Phenotype measure:   CGDpheno1   bodylength

ID, description, units MPD:31889   bodylength   body length (tip of nose to base of tail)   [cm]
Data set, strains CGDpheno1   inbred w/CC7   66 strains     sex: both     age: 13wks
Procedure body size and weight
Ontology mappings

  STRAIN COMPARISON PLOT
Dimensions Width:   px    Height:   px
Download Plot   
Visualization Options

CGDpheno1 - body length (tip of nose to base of tail)



  MEASURE SUMMARY
Measure Summary FemaleMale
Number of strains tested66 strains65 strains
Mean of the strain means8.39   cm 8.73   cm
Median of the strain means8.46   cm 8.66   cm
SD of the strain means± 0.728 ± 0.702
Coefficient of variation (CV)0.0868 0.0804
Min–max range of strain means6.67   –   10.4   cm 7.30   –   10.9   cm
Mean sample size per strain6.5   mice 6.6   mice


  STRAIN MEANS (SUBMITTER-ADJUSTED)
Strain Sex Mean SD N mice SEM CV Min, Max Z score
129S1/SvImJ f 8.82 0.3   8 0.106 0.034 0.59
129S1/SvImJ m 9.18 0.292   7 0.111 0.0318 0.65
A/J f 8.11 0.276   7 0.104 0.034 -0.38
A/J m 8.46 0.278   8 0.0982 0.0328 -0.38
AKR/J f 9.49 0.271   8 0.0956 0.0285 1.51
AKR/J m 9.43 0.283   8 0.0999 0.03 1.0
ALR/LtJ f 9.51 0.29   8 0.103 0.0305 1.54
ALR/LtJ m 9.57 0.29   8 0.103 0.0303 1.2
ALS/LtJ f 9.67 0.265   8 0.0935 0.0273 1.76
ALS/LtJ m 10.0 0.261   8 0.0924 0.026 1.81
BALB/cByJ f 8.57 0.293   8 0.104 0.0342 0.25
BALB/cByJ m 8.66 0.293   8 0.104 0.0339 -0.09
BPH/2J f 8.12 0.281   8 0.0993 0.0346 -0.37
BPL/1J f 7.65 0.271   5 0.121 0.0354 -1.01
BPL/1J m 8.57 0.248   2   0.175 0.0289 -0.22
BPN/3J f 8.82 0.249   4 0.124 0.0282 0.59
BPN/3J m 8.97 0.264   4 0.132 0.0295 0.35
BUB/BnJ f 8.95 0.244   1   0.244 0.0272 0.77
C3H/HeJ f 8.91 0.287   8 0.101 0.0322 0.72
C3H/HeJ m 8.78 0.283   8 0.1 0.0322 0.08
C57BL/6J f 8.53 0.309   96 0.0316 0.0362 0.2
C57BL/6J m 8.81 0.296   79 0.0333 0.0336 0.12
C57BR/cdJ f 8.71 0.253   4 0.126 0.029 0.44
C57BR/cdJ m 9.04 0.253   4 0.126 0.028 0.45
C57L/J f 8.92 0.292   8 0.103 0.0327 0.73
C57L/J m 9.06 0.273   8 0.0966 0.0302 0.48
C58/J f 8.55 0.252   2   0.179 0.0295 0.22
CALB/RkJ m 8.63 0.256   6 0.105 0.0296 -0.14
CAST/EiJ f 7.01 0.253   6 0.103 0.0362 -1.89
CAST/EiJ m 7.85 0.252   6 0.103 0.0321 -1.25
CBA/CaJ f 8.49 0.297   8 0.105 0.035 0.14
