Project measure / variable:   Berndt2   airway_elas_slope

ID, description, units MPD:35196   airway_elas_slope   lung tissue dynamic elastance (H20 pressure)   [cm/mL]  response index  
methacholine study
Data set, strains Berndt2   inbred   29 strains     sex: both     age: 9-12wks
Procedure ventilator
Ontology mappings

  •   Or, add this measure to your collection.
       
  •     no folder
  •     put it in new folder  

  STRAIN COMPARISON PLOT
Dimensions Width:   px    Height:   px
Download Plot   
Visualization Options

Berndt2 - lung tissue dynamic elastance (H20 pressure) response index



  MEASURE SUMMARY
Measure Summary FemaleMale
Number of strains tested29 strains29 strains
Mean of the strain means0.158   cm/mL 0.184   cm/mL
Median of the strain means0.160   cm/mL 0.175   cm/mL
SD of the strain means± 0.0704 ± 0.0688
Coefficient of variation (CV)0.445 0.373
Min–max range of strain means0.0391   –   0.295   cm/mL 0.0820   –   0.457   cm/mL
Mean sample size per strain8.7   mice 9.9   mice


  ANOVA, Q-Q NORMALITY ASSESSMENT
ANOVA summary      
FactorDFSum of squaresMean sum of squaresF valuep value (Pr>F)
sex 1 0.1017 0.1017 12.2831 0.0005
strain 28 1.6054 0.0573 6.9218 < 0.0001
sex:strain 28 0.8349 0.0298 3.5998 < 0.0001
Residuals 477 3.9512 0.0083


Q-Q normality assessment based on residuals

  


  STRAIN MEANS (UNADJUSTED)
  
Select table page:
Strain Sex Mean SD N mice SEM CV Min, Max Z score
129S1/SvImJ f 0.061 0.0571   9 0.019 0.936 0.014, 0.163 -1.38
129S1/SvImJ m 0.153 0.0959   8 0.0339 0.626 0.013, 0.274 -0.46
A/J f 0.265 0.149   10 0.0471 0.561 -0.055, 0.452 1.52
A/J m 0.457 0.145   9 0.0483 0.317 0.198, 0.64 3.96
AKR/J f 0.199 0.0848   9 0.0283 0.426 0.065, 0.313 0.58
AKR/J m 0.172 0.0618   10 0.0195 0.36 0.048, 0.276 -0.18
BALB/cByJ f 0.295 0.0897   8 0.0317 0.304 0.146, 0.408 1.95
BALB/cByJ m 0.2 0.103   8 0.0365 0.516 0.092, 0.422 0.23
BALB/cJ f 0.207 0.0448   8 0.0158 0.217 0.147, 0.266 0.7
BALB/cJ m 0.236 0.122   12 0.0353 0.518 0.01, 0.403 0.75
BTBR T+ Itpr3tf/J f 0.127 0.0821   10 0.026 0.649 -0.024, 0.284 -0.44
BTBR T+ Itpr3tf/J m 0.176 0.0829   10 0.0262 0.47 0.084, 0.327 -0.12
BUB/BnJ f 0.198 0.0819   9 0.0273 0.413 0.077, 0.28 0.57
BUB/BnJ m 0.263 0.109   10 0.0344 0.414 0.131, 0.468 1.14
C3H/HeJ f 0.176 0.0504   10 0.0159 0.285 0.111, 0.236 0.26
C3H/HeJ m 0.114 0.0657   9 0.0219 0.577 0.023, 0.227 -1.02
C57BL/10J f 0.0728 0.0695   9 0.0232 0.955 0.014, 0.211 -1.21
C57BL/10J m 0.131 0.0741   10 0.0234 0.567 0.035, 0.282 -0.78
C57BL/6J f 0.0604 0.0412   7 0.0156 0.683 0.019, 0.14 -1.39
C57BL/6J m 0.187 0.0936   8 0.0331 0.502 0.048, 0.306 0.04
C57BLKS/J f 0.142 0.0585   9 0.0195 0.411 0.065, 0.235 -0.23
C57BLKS/J m 0.154 0.0876   12 0.0253 0.571 0.039, 0.323 -0.44
C57BR/cdJ f 0.232 0.133   7 0.0504 0.576 0.06, 0.461 1.05
C57BR/cdJ m 0.146 0.0666   12 0.0192 0.457 0.076, 0.269 -0.56
C57L/J f 0.161 0.141   6 0.0575 0.876 0.06, 0.419 0.04
C57L/J m 0.16 0.0923   10 0.0292 0.577 0.039, 0.299 -0.35
CBA/J f 0.134 0.0755   8 0.0267 0.563 0.037, 0.241 -0.34
CBA/J m 0.107 0.0595   11 0.0179 0.556 0.033, 0.229 -1.13
CE/J f 0.187 0.1   9 0.0334 0.536 0.053, 0.314 0.41
CE/J m 0.185 0.0678   9 0.0226 0.366 0.079, 0.264 0.01
DBA/1J f 0.217 0.12   9 0.0401 0.554 0.069, 0.382 0.84
DBA/1J m 0.235 0.0964   11 0.0291 0.411 0.134, 0.441 0.74
DBA/2J f 0.142 0.0805   10 0.0255 0.568 0.018, 0.272 -0.23
DBA/2J m 0.262 0.115   10 0.0363 0.438 0.031, 0.462 1.13
FVB/NJ f 0.123 0.0913   10 0.0289 0.741 0.041, 0.343 -0.5
FVB/NJ m 0.239 0.0955   10 0.0302 0.4 0.067, 0.353 0.79
I/LnJ f 0.291 0.24   9 0.0799 0.823 0.139, 0.908 1.89
I/LnJ m 0.175 0.0937   8 0.0331 0.534 0.008, 0.259 -0.14
KK/HlJ f 0.233 0.0736   9 0.0245 0.315 0.074, 0.326 1.07
KK/HlJ m 0.154 0.0926   10 0.0293 0.601 0.038, 0.309 -0.44
LP/J f 0.0391 0.0311   9 0.0104 0.796 0.005, 0.108 -1.69
LP/J m 0.177 0.0962   12 0.0278 0.545 0.069, 0.39 -0.11
NOD/ShiLtJ f 0.151 0.0825   9 0.0275 0.547 0.077, 0.356 -0.1
NOD/ShiLtJ m 0.207 0.0771   11 0.0232 0.372 0.1, 0.373 0.33
NON/ShiLtJ f 0.16 0.0774   7 0.0293 0.484 0.071, 0.289 0.03
NON/ShiLtJ m 0.177 0.0338   7 0.0128 0.191 0.131, 0.225 -0.11
NZW/LacJ f 0.179 0.0988   8 0.0349 0.553 0.053, 0.379 0.3
NZW/LacJ m 0.118 0.0823   10 0.026 0.698 0.028, 0.318 -0.97
PL/J f 0.103 0.0444   9 0.0148 0.429 0.029, 0.18 -0.78
PL/J m 0.162 0.0609   8 0.0215 0.375 0.045, 0.229 -0.33
RIIIS/J f 0.199 0.102   5 0.0454 0.51 0.062, 0.33 0.58
RIIIS/J m 0.143 0.11   9 0.0365 0.768 0.032, 0.398 -0.6
SJL/J f 0.0604 0.0374   8 0.0132 0.619 0.019, 0.118 -1.39
SJL/J m 0.207 0.081   12 0.0234 0.391 0.061, 0.368 0.33
SM/J f 0.0923 0.0587   10 0.0186 0.636 0.027, 0.219 -0.93
SM/J m 0.082 0.0469   8 0.0166 0.572 -0.019, 0.123 -1.49
SWR/J f 0.0763 0.0331   9 0.011 0.433 0.028, 0.123 -1.16
SWR/J m 0.169 0.0739   12 0.0213 0.437 0.042, 0.297 -0.22


