Phenotype measure:   Zheng1   Lgradient

ID, description, units MPD:29807   Lgradient   middle ear gradient at maximum compliance, left ear   [mL]
Data set, strains Zheng1   inbred   56 strains     sex: both     age: 5-68wks
Procedure tympanometry
Ontology mappings

  STRAIN COMPARISON PLOT
Dimensions Width:   px    Height:   px
Download Plot   
Visualization Options

Zheng1 - middle ear gradient at maximum compliance, left ear



  MEASURE SUMMARY
Measure Summary FemaleMale
Number of strains tested54 strains56 strains
Mean of the strain means0.0879   mL 0.0811   mL
Median of the strain means0.0832   mL 0.0796   mL
SD of the strain means± 0.0284 ± 0.0239
Coefficient of variation (CV)0.323 0.295
Min–max range of strain means0.0489   –   0.185   mL 0.0372   –   0.156   mL
Mean sample size per strain4.1   mice 3.6   mice


  ANOVA, Q-Q NORMALITY ASSESSMENT
ANOVA summary      
FactorDFSum of squaresMean sum of squaresF valuep value (Pr>F)
sex 1 0.0069 0.0069 5.3762 0.0211
strain 48 0.1661 0.0035 2.7002 < 0.0001
sex:strain 48 0.0822 0.0017 1.3358 0.0805
Residuals 274 0.3511 0.0013


Q-Q normality assessment based on residuals

  


  STRAIN MEANS (UNADJUSTED)
  
