Phenotype measure:   Zheng1   Rgradient

ID, description, units MPD:29803   Rgradient   middle ear gradient at maximum compliance, right ear   [mL]   measure
Data set, strains Zheng1   inbred   56 strains     sex: both     age: 5-68wks
Procedure tympanometry
Ontology mappings

  STRAIN COMPARISON PLOT
Dimensions Width:   px    Height:   px
Download Plot   
Visualization Options

Zheng1 - middle ear gradient at maximum compliance, right ear



  MEASURE SUMMARY
Measure Summary FemaleMale
Number of strains tested54 strains56 strains
Mean of the strain means0.0826   mL 0.0789   mL
Median of the strain means0.0799   mL 0.0737   mL
SD of the strain means± 0.0267 ± 0.0263
Coefficient of variation (CV)0.323 0.334
Min–max range of strain means0.0400   –   0.179   mL 0.0307   –   0.158   mL
Mean sample size per strain4.1   mice 3.6   mice


  ANOVA, Q-Q NORMALITY ASSESSMENT
ANOVA summary      
FactorDFSum of squaresMean sum of squaresF valuep value (Pr>F)
sex 1 0.0074 0.0074 11.0673 0.001
strain 48 0.1483 0.0031 4.617 < 0.0001
sex:strain 48 0.0731 0.0015 2.2764 < 0.0001
Residuals 274 0.1834 0.0007


Q-Q normality assessment based on residuals

  


  STRAIN MEANS (UNADJUSTED)
  
