Phenotype measure:   Zheng1   Lvolume

ID, description, units MPD:29806   Lvolume   outer ear canal equivalent volume, left ear   [mL]
Data set, strains Zheng1   inbred   56 strains     sex: both     age: 5-68wks
Procedure tympanometry
Ontology mappings

  STRAIN COMPARISON PLOT
Dimensions Width:   px    Height:   px
Download Plot   
Visualization Options

Zheng1 - outer ear canal equivalent volume, left ear



  MEASURE SUMMARY
Measure Summary FemaleMale
Number of strains tested54 strains56 strains
Mean of the strain means0.224   mL 0.221   mL
Median of the strain means0.226   mL 0.218   mL
SD of the strain means± 0.0239 ± 0.0239
Coefficient of variation (CV)0.107 0.108
Min–max range of strain means0.175   –   0.284   mL 0.176   –   0.271   mL
Mean sample size per strain4.1   mice 3.6   mice


  ANOVA, Q-Q NORMALITY ASSESSMENT
ANOVA summary      
FactorDFSum of squaresMean sum of squaresF valuep value (Pr>F)
sex 1 0.0015 0.0015 3.3421 0.0686
strain 48 0.1316 0.0027 6.3077 < 0.0001
sex:strain 48 0.0623 0.0013 2.9891 < 0.0001
Residuals 274 0.1191 0.0004


Q-Q normality assessment based on residuals

  


