Phenotype measure:   CGDpheno1   NEFA

ID, description, units MPD:31848   NEFA   non-esterified free fatty acids (plasma NEFA, FFA)   [mEq/L]
Data set, strains CGDpheno1   inbred w/CC8   72 strains     sex: both     age: 12wks
Procedure lipid profile
Ontology mappings

  STRAIN COMPARISON PLOT
Dimensions Width:   px    Height:   px
Download Plot   
Visualization Options

CGDpheno1 - non-esterified free fatty acids (plasma NEFA, FFA)



  MEASURE SUMMARY
Measure Summary FemaleMale
Number of strains tested71 strains72 strains
Mean of the strain means2.23   mEq/L 2.28   mEq/L
Median of the strain means2.20   mEq/L 2.19   mEq/L
SD of the strain means± 0.597 ± 0.608
Coefficient of variation (CV)0.267 0.266
Min–max range of strain means1.25   –   3.84   mEq/L 1.39   –   4.14   mEq/L
Mean sample size per strain7.5   mice 6.8   mice


  STRAIN MEANS (SUBMITTER-ADJUSTED)
Strain Sex Mean SD N mice SEM CV Min, Max Z score
129S1/SvImJ f 1.65 0.627   8 0.222 0.38 -0.98
129S1/SvImJ m 1.93 0.597   6 0.244 0.309 -0.58
A/J f 1.94 0.628   7 0.237 0.324 -0.49
A/J m 1.61 0.61   7 0.23 0.379 -1.11
AKR/J f 2.52 0.615   9 0.205 0.244 0.48
AKR/J m 2.82 0.611   6 0.249 0.216 0.88
ALR/LtJ f 1.97 0.613   8 0.217 0.311 -0.44
ALR/LtJ m 2.27 0.599   7 0.227 0.265 -0.02
ALS/LtJ f 2.51 0.563   8 0.199 0.224 0.46
ALS/LtJ m 2.99 0.554   7 0.209 0.186 1.16
BALB/cByJ f 2.84 0.645   8 0.228 0.227 1.02
BALB/cByJ m 3.6 0.628   7 0.237 0.175 2.17
BPH/2J f 1.62 0.608   8 0.215 0.376 -1.03
BPH/2J m 1.89 0.545   7 0.206 0.288 -0.65
BPL/1J f 2.31 0.565   8 0.2 0.244 0.13
BPL/1J m 2.35 0.538   7 0.203 0.229 0.11
BPN/3J f 2.45 0.526   4 0.263 0.214 0.36
BPN/3J m 2.25 0.536   4 0.268 0.238 -0.05
BTBR T+ Itpr3tf/J f 2.03 0.636   7 0.24 0.313 -0.34
BTBR T+ Itpr3tf/J m 2.04 0.58   4 0.29 0.284 -0.4
BUB/BnJ f 2.08 0.643   9 0.214 0.308 -0.26
BUB/BnJ m 1.84 0.58   4 0.29 0.316 -0.73
C3H/HeJ f 1.65 0.624   8 0.221 0.378 -0.98
C3H/HeJ m 2.2 0.619   8 0.219 0.282 -0.14
C57BL/6J f 1.79 0.699   112 0.066 0.391 -0.74
C57BL/6J m 1.81 0.675   97 0.0685 0.374 -0.78
C57BR/cdJ f 1.98 0.545   8 0.193 0.275 -0.42
C57BR/cdJ m 1.92 0.545   8 0.193 0.284 -0.6
C57L/J f 1.77 0.637   8 0.225 0.36 -0.78
C57L/J m 1.9 0.605   6 0.247 0.318 -0.63
C58/J f 1.61 0.653   8 0.231 0.405 -1.04
C58/J m 1.93 0.636   7 0.24 0.33 -0.58
CALB/RkJ m 1.53 0.537   6 0.219 0.35 -1.24
CAST/EiJ f 3.3 0.534   5 0.239 0.162 1.79