  LEAST SQUARES MEANS (MODEL-ADJUSTED)
Strain Sex Mean SEM UpperCL LowerCL
129S1/SvImJ f 0.061 0.0303 0.1206 0.0014
129S1/SvImJ m 0.1531 0.0322 0.2164 0.0899
A/J f 0.2654 0.0288 0.322 0.2088
A/J m 0.4569 0.0303 0.5165 0.3973
AKR/J f 0.199 0.0303 0.2586 0.1394
AKR/J m 0.1719 0.0288 0.2285 0.1153
BALB/cByJ f 0.295 0.0322 0.3582 0.2318
BALB/cByJ m 0.2001 0.0322 0.2634 0.1369
BALB/cJ f 0.2066 0.0322 0.2699 0.1434
BALB/cJ m 0.2362 0.0263 0.2878 0.1845
BTBR T+ Itpr3tf/J f 0.1266 0.0288 0.1832 0.07
BTBR T+ Itpr3tf/J m 0.1763 0.0288 0.2329 0.1197
BUB/BnJ f 0.1982 0.0303 0.2578 0.1386
BUB/BnJ m 0.2629 0.0288 0.3195 0.2063
C3H/HeJ f 0.1764 0.0288 0.233 0.1198
C3H/HeJ m 0.1138 0.0303 0.1734 0.0542
C57BL/10J f 0.0728 0.0303 0.1324 0.0132
C57BL/10J m 0.1306 0.0288 0.1872 0.074
C57BL/6J f 0.0604 0.0344 0.128 0.0
C57BL/6J m 0.1866 0.0322 0.2499 0.1234
C57BLKS/J f 0.1423 0.0303 0.2019 0.0827
C57BLKS/J m 0.1536 0.0263 0.2052 0.102
C57BR/cdJ f 0.2316 0.0344 0.2992 0.164
C57BR/cdJ m 0.1457 0.0263 0.1973 0.094
C57L/J f 0.1607 0.0372 0.2337 0.0877
C57L/J m 0.1599 0.0288 0.2165 0.1033
CBA/J f 0.1341 0.0322 0.1974 0.0709
CBA/J m 0.107 0.0274 0.1609 0.0531
CE/J f 0.187 0.0303 0.2466 0.1274
CE/J m 0.1851 0.0303 0.2447 0.1255
DBA/1J f 0.2173 0.0303 0.2769 0.1577
DBA/1J m 0.2347 0.0274 0.2886 0.1808
DBA/2J f 0.1417 0.0288 0.1983 0.0851
DBA/2J m 0.262 0.0288 0.3186 0.2054
FVB/NJ f 0.1232 0.0288 0.1798 0.0666
FVB/NJ m 0.239 0.0288 0.2956 0.1824
I/LnJ f 0.2914 0.0303 0.3511 0.2318
I/LnJ m 0.1753 0.0322 0.2385 0.112
KK/HlJ f 0.2334 0.0303 0.2931 0.1738
KK/HlJ m 0.154 0.0288 0.2106 0.0974
LP/J f 0.0391 0.0303 0.0987 0.0
LP/J m 0.1766 0.0263 0.2282 0.125
NOD/ShiLtJ f 0.1507 0.0303 0.2103 0.0911
NOD/ShiLtJ m 0.2072 0.0274 0.2611 0.1533
NON/ShiLtJ f 0.1599 0.0344 0.2275 0.0923
NON/ShiLtJ m 0.177 0.0344 0.2446 0.1094
NZW/LacJ f 0.1786 0.0322 0.2419 0.1154
NZW/LacJ m 0.1179 0.0288 0.1745 0.0613
PL/J f 0.1034 0.0303 0.1631 0.0438
PL/J m 0.1624 0.0322 0.2256 0.0991
RIIIS/J f 0.1992 0.0407 0.2792 0.1192
RIIIS/J m 0.1428 0.0303 0.2024 0.0832
SJL/J f 0.0604 0.0322 0.1236 0.0
SJL/J m 0.2073 0.0263 0.2589 0.1556
SM/J f 0.0923 0.0288 0.1489 0.0357
SM/J m 0.082 0.0322 0.1452 0.0188
SWR/J f 0.0763 0.0303 0.1359 0.0167
SWR/J m 0.1693 0.0263 0.2209 0.1176