  STRAIN MEANS (UNADJUSTED)
Strain Sex Mean SD N mice SEM CV Min, Max Z score
129P1/ReJ m 0.212 0.011   3 0.00636 0.0519 0.205, 0.225 -0.36
129P3/J f 0.262 0.00289   3 0.00167 0.011 0.26, 0.265 1.57
129P3/J m 0.262 0.00289   3 0.00167 0.011 0.26, 0.265 1.74
129S1/SvImJ f 0.244 0.0292   6 0.0119 0.12 0.223, 0.3 0.82
129S1/SvImJ m 0.271 0.0128   4 0.00639 0.0472 0.256, 0.287 2.11
129T2/SvEmsJ f 0.204 0.00548   5 0.00245 0.0268 0.2, 0.21 -0.85
129T2/SvEmsJ m 0.21 0.0135   5 0.00604 0.0642 0.195, 0.226 -0.44
129X1/SvJ m 0.269 0.0264   4 0.0132 0.0981 0.247, 0.307 2.03
A/HeJ f 0.229 0.0193   6 0.0079 0.0845 0.205, 0.253 0.19
A/HeJ m 0.21 0.01   3 0.00577 0.0476 0.2, 0.22 -0.44
AKR/J f 0.284 0.0757   2   0.0535 0.267 0.23, 0.337 2.49
AKR/J m 0.176 0.0242   3 0.014 0.138 0.157, 0.203 -1.86
A/WySnJ f 0.276 0.0439   6 0.0179 0.159 0.22, 0.347 2.16
A/WySnJ m 0.204 0.00342   4 0.00171 0.0168 0.2, 0.208 -0.69
BALB/cByJ f 0.192 0.00404   4 0.00202 0.0211 0.188, 0.195 -1.35
BALB/cByJ m 0.228 0.0155   4 0.00777 0.0681 0.21, 0.248 0.31
BALB/cJ f 0.215 0.0171   4 0.00855 0.0796 0.2, 0.237 -0.39
BUB/BnJ f 0.257 0.0233   5 0.0104 0.0905 0.23, 0.285 1.37
BUB/BnJ m 0.268 0.00354   2   0.0025 0.0132 0.265, 0.27 1.99
BXA14/PgnJ f 0.228 0.0163   2   0.0115 0.0712 0.217, 0.24 0.15
BXA14/PgnJ m 0.208 0.00707   2   0.005 0.034 0.203, 0.213 -0.52
BXSB/MpJ f 0.206 0.00742   5 0.00332 0.036 0.195, 0.215 -0.77
BXSB/MpJ m 0.226 0.0139   5 0.0062 0.0614 0.21, 0.24 0.23
C3HeB/FeJ f 0.214 0.0244   5 0.0109 0.114 0.177, 0.24 -0.43
C3HeB/FeJ m 0.216 0.0174   5 0.0078 0.0809 0.185, 0.228 -0.19
C3H/HeJ f 0.209 0.00829   5 0.00371 0.0396 0.2, 0.222 -0.64
C3H/HeJ m 0.214 0.00769   6 0.00314 0.036 0.207, 0.229 -0.27
C3H/HeOuJ m 0.248 0.0534   4 0.0267 0.215 0.2, 0.323 1.15
C3H/HeSnJ f 0.246 0.00819   5 0.00366 0.0333 0.233, 0.255 0.9
C3H/HeSnJ m 0.238 0.00764   3 0.00441 0.032 0.23, 0.245 0.73
C57BL/10SnJ m 0.24 0.0808   3 0.0467 0.337 0.192, 0.333 0.81
C57BL/6ByJ f 0.202 0.0216   6 0.00883 0.107 0.18, 0.235 -0.94
C57BL/6ByJ m 0.243 0.0362   3 0.0209 0.149 0.22, 0.285 0.94
C57BL/6J f 0.227 0.0256   6 0.0105 0.113 0.2, 0.265 0.11
C57BL/6J m 0.232 0.0337   4 0.0169 0.146 0.21, 0.282 0.48
