Phenotype measure:   CGDpheno1   MPV

ID, description, units MPD:31821   MPV   mean platelet volume (MPV)   [fL]
Data set, strains CGDpheno1   inbred w/CC8   72 strains     sex: both     age: 11wks
Procedure complete blood count
Ontology mappings

  STRAIN COMPARISON PLOT
Dimensions Width:   px    Height:   px
Download Plot   
Visualization Options

CGDpheno1 - mean platelet volume (MPV)



  MEASURE SUMMARY
Measure Summary FemaleMale
Number of strains tested71 strains72 strains
Mean of the strain means5.47   fL 5.60   fL
Median of the strain means5.32   fL 5.48   fL
SD of the strain means± 0.560 ± 0.740
Coefficient of variation (CV)0.102 0.132
Min–max range of strain means4.47   –   7.42   fL 4.52   –   10.0   fL
Mean sample size per strain7.2   mice 6.8   mice


  STRAIN MEANS (SUBMITTER-ADJUSTED)
  
Select table page:
Strain Sex Mean SD N mice SEM CV Min, Max Z score
129S1/SvImJ f 6.18 0.624   7 0.236 0.101 1.28
129S1/SvImJ m 6.18 0.626   6 0.256 0.101 0.78
A/J f 5.29 0.641   8 0.227 0.121 -0.31
A/J m 5.87 0.613   7 0.232 0.104 0.37
AKR/J f 5.19 0.637   7 0.241 0.123 -0.49
AKR/J m 4.95 0.641   8 0.227 0.13 -0.88
ALR/LtJ f 4.91 0.641   8 0.226 0.131 -0.99
ALR/LtJ m 5.37 0.641   8 0.226 0.119 -0.31
ALS/LtJ f 5.65 0.594   7 0.224 0.105 0.33
ALS/LtJ m 5.92 0.575   7 0.217 0.0971 0.43
BALB/cByJ f 5.54 0.666   8 0.236 0.12 0.13
BALB/cByJ m 5.52 0.624   6 0.255 0.113 -0.11
BPH/2J f 5.32 0.63   8 0.223 0.119 -0.26
BPH/2J m 6.36 0.584   8 0.206 0.0919 1.03
BPL/1J f 5.91 0.576   7 0.218 0.0974 0.79
BPL/1J m 5.76 0.555   6 0.227 0.0964 0.22
BPN/3J f 5.8 0.568   8 0.201 0.0981 0.6
BPN/3J m 6.29 0.586   7 0.221 0.0932 0.93
BTBR T+ Itpr3tf/J f 6.53 0.723   8 0.256 0.111 1.9
BTBR T+ Itpr3tf/J m 5.42 0.697   7 0.263 0.129 -0.24
BUB/BnJ f 6.68 0.662   7 0.25 0.099 2.17
BUB/BnJ m 10.0 0.611   4 0.305 0.061 5.94
C3H/HeJ f 5.68 0.657   8 0.232 0.116 0.38
C3H/HeJ m 5.25 0.627   8 0.222 0.119 -0.47
C57BL/6J f 5.53 1.12   116 0.104 0.203 0.11
C57BL/6J m 5.71 1.02   92 0.107 0.179 0.15
C57BR/cdJ f 5.17 0.574   8 0.203 0.111 -0.53
C57BR/cdJ m 5.37 0.574   8 0.203 0.107 -0.31
C57L/J f 5.3 0.6   4 0.3 0.113 -0.3
C57L/J m 5.42 0.705   8 0.249 0.13 -0.24
C58/J f 5.38 0.723   8 0.256 0.135 -0.15
C58/J m 5.32 0.697   7 0.263 0.131 -0.38
CALB/RkJ m 5.35 0.543   4 0.271 0.102 -0.34
CAST/EiJ f 5.5 0.558   6 0.228 0.101 0.06