Select table page:
Strain Sex Mean SD N mice SEM CV Min, Max Z score
129P1/ReJ m 0.0689 0.0106   3 0.0061 0.153 0.0567, 0.075 -0.38
129P3/J f 0.0817 0.0153   3 0.00882 0.187 0.065, 0.095 -0.04
129P3/J m 0.12 0.018   3 0.0104 0.15 0.105, 0.14 1.56
129S1/SvImJ f 0.108 0.0259   6 0.0106 0.239 0.08, 0.152 0.95
129S1/SvImJ m 0.137 0.0309   4 0.0155 0.226 0.118, 0.183 2.21
129T2/SvEmsJ f 0.084 0.0401   5 0.0179 0.477 0.055, 0.145 0.05
129T2/SvEmsJ m 0.0918 0.0197   5 0.00881 0.215 0.068, 0.122 0.49
129X1/SvJ m 0.158 0.0325   4 0.0163 0.206 0.132, 0.205 3.01
A/HeJ f 0.14 0.0663   6 0.0271 0.475 0.07, 0.25 2.15
A/HeJ m 0.0983 0.0321   3 0.0186 0.327 0.075, 0.135 0.74
AKR/J f 0.0835 0.0332   2   0.0235 0.398 0.06, 0.107 0.03
AKR/J m 0.05 0.0115   3 0.00667 0.231 0.0367, 0.0567 -1.1
A/WySnJ f 0.179 0.0523   6 0.0214 0.293 0.075, 0.223 3.61
A/WySnJ m 0.0882 0.00988   4 0.00494 0.112 0.082, 0.103 0.35
BALB/cByJ f 0.0781 0.023   4 0.0115 0.295 0.055, 0.11 -0.17
BALB/cByJ m 0.107 0.0256   4 0.0128 0.238 0.074, 0.133 1.07
BALB/cJ f 0.138 0.0187   4 0.00937 0.136 0.12, 0.157 2.07
BUB/BnJ f 0.114 0.0262   5 0.0117 0.23 0.09, 0.155 1.17
BUB/BnJ m 0.0675 0.0247   2   0.0175 0.367 0.05, 0.085 -0.43
BXA14/PgnJ f 0.0583 0.0118   2   0.00835 0.202 0.05, 0.0667 -0.91
BXA14/PgnJ m 0.0991 0.00827   2   0.00585 0.0834 0.0933, 0.105 0.77
BXSB/MpJ f 0.113 0.0313   5 0.014 0.277 0.065, 0.15 1.14
BXSB/MpJ m 0.094 0.0147   5 0.0066 0.157 0.07, 0.11 0.57
C3HeB/FeJ f 0.0793 0.0264   5 0.0118 0.333 0.05, 0.12 -0.13
C3HeB/FeJ m 0.109 0.0393   5 0.0176 0.361 0.076, 0.165 1.14
C3H/HeJ f 0.0948 0.0252   5 0.0113 0.265 0.064, 0.13 0.46
C3H/HeJ m 0.0791 0.00797   6 0.00325 0.101 0.0673, 0.0873 0.01
C3H/HeOuJ m 0.126 0.0211   4 0.0106 0.168 0.1, 0.15 1.79
C3H/HeSnJ f 0.096 0.0248   5 0.0111 0.259 0.065, 0.13 0.5
C3H/HeSnJ m 0.0833 0.0501   3 0.0289 0.601 0.045, 0.14 0.17
C57BL/10SnJ m 0.122 0.0613   3 0.0354 0.501 0.084, 0.193 1.64
C57BL/6ByJ f 0.085 0.0141   6 0.00577 0.166 0.07, 0.11 0.09
C57BL/6ByJ m 0.0667 0.0161   3 0.00928 0.241 0.055, 0.085 -0.46
C57BL/6J f 0.11 0.0387   6 0.0158 0.352 0.065, 0.175 1.02
C57BL/6J m 0.0781 0.0114   4 0.00572 0.146 0.065, 0.0925 -0.03
C57BLKS/J f 0.0617 0.00289   3 0.00167 0.0468 0.06, 0.065 -0.78