Select table page:
Strain Sex Mean SD N mice SEM CV Min, Max Z score
129P1/ReJ m 0.0372 0.0197   3 0.0114 0.53 0.025, 0.06 -1.84
129P3/J f 0.065 0.0278   3 0.0161 0.428 0.035, 0.09 -0.81
129P3/J m 0.0717 0.0202   3 0.0117 0.282 0.05, 0.09 -0.39
129S1/SvImJ f 0.0967 0.0357   6 0.0146 0.37 0.065, 0.16 0.31
129S1/SvImJ m 0.12 0.0131   4 0.00653 0.109 0.104, 0.136 1.63
129T2/SvEmsJ f 0.067 0.012   5 0.00539 0.18 0.05, 0.08 -0.74
129T2/SvEmsJ m 0.0726 0.0301   5 0.0135 0.415 0.036, 0.114 -0.36
129X1/SvJ m 0.129 0.0193   4 0.00966 0.15 0.11, 0.15 2.0
A/HeJ f 0.154 0.076   6 0.031 0.492 0.065, 0.28 2.33
A/HeJ m 0.107 0.0475   3 0.0274 0.446 0.06, 0.155 1.08
AKR/J f 0.1 0.0521   2   0.0369 0.52 0.0633, 0.137 0.43
AKR/J m 0.05 0.0265   3 0.0153 0.529 0.03, 0.08 -1.3
A/WySnJ f 0.157 0.0428   6 0.0175 0.273 0.075, 0.187 2.43
A/WySnJ m 0.0813 0.0194   4 0.00968 0.238 0.0633, 0.108 0.01
BALB/cByJ f 0.0688 0.0211   4 0.0105 0.306 0.055, 0.1 -0.67
BALB/cByJ m 0.105 0.02   4 0.01 0.191 0.0787, 0.126 1.0
BALB/cJ f 0.107 0.00532   4 0.00266 0.0498 0.1, 0.113 0.67
BUB/BnJ f 0.139 0.0608   5 0.0272 0.438 0.1, 0.245 1.8
BUB/BnJ m 0.0575 0.00354   2   0.0025 0.0615 0.055, 0.06 -0.99
BXA14/PgnJ f 0.0616 0.00233   2   0.00165 0.0378 0.06, 0.0633 -0.93
BXA14/PgnJ m 0.0591 0.00587   2   0.00415 0.0992 0.055, 0.0633 -0.92
BXSB/MpJ f 0.1 0.0235   5 0.0105 0.235 0.08, 0.13 0.43
BXSB/MpJ m 0.108 0.0569   5 0.0254 0.526 0.045, 0.19 1.13
C3HeB/FeJ f 0.0894 0.0242   5 0.0108 0.27 0.0533, 0.117 0.05
C3HeB/FeJ m 0.107 0.0653   5 0.0292 0.608 0.06, 0.222 1.08
C3H/HeJ f 0.0854 0.00631   5 0.00282 0.0739 0.08, 0.095 -0.09
C3H/HeJ m 0.0898 0.0148   6 0.00602 0.164 0.0682, 0.106 0.36
C3H/HeOuJ m 0.0833 0.0122   4 0.00609 0.146 0.07, 0.0967 0.09
C3H/HeSnJ f 0.0985 0.0187   5 0.00835 0.19 0.0725, 0.115 0.37
C3H/HeSnJ m 0.065 0.0132   3 0.00764 0.204 0.05, 0.075 -0.67
C57BL/10SnJ m 0.108 0.0251   3 0.0145 0.232 0.09, 0.137 1.13
C57BL/6ByJ f 0.0658 0.0203   6 0.00828 0.308 0.035, 0.0925 -0.78
C57BL/6ByJ m 0.08 0.0522   3 0.0301 0.653 0.045, 0.14 -0.05
C57BL/6J f 0.0829 0.0327   6 0.0133 0.394 0.045, 0.12 -0.18
C57BL/6J m 0.101 0.033   4 0.0165 0.326 0.07, 0.147 0.83
C57BLKS/J f 0.0933 0.0225   3 0.013 0.242 0.07, 0.115 0.19