C57BLKS/J f 0.233 0.00577   3 0.00333 0.0247 0.23, 0.24 0.36
C57BLKS/J m 0.247 0.00764   3 0.00441 0.031 0.24, 0.255 1.11
C57BR/cdJ f 0.19 0.005   3 0.00289 0.0263 0.185, 0.195 -1.44
C57BR/cdJ m 0.187 0.00289   3 0.00167 0.0155 0.185, 0.19 -1.4
C57L/J m 0.225 0.011   6 0.00447 0.0487 0.215, 0.245 0.19
C58/J f 0.229 0.0156   3 0.009 0.0681 0.22, 0.247 0.19
C58/J m 0.231 0.0201   3 0.0116 0.0869 0.21, 0.25 0.44
CAST/EiJ f 0.218 0.0101   5 0.0045 0.0461 0.206, 0.23 -0.27
CAST/EiJ m 0.186 0.00616   4 0.00308 0.0331 0.177, 0.19 -1.44
CBA/CaGnLeJ f 0.201 0.00479   4 0.00239 0.0238 0.195, 0.205 -0.98
CBA/CaGnLeJ m 0.203 0.00577   3 0.00333 0.0284 0.2, 0.21 -0.73
CBA/CaH-T(14;15)6Ca/J f 0.213 0.0104   3 0.00601 0.0488 0.205, 0.225 -0.48
CBA/CaH-T(14;15)6Ca/J m 0.217 0.0189   3 0.0109 0.0874 0.195, 0.23 -0.15
CBA/CaJ f 0.215 0.0   3 0.0 0.0 0.215, 0.215 -0.39
CBA/CaJ m 0.207 0.00777   4 0.00388 0.0376 0.197, 0.215 -0.57
CBA/J f 0.227 0.019   6 0.00777 0.0838 0.205, 0.26 0.11
CBA/J m 0.18 0.0132   3 0.00764 0.0735 0.17, 0.195 -1.69
CE/J f 0.205 0.015   3 0.00866 0.0732 0.19, 0.22 -0.81
CE/J m 0.201 0.0101   3 0.00586 0.0505 0.19, 0.21 -0.82
DBA/1J f 0.228 0.00866   4 0.00433 0.0381 0.22, 0.24 0.15
DBA/1LacJ f 0.216 0.0183   6 0.00748 0.0848 0.195, 0.24 -0.35
DBA/1LacJ m 0.217 0.034   3 0.0196 0.157 0.19, 0.255 -0.15
DBA/2J f 0.209 0.0119   6 0.00487 0.0571 0.195, 0.225 -0.64
DBA/2J m 0.2 0.0132   3 0.00764 0.0661 0.19, 0.215 -0.86
EL/SuzSeyFrkJ f 0.207 0.00351   3 0.00203 0.017 0.203, 0.21 -0.73
EL/SuzSeyFrkJ m 0.194 0.00918   5 0.00411 0.0472 0.184, 0.207 -1.11
FVB/NJ f 0.175 0.01   5 0.00448 0.0574 0.16, 0.187 -2.07
I/LnJ f 0.252 0.00764   3 0.00441 0.0303 0.245, 0.26 1.16
I/LnJ m 0.252 0.00577   3 0.00333 0.0229 0.245, 0.255 1.32
KK/HlJ f 0.263 0.0362   3 0.0209 0.137 0.24, 0.305 1.62
KK/HlJ m 0.234 0.0121   6 0.00494 0.0518 0.22, 0.25 0.56
LP/J f 0.246 0.0669   6 0.0273 0.272 0.214, 0.382 0.9
LP/J m 0.247 0.0172   5 0.00769 0.0697 0.23, 0.265 1.11
MA/MyJ f 0.242 0.0106   2   0.0075 0.0437 0.235, 0.25 0.74
MA/MyJ m 0.254 0.00854   4 0.00427 0.0337 0.245, 0.265 1.4
MOLD/RkJ f 0.202 0.0425   3 0.0246 0.211 0.17, 0.25 -0.94
MOLD/RkJ m 0.182 0.00289   3 0.00167 0.0159 0.18, 0.185 -1.61