C57BLKS/J m 0.0817 0.0176   3 0.0101 0.215 0.065, 0.1 0.11
C57BR/cdJ f 0.0967 0.0289   3 0.0167 0.299 0.08, 0.13 0.53
C57BR/cdJ m 0.0633 0.0275   3 0.0159 0.435 0.045, 0.095 -0.59
C57L/J m 0.151 0.0435   6 0.0178 0.289 0.1, 0.215 2.74
C58/J f 0.07 0.0222   3 0.0128 0.317 0.045, 0.0875 -0.47
C58/J m 0.0633 0.0218   3 0.0126 0.345 0.045, 0.0875 -0.59
CAST/EiJ f 0.0529 0.012   5 0.00538 0.227 0.04, 0.065 -1.11
CAST/EiJ m 0.0533 0.00722   4 0.00361 0.135 0.0433, 0.06 -0.97
CBA/CaGnLeJ f 0.0763 0.0075   4 0.00375 0.0984 0.07, 0.085 -0.24
CBA/CaGnLeJ m 0.0567 0.00289   3 0.00167 0.0509 0.055, 0.06 -0.84
CBA/CaH-T(14;15)6Ca/J f 0.0917 0.0189   3 0.0109 0.207 0.07, 0.105 0.34
CBA/CaH-T(14;15)6Ca/J m 0.075 0.0328   3 0.0189 0.437 0.04, 0.105 -0.15
CBA/CaJ f 0.0667 0.0161   3 0.00928 0.241 0.055, 0.085 -0.6
CBA/CaJ m 0.0892 0.0138   4 0.00692 0.155 0.07, 0.1 0.39
CBA/J f 0.0563 0.0166   6 0.00676 0.294 0.03, 0.08 -0.99
CBA/J m 0.0617 0.0153   3 0.00882 0.248 0.045, 0.075 -0.65
CE/J f 0.085 0.0304   3 0.0176 0.358 0.065, 0.12 0.09
CE/J m 0.0422 0.00632   3 0.00365 0.15 0.035, 0.0467 -1.39
DBA/1J f 0.0613 0.018   4 0.00898 0.293 0.035, 0.075 -0.8
DBA/1LacJ f 0.0953 0.0173   6 0.00708 0.182 0.08, 0.122 0.47
DBA/1LacJ m 0.0767 0.00289   3 0.00167 0.0377 0.075, 0.08 -0.08
DBA/2J f 0.0921 0.0168   6 0.00687 0.183 0.0775, 0.12 0.35
DBA/2J m 0.06 0.0132   3 0.00764 0.22 0.05, 0.075 -0.72
EL/SuzSeyFrkJ f 0.0799 0.0217   3 0.0125 0.271 0.06, 0.103 -0.1
EL/SuzSeyFrkJ m 0.0421 0.017   5 0.0076 0.403 0.0267, 0.064 -1.4
FVB/NJ f 0.0433 0.0153   5 0.00684 0.353 0.0267, 0.0667 -1.47
I/LnJ f 0.04 0.0173   3 0.01 0.433 0.02, 0.05 -1.6
I/LnJ m 0.065 0.0278   3 0.0161 0.428 0.035, 0.09 -0.53
KK/HlJ f 0.0783 0.0252   3 0.0145 0.321 0.055, 0.105 -0.16
KK/HlJ m 0.0783 0.0427   6 0.0174 0.546 0.045, 0.155 -0.02
LP/J f 0.12 0.023   6 0.0094 0.192 0.0975, 0.149 1.4
LP/J m 0.0537 0.0122   5 0.00544 0.227 0.0383, 0.0683 -0.96
MA/MyJ f 0.08 0.0141   2   0.01 0.177 0.07, 0.09 -0.1
MA/MyJ m 0.085 0.0542   4 0.0271 0.637 0.045, 0.165 0.23
MOLD/RkJ f 0.0633 0.0144   3 0.00833 0.228 0.055, 0.08 -0.72
MOLD/RkJ m 0.065 0.025   3 0.0144 0.385 0.04, 0.09 -0.53
MOLF/EiJ f 0.08 0.02   3 0.0115 0.25 0.06, 0.1 -0.1
