Project measure / variable:   Mills1   RBC_micronucl_M12

ID, description, units MPD:25232   RBC_micronucl_M12   red blood cells (RBC) with micronuclei   [%]  at age 12mo  
Data set, strains Mills1   inbred   30 strains     sex: both     age: 52wks
Procedure chromosome instability assessment
Ontology mappings

  •   Or, add this measure to your collection.
       
  •     no folder
  •     put it in new folder  

  STRAIN COMPARISON PLOT
Dimensions Width:   px    Height:   px
Download Plot   
Visualization Options

Mills1 - red blood cells (RBC) with micronuclei at age 12mo



  MEASURE SUMMARY
Measure Summary FemaleMale
Number of strains tested26 strains28 strains
Mean of the strain means0.169   % 0.243   %
Median of the strain means0.143   % 0.197   %
SD of the strain means± 0.0858 ± 0.126
Coefficient of variation (CV)0.509 0.517
Min–max range of strain means0.0855   –   0.480   % 0.0982   –   0.641   %
Mean sample size per strain5.5   mice 5.0   mice


  ANOVA, Q-Q NORMALITY ASSESSMENT
ANOVA summary      
FactorDFSum of squaresMean sum of squaresF valuep value (Pr>F)
sex 1 0.4031 0.4031 42.1561 < 0.0001
strain 23 1.9279 0.0838 8.7669 < 0.0001
sex:strain 23 1.0773 0.0468 4.8987 < 0.0001
Residuals 208 1.9888 0.0096


Q-Q normality assessment based on residuals

  


  STRAIN MEANS (UNADJUSTED)
  
