Project measure / variable:   Jentsch1   revers_latency_reward

ID, description, units MPD:40312   revers_latency_reward   average latency to retrieve food reward, reversal phase   [s]  
Data set, strains Jentsch1   BXD w/par   53 strains     sex: m     age: 17wks
Procedure operant conditioning chamber
Ontology mappings

  •   Or, add this measure to your collection.
       
  •     no folder
  •     put it in new folder  

  STRAIN COMPARISON PLOT
Dimensions Width:   px    Height:   px
Download Plot   
Visualization Options

Jentsch1 - average latency to retrieve food reward, reversal phase



  MEASURE SUMMARY
Measure Summary Male
Number of strains tested53 strains
Mean of the strain means0.302   s
Median of the strain means0.300   s
SD of the strain means± 0.0614
Coefficient of variation (CV)0.204
Min–max range of strain means0.200   –   0.450   s
Mean sample size per strain3.3   mice


  ANOVA, Q-Q NORMALITY ASSESSMENT
ANOVA summary      
FactorDFSum of squaresMean sum of squaresF valuep value (Pr>F)
strain 52 0.5423 0.0104 2.3859 < 0.0001
Residuals 123 0.5377 0.0044


Q-Q normality assessment based on residuals

  


  STRAIN MEANS (UNADJUSTED)
  
Select table page:
Strain Sex Mean SD N mice SEM CV Min, Max Z score
BXD100/RwwJ m 0.38 0.11   5 0.049 0.288 0.3, 0.5 1.28
BXD102/RwwJ m 0.28 0.0447   5 0.02 0.16 0.2, 0.3 -0.35
BXD12/TyJ m 0.4 0.0   2   0.0 0.0 0.4, 0.4 1.6
BXD13/TyJ m 0.2 0.0   2   0.0 0.0 0.2, 0.2 -1.66
BXD14/TyJ m 0.3 0.0   2   0.0 0.0 0.3, 0.3 -0.03
BXD16/TyJ m 0.2 0.0   2   0.0 0.0 0.2, 0.2 -1.66
BXD18/TyJ m 0.25 0.0707   2   0.05 0.283 0.2, 0.3 -0.84
BXD1/TyJ m 0.32 0.0447   5 0.02 0.14 0.3, 0.4 0.3
BXD22/TyJ m 0.25 0.0707   2   0.05 0.283 0.2, 0.3 -0.84
BXD24/TyJ m 0.32 0.11   5 0.049 0.342 0.2, 0.5 0.3
BXD25/TyJ m 0.3 0.0   2   0.0 0.0 0.3, 0.3 -0.03
BXD29-Tlr4lps-2J/J m 0.4 0.141   2   0.1 0.354 0.3, 0.5 1.6
BXD2/TyJ m 0.4 0.0   2   0.0 0.0 0.4, 0.4 1.6
BXD31/TyJ m 0.4 0.141   4 0.0707 0.354 0.3, 0.6 1.6
BXD32/TyJ m 0.3 0.0   4 0.0 0.0 0.3, 0.3 -0.03
BXD34/TyJ m 0.25 0.0548   6 0.0224 0.219 0.2, 0.3 -0.84
BXD36/TyJ m 0.35 0.0707   2   0.05 0.202 0.3, 0.4 0.79
BXD38/TyJ m 0.225 0.05   4 0.025 0.222 0.2, 0.3 -1.25
BXD39/TyJ m 0.3 0.0   3 0.0 0.0 0.3, 0.3 -0.03
BXD40/TyJ m 0.26 0.0548   5 0.0245 0.211 0.2, 0.3 -0.68
BXD42/TyJ m 0.26 0.0548   5 0.0245 0.211 0.2, 0.3 -0.68
BXD43/RwwJ m 0.3 0.0816   4 0.0408 0.272 0.2, 0.4 -0.03
BXD44/RwwJ m 0.35 0.0707   2   0.05 0.202 0.3, 0.4 0.79
BXD45/RwwJ m 0.3 0.0   2   0.0 0.0 0.3, 0.3 -0.03
BXD48a/RwwJ m 0.275 0.05   4 0.025 0.182 0.2, 0.3 -0.43
BXD49/RwwJ m 0.3 0.0   2   0.0 0.0 0.3, 0.3 -0.03
BXD50/RwwJ m 0.325 0.05   4 0.025 0.154 0.3, 0.4 0.38
BXD51/RwwJ m 0.233 0.0577   3 0.0333 0.247 0.2, 0.3 -1.12
BXD55/RwwJ m 0.3 0.0   3 0.0 0.0 0.3, 0.3 -0.03
BXD56/RwwJ m 0.45 0.0707   2   0.05 0.157 0.4, 0.5 2.42
BXD60/RwwJ m 0.2 0.0   2   0.0 0.0 0.2, 0.2 -1.66
BXD61/RwwJ m 0.233 0.0577   3 0.0333 0.247 0.2, 0.3 -1.12
BXD62/RwwJ m 0.34 0.0894   5 0.04 0.263 0.2, 0.4 0.63
BXD65/RwwJ m 0.35 0.0707   2   0.05 0.202 0.3, 0.4 0.79
BXD66/RwwJ m 0.25 0.0707   2   0.05 0.283 0.2, 0.3 -0.84
BXD68/RwwJ m 0.283 0.0408   6 0.0167 0.144 0.2, 0.3 -0.3
BXD70/RwwJ m 0.433 0.0577   3 0.0333 0.133 0.4, 0.5 2.14
BXD71/RwwJ m 0.225 0.05   4 0.025 0.222 0.2, 0.3 -1.25
BXD73a/RwwJ m 0.3 0.0   5 0.0 0.0 0.3, 0.3 -0.03
BXD73b/RwwJ m 0.3 0.0   4 0.0 0.0 0.3, 0.3 -0.03
BXD73/RwwJ m 0.3 0.0   2   0.0 0.0 0.3, 0.3 -0.03
BXD75/RwwJ m 0.32 0.0837   5 0.0374 0.261 0.2, 0.4 0.3
BXD77/RwwJ m 0.35 0.0707   2   0.05 0.202 0.3, 0.4 0.79
BXD83/RwwJ m 0.325 0.05   4 0.025 0.154 0.3, 0.4 0.38
BXD84/RwwJ m 0.367 0.115   3 0.0667 0.315 0.3, 0.5 1.07
BXD85/RwwJ m 0.28 0.0447   5 0.02 0.16 0.2, 0.3 -0.35
BXD86/RwwJ m 0.375 0.05   4 0.025 0.133 0.3, 0.4 1.2
BXD89/RwwJ m 0.267 0.115   3 0.0667 0.433 0.2, 0.4 -0.56
BXD90/RwwJ m 0.35 0.0707   2   0.05 0.202 0.3, 0.4 0.79
BXD95/RwwJ m 0.25 0.0707   2   0.05 0.283 0.2, 0.3 -0.84
BXD98/RwwJ m 0.2 0.0   2   0.0 0.0 0.2, 0.2 -1.66
C57BL/6J m 0.26 0.0548   5 0.0245 0.211 0.2, 0.3 -0.68
DBA/2J m 0.25 0.1   4 0.05 0.4 0.2, 0.4 -0.84