CAST/EiJ m 1.69 0.524   3 0.302 0.31 -0.98
CBA/CaJ f 1.75 0.625   8 0.221 0.357 -0.81
CBA/CaJ m 1.86 0.533   2   0.377 0.287 -0.7
CE/J f 1.65 0.574   7 0.217 0.349 -0.98
CE/J m 1.81 0.551   8 0.195 0.304 -0.78
CZECHI/EiJ f 2.72 0.544   6 0.222 0.2 0.82
CZECHI/EiJ m 2.14 0.551   7 0.208 0.258 -0.24
CZECHII/EiJ f 1.43 0.549   7 0.207 0.385 -1.35
CZECHII/EiJ m 1.46 0.538   7 0.203 0.37 -1.35
DBA/1J f 1.8 0.625   8 0.221 0.346 -0.73
DBA/1J m 1.98 0.566   6 0.231 0.286 -0.5
DBA/2J f 1.97 0.574   6 0.234 0.291 -0.44
DBA/2J m 1.91 0.603   8 0.213 0.316 -0.61
DDY/JclSidSeyFrkJ f 2.64 0.546   8 0.193 0.207 0.68
DDY/JclSidSeyFrkJ m 3.11 0.546   8 0.193 0.175 1.36
EL/SuzSeyFrkJ f 2.97 0.585   8 0.207 0.197 1.23
EL/SuzSeyFrkJ m 2.57 0.575   7 0.217 0.224 0.47
FVB/NJ f 2.66 0.611   10 0.193 0.23 0.72
FVB/NJ m 2.12 0.627   8 0.222 0.296 -0.27
I/LnJ f 1.27 0.618   6 0.252 0.485 -1.61
I/LnJ m 1.72 0.571   4 0.285 0.332 -0.93
JF1/MsJ f 3.54 0.547   8 0.193 0.155 2.19
JF1/MsJ m 2.86 0.543   7 0.205 0.19 0.95
KK/HlJ f 2.43 0.549   8 0.194 0.226 0.33
KK/HlJ m 2.26 0.541   6 0.221 0.24 -0.04
LEWES/EiJ f 2.41 0.533   6 0.218 0.221 0.3
LEWES/EiJ m 3.01 0.53   5 0.237 0.176 1.2
LG/J f 2.73 0.619   8 0.219 0.227 0.83
LG/J m 2.9 0.564   8 0.199 0.194 1.01
LP/J f 1.53 0.597   8 0.211 0.39 -1.18
LP/J m 1.56 0.566   8 0.2 0.362 -1.19
LT/SvEiJ f 1.68 0.581   8 0.205 0.345 -0.93
LT/SvEiJ m 1.7 0.581   8 0.205 0.342 -0.96
MA/MyJ f 2.21 0.584   8 0.206 0.264 -0.04
MA/MyJ m 2.19 0.584   8 0.206 0.266 -0.15
MOLF/EiJ f 1.44 0.544   8 0.192 0.379 -1.33
MOLF/EiJ m 1.83 0.551   7 0.208 0.301 -0.75
MRL/MpJ f 2.5 0.611   8 0.216 0.244 0.45
MRL/MpJ m 1.53 0.571   4 0.285 0.374 -1.24
MSM/MsJ f 2.5 0.552   7 0.209 0.221 0.45
MSM/MsJ m 2.61 0.526   3 0.304 0.202 0.54
NH/KiPtJ f 2.5 0.54   7 0.204 0.216 0.45
NH/KiPtJ m 2.71 0.546   8 0.193 0.201 0.7
NOD/ShiLtJ f 1.88 0.595   6 0.243 0.317 -0.59
NOD/ShiLtJ m 2.53 0.586   7 0.221 0.231 0.41
NON/ShiLtJ f 3.84 0.551   8 0.195 0.144 2.69
NON/ShiLtJ m 3.73 0.593   8 0.21 0.159 2.38
NOR/LtJ f 2.16 0.643   8 0.227 0.298 -0.12
NOR/LtJ m 2.21 0.519   2   0.367 0.234 -0.12
NZB/BlNJ f 1.43 0.653   8 0.231 0.458 -1.35
NZB/BlNJ m 2.08 0.587   8 0.207 0.283 -0.33
NZL/LtJ f 3.25 0.548   8 0.194 0.169 1.7
NZL/LtJ m 3.6 0.552   8 0.195 0.154 2.17
NZM2410/J f 2.65 0.566   7 0.214 0.213 0.7
NZM2410/J m 2.38 0.562   8 0.199 0.236 0.16