MOLF/EiJ f 0.205 0.025   3 0.0144 0.122 0.18, 0.23 -0.81
MOLF/EiJ m 0.193 0.0104   3 0.00601 0.0538 0.185, 0.205 -1.15
MRL/MpJ f 0.19 0.01   6 0.00408 0.0526 0.175, 0.205 -1.44
MRL/MpJ m 0.254 0.0252   5 0.0113 0.099 0.215, 0.28 1.4
NON/ShiLtJ f 0.243 0.0104   3 0.00601 0.0428 0.235, 0.255 0.78
NON/ShiLtJ m 0.22 0.0392   5 0.0175 0.178 0.2, 0.29 -0.02
NOR/LtJ f 0.259 0.0312   4 0.0156 0.121 0.24, 0.305 1.45
NOR/LtJ m 0.23 0.0   2   0.0 0.0 0.23, 0.23 0.4
NZB/BlNJ m 0.211 0.0197   5 0.00879 0.0933 0.19, 0.233 -0.4
NZO/HlLtJ f 0.201 0.0082   5 0.00367 0.0407 0.195, 0.215 -0.98
NZO/HlLtJ m 0.225 0.00707   2   0.005 0.0314 0.22, 0.23 0.19
NZW/LacJ f 0.242 0.0126   4 0.00629 0.0519 0.225, 0.255 0.74
PERA/EiJ f 0.192 0.00443   4 0.00222 0.0232 0.185, 0.195 -1.35
PERA/EiJ m 0.188 0.00354   2   0.0025 0.0189 0.185, 0.19 -1.36
P/J f 0.228 0.00289   3 0.00167 0.0126 0.225, 0.23 0.15
P/J m 0.222 0.00289   3 0.00167 0.013 0.22, 0.225 0.06
PL/J f 0.227 0.0151   3 0.00874 0.0666 0.21, 0.238 0.11
PL/J m 0.223 0.00153   3 0.000882 0.00684 0.222, 0.225 0.1
RBF/DnJ f 0.226 0.0348   4 0.0174 0.154 0.195, 0.265 0.07
RBF/DnJ m 0.206 0.00513   3 0.00296 0.025 0.2, 0.21 -0.61
RF/J f 0.21 0.0176   3 0.0101 0.0837 0.19, 0.223 -0.6
RF/J m 0.207 0.0   3 0.0 0.0 0.207, 0.207 -0.57
RIIIS/J f 0.225 0.049   3 0.0283 0.218 0.18, 0.277 0.03
RIIIS/J m 0.225 0.00686   6 0.0028 0.0305 0.216, 0.234 0.19
SEA/GnJ f 0.222 0.0161   3 0.00928 0.0725 0.21, 0.24 -0.1
SEA/GnJ m 0.207 0.0126   3 0.00726 0.0609 0.195, 0.22 -0.57
SJL/Bm f 0.234 0.0268   3 0.0155 0.114 0.21, 0.263 0.4
SJL/Bm m 0.224 0.0169   3 0.00977 0.0754 0.21, 0.243 0.15
SJL/J f 0.234 0.0182   5 0.00812 0.0776 0.215, 0.26 0.4
SM/J m 0.188 0.00671   5 0.003 0.0357 0.18, 0.195 -1.36
SPRET/EiJ f 0.242 0.00289   3 0.00167 0.0119 0.24, 0.245 0.74
SPRET/EiJ m 0.232 0.0106   2   0.0075 0.0456 0.225, 0.24 0.48
SWR/J f 0.21 0.0155   6 0.00632 0.0738 0.195, 0.235 -0.6
SWR/J m 0.209 0.015   6 0.00611 0.0716 0.19, 0.225 -0.48
WSB/EiJ f 0.192 0.00404   3 0.00233 0.021 0.19, 0.197 -1.35
WSB/EiJ m 0.198 0.00404   3 0.00233 0.0204 0.193, 0.2 -0.94
YBR/EiJ f 0.268 0.0306   3 0.0176 0.114 0.235, 0.295 1.83
YBR/EiJ m 0.248 0.0161   3 0.00928 0.0647 0.23, 0.26 1.15