CBA/CaJ m 8.68 0.277   8 0.0978 0.0319 -0.07
CE/J f 8.5 0.269   6 0.11 0.0316 0.16
CE/J m 8.83 0.263   8 0.0929 0.0298 0.15
CZECHI/EiJ f 8.39 0.26   6 0.106 0.031 0.0
CZECHI/EiJ m 8.29 0.252   4 0.126 0.0304 -0.62
CZECHII/EiJ f 7.41 0.256   7 0.0968 0.0346 -1.34
CZECHII/EiJ m 7.99 0.257   8 0.0909 0.0322 -1.05
DBA/1J f 8.58 0.297   8 0.105 0.0346 0.27
DBA/1J m 8.34 0.274   7 0.104 0.0329 -0.55
DBA/2J f 8.5 0.279   8 0.0985 0.0328 0.16
DBA/2J m 8.81 0.279   8 0.0985 0.0316 0.12
DDY/JclSidSeyFrkJ f 8.74 0.26   6 0.106 0.0298 0.48
DDY/JclSidSeyFrkJ m 8.92 0.256   5 0.115 0.0287 0.28
EL/SuzSeyFrkJ f 9.29 0.278   7 0.105 0.0299 1.24
EL/SuzSeyFrkJ m 9.86 0.266   5 0.119 0.027 1.62
FVB/NJ f 8.63 0.277   5 0.124 0.0321 0.33
FVB/NJ m 9.08 0.3   8 0.106 0.033 0.5
I/LnJ f 8.36 0.276   8 0.0976 0.033 -0.04
I/LnJ m 8.59 0.258   6 0.105 0.0301 -0.19
JF1/MsJ f 7.46 0.259   8 0.0914 0.0347 -1.27
JF1/MsJ m 7.33 0.257   7 0.0971 0.035 -1.99
KK/HlJ f 9.07 0.256   6 0.104 0.0282 0.94
KK/HlJ m 9.04 0.256   7 0.0969 0.0283 0.45
LEWES/EiJ f 7.36 0.251   6 0.102 0.0341 -1.41
LEWES/EiJ m 8.14 0.255   7 0.0963 0.0313 -0.84
LG/J m 10.9 0.248   3 0.143 0.0228 3.1
LP/J f 7.86 0.291   6 0.119 0.037 -0.72
LP/J m 8.54 0.268   8 0.0947 0.0313 -0.27
LT/SvEiJ f 7.94 0.257   3 0.148 0.0324 -0.61
LT/SvEiJ m 8.11 0.257   3 0.148 0.0317 -0.88
MA/MyJ f 8.44 0.258   4 0.129 0.0305 0.07
MA/MyJ m 8.49 0.258   4 0.129 0.0303 -0.34
MOLF/EiJ f 7.74 0.256   7 0.0968 0.0331 -0.89
MOLF/EiJ m 8.37 0.26   4 0.13 0.0311 -0.51
MRL/MpJ f 10.4 0.275   7 0.104 0.0265 2.76
MRL/MpJ m 10.7 0.285   7 0.108 0.0267 2.81
MSM/MsJ f 6.67 0.248   2   0.175 0.0372 -2.36
NH/KiPtJ f 7.92 0.252   4 0.126 0.0318 -0.64
NH/KiPtJ m 8.45 0.248   3 0.143 0.0293 -0.39
NOD/ShiLtJ f 8.73 0.281   7 0.106 0.0322 0.47
NOD/ShiLtJ m 8.93 0.277   8 0.0981 0.0311 0.29
NON/ShiLtJ f 9.02 0.26   8 0.0918 0.0288 0.87
NON/ShiLtJ m 9.25 0.284   7 0.107 0.0307 0.75
NOR/LtJ f 9.11 0.297   8 0.105 0.0325 0.99
NOR/LtJ m 9.09 0.262   8 0.0925 0.0288 0.52
NZB/BlNJ m 9.52 0.278   8 0.0983 0.0292 1.13
NZL/LtJ f 9.5 0.26   8 0.0918 0.0274 1.53
NZL/LtJ m 9.57 0.262   8 0.0926 0.0274 1.2
NZM2410/J f 8.42 0.261   6 0.107 0.031 0.05
NZM2410/J m 9.04 0.266   7 0.1 0.0294 0.45