CAST/EiJ m 5.68 0.572   8 0.202 0.101 0.11
CBA/CaJ f 4.88 0.68   8 0.24 0.139 -1.05
CBA/CaJ m 5.86 0.534   3 0.309 0.0912 0.35
CE/J f 5.54 0.584   5 0.261 0.105 0.13
CE/J m 5.27 0.571   6 0.233 0.108 -0.45
CZECHI/EiJ f 5.28 0.566   6 0.231 0.107 -0.33
CZECHI/EiJ m 5.71 0.566   6 0.231 0.0991 0.15
CZECHII/EiJ f 5.81 0.578   8 0.204 0.0995 0.62
CZECHII/EiJ m 5.67 0.575   8 0.203 0.101 0.1
DBA/1J f 5.02 0.68   8 0.24 0.135 -0.8
DBA/1J m 4.88 0.622   9 0.207 0.128 -0.97
DBA/2J f 4.94 0.582   7 0.22 0.118 -0.94
DBA/2J m 5.2 0.634   8 0.224 0.122 -0.54
DDY/JclSidSeyFrkJ f 5.15 0.568   7 0.215 0.11 -0.56
DDY/JclSidSeyFrkJ m 5.31 0.537   4 0.268 0.101 -0.39
EL/SuzSeyFrkJ f 5.53 0.676   11 0.204 0.122 0.11
EL/SuzSeyFrkJ m 5.51 0.536   3 0.309 0.0973 -0.12
FVB/NJ f 5.5 0.603   5 0.27 0.11 0.06
FVB/NJ m 5.14 0.646   8 0.228 0.126 -0.62
I/LnJ f 6.16 0.648   8 0.229 0.105 1.24
I/LnJ m 5.97 0.578   6 0.236 0.0968 0.5
JF1/MsJ f 5.21 0.567   7 0.214 0.109 -0.46
JF1/MsJ m 5.36 0.583   8 0.206 0.109 -0.32
KK/HlJ f 7.42 0.56   6 0.228 0.0755 3.49
KK/HlJ m 7.06 0.583   8 0.206 0.0825 1.97
LEWES/EiJ f 5.47 0.553   6 0.226 0.101 0.01
LEWES/EiJ m 5.46 0.54   5 0.241 0.0989 -0.19
LG/J f 4.77 0.618   7 0.234 0.13 -1.24
LG/J m 4.94 0.59   8 0.208 0.119 -0.89
LP/J f 5.88 0.633   8 0.224 0.108 0.74
LP/J m 5.19 0.603   8 0.213 0.116 -0.55
LT/SvEiJ f 5.18 0.619   8 0.219 0.12 -0.51
LT/SvEiJ m 5.22 0.588   6 0.24 0.113 -0.51
MA/MyJ f 5.56 0.603   6 0.246 0.109 0.17
MA/MyJ m 5.59 0.623   7 0.235 0.111 -0.01
MOLF/EiJ f 4.58 0.553   6 0.226 0.121 -1.58
MOLF/EiJ m 4.88 0.553   5 0.247 0.113 -0.97
MRL/MpJ f 5.28 0.628   5 0.281 0.119 -0.33
MRL/MpJ m 5.19 0.705   8 0.249 0.136 -0.55
MSM/MsJ f 4.91 0.572   7 0.216 0.116 -0.99
MSM/MsJ m 4.53 0.581   7 0.22 0.128 -1.44
NH/KiPtJ f 5.11 0.575   8 0.203 0.112 -0.64
NH/KiPtJ m 5.88 0.563   7 0.213 0.0958 0.38
NOD/ShiLtJ f 5.17 0.634   8 0.224 0.122 -0.53
NOD/ShiLtJ m 5.45 0.634   8 0.224 0.116 -0.2
NON/ShiLtJ f 5.2 0.585   8 0.207 0.113 -0.47
NON/ShiLtJ m 5.23 0.602   7 0.228 0.115 -0.5
NOR/LtJ f 4.87 0.685   8 0.242 0.14 -1.06
NOR/LtJ m 5.33 0.589   8 0.208 0.111 -0.36
NZB/BlNJ f 4.81 0.723   8 0.256 0.15 -1.17
NZB/BlNJ m 6.38 0.606   6 0.247 0.0949 1.05
NZL/LtJ f 6.34 0.572   7 0.216 0.0902 1.56
NZL/LtJ m 6.75 0.595   8 0.21 0.0882 1.55
NZM2410/J f 6.16 0.594   7 0.224 0.0964 1.24
NZM2410/J m 6.36 0.581   7 0.219 0.0913 1.03