MOLF/EiJ m 0.0717 0.00764   3 0.00441 0.107 0.065, 0.08 -0.27
MRL/MpJ f 0.08 0.0263   6 0.0107 0.328 0.04, 0.12 -0.1
MRL/MpJ m 0.056 0.00912   5 0.00408 0.163 0.0425, 0.0675 -0.87
NON/ShiLtJ f 0.0533 0.0189   3 0.0109 0.355 0.04, 0.075 -1.1
NON/ShiLtJ m 0.0725 0.0103   5 0.00461 0.142 0.06, 0.085 -0.24
NOR/LtJ f 0.075 0.0238   4 0.0119 0.317 0.04, 0.09 -0.29
NOR/LtJ m 0.0775 0.00354   2   0.0025 0.0456 0.075, 0.08 -0.05
NZB/BlNJ m 0.0307 0.0189   5 0.00845 0.616 0.0167, 0.0633 -1.83
NZO/HlLtJ f 0.0653 0.00416   5 0.00186 0.0637 0.06, 0.0717 -0.65
NZO/HlLtJ m 0.07 0.0141   2   0.01 0.202 0.06, 0.08 -0.34
NZW/LacJ f 0.126 0.0325   4 0.0163 0.257 0.095, 0.17 1.62
PERA/EiJ f 0.0408 0.0104   4 0.0052 0.255 0.03, 0.0533 -1.57
PERA/EiJ m 0.0725 0.0177   2   0.0125 0.244 0.06, 0.085 -0.24
P/J f 0.055 0.018   3 0.0104 0.328 0.04, 0.075 -1.04
P/J m 0.0467 0.0293   3 0.0169 0.628 0.025, 0.08 -1.22
PL/J f 0.103 0.0102   3 0.0059 0.0989 0.0967, 0.115 0.76
PL/J m 0.0882 0.034   3 0.0196 0.386 0.055, 0.123 0.35
RBF/DnJ f 0.0625 0.0223   4 0.0111 0.356 0.045, 0.095 -0.75
RBF/DnJ m 0.0625 0.0198   3 0.0115 0.317 0.0475, 0.085 -0.62
RF/J f 0.0422 0.0107   3 0.00619 0.254 0.03, 0.05 -1.52
RF/J m 0.0533 0.0167   3 0.00961 0.312 0.0367, 0.07 -0.97
RIIIS/J f 0.0733 0.0145   3 0.00839 0.198 0.0633, 0.09 -0.35
RIIIS/J m 0.0965 0.0321   6 0.0131 0.332 0.064, 0.15 0.67
SEA/GnJ f 0.08 0.0218   3 0.0126 0.272 0.065, 0.105 -0.1
SEA/GnJ m 0.08 0.02   3 0.0115 0.25 0.06, 0.1 0.04
SJL/Bm f 0.0728 0.0155   3 0.00893 0.213 0.055, 0.0833 -0.37
SJL/Bm m 0.0483 0.00438   3 0.00253 0.0907 0.045, 0.0533 -1.16
SJL/J f 0.078 0.0217   5 0.0097 0.278 0.055, 0.105 -0.17
SM/J m 0.067 0.0148   5 0.00663 0.221 0.045, 0.085 -0.45
SPRET/EiJ f 0.0833 0.00289   3 0.00167 0.0346 0.08, 0.085 0.02
SPRET/EiJ m 0.075 0.0   2   0.0 0.0 0.075, 0.075 -0.15
SWR/J f 0.0717 0.0316   6 0.0129 0.441 0.03, 0.12 -0.41
SWR/J m 0.101 0.0424   6 0.0173 0.42 0.065, 0.18 0.84
WSB/EiJ f 0.104 0.00822   3 0.00475 0.0789 0.0967, 0.113 0.8
WSB/EiJ m 0.0711 0.00697   3 0.00402 0.098 0.0633, 0.0767 -0.29
YBR/EiJ f 0.0633 0.0275   3 0.0159 0.435 0.045, 0.095 -0.72
YBR/EiJ m 0.0683 0.0301   3 0.0174 0.441 0.04, 0.1 -0.4


