Phenotype measure:   Lake1   LUC

ID, description, units MPD:19984   LUC   large unstained cells count (LUC; units per volume x 103)   [n/µL]
Data set, strains Lake1   B6.A consomic w/par   23 strains     sex: both     age: 7wks
Procedure complete blood count
Ontology mappings

  STRAIN COMPARISON PLOT
Dimensions Width:   px    Height:   px
Download Plot   
Visualization Options

Lake1 - large unstained cells count (LUC; units per volume x 103)



  MEASURE SUMMARY
Measure Summary FemaleMale
Number of strains tested23 strains23 strains
Mean of the strain means0.103   n/µL 0.143   n/µL
Median of the strain means0.104   n/µL 0.155   n/µL
SD of the strain means± 0.0536 ± 0.0510
Coefficient of variation (CV)0.521 0.356
Min–max range of strain means0.0260   –   0.215   n/µL 0.0222   –   0.222   n/µL
Mean sample size per strain7.9   mice 7.9   mice


  ANOVA, Q-Q NORMALITY ASSESSMENT
ANOVA summary      
FactorDFSum of squaresMean sum of squaresF valuep value (Pr>F)
sex 1 0.1557 0.1557 35.9363 < 0.0001
strain 22 0.5991 0.0272 6.2853 < 0.0001
sex:strain 22 0.3465 0.0158 3.6353 < 0.0001
Residuals 321 1.3908 0.0043


Q-Q normality assessment based on residuals

  


  STRAIN MEANS (UNADJUSTED)
Strain Sex Mean SD N mice SEM CV Min, Max Z score
A/J f 0.026 0.00787   8 0.00278 0.302 0.0137, 0.035 -1.43
A/J m 0.0222 0.00462   8 0.00163 0.208 0.0166, 0.0316 -2.37
B6.A-Chr1 f 0.173 0.097   8 0.0343 0.56 0.0536, 0.339 1.31
B6.A-Chr1 m 0.156 0.0361   8 0.0128 0.232 0.108, 0.2 0.25
B6.A-Chr10 f 0.0532 0.0206   7 0.00777 0.387 0.0212, 0.0895 -0.93
B6.A-Chr10 m 0.154 0.0529   8 0.0187 0.343 0.0766, 0.236 0.21
B6.A-Chr11 f 0.127 0.0339   8 0.012 0.267 0.0839, 0.182 0.45
B6.A-Chr11 m 0.14 0.0889   8 0.0314 0.633 0.0486, 0.316 -0.06
B6.A-Chr12 f 0.104 0.0162   8 0.00572 0.155 0.0851, 0.132 0.02
B6.A-Chr12 m 0.196 0.0894   8 0.0316 0.457 0.0936, 0.353 1.04
B6.A-Chr13 f 0.0616 0.0232   8 0.00821 0.377 0.0258, 0.1 -0.77
B6.A-Chr13 m 0.142 0.0481   8 0.017 0.34 0.0773, 0.216 -0.02
B6.A-Chr14 f 0.106 0.0287   8 0.0101 0.27 0.0595, 0.154 0.06
B6.A-Chr14 m 0.162 0.0962   8 0.034 0.595 0.0626, 0.308 0.37
B6.A-Chr15 f 0.124 0.0238   9 0.00795 0.193 0.0938, 0.164 0.39
B6.A-Chr15 m 0.215 0.105   7 0.0395 0.485 0.11, 0.362 1.41
B6.A-Chr16 f 0.0351 0.0154   8 0.00546 0.44 0.0179, 0.0672 -1.27
B6.A-Chr16 m 0.103 0.0637   8 0.0225 0.618 0.0361, 0.187 -0.79
B6.A-Chr17 f 0.151 0.0408   8 0.0144 0.27 0.117, 0.241 0.9
B6.A-Chr17 m 0.164 0.101   8 0.0357 0.615 0.0595, 0.314 0.41
B6.A-Chr18 f 0.0682 0.0187   8 0.00661 0.274 0.046, 0.0997 -0.65
B6.A-Chr18 m 0.216 0.057   8 0.0202 0.264 0.149, 0.313 1.43
B6.A-Chr19 f 0.065 0.0244   8 0.00862 0.375 0.0328, 0.0967 -0.71
B6.A-Chr19 m 0.106 0.0793   7 0.03 0.747 0.0413, 0.278 -0.73
B6.A-Chr2 f 0.184 0.0826   7 0.0312 0.449 0.0396, 0.271 1.51
B6.A-Chr2 m 0.222 0.0538   8 0.019 0.243 0.113, 0.299 1.55
B6.A-Chr3 f 0.124 0.0496   8 0.0175 0.399 0.0499, 0.194 0.39
B6.A-Chr3 m 0.088 0.0314   8 0.0111 0.357 0.0457, 0.127 -1.08
B6.A-Chr4 f 0.0385 0.0205   8 0.00724 0.533 0.0194, 0.0807 -1.2
B6.A-Chr4 m 0.079 0.0284   7 0.0107 0.36 0.0497, 0.133 -1.26
B6.A-Chr5 f 0.106 0.0829   8 0.0293 0.779 0.0226, 0.285 0.06
B6.A-Chr5 m 0.167 0.0948   8 0.0335 0.569 0.039, 0.314 0.47
B6.A-Chr6 f 0.0383 0.017   8 0.00599 0.443 0.0194, 0.0647 -1.21
B6.A-Chr6 m 0.161 0.0317   8 0.0112 0.197 0.136, 0.228 0.35
B6.A-Chr7 f 0.178 0.134   8 0.0473 0.75 0.0595, 0.436 1.4
B6.A-Chr7 m 0.0493 0.0168   8 0.00595 0.341 0.0259, 0.0702 -1.84
B6.A-Chr8 f 0.0744 0.0202   8 0.00714 0.271 0.0505, 0.102 -0.53
B6.A-Chr8 m 0.169 0.107   12 0.0309 0.633 0.0411, 0.403 0.51
B6.A-Chr9 f 0.215 0.11   8 0.039 0.513 0.0532, 0.364 2.09
B6.A-Chr9 m 0.155 0.0613   8 0.0217 0.396 0.0681, 0.274 0.23
B6.A-ChrX f 0.0707 0.021   8 0.00743 0.297 0.0421, 0.0978 -0.6
B6.A-ChrX m 0.141 0.0962   8 0.034 0.682 0.0467, 0.283 -0.04
B6.A-ChrY f 0.149 0.0788   7 0.0298 0.53 0.0386, 0.249 0.86
B6.A-ChrY m 0.169 0.107   8 0.0377 0.63 0.0724, 0.364 0.51
C57BL/6J f 0.0948 0.0883   8 0.0312 0.932 0.0446, 0.31 -0.15
C57BL/6J m 0.116 0.0385   8 0.0136 0.332 0.0874, 0.205 -0.53