Select table page:
Strain Sex Mean SD N mice SEM CV Min, Max Z score
129S1/SvImJ f 0.113 0.0137   6 0.00558 0.121 0.1, 0.14 -0.65
129S1/SvImJ m 0.27 0.314   9 0.105 1.16 0.13, 1.1 0.21
A/J m 0.165 0.00707   2   0.005 0.0429 0.16, 0.17 -0.62
AKR/J f 0.183 0.127   3 0.0736 0.695 0.1, 0.33 0.17
AKR/J m 0.282 0.285   5 0.128 1.01 0.13, 0.79 0.31
BALB/cByJ f 0.182 0.00957   4 0.00479 0.0525 0.17, 0.19 0.16
BALB/cByJ m 0.223 0.00577   3 0.00333 0.0259 0.22, 0.23 -0.16
BTBR T+ Itpr3tf/J f 0.146 0.0477   7 0.018 0.327 0.074, 0.2 -0.26
BTBR T+ Itpr3tf/J m 0.0982 0.0606   6 0.0247 0.617 0.061, 0.22 -1.15
BUB/BnJ f 0.201 0.0313   7 0.0118 0.155 0.16, 0.24 0.38
BUB/BnJ m 0.19 0.0424   2   0.03 0.223 0.16, 0.22 -0.42
C3H/HeJ m 0.2 0.0158   5 0.00707 0.0791 0.18, 0.22 -0.34
C57BL/10J m 0.438 0.0349   5 0.0156 0.0797 0.4, 0.48 1.55
C57BL/6J f 0.138 0.0417   6 0.017 0.301 0.11, 0.22 -0.36
C57BL/6J m 0.262 0.0306   6 0.0125 0.117 0.23, 0.3 0.15
C57BLKS/J f 0.117 0.0115   3 0.00667 0.099 0.11, 0.13 -0.6
C57BLKS/J m 0.172 0.0248   6 0.0101 0.145 0.13, 0.2 -0.57
C57BR/cdJ f 0.168 0.012   9 0.00401 0.0716 0.15, 0.19 -0.01
C57BR/cdJ m 0.448 0.125   4 0.0624 0.279 0.34, 0.61 1.63
C57L/J f 0.114 0.00548   5 0.00245 0.048 0.11, 0.12 -0.64
C57L/J m 0.14 0.01   5 0.00447 0.0714 0.13, 0.15 -0.82
CBA/J f 0.0855 0.00878   6 0.00358 0.103 0.074, 0.097 -0.97
CBA/J m 0.111 0.0132   6 0.00539 0.119 0.086, 0.12 -1.05
DBA/2J f 0.117 0.0137   6 0.00558 0.117 0.1, 0.14 -0.6
DBA/2J m 0.157 0.0153   3 0.00882 0.0975 0.14, 0.17 -0.68
FVB/NJ f 0.14 0.019   6 0.00775 0.136 0.11, 0.16 -0.33
FVB/NJ m 0.194 0.0623   5 0.0279 0.321 0.14, 0.28 -0.39
KK/HlJ f 0.137 0.0175   6 0.00715 0.128 0.11, 0.16 -0.37
KK/HlJ m 0.641 0.0453   7 0.0171 0.0705 0.58, 0.7 3.17
LP/J f 0.13 0.02   5 0.00894 0.154 0.11, 0.16 -0.45
LP/J m 0.173 0.00577   3 0.00333 0.0333 0.17, 0.18 -0.56
MRL/MpJ f 0.282 0.313   6 0.128 1.11 0.13, 0.92 1.32
MRL/MpJ m 0.146 0.0114   5 0.0051 0.0781 0.13, 0.16 -0.77
NOD.B10Sn-H2b/J f 0.15 0.0271   4 0.0135 0.181 0.13, 0.19 -0.22
NOD.B10Sn-H2b/J m 0.153 0.0115   3 0.00667 0.0753 0.14, 0.16 -0.72
NON/ShiLtJ f 0.248 0.0653   9 0.0218 0.264 0.17, 0.35 0.93
NON/ShiLtJ m 0.243 0.0489   8 0.0173 0.202 0.19, 0.33 0.0
NZO/HlLtJ f 0.165 0.0212   2   0.015 0.129 0.15, 0.18 -0.04
NZO/HlLtJ m 0.33 0.0383   4 0.0191 0.116 0.3, 0.38 0.69
NZW/LacJ f 0.165 0.00577   4 0.00289 0.035 0.16, 0.17 -0.04
NZW/LacJ m 0.187 0.00816   6 0.00333 0.0437 0.18, 0.2 -0.45
P/J m 0.312 0.039   5 0.0174 0.125 0.27, 0.37 0.55
PL/J f 0.48 0.0775   5 0.0346 0.161 0.4, 0.58 3.63
PL/J m 0.462 0.0427   5 0.0191 0.0923 0.42, 0.52 1.74
PWD/PhJ f 0.115 0.0105   6 0.00428 0.0912 0.1, 0.13 -0.62
PWD/PhJ m 0.188 0.113   5 0.0506 0.602 0.13, 0.39 -0.44
RIIIS/J f 0.122 0.0218   6 0.00892 0.179 0.094, 0.14 -0.54
RIIIS/J m 0.23 0.012   8 0.00423 0.052 0.21, 0.25 -0.1
SJL/J f 0.335 0.0638   6 0.026 0.19 0.26, 0.44 1.94
SM/J f 0.0872 0.0185   6 0.00756 0.212 0.065, 0.12 -0.95
SM/J m 0.287 0.0208   3 0.012 0.0726 0.27, 0.31 0.35
SWR/J f 0.152 0.00837   5 0.00374 0.055 0.14, 0.16 -0.19
WSB/EiJ f 0.11 0.0934   6 0.0381 0.848 0.061, 0.3 -0.68
WSB/EiJ m 0.103 0.0566   6 0.0231 0.546 0.054, 0.18 -1.11