C57BLKS/J m 0.1 0.0132   3 0.00764 0.132 0.085, 0.11 0.79
C57BR/cdJ f 0.0717 0.0247   3 0.0142 0.344 0.055, 0.1 -0.57
C57BR/cdJ m 0.095 0.0278   3 0.0161 0.293 0.065, 0.12 0.58
C57L/J m 0.156 0.0242   6 0.00987 0.155 0.115, 0.185 3.13
C58/J f 0.1 0.0241   3 0.0139 0.241 0.085, 0.128 0.43
C58/J m 0.0792 0.00722   3 0.00417 0.0912 0.075, 0.0875 -0.08
CAST/EiJ f 0.0562 0.0149   5 0.00667 0.265 0.03, 0.066 -1.12
CAST/EiJ m 0.0517 0.00795   4 0.00397 0.154 0.0433, 0.06 -1.23
CBA/CaGnLeJ f 0.07 0.0178   4 0.0089 0.254 0.055, 0.095 -0.63
CBA/CaGnLeJ m 0.0617 0.00764   3 0.00441 0.124 0.055, 0.07 -0.81
CBA/CaH-T(14;15)6Ca/J f 0.0917 0.0189   3 0.0109 0.207 0.07, 0.105 0.13
CBA/CaH-T(14;15)6Ca/J m 0.0883 0.0375   3 0.0217 0.425 0.05, 0.125 0.3
CBA/CaJ f 0.0717 0.0126   3 0.00726 0.176 0.06, 0.085 -0.57
CBA/CaJ m 0.0729 0.00712   4 0.00356 0.0977 0.068, 0.0833 -0.34
CBA/J f 0.0808 0.0306   6 0.0125 0.378 0.05, 0.13 -0.25
CBA/J m 0.04 0.00866   3 0.005 0.217 0.03, 0.045 -1.72
CE/J f 0.0667 0.00764   3 0.00441 0.115 0.06, 0.075 -0.75
CE/J m 0.0656 0.00768   3 0.00443 0.117 0.0567, 0.07 -0.65
DBA/1J f 0.0688 0.0165   4 0.00826 0.24 0.05, 0.085 -0.67
DBA/1LacJ f 0.127 0.025   6 0.0102 0.197 0.09, 0.152 1.38
DBA/1LacJ m 0.102 0.00764   3 0.00441 0.0751 0.095, 0.11 0.87
DBA/2J f 0.093 0.0219   6 0.00895 0.236 0.0725, 0.128 0.18
DBA/2J m 0.0633 0.0284   3 0.0164 0.449 0.04, 0.095 -0.74
EL/SuzSeyFrkJ f 0.0489 0.0284   3 0.0164 0.58 0.02, 0.0767 -1.37
EL/SuzSeyFrkJ m 0.0684 0.0329   5 0.0147 0.481 0.04, 0.123 -0.53
FVB/NJ f 0.064 0.0116   5 0.0052 0.182 0.05, 0.08 -0.84
I/LnJ f 0.05 0.0132   3 0.00764 0.265 0.035, 0.06 -1.34
I/LnJ m 0.0883 0.00764   3 0.00441 0.0865 0.08, 0.095 0.3
KK/HlJ f 0.11 0.0229   3 0.0132 0.208 0.09, 0.135 0.78
KK/HlJ m 0.0879 0.0292   6 0.0119 0.332 0.045, 0.13 0.28
LP/J f 0.131 0.071   6 0.029 0.54 0.08, 0.271 1.52
LP/J m 0.121 0.0379   5 0.017 0.313 0.09, 0.182 1.67
MA/MyJ f 0.065 0.0141   2   0.01 0.218 0.055, 0.075 -0.81
MA/MyJ m 0.085 0.0351   4 0.0176 0.413 0.05, 0.12 0.16
MOLD/RkJ f 0.08 0.0312   3 0.018 0.39 0.055, 0.115 -0.28
MOLD/RkJ m 0.0567 0.0104   3 0.00601 0.184 0.045, 0.065 -1.02