  LEAST SQUARES MEANS (MODEL-ADJUSTED)
Strain Sex Mean SEM UpperCL LowerCL
129P3/J f 0.2617 0.012 0.2854 0.238
129P3/J m 0.2617 0.012 0.2854 0.238
129S1/SvImJ f 0.2438 0.0085 0.2606 0.2271
129S1/SvImJ m 0.2708 0.0104 0.2913 0.2502
129T2/SvEmsJ f 0.204 0.0093 0.2224 0.1856
129T2/SvEmsJ m 0.2102 0.0093 0.2286 0.1918
A/HeJ f 0.2288 0.0085 0.2456 0.2121
A/HeJ m 0.21 0.012 0.2337 0.1863
AKR/J f 0.2835 0.0147 0.3125 0.2545
AKR/J m 0.1757 0.012 0.1994 0.152
A/WySnJ f 0.2762 0.0085 0.2929 0.2594
A/WySnJ m 0.2035 0.0104 0.224 0.183
BALB/cByJ f 0.1915 0.0104 0.212 0.171
BALB/cByJ m 0.2282 0.0104 0.2488 0.2077
BUB/BnJ f 0.2574 0.0093 0.2758 0.239
BUB/BnJ m 0.2675 0.0147 0.2965 0.2385
BXA14/PgnJ f 0.2285 0.0147 0.2575 0.1995
BXA14/PgnJ m 0.208 0.0147 0.237 0.179
BXSB/MpJ f 0.206 0.0093 0.2244 0.1876
BXSB/MpJ m 0.226 0.0093 0.2444 0.2076
C3HeB/FeJ f 0.2144 0.0093 0.2328 0.196
C3HeB/FeJ m 0.2156 0.0093 0.234 0.1972
C3H/HeJ f 0.2094 0.0093 0.2278 0.191
C3H/HeJ m 0.214 0.0085 0.2308 0.1972
C3H/HeSnJ f 0.246 0.0093 0.2644 0.2276
C3H/HeSnJ m 0.2383 0.012 0.262 0.2146
C57BL/6ByJ f 0.2025 0.0085 0.2193 0.1857
C57BL/6ByJ m 0.2433 0.012 0.267 0.2196
C57BL/6J f 0.2267 0.0085 0.2434 0.2099
C57BL/6J m 0.2317 0.0104 0.2523 0.2112
C57BLKS/J f 0.2333 0.012 0.257 0.2096
C57BLKS/J m 0.2467 0.012 0.2704 0.223
C57BR/cdJ f 0.19 0.012 0.2137 0.1663
C57BR/cdJ m 0.1867 0.012 0.2104 0.163
C58/J f 0.229 0.012 0.2527 0.2053
C58/J m 0.231 0.012 0.2547 0.2073
CAST/EiJ f 0.2182 0.0093 0.2366 0.1998
CAST/EiJ m 0.186 0.0104 0.2065 0.1655
CBA/CaGnLeJ f 0.2012 0.0104 0.2218 0.1807
CBA/CaGnLeJ m 0.2033 0.012 0.227 0.1796
CBA/CaH-T(14;15)6Ca/J f 0.2133 0.012 0.237 0.1896
CBA/CaH-T(14;15)6Ca/J m 0.2167 0.012 0.2404 0.193
CBA/CaJ f 0.215 0.012 0.2387 0.1913
CBA/CaJ m 0.2065 0.0104 0.227 0.186
CBA/J f 0.2272 0.0085 0.2439 0.2104
CBA/J m 0.18 0.012 0.2037 0.1563
CE/J f 0.205 0.012 0.2287 0.1813
CE/J m 0.201 0.012 0.2247 0.1773
DBA/1LacJ f 0.2162 0.0085 0.2329 0.1994
DBA/1LacJ m 0.2167 0.012 0.2404 0.193
DBA/2J f 0.2088 0.0085 0.2256 0.1921
DBA/2J m 0.2 0.012 0.2237 0.1763
EL/SuzSeyFrkJ f 0.2067 0.012 0.2304 0.183
EL/SuzSeyFrkJ m 0.1944 0.0093 0.2128 0.176
I/LnJ f 0.2517 0.012 0.2754 0.228
I/LnJ m 0.2517 0.012 0.2754 0.228
KK/HlJ f 0.2633 0.012 0.287 0.2396
KK/HlJ m 0.2337 0.0085 0.2504 0.2169
LP/J f 0.2458 0.0085 0.2626 0.2291
LP/J m 0.2466 0.0093 0.265 0.2282
MA/MyJ f 0.2425 0.0147 0.2715 0.2135
MA/MyJ m 0.2537 0.0104 0.2743 0.2332
MOLD/RkJ f 0.2017 0.012 0.2254 0.178
MOLD/RkJ m 0.1817 0.012 0.2054 0.158
MOLF/EiJ f 0.205 0.012 0.2287 0.1813
MOLF/EiJ m 0.1933 0.012 0.217 0.1696
MRL/MpJ f 0.19 0.0085 0.2068 0.1732
MRL/MpJ m 0.2544 0.0093 0.2728 0.236
NON/ShiLtJ f 0.2433 0.012 0.267 0.2196
NON/ShiLtJ m 0.22 0.0093 0.2384 0.2016
NOR/LtJ f 0.2587 0.0104 0.2793 0.2382
NOR/LtJ m 0.23 0.0147 0.259 0.201
NZO/HlLtJ f 0.2014 0.0093 0.2198 0.183
NZO/HlLtJ m 0.225 0.0147 0.254 0.196
PERA/EiJ f 0.1915 0.0104 0.212 0.171
PERA/EiJ m 0.1875 0.0147 0.2165 0.1585
P/J f 0.2283 0.012 0.252 0.2046
P/J m 0.2217 0.012 0.2454 0.198
PL/J f 0.2273 0.012 0.251 0.2036
PL/J m 0.2233 0.012 0.247 0.1996
RBF/DnJ f 0.2257 0.0104 0.2463 0.2052
RBF/DnJ m 0.2057 0.012 0.2294 0.182
RF/J f 0.21 0.012 0.2337 0.1863
RF/J m 0.207 0.012 0.2307 0.1833
RIIIS/J f 0.2247 0.012 0.2484 0.201
RIIIS/J m 0.2247 0.0085 0.2414 0.2079
SEA/GnJ f 0.2217 0.012 0.2454 0.198
SEA/GnJ m 0.2067 0.012 0.2304 0.183
SJL/Bm f 0.2343 0.012 0.258 0.2106
SJL/Bm m 0.2243 0.012 0.248 0.2006
SPRET/EiJ f 0.2417 0.012 0.2654 0.218
SPRET/EiJ m 0.2325 0.0147 0.2615 0.2035
SWR/J f 0.21 0.0085 0.2268 0.1932
SWR/J m 0.2092 0.0085 0.2259 0.1924
WSB/EiJ f 0.1923 0.012 0.216 0.1686
WSB/EiJ m 0.1977 0.012 0.2214 0.174
YBR/EiJ f 0.2683 0.012 0.292 0.2446
YBR/EiJ m 0.2483 0.012 0.272 0.2246