  LEAST SQUARES MEANS (MODEL-ADJUSTED)
Strain Sex Mean SEM UpperCL LowerCL
129S1/SvImJ f 0.1133 0.0399 0.192 0.0346
129S1/SvImJ m 0.27 0.0326 0.3343 0.2057
AKR/J f 0.1833 0.0565 0.2946 0.072
AKR/J m 0.282 0.0437 0.3682 0.1958
BALB/cByJ f 0.1825 0.0489 0.2789 0.0861
BALB/cByJ m 0.2233 0.0565 0.3346 0.112
BTBR T+ Itpr3tf/J f 0.1457 0.037 0.2186 0.0729
BTBR T+ Itpr3tf/J m 0.0982 0.0399 0.1769 0.0195
BUB/BnJ f 0.2014 0.037 0.2743 0.1286
BUB/BnJ m 0.19 0.0691 0.3263 0.0537
C57BL/6J f 0.1383 0.0399 0.217 0.0596
C57BL/6J m 0.2617 0.0399 0.3404 0.183
C57BLKS/J f 0.1167 0.0565 0.228 0.0054
C57BLKS/J m 0.1717 0.0399 0.2504 0.093
C57BR/cdJ f 0.1678 0.0326 0.232 0.1035
C57BR/cdJ m 0.4475 0.0489 0.5439 0.3511
C57L/J f 0.114 0.0437 0.2002 0.0278
C57L/J m 0.14 0.0437 0.2262 0.0538
CBA/J f 0.0855 0.0399 0.1642 0.0068
CBA/J m 0.111 0.0399 0.1897 0.0323
DBA/2J f 0.1167 0.0399 0.1954 0.038
DBA/2J m 0.1567 0.0565 0.268 0.0454
FVB/NJ f 0.14 0.0399 0.2187 0.0613
FVB/NJ m 0.194 0.0437 0.2802 0.1078
KK/HlJ f 0.1367 0.0399 0.2154 0.058
KK/HlJ m 0.6414 0.037 0.7143 0.5686
LP/J f 0.13 0.0437 0.2162 0.0438
LP/J m 0.1733 0.0565 0.2846 0.062
MRL/MpJ f 0.2817 0.0399 0.3604 0.203
MRL/MpJ m 0.146 0.0437 0.2322 0.0598
NOD.B10Sn-H2b/J f 0.15 0.0489 0.2464 0.0536
NOD.B10Sn-H2b/J m 0.1533 0.0565 0.2646 0.042
NON/ShiLtJ f 0.2478 0.0326 0.312 0.1835
NON/ShiLtJ m 0.2425 0.0346 0.3107 0.1743
NZO/HlLtJ f 0.165 0.0691 0.3013 0.0287
NZO/HlLtJ m 0.33 0.0489 0.4264 0.2336
NZW/LacJ f 0.165 0.0489 0.2614 0.0686
NZW/LacJ m 0.1867 0.0399 0.2654 0.108
PL/J f 0.48 0.0437 0.5662 0.3938
PL/J m 0.462 0.0437 0.5482 0.3758
PWD/PhJ f 0.115 0.0399 0.1937 0.0363
PWD/PhJ m 0.188 0.0437 0.2742 0.1018
RIIIS/J f 0.1218 0.0399 0.2005 0.0431
RIIIS/J m 0.23 0.0346 0.2982 0.1618
SM/J f 0.0872 0.0399 0.1659 0.0085
SM/J m 0.2867 0.0565 0.398 0.1754
WSB/EiJ f 0.1102 0.0399 0.1889 0.0315
WSB/EiJ m 0.1035 0.0399 0.1822 0.0248


  LEAST SQUARES MEANS (MODEL-ADJUSTED), SEXES COMBINED
Strain Sex Mean SEM UpperCL LowerCL
129S1/SvImJ both 0.1917 0.0258 0.2425 0.1409
AKR/J both 0.2327 0.0357 0.3031 0.1623
BALB/cByJ both 0.2029 0.0373 0.2765 0.1293
BTBR T+ Itpr3tf/J both 0.1219 0.0272 0.1756 0.0683
BUB/BnJ both 0.1957 0.0392 0.273 0.1184
C57BL/6J both 0.2 0.0282 0.2556 0.1444
C57BLKS/J both 0.1442 0.0346 0.2123 0.076
C57BR/cdJ both 0.3076 0.0294 0.3656 0.2497
C57L/J both 0.127 0.0309 0.188 0.066
CBA/J both 0.0982 0.0282 0.1539 0.0426
DBA/2J both 0.1367 0.0346 0.2048 0.0685
FVB/NJ both 0.167 0.0296 0.2254 0.1086
KK/HlJ both 0.389 0.0272 0.4427 0.3354
LP/J both 0.1517 0.0357 0.2221 0.0813
MRL/MpJ both 0.2138 0.0296 0.2722 0.1555
NOD.B10Sn-H2b/J both 0.1517 0.0373 0.2253 0.0781
NON/ShiLtJ both 0.2451 0.0238 0.292 0.1983
NZO/HlLtJ both 0.2475 0.0423 0.331 0.164
NZW/LacJ both 0.1758 0.0316 0.238 0.1136
PL/J both 0.471 0.0309 0.532 0.41
PWD/PhJ both 0.1515 0.0296 0.2099 0.0931
RIIIS/J both 0.1759 0.0264 0.228 0.1239
SM/J both 0.1869 0.0346 0.2551 0.1188
WSB/EiJ both 0.1068 0.0282 0.1625 0.0512




  GWAS USING LINEAR MIXED MODELS