  LEAST SQUARES MEANS (MODEL-ADJUSTED)
Strain Sex Mean SEM UpperCL LowerCL
129P3/J f 0.0817 0.0149 0.1111 0.0523
129P3/J m 0.12 0.0149 0.1494 0.0906
129S1/SvImJ f 0.1082 0.0106 0.129 0.0874
129S1/SvImJ m 0.1368 0.0129 0.1622 0.1113
129T2/SvEmsJ f 0.084 0.0116 0.1068 0.0612
129T2/SvEmsJ m 0.0918 0.0116 0.1146 0.069
A/HeJ f 0.1397 0.0106 0.1605 0.1189
A/HeJ m 0.0983 0.0149 0.1277 0.0689
AKR/J f 0.0835 0.0183 0.1195 0.0475
AKR/J m 0.05 0.0149 0.0794 0.0206
A/WySnJ f 0.1787 0.0106 0.1995 0.1579
A/WySnJ m 0.0882 0.0129 0.1137 0.0628
BALB/cByJ f 0.0781 0.0129 0.1036 0.0527
BALB/cByJ m 0.1072 0.0129 0.1327 0.0818
BUB/BnJ f 0.1136 0.0116 0.1364 0.0908
BUB/BnJ m 0.0675 0.0183 0.1035 0.0315
BXA14/PgnJ f 0.0583 0.0183 0.0944 0.0223
BXA14/PgnJ m 0.0991 0.0183 0.1352 0.0631
BXSB/MpJ f 0.113 0.0116 0.1358 0.0902
BXSB/MpJ m 0.094 0.0116 0.1168 0.0712
C3HeB/FeJ f 0.0793 0.0116 0.1021 0.0566
C3HeB/FeJ m 0.1088 0.0116 0.1316 0.086
C3H/HeJ f 0.0948 0.0116 0.1176 0.072
C3H/HeJ m 0.0791 0.0106 0.0998 0.0583
C3H/HeSnJ f 0.096 0.0116 0.1188 0.0732
C3H/HeSnJ m 0.0833 0.0149 0.1127 0.0539
C57BL/6ByJ f 0.085 0.0106 0.1058 0.0642
C57BL/6ByJ m 0.0667 0.0149 0.0961 0.0373
C57BL/6J f 0.11 0.0106 0.1308 0.0892
C57BL/6J m 0.0781 0.0129 0.1036 0.0527
C57BLKS/J f 0.0617 0.0149 0.0911 0.0323
C57BLKS/J m 0.0817 0.0149 0.1111 0.0523
C57BR/cdJ f 0.0967 0.0149 0.1261 0.0673
C57BR/cdJ m 0.0633 0.0149 0.0927 0.0339
C58/J f 0.07 0.0149 0.0994 0.0406
C58/J m 0.0633 0.0149 0.0927 0.0339
CAST/EiJ f 0.0529 0.0116 0.0757 0.0301
CAST/EiJ m 0.0533 0.0129 0.0788 0.0279
CBA/CaGnLeJ f 0.0762 0.0129 0.1017 0.0508
CBA/CaGnLeJ m 0.0567 0.0149 0.0861 0.0273
CBA/CaH-T(14;15)6Ca/J f 0.0917 0.0149 0.1211 0.0623
CBA/CaH-T(14;15)6Ca/J m 0.075 0.0149 0.1044 0.0456
CBA/CaJ f 0.0667 0.0149 0.0961 0.0373
CBA/CaJ m 0.0892 0.0129 0.1147 0.0638
CBA/J f 0.0563 0.0106 0.077 0.0355
CBA/J m 0.0617 0.0149 0.0911 0.0323
CE/J f 0.085 0.0149 0.1144 0.0556
CE/J m 0.0422 0.0149 0.0716 0.0128
DBA/1LacJ f 0.0953 0.0106 0.1161 0.0745
DBA/1LacJ m 0.0767 0.0149 0.1061 0.0473
DBA/2J f 0.0921 0.0106 0.1129 0.0713
DBA/2J m 0.06 0.0149 0.0894 0.0306
EL/SuzSeyFrkJ f 0.0799 0.0149 0.1093 0.0505
EL/SuzSeyFrkJ m 0.0421 0.0116 0.0649 0.0194
I/LnJ f 0.04 0.0149 0.0694 0.0106
I/LnJ m 0.065 0.0149 0.0944 0.0356
KK/HlJ f 0.0783 0.0149 0.1077 0.0489
KK/HlJ m 0.0783 0.0106 0.0991 0.0575
LP/J f 0.1201 0.0106 0.1409 0.0993
LP/J m 0.0537 0.0116 0.0764 0.0309
MA/MyJ f 0.08 0.0183 0.116 0.044
MA/MyJ m 0.085 0.0129 0.1105 0.0595
MOLD/RkJ f 0.0633 0.0149 0.0927 0.0339
MOLD/RkJ m 0.065 0.0149 0.0944 0.0356
MOLF/EiJ f 0.08 0.0149 0.1094 0.0506
MOLF/EiJ m 0.0717 0.0149 0.1011 0.0423
MRL/MpJ f 0.08 0.0106 0.1008 0.0592
MRL/MpJ m 0.056 0.0116 0.0788 0.0332
NON/ShiLtJ f 0.0533 0.0149 0.0827 0.0239
NON/ShiLtJ m 0.0725 0.0116 0.0953 0.0497
NOR/LtJ f 0.075 0.0129 0.1005 0.0495
NOR/LtJ m 0.0775 0.0183 0.1135 0.0415
NZO/HlLtJ f 0.0653 0.0116 0.0881 0.0426
NZO/HlLtJ m 0.07 0.0183 0.106 0.034
PERA/EiJ f 0.0408 0.0129 0.0663 0.0154
PERA/EiJ m 0.0725 0.0183 0.1085 0.0365
P/J f 0.055 0.0149 0.0844 0.0256
P/J m 0.0467 0.0149 0.0761 0.0173
PL/J f 0.1032 0.0149 0.1326 0.0738
PL/J m 0.0882 0.0149 0.1176 0.0588
RBF/DnJ f 0.0625 0.0129 0.088 0.037
RBF/DnJ m 0.0625 0.0149 0.0919 0.0331
RF/J f 0.0422 0.0149 0.0716 0.0128
RF/J m 0.0533 0.0149 0.0827 0.0239
RIIIS/J f 0.0733 0.0149 0.1027 0.0439
RIIIS/J m 0.0965 0.0106 0.1173 0.0757
SEA/GnJ f 0.08 0.0149 0.1094 0.0506
SEA/GnJ m 0.08 0.0149 0.1094 0.0506
SJL/Bm f 0.0728 0.0149 0.1022 0.0434
SJL/Bm m 0.0483 0.0149 0.0777 0.0189
SPRET/EiJ f 0.0833 0.0149 0.1127 0.0539
SPRET/EiJ m 0.075 0.0183 0.111 0.039
SWR/J f 0.0717 0.0106 0.0925 0.0509
SWR/J m 0.1008 0.0106 0.1216 0.08
WSB/EiJ f 0.1042 0.0149 0.1336 0.0748
WSB/EiJ m 0.0711 0.0149 0.1005 0.0417
YBR/EiJ f 0.0633 0.0149 0.0927 0.0339
YBR/EiJ m 0.0683 0.0149 0.0977 0.0389