  LEAST SQUARES MEANS (MODEL-ADJUSTED)
Strain Sex Mean SEM UpperCL LowerCL
BXD100/RwwJ m 0.38 0.0296 0.4385 0.3215
BXD102/RwwJ m 0.28 0.0296 0.3385 0.2215
BXD12/TyJ m 0.4 0.0468 0.4925 0.3075
BXD13/TyJ m 0.2 0.0468 0.2925 0.1075
BXD14/TyJ m 0.3 0.0468 0.3925 0.2075
BXD16/TyJ m 0.2 0.0468 0.2925 0.1075
BXD18/TyJ m 0.25 0.0468 0.3425 0.1575
BXD1/TyJ m 0.32 0.0296 0.3785 0.2615
BXD22/TyJ m 0.25 0.0468 0.3425 0.1575
BXD24/TyJ m 0.32 0.0296 0.3785 0.2615
BXD25/TyJ m 0.3 0.0468 0.3925 0.2075
BXD29-Tlr4lps-2J/J m 0.4 0.0468 0.4925 0.3075
BXD2/TyJ m 0.4 0.0468 0.4925 0.3075
BXD31/TyJ m 0.4 0.0331 0.4654 0.3346
BXD32/TyJ m 0.3 0.0331 0.3654 0.2346
BXD34/TyJ m 0.25 0.027 0.3034 0.1966
BXD36/TyJ m 0.35 0.0468 0.4425 0.2575
BXD38/TyJ m 0.225 0.0331 0.2904 0.1596
BXD39/TyJ m 0.3 0.0382 0.3756 0.2244
BXD40/TyJ m 0.26 0.0296 0.3185 0.2015
BXD42/TyJ m 0.26 0.0296 0.3185 0.2015
BXD43/RwwJ m 0.3 0.0331 0.3654 0.2346
BXD44/RwwJ m 0.35 0.0468 0.4425 0.2575
BXD45/RwwJ m 0.3 0.0468 0.3925 0.2075
BXD48a/RwwJ m 0.275 0.0331 0.3404 0.2096
BXD49/RwwJ m 0.3 0.0468 0.3925 0.2075
BXD50/RwwJ m 0.325 0.0331 0.3904 0.2596
BXD51/RwwJ m 0.2333 0.0382 0.3089 0.1578
BXD55/RwwJ m 0.3 0.0382 0.3756 0.2244
BXD56/RwwJ m 0.45 0.0468 0.5425 0.3575
BXD60/RwwJ m 0.2 0.0468 0.2925 0.1075
BXD61/RwwJ m 0.2333 0.0382 0.3089 0.1578
BXD62/RwwJ m 0.34 0.0296 0.3985 0.2815
BXD65/RwwJ m 0.35 0.0468 0.4425 0.2575
BXD66/RwwJ m 0.25 0.0468 0.3425 0.1575
BXD68/RwwJ m 0.2833 0.027 0.3368 0.2299
BXD70/RwwJ m 0.4333 0.0382 0.5089 0.3578
BXD71/RwwJ m 0.225 0.0331 0.2904 0.1596
BXD73a/RwwJ m 0.3 0.0296 0.3585 0.2415
BXD73b/RwwJ m 0.3 0.0331 0.3654 0.2346
BXD73/RwwJ m 0.3 0.0468 0.3925 0.2075
BXD75/RwwJ m 0.32 0.0296 0.3785 0.2615
BXD77/RwwJ m 0.35 0.0468 0.4425 0.2575
BXD83/RwwJ m 0.325 0.0331 0.3904 0.2596
BXD84/RwwJ m 0.3667 0.0382 0.4422 0.2911
BXD85/RwwJ m 0.28 0.0296 0.3385 0.2215
BXD86/RwwJ m 0.375 0.0331 0.4404 0.3096
BXD89/RwwJ m 0.2667 0.0382 0.3422 0.1911
BXD90/RwwJ m 0.35 0.0468 0.4425 0.2575
BXD95/RwwJ m 0.25 0.0468 0.3425 0.1575
BXD98/RwwJ m 0.2 0.0468 0.2925 0.1075
C57BL/6J m 0.26 0.0296 0.3185 0.2015
DBA/2J m 0.25 0.0331 0.3154 0.1846




  GWAS USING LINEAR MIXED MODELS