MOLF/EiJ f 0.0825 0.0175   3 0.0101 0.212 0.0625, 0.095 -0.19
MOLF/EiJ m 0.075 0.01   3 0.00577 0.133 0.065, 0.085 -0.26
MRL/MpJ f 0.0583 0.0244   6 0.00997 0.419 0.025, 0.095 -1.04
MRL/MpJ m 0.066 0.0196   5 0.00875 0.297 0.035, 0.085 -0.63
NON/ShiLtJ f 0.185 0.191   3 0.11 1.03 0.07, 0.405 3.42
NON/ShiLtJ m 0.0655 0.0123   5 0.0055 0.188 0.055, 0.085 -0.65
NOR/LtJ f 0.0963 0.0368   4 0.0184 0.383 0.05, 0.14 0.3
NOR/LtJ m 0.103 0.0177   2   0.0125 0.172 0.09, 0.115 0.92
NZB/BlNJ m 0.0637 0.011   5 0.0049 0.172 0.05, 0.0767 -0.73
NZO/HlLtJ f 0.064 0.0366   5 0.0164 0.573 0.035, 0.125 -0.84
NZO/HlLtJ m 0.0688 0.0265   2   0.0187 0.386 0.05, 0.0875 -0.51
NZW/LacJ f 0.095 0.0332   4 0.0166 0.349 0.05, 0.12 0.25
PERA/EiJ f 0.0508 0.00956   4 0.00478 0.188 0.04, 0.0633 -1.31
PERA/EiJ m 0.0475 0.0177   2   0.0125 0.372 0.035, 0.06 -1.41
P/J f 0.0633 0.00289   3 0.00167 0.0456 0.06, 0.065 -0.87
P/J m 0.0567 0.0126   3 0.00726 0.222 0.045, 0.07 -1.02
PL/J f 0.0927 0.0162   3 0.00933 0.174 0.078, 0.11 0.17
PL/J m 0.09 0.03   3 0.0173 0.333 0.06, 0.12 0.37
RBF/DnJ f 0.0813 0.0136   4 0.00681 0.168 0.0625, 0.095 -0.23
RBF/DnJ m 0.0683 0.0202   3 0.0117 0.296 0.05, 0.09 -0.54
RF/J f 0.089 0.0156   3 0.009 0.175 0.08, 0.107 0.04
RF/J m 0.0857 0.0289   3 0.0167 0.338 0.06, 0.117 0.19
RIIIS/J f 0.0835 0.0418   3 0.0241 0.5 0.0367, 0.117 -0.16
RIIIS/J m 0.118 0.0645   6 0.0263 0.548 0.08, 0.246 1.54
SEA/GnJ f 0.123 0.0208   3 0.012 0.169 0.1, 0.14 1.24
SEA/GnJ m 0.0717 0.0419   3 0.0242 0.585 0.045, 0.12 -0.39
SJL/Bm f 0.0533 0.00577   3 0.00333 0.108 0.05, 0.06 -1.22
SJL/Bm m 0.0439 0.00975   3 0.00563 0.222 0.0367, 0.055 -1.56
SJL/J f 0.074 0.0119   5 0.00534 0.161 0.06, 0.09 -0.49
SM/J m 0.063 0.012   5 0.00539 0.191 0.05, 0.08 -0.76
SPRET/EiJ f 0.075 0.015   3 0.00866 0.2 0.06, 0.09 -0.45
SPRET/EiJ m 0.0775 0.0106   2   0.0075 0.137 0.07, 0.085 -0.15
SWR/J f 0.0883 0.0189   6 0.00771 0.214 0.065, 0.115 0.01
SWR/J m 0.0908 0.0481   6 0.0196 0.53 0.045, 0.18 0.41
WSB/EiJ f 0.112 0.0402   3 0.0232 0.358 0.07, 0.15 0.85
WSB/EiJ m 0.0857 0.0238   3 0.0137 0.278 0.06, 0.107 0.19
YBR/EiJ f 0.102 0.0301   3 0.0174 0.296 0.07, 0.13 0.5
YBR/EiJ m 0.085 0.0265   3 0.0153 0.311 0.065, 0.115 0.16