NZO/HlLtJ f 9.32 0.26   7 0.0981 0.0279 1.28
NZO/HlLtJ m 9.63 0.258   8 0.0913 0.0268 1.29
NZW/LacJ f 9.01 0.297   8 0.105 0.0329 0.86
NZW/LacJ m 9.35 0.282   6 0.115 0.0302 0.89
PANCEVO/EiJ f 7.52 0.256   5 0.115 0.0341 -1.19
PANCEVO/EiJ m 7.59 0.255   7 0.0965 0.0336 -1.62
PERA/EiJ f 8.51 0.252   4 0.126 0.0296 0.17
PERA/EiJ m 8.54 0.25   5 0.112 0.0292 -0.27
PERC/EiJ f 7.0 0.252   5 0.113 0.0361 -1.9
PERC/EiJ m 7.73 0.255   8 0.0902 0.033 -1.42
P/J f 8.29 0.267   7 0.101 0.0322 -0.13
P/J m 8.83 0.279   8 0.0986 0.0316 0.15
PL/J f 8.2 0.29   8 0.103 0.0354 -0.26
PL/J m 8.3 0.297   8 0.105 0.0357 -0.61
PN/nBSwUmabJ f 8.37 0.263   7 0.0995 0.0315 -0.02
PN/nBSwUmabJ m 8.8 0.268   8 0.0949 0.0305 0.1
PWD/PhJ f 8.2 0.29   8 0.103 0.0354 -0.26
PWD/PhJ m 8.33 0.284   7 0.107 0.0341 -0.56
RBA/DnJ f 8.82 0.241   1   0.241 0.0273 0.59
RBA/DnJ m 8.66 0.252   4 0.126 0.0291 -0.09
RBF/DnJ f 8.92 0.275   7 0.104 0.0309 0.73
RBF/DnJ m 9.04 0.282   8 0.0995 0.0311 0.45
RF/J f 9.27 0.264   7 0.0999 0.0285 1.21
RF/J m 9.2 0.25   7 0.0943 0.0271 0.67
RIIIS/J f 7.58 0.247   4 0.124 0.0326 -1.11
RIIIS/J m 7.88 0.245   4 0.123 0.0311 -1.21
SB/LeJ f 8.21 0.252   8 0.0891 0.0307 -0.24
SB/LeJ m 8.16 0.252   8 0.0891 0.0309 -0.81
SEA/GnJ f 8.92 0.257   8 0.0908 0.0288 0.73
SEA/GnJ m 9.21 0.254   8 0.09 0.0276 0.69
SF/CamEiJ f 7.99 0.308   8 0.109 0.0386 -0.54
SF/CamEiJ m 8.49 0.271   8 0.0957 0.0319 -0.34
SJL/J f 8.16 0.285   7 0.108 0.035 -0.31
SJL/J m 8.46 0.278   6 0.114 0.0329 -0.38
SKIVE/EiJ f 7.82 0.258   8 0.0914 0.0331 -0.78
SKIVE/EiJ m 8.27 0.26   8 0.092 0.0315 -0.65
SM/J m 8.16 0.29   8 0.103 0.0356 -0.81
SOD1/EiJ f 7.41 0.291   8 0.103 0.0392 -1.34
SOD1/EiJ m 7.66 0.264   4 0.132 0.0345 -1.52
SPRET/EiJ f 7.39 0.26   8 0.0919 0.0352 -1.37
SPRET/EiJ m 7.3 0.261   8 0.0922 0.0357 -2.03
SWR/J f 8.16 0.278   6 0.113 0.0341 -0.31
SWR/J m 8.64 0.297   8 0.105 0.0343 -0.12
TALLYHO/JngJ f 8.66 0.27   8 0.0954 0.0311 0.38
TIRANO/EiJ f 7.71 0.252   6 0.103 0.0326 -0.93
TIRANO/EiJ m 8.38 0.248   4 0.124 0.0295 -0.49
WSB/EiJ f 6.9 0.258   8 0.0912 0.0374 -2.04
WSB/EiJ m 7.44 0.249   6 0.102 0.0334 -1.83
ZALENDE/EiJ f 8.32 0.267   7 0.101 0.0321 -0.09
ZALENDE/EiJ m 9.29 0.255   2   0.18 0.0274 0.8




  GWAS USING LINEAR MIXED MODELS