  LEAST SQUARES MEANS (MODEL-ADJUSTED), SEXES COMBINED
Strain Sex Mean SEM UpperCL LowerCL
129P3/J both 0.1008 0.0106 0.1216 0.08
129S1/SvImJ both 0.1225 0.0084 0.1389 0.106
129T2/SvEmsJ both 0.0879 0.0082 0.104 0.0718
A/HeJ both 0.119 0.0091 0.137 0.101
AKR/J both 0.0668 0.0118 0.09 0.0435
A/WySnJ both 0.1335 0.0084 0.1499 0.117
BALB/cByJ both 0.0927 0.0091 0.1107 0.0747
BUB/BnJ both 0.0906 0.0108 0.1119 0.0692
BXA14/PgnJ both 0.0787 0.0129 0.1042 0.0533
BXSB/MpJ both 0.1035 0.0082 0.1196 0.0874
C3HeB/FeJ both 0.0941 0.0082 0.1102 0.078
C3H/HeJ both 0.0869 0.0078 0.1023 0.0715
C3H/HeSnJ both 0.0897 0.0094 0.1083 0.0711
C57BL/6ByJ both 0.0758 0.0091 0.0938 0.0578
C57BL/6J both 0.0941 0.0084 0.1105 0.0776
C57BLKS/J both 0.0717 0.0106 0.0925 0.0509
C57BR/cdJ both 0.08 0.0106 0.1008 0.0592
C58/J both 0.0667 0.0106 0.0875 0.0459
CAST/EiJ both 0.0531 0.0087 0.0702 0.036
CBA/CaGnLeJ both 0.0665 0.0099 0.0859 0.047
CBA/CaH-T(14;15)6Ca/J both 0.0833 0.0106 0.1041 0.0625
CBA/CaJ both 0.0779 0.0099 0.0974 0.0585
CBA/J both 0.059 0.0091 0.077 0.041
CE/J both 0.0636 0.0106 0.0844 0.0428
DBA/1LacJ both 0.086 0.0091 0.104 0.068
DBA/2J both 0.076 0.0091 0.094 0.058
EL/SuzSeyFrkJ both 0.061 0.0094 0.0796 0.0424
I/LnJ both 0.0525 0.0106 0.0733 0.0317
KK/HlJ both 0.0783 0.0091 0.0963 0.0603
LP/J both 0.0869 0.0078 0.1023 0.0715
MA/MyJ both 0.0825 0.0112 0.1046 0.0604
MOLD/RkJ both 0.0642 0.0106 0.085 0.0434
MOLF/EiJ both 0.0758 0.0106 0.0966 0.055
MRL/MpJ both 0.068 0.0078 0.0834 0.0526
NON/ShiLtJ both 0.0629 0.0094 0.0815 0.0443
NOR/LtJ both 0.0763 0.0112 0.0983 0.0542
NZO/HlLtJ both 0.0677 0.0108 0.089 0.0464
PERA/EiJ both 0.0567 0.0112 0.0787 0.0346
P/J both 0.0508 0.0106 0.0716 0.03
PL/J both 0.0957 0.0106 0.1165 0.0749
RBF/DnJ both 0.0625 0.0099 0.082 0.043
RF/J both 0.0478 0.0106 0.0686 0.027
RIIIS/J both 0.0849 0.0091 0.1029 0.0669
SEA/GnJ both 0.08 0.0106 0.1008 0.0592
SJL/Bm both 0.0605 0.0106 0.0813 0.0398
SPRET/EiJ both 0.0792 0.0118 0.1024 0.0559
SWR/J both 0.0862 0.0075 0.101 0.0715
WSB/EiJ both 0.0877 0.0106 0.1085 0.0669
YBR/EiJ both 0.0658 0.0106 0.0866 0.045




  GWAS USING LINEAR MIXED MODELS