NZO/HlLtJ f 3.11 0.546   7 0.206 0.176 1.47
NZO/HlLtJ m 3.2 0.547   8 0.193 0.171 1.51
NZW/LacJ f 2.39 0.625   8 0.221 0.262 0.26
NZW/LacJ m 2.46 0.601   8 0.212 0.244 0.29
PANCEVO/EiJ f 1.93 0.536   5 0.24 0.277 -0.51
PANCEVO/EiJ m 1.95 0.539   7 0.204 0.277 -0.55
PERA/EiJ f 2.21 0.547   8 0.193 0.247 -0.04
PERA/EiJ m 1.98 0.538   7 0.203 0.272 -0.5
PERC/EiJ f 2.1 0.545   6 0.223 0.259 -0.22
PERC/EiJ m 2.19 0.543   8 0.192 0.247 -0.15
P/J f 2.22 0.56   7 0.212 0.253 -0.02
P/J m 2.25 0.574   7 0.217 0.254 -0.05
PL/J f 2.6 0.613   8 0.217 0.236 0.61
PL/J m 2.56 0.564   4 0.282 0.221 0.46
PN/nBSwUmabJ f 2.2 0.554   7 0.209 0.252 -0.06
PN/nBSwUmabJ m 1.93 0.569   8 0.201 0.295 -0.58
PWD/PhJ f 1.51 0.613   8 0.217 0.405 -1.21
PWD/PhJ m 1.71 0.613   8 0.217 0.358 -0.94
PWK/PhJ f 3.71 0.619   8 0.219 0.167 2.48
PWK/PhJ m 3.28 0.561   4 0.281 0.171 1.64
RBA/DnJ f 2.02 0.542   7 0.205 0.268 -0.36
RBA/DnJ m 2.32 0.546   8 0.193 0.235 0.06
RBF/DnJ f 3.09 0.613   8 0.217 0.199 1.44
RBF/DnJ m 4.14 0.61   8 0.216 0.148 3.05
RF/J f 2.52 0.544   6 0.222 0.216 0.48
RF/J m 2.39 0.537   8 0.19 0.224 0.18
RIIIS/J f 2.58 0.538   8 0.19 0.208 0.58
RIIIS/J m 2.22 0.534   6 0.218 0.241 -0.1
SB/LeJ f 1.77 0.536   8 0.19 0.304 -0.78
SB/LeJ m 1.95 0.536   8 0.19 0.275 -0.55
SEA/GnJ f 1.67 0.549   8 0.194 0.329 -0.94
SEA/GnJ m 1.69 0.551   9 0.184 0.327 -0.98
SF/CamEiJ f 1.62 0.636   8 0.225 0.392 -1.03
SF/CamEiJ m 1.77 0.573   8 0.203 0.325 -0.84
SJL/J f 1.94 0.637   8 0.225 0.328 -0.49
SJL/J m 2.04 0.553   3 0.319 0.271 -0.4
SKIVE/EiJ f 2.6 0.544   8 0.192 0.21 0.61
SKIVE/EiJ m 2.7 0.547   8 0.193 0.203 0.69
SM/J f 1.75 0.653   8 0.231 0.374 -0.81
SM/J m 2.91 0.613   8 0.217 0.211 1.03
SOD1/EiJ f 2.22 0.602   8 0.213 0.272 -0.02
SOD1/EiJ m 2.23 0.576   8 0.204 0.258 -0.09
SPRET/EiJ f 2.6 0.544   7 0.206 0.209 0.61
SPRET/EiJ m 1.57 0.555   8 0.196 0.354 -1.17
SWR/J f 2.62 0.714   6 0.292 0.273 0.65
SWR/J m 2.53 0.621   9 0.207 0.246 0.41
TALLYHO/JngJ f 3.39 0.556   6 0.227 0.164 1.94
TALLYHO/JngJ m 3.89 0.564   7 0.213 0.145 2.64
TIRANO/EiJ f 1.25 0.529   6 0.216 0.425 -1.65
TIRANO/EiJ m 1.81 0.533   7 0.202 0.295 -0.78
WSB/EiJ f 1.8 0.545   7 0.206 0.303 -0.73
WSB/EiJ m 1.39 0.533   7 0.201 0.382 -1.47
ZALENDE/EiJ f 1.57 0.557   7 0.211 0.355 -1.11
ZALENDE/EiJ m 2.38 0.533   4 0.267 0.224 0.16




  GWAS USING LINEAR MIXED MODELS