0.1409 0.0147 0.1698 0.112
B6.PWD-Chr10.2 both 0.1404 0.0124 0.1648 0.1159
B6.PWD-Chr10.3 both 0.1756 0.0142 0.2036 0.1477
B6.PWD-Chr11.1 both 0.2042 0.0116 0.227 0.1814
B6.PWD-Chr11.2 both 0.1815 0.0127 0.2065 0.1565
B6.PWD-Chr11.3 both 0.113 0.0135 0.1395 0.0865
B6.PWD-Chr12 both 0.1613 0.0142 0.1892 0.1333
B6.PWD-Chr14 both 0.1972 0.0134 0.2236 0.1709
B6.PWD-Chr15 both 0.1306 0.0142 0.1586 0.1027
B6.PWD-Chr16 both 0.1908 0.0147 0.2197 0.162
B6.PWD-Chr17 both 0.1437 0.0174 0.178 0.1095
B6.PWD-Chr18 both 0.1525 0.0142 0.1804 0.1246
B6.PWD-Chr19 both 0.2025 0.0142 0.2304 0.1746
B6.PWD-Chr5 both 0.1944 0.0142 0.2223 0.1664
B6.PWD-Chr6 both 0.1744 0.0142 0.2023 0.1464
B6.PWD-Chr9 both 0.1502 0.0178 0.1852 0.1152
B6.PWD-ChrX.1 both 0.1618 0.0172 0.1957 0.128
B6.PWD-ChrX.3 both 0.1588 0.0142 0.1867 0.1308
B6.PWD-ChrY both 0.1641 0.0147 0.193 0.1352
B6.PWD-mt both 0.1881 0.0142 0.2161 0.1602
C57BL/6J both 0.1175 0.0142 0.1454 0.0896
PWD/PhJ both 0.1717 0.0138 0.1988 0.1445