  LEAST SQUARES MEANS (MODEL-ADJUSTED), SEXES COMBINED
Strain Sex Mean SEM UpperCL LowerCL
129P3/J both 0.2617 0.0085 0.2784 0.2449
129S1/SvImJ both 0.2573 0.0067 0.2705 0.244
129T2/SvEmsJ both 0.2071 0.0066 0.2201 0.1941
A/HeJ both 0.2194 0.0074 0.2339 0.2049
AKR/J both 0.2296 0.0095 0.2483 0.2109
A/WySnJ both 0.2398 0.0067 0.2531 0.2266
BALB/cByJ both 0.2099 0.0074 0.2244 0.1954
BUB/BnJ both 0.2624 0.0087 0.2796 0.2453
BXA14/PgnJ both 0.2182 0.0104 0.2388 0.1977
BXSB/MpJ both 0.216 0.0066 0.229 0.203
C3HeB/FeJ both 0.215 0.0066 0.228 0.202
C3H/HeJ both 0.2117 0.0063 0.2241 0.1993
C3H/HeSnJ both 0.2422 0.0076 0.2572 0.2272
C57BL/6ByJ both 0.2229 0.0074 0.2374 0.2084
C57BL/6J both 0.2292 0.0067 0.2425 0.216
C57BLKS/J both 0.24 0.0085 0.2568 0.2232
C57BR/cdJ both 0.1883 0.0085 0.2051 0.1716
C58/J both 0.23 0.0085 0.2468 0.2132
CAST/EiJ both 0.2021 0.007 0.2159 0.1883
CBA/CaGnLeJ both 0.2023 0.008 0.218 0.1866
CBA/CaH-T(14;15)6Ca/J both 0.215 0.0085 0.2318 0.1982
CBA/CaJ both 0.2107 0.008 0.2264 0.1951
CBA/J both 0.2036 0.0074 0.2181 0.1891
CE/J both 0.203 0.0085 0.2198 0.1862
DBA/1LacJ both 0.2164 0.0074 0.2309 0.2019
DBA/2J both 0.2044 0.0074 0.2189 0.1899
EL/SuzSeyFrkJ both 0.2005 0.0076 0.2155 0.1855
I/LnJ both 0.2517 0.0085 0.2684 0.2349
KK/HlJ both 0.2485 0.0074 0.263 0.234
LP/J both 0.2462 0.0063 0.2586 0.2338
MA/MyJ both 0.2481 0.009 0.2659 0.2304
MOLD/RkJ both 0.1917 0.0085 0.2084 0.1749
MOLF/EiJ both 0.1992 0.0085 0.2159 0.1824
MRL/MpJ both 0.2222 0.0063 0.2346 0.2098
NON/ShiLtJ both 0.2317 0.0076 0.2467 0.2167
NOR/LtJ both 0.2444 0.009 0.2621 0.2266
NZO/HlLtJ both 0.2132 0.0087 0.2304 0.196
PERA/EiJ both 0.1895 0.009 0.2073 0.1717
P/J both 0.225 0.0085 0.2418 0.2082
PL/J both 0.2253 0.0085 0.2421 0.2086
RBF/DnJ both 0.2157 0.008 0.2314 0.2
RF/J both 0.2085 0.0085 0.2253 0.1917
RIIIS/J both 0.2247 0.0074 0.2392 0.2102
SEA/GnJ both 0.2142 0.0085 0.2309 0.1974
SJL/Bm both 0.2293 0.0085 0.2461 0.2126
SPRET/EiJ both 0.2371 0.0095 0.2558 0.2184
SWR/J both 0.2096 0.006 0.2214 0.1977
WSB/EiJ both 0.195 0.0085 0.2118 0.1782
YBR/EiJ both 0.2583 0.0085 0.2751 0.2416




  GWAS USING LINEAR MIXED MODELS