  LEAST SQUARES MEANS (MODEL-ADJUSTED)
Strain Sex Mean SEM UpperCL LowerCL
129P3/J f 0.065 0.0207 0.1057 0.0243
129P3/J m 0.0717 0.0207 0.1124 0.031
129S1/SvImJ f 0.0967 0.0146 0.1254 0.0679
129S1/SvImJ m 0.12 0.0179 0.1552 0.0848
129T2/SvEmsJ f 0.067 0.016 0.0985 0.0355
129T2/SvEmsJ m 0.0726 0.016 0.1041 0.0411
A/HeJ f 0.1545 0.0146 0.1833 0.1257
A/HeJ m 0.1067 0.0207 0.1474 0.066
AKR/J f 0.1001 0.0253 0.15 0.0503
AKR/J m 0.05 0.0207 0.0907 0.0093
A/WySnJ f 0.1567 0.0146 0.1854 0.1279
A/WySnJ m 0.0813 0.0179 0.1166 0.0461
BALB/cByJ f 0.0687 0.0179 0.104 0.0335
BALB/cByJ m 0.1049 0.0179 0.1402 0.0697
BUB/BnJ f 0.1388 0.016 0.1703 0.1073
BUB/BnJ m 0.0575 0.0253 0.1073 0.0077
BXA14/PgnJ f 0.0616 0.0253 0.1115 0.0118
BXA14/PgnJ m 0.0591 0.0253 0.109 0.0093
BXSB/MpJ f 0.1 0.016 0.1315 0.0685
BXSB/MpJ m 0.108 0.016 0.1395 0.0765
C3HeB/FeJ f 0.0894 0.016 0.1209 0.0579
C3HeB/FeJ m 0.1074 0.016 0.1389 0.0759
C3H/HeJ f 0.0854 0.016 0.1169 0.0539
C3H/HeJ m 0.0898 0.0146 0.1186 0.061
C3H/HeSnJ f 0.0985 0.016 0.13 0.067
C3H/HeSnJ m 0.065 0.0207 0.1057 0.0243
C57BL/6ByJ f 0.0658 0.0146 0.0946 0.0371
C57BL/6ByJ m 0.08 0.0207 0.1207 0.0393
C57BL/6J f 0.0829 0.0146 0.1117 0.0541
C57BL/6J m 0.1011 0.0179 0.1364 0.0659
C57BLKS/J f 0.0933 0.0207 0.134 0.0526
C57BLKS/J m 0.1 0.0207 0.1407 0.0593
C57BR/cdJ f 0.0717 0.0207 0.1124 0.031
C57BR/cdJ m 0.095 0.0207 0.1357 0.0543
C58/J f 0.1002 0.0207 0.1409 0.0595
C58/J m 0.0792 0.0207 0.1199 0.0385
CAST/EiJ f 0.0562 0.016 0.0877 0.0247
CAST/EiJ m 0.0517 0.0179 0.0869 0.0164
CBA/CaGnLeJ f 0.07 0.0179 0.1052 0.0348
CBA/CaGnLeJ m 0.0617 0.0207 0.1024 0.021
CBA/CaH-T(14;15)6Ca/J f 0.0917 0.0207 0.1324 0.051
CBA/CaH-T(14;15)6Ca/J m 0.0883 0.0207 0.129 0.0476
CBA/CaJ f 0.0717 0.0207 0.1124 0.031
CBA/CaJ m 0.0729 0.0179 0.1081 0.0377
CBA/J f 0.0808 0.0146 0.1096 0.0521
CBA/J m 0.04 0.0207 0.0807 0.0
CE/J f 0.0667 0.0207 0.1074 0.026
CE/J m 0.0656 0.0207 0.1063 0.0249
DBA/1LacJ f 0.1265 0.0146 0.1553 0.0977
DBA/1LacJ m 0.1017 0.0207 0.1424 0.061
DBA/2J f 0.093 0.0146 0.1218 0.0642
DBA/2J m 0.0633 0.0207 0.104 0.0226
EL/SuzSeyFrkJ f 0.0489 0.0207 0.0896 0.0082
EL/SuzSeyFrkJ m 0.0684 0.016 0.0999 0.0369
I/LnJ f 0.05 0.0207 0.0907 0.0093
I/LnJ m 0.0883 0.0207 0.129 0.0476
KK/HlJ f 0.11 0.0207 0.1507 0.0693
KK/HlJ m 0.0879 0.0146 0.1167 0.0591
LP/J f 0.1315 0.0146 0.1603 0.1027
LP/J m 0.1214 0.016 0.1529 0.0899
MA/MyJ f 0.065 0.0253 0.1148 0.0152
MA/MyJ m 0.085 0.0179 0.1202 0.0498
MOLD/RkJ f 0.08 0.0207 0.1207 0.0393
MOLD/RkJ m 0.0567 0.0207 0.0974 0.016
MOLF/EiJ f 0.0825 0.0207 0.1232 0.0418
MOLF/EiJ m 0.075 0.0207 0.1157 0.0343
MRL/MpJ f 0.0583 0.0146 0.0871 0.0296
MRL/MpJ m 0.066 0.016 0.0975 0.0345
NON/ShiLtJ f 0.185 0.0207 0.2257 0.1443
NON/ShiLtJ m 0.0655 0.016 0.097 0.034
NOR/LtJ f 0.0962 0.0179 0.1315 0.061
NOR/LtJ m 0.1025 0.0253 0.1523 0.0527
NZO/HlLtJ f 0.064 0.016 0.0955 0.0325
NZO/HlLtJ m 0.0687 0.0253 0.1186 0.0189
PERA/EiJ f 0.0508 0.0179 0.0861 0.0156
PERA/EiJ m 0.0475 0.0253 0.0973 0.0
P/J f 0.0633 0.0207 0.104 0.0226
P/J m 0.0567 0.0207 0.0974 0.016
PL/J f 0.0927 0.0207 0.1334 0.052
PL/J m 0.09 0.0207 0.1307 0.0493
RBF/DnJ f 0.0812 0.0179 0.1165 0.046
RBF/DnJ m 0.0683 0.0207 0.109 0.0276
RF/J f 0.089 0.0207 0.1297 0.0483
RF/J m 0.0857 0.0207 0.1264 0.045
RIIIS/J f 0.0835 0.0207 0.1242 0.0428
RIIIS/J m 0.1178 0.0146 0.1466 0.0891
SEA/GnJ f 0.1233 0.0207 0.164 0.0826
SEA/GnJ m 0.0717 0.0207 0.1124 0.031
SJL/Bm f 0.0533 0.0207 0.094 0.0126
SJL/Bm m 0.0439 0.0207 0.0846 0.0032
SPRET/EiJ f 0.075 0.0207 0.1157 0.0343
SPRET/EiJ m 0.0775 0.0253 0.1273 0.0277
SWR/J f 0.0883 0.0146 0.1171 0.0596
SWR/J m 0.0908 0.0146 0.1196 0.0621
WSB/EiJ f 0.1123 0.0207 0.153 0.0716
WSB/EiJ m 0.0857 0.0207 0.1264 0.045
YBR/EiJ f 0.1017 0.0207 0.1424 0.061
YBR/EiJ m 0.085 0.0207 0.1257 0.0443