  LEAST SQUARES MEANS (MODEL-ADJUSTED), SEXES COMBINED
Strain Sex Mean SEM UpperCL LowerCL
129S1/SvImJ both 0.1071 0.0221 0.1505 0.0636
A/J both 0.3611 0.0209 0.4022 0.3201
AKR/J both 0.1854 0.0209 0.2265 0.1444
BALB/cByJ both 0.2476 0.0228 0.2923 0.2029
BALB/cJ both 0.2214 0.0208 0.2622 0.1806
BTBR T+ Itpr3tf/J both 0.1514 0.0204 0.1914 0.1115
BUB/BnJ both 0.2306 0.0209 0.2716 0.1895
C3H/HeJ both 0.1451 0.0209 0.1862 0.104
C57BL/10J both 0.1017 0.0209 0.1428 0.0606
C57BL/6J both 0.1235 0.0236 0.1698 0.0772
C57BLKS/J both 0.148 0.0201 0.1874 0.1085
C57BR/cdJ both 0.1886 0.0216 0.2311 0.1461
C57L/J both 0.1603 0.0235 0.2065 0.1141
CBA/J both 0.1206 0.0211 0.1621 0.079
CE/J both 0.1861 0.0215 0.2282 0.1439
DBA/1J both 0.226 0.0205 0.2662 0.1858
DBA/2J both 0.2018 0.0204 0.2418 0.1619
FVB/NJ both 0.1811 0.0204 0.2211 0.1411
I/LnJ both 0.2333 0.0221 0.2768 0.1899
KK/HlJ both 0.1937 0.0209 0.2348 0.1526
LP/J both 0.1078 0.0201 0.1473 0.0684
NOD/ShiLtJ both 0.1789 0.0205 0.2191 0.1387
NON/ShiLtJ both 0.1684 0.0243 0.2162 0.1206
NZW/LacJ both 0.1483 0.0216 0.1907 0.1058
PL/J both 0.1329 0.0221 0.1764 0.0895
RIIIS/J both 0.171 0.0254 0.2209 0.1211
SJL/J both 0.1338 0.0208 0.1746 0.093
SM/J both 0.0871 0.0216 0.1296 0.0447
SWR/J both 0.1228 0.0201 0.1622 0.0834




  GWAS USING LINEAR MIXED MODELS