NZO/HlLtJ f 6.28 0.558   5 0.25 0.0889 1.45
NZO/HlLtJ m 6.34 0.58   8 0.205 0.0916 1.0
NZW/LacJ f 7.13 0.68   8 0.24 0.0953 2.97
NZW/LacJ m 6.32 0.628   7 0.237 0.0993 0.97
PANCEVO/EiJ f 5.38 0.522   3 0.301 0.097 -0.15
PANCEVO/EiJ m 5.33 0.553   6 0.226 0.104 -0.36
PERA/EiJ f 4.89 0.568   7 0.215 0.116 -1.03
PERA/EiJ m 4.78 0.553   6 0.226 0.116 -1.11
PERC/EiJ f 4.47 0.557   6 0.227 0.124 -1.78
PERC/EiJ m 4.52 0.561   7 0.212 0.124 -1.46
P/J f 5.76 0.592   7 0.224 0.103 0.53
P/J m 6.24 0.603   6 0.246 0.0967 0.86
PL/J f 5.12 0.641   8 0.226 0.125 -0.62
PL/J m 5.66 0.68   8 0.24 0.12 0.08
PN/nBSwUmabJ f 5.07 0.571   6 0.233 0.113 -0.71
PN/nBSwUmabJ m 5.05 0.555   5 0.248 0.11 -0.74
PWD/PhJ f 5.53 0.603   6 0.246 0.109 0.11
PWD/PhJ m 5.9 0.622   7 0.235 0.105 0.41
PWK/PhJ f 4.8 0.618   7 0.234 0.129 -1.19
PWK/PhJ m 5.02 0.637   8 0.225 0.127 -0.78
RBA/DnJ f 5.32 0.58   8 0.205 0.109 -0.26
RBA/DnJ m 5.73 0.572   7 0.216 0.0997 0.18
RBF/DnJ f 5.29 0.674   8 0.238 0.127 -0.31
RBF/DnJ m 5.77 0.68   7 0.257 0.118 0.23
RF/J f 5.26 0.594   8 0.21 0.113 -0.37
RF/J m 5.84 0.579   8 0.205 0.0992 0.32
RIIIS/J f 5.33 0.568   8 0.201 0.107 -0.24
RIIIS/J m 5.59 0.555   7 0.21 0.0993 -0.01
SB/LeJ f 5.83 0.557   7 0.211 0.0956 0.65
SB/LeJ m 6.27 0.568   8 0.201 0.0906 0.91
SEA/GnJ f 4.88 0.556   6 0.227 0.114 -1.05
SEA/GnJ m 5.23 0.551   6 0.225 0.105 -0.5
SF/CamEiJ f 5.0 0.652   7 0.247 0.13 -0.83
SF/CamEiJ m 4.67 0.605   8 0.214 0.13 -1.26
SJL/J f 5.33 0.705   8 0.249 0.132 -0.24
SJL/J m 5.58 0.6   4 0.3 0.108 -0.03
SKIVE/EiJ f 5.32 0.579   8 0.205 0.109 -0.26
SKIVE/EiJ m 5.42 0.582   8 0.206 0.107 -0.24
SM/J f 5.14 0.723   8 0.256 0.141 -0.58
SM/J m 5.51 0.641   8 0.226 0.116 -0.12
SOD1/EiJ f 5.78 0.639   8 0.226 0.111 0.56
SOD1/EiJ m 4.89 0.615   8 0.217 0.126 -0.96
SPRET/EiJ f 4.87 0.569   7 0.215 0.117 -1.06
SPRET/EiJ m 4.59 0.544   5 0.243 0.118 -1.36
SWR/J f 5.79 0.578   8 0.204 0.0997 0.58
SWR/J m 5.53 0.657   7 0.248 0.119 -0.09
TALLYHO/JngJ f 6.03 0.594   7 0.224 0.0985 1.01
TALLYHO/JngJ m 6.3 0.581   7 0.22 0.0922 0.95
TIRANO/EiJ f 5.17 0.564   7 0.213 0.109 -0.53
TIRANO/EiJ m 5.02 0.548   6 0.224 0.109 -0.78
WSB/EiJ f 6.29 0.555   6 0.226 0.0882 1.47
WSB/EiJ m 5.71 0.558   7 0.211 0.0976 0.15
ZALENDE/EiJ f 5.71 0.603   8 0.213 0.106 0.44
ZALENDE/EiJ m 5.3 0.538   3 0.311 0.101 -0.4




  GWAS USING LINEAR MIXED MODELS