  LEAST SQUARES MEANS (MODEL-ADJUSTED), SEXES COMBINED
Strain Sex Mean SEM UpperCL LowerCL
129P3/J both 0.0683 0.0146 0.0971 0.0396
129S1/SvImJ both 0.1083 0.0116 0.1311 0.0856
129T2/SvEmsJ both 0.0698 0.0113 0.0921 0.0475
A/HeJ both 0.1306 0.0127 0.1555 0.1057
AKR/J both 0.0751 0.0163 0.1072 0.0429
A/WySnJ both 0.119 0.0116 0.1417 0.0963
BALB/cByJ both 0.0868 0.0127 0.1118 0.0619
BUB/BnJ both 0.0982 0.015 0.1276 0.0687
BXA14/PgnJ both 0.0604 0.0179 0.0956 0.0252
BXSB/MpJ both 0.104 0.0113 0.1263 0.0817
C3HeB/FeJ both 0.0984 0.0113 0.1207 0.0761
C3H/HeJ both 0.0876 0.0108 0.1089 0.0663
C3H/HeSnJ both 0.0818 0.0131 0.1075 0.056
C57BL/6ByJ both 0.0729 0.0127 0.0978 0.048
C57BL/6J both 0.092 0.0116 0.1148 0.0693
C57BLKS/J both 0.0967 0.0146 0.1254 0.0679
C57BR/cdJ both 0.0833 0.0146 0.1121 0.0546
C58/J both 0.0897 0.0146 0.1184 0.0609
CAST/EiJ both 0.0539 0.012 0.0776 0.0303
CBA/CaGnLeJ both 0.0658 0.0137 0.0927 0.0389
CBA/CaH-T(14;15)6Ca/J both 0.09 0.0146 0.1188 0.0612
CBA/CaJ both 0.0723 0.0137 0.0992 0.0454
CBA/J both 0.0604 0.0127 0.0853 0.0355
CE/J both 0.0661 0.0146 0.0949 0.0373
DBA/1LacJ both 0.1141 0.0127 0.139 0.0892
DBA/2J both 0.0782 0.0127 0.1031 0.0533
EL/SuzSeyFrkJ both 0.0587 0.0131 0.0844 0.0329
I/LnJ both 0.0692 0.0146 0.0979 0.0404
KK/HlJ both 0.099 0.0127 0.1239 0.074
LP/J both 0.1265 0.0108 0.1478 0.1051
MA/MyJ both 0.075 0.0155 0.1055 0.0445
MOLD/RkJ both 0.0683 0.0146 0.0971 0.0396
MOLF/EiJ both 0.0787 0.0146 0.1075 0.05
MRL/MpJ both 0.0622 0.0108 0.0835 0.0408
NON/ShiLtJ both 0.1252 0.0131 0.151 0.0995
NOR/LtJ both 0.0994 0.0155 0.1299 0.0689
NZO/HlLtJ both 0.0664 0.015 0.0959 0.0369
PERA/EiJ both 0.0492 0.0155 0.0797 0.0186
P/J both 0.06 0.0146 0.0888 0.0312
PL/J both 0.0913 0.0146 0.1201 0.0626
RBF/DnJ both 0.0748 0.0137 0.1017 0.0479
RF/J both 0.0873 0.0146 0.1161 0.0586
RIIIS/J both 0.1006 0.0127 0.1256 0.0757
SEA/GnJ both 0.0975 0.0146 0.1263 0.0687
SJL/Bm both 0.0486 0.0146 0.0774 0.0198
SPRET/EiJ both 0.0763 0.0163 0.1084 0.0441
SWR/J both 0.0896 0.0103 0.1099 0.0692
WSB/EiJ both 0.099 0.0146 0.1278 0.0702
YBR/EiJ both 0.0933 0.0146 0.1221 0.0646




  GWAS USING LINEAR MIXED MODELS