  LEAST SQUARES MEANS (MODEL-ADJUSTED)
Strain Sex Mean SEM UpperCL LowerCL
A/J f 0.026 0.0233 0.0718 0.0
A/J m 0.0222 0.0233 0.0679 0.0
B6.A-Chr1 f 0.1732 0.0233 0.219 0.1274
B6.A-Chr1 m 0.1559 0.0233 0.2017 0.1101
B6.A-Chr10 f 0.0532 0.0249 0.1021 0.0042
B6.A-Chr10 m 0.1544 0.0233 0.2002 0.1086
B6.A-Chr11 f 0.1272 0.0233 0.173 0.0815
B6.A-Chr11 m 0.1404 0.0233 0.1862 0.0946
B6.A-Chr12 f 0.1042 0.0233 0.15 0.0584
B6.A-Chr12 m 0.1956 0.0233 0.2414 0.1498
B6.A-Chr13 f 0.0616 0.0233 0.1073 0.0158
B6.A-Chr13 m 0.1416 0.0233 0.1874 0.0958
B6.A-Chr14 f 0.1065 0.0233 0.1522 0.0607
B6.A-Chr14 m 0.1616 0.0233 0.2073 0.1158
B6.A-Chr15 f 0.1236 0.0219 0.1668 0.0805
B6.A-Chr15 m 0.2154 0.0249 0.2644 0.1665
B6.A-Chr16 f 0.0351 0.0233 0.0809 0.0
B6.A-Chr16 m 0.1031 0.0233 0.1489 0.0573
B6.A-Chr17 f 0.1514 0.0233 0.1972 0.1056
B6.A-Chr17 m 0.1644 0.0233 0.2102 0.1186
B6.A-Chr18 f 0.0682 0.0233 0.114 0.0224
B6.A-Chr18 m 0.2162 0.0233 0.262 0.1705
B6.A-Chr19 f 0.065 0.0233 0.1108 0.0193
B6.A-Chr19 m 0.1061 0.0249 0.155 0.0571
B6.A-Chr2 f 0.1838 0.0249 0.2327 0.1349
B6.A-Chr2 m 0.2215 0.0233 0.2673 0.1757
B6.A-Chr3 f 0.1241 0.0233 0.1699 0.0783
B6.A-Chr3 m 0.088 0.0233 0.1338 0.0422
B6.A-Chr4 f 0.0385 0.0233 0.0842 0.0
B6.A-Chr4 m 0.079 0.0249 0.128 0.0301
B6.A-Chr5 f 0.1063 0.0233 0.1521 0.0606
B6.A-Chr5 m 0.1666 0.0233 0.2124 0.1209
B6.A-Chr6 f 0.0383 0.0233 0.0841 0.0
B6.A-Chr6 m 0.1606 0.0233 0.2064 0.1148
B6.A-Chr7 f 0.1784 0.0233 0.2242 0.1327
B6.A-Chr7 m 0.0493 0.0233 0.0951 0.0035
B6.A-Chr8 f 0.0744 0.0233 0.1202 0.0287
B6.A-Chr8 m 0.1692 0.019 0.2066 0.1319
B6.A-Chr9 f 0.2152 0.0233 0.261 0.1695
B6.A-Chr9 m 0.1548 0.0233 0.2005 0.109
B6.A-ChrX f 0.0707 0.0233 0.1165 0.0249
B6.A-ChrX m 0.141 0.0233 0.1867 0.0952
B6.A-ChrY f 0.1487 0.0249 0.1976 0.0997
B6.A-ChrY m 0.1695 0.0233 0.2153 0.1237
C57BL/6J f 0.0948 0.0233 0.1406 0.049
C57BL/6J m 0.116 0.0233 0.1618 0.0703


  LEAST SQUARES MEANS (MODEL-ADJUSTED), SEXES COMBINED
Strain Sex Mean SEM UpperCL LowerCL
A/J both 0.0241 0.0165 0.0565 0.0
B6.A-Chr1 both 0.1645 0.0165 0.1969 0.1322
B6.A-Chr10 both 0.1038 0.017 0.1373 0.0703
B6.A-Chr11 both 0.1338 0.0165 0.1662 0.1015
B6.A-Chr12 both 0.1499 0.0165 0.1823 0.1175
B6.A-Chr13 both 0.1016 0.0165 0.1339 0.0692
B6.A-Chr14 both 0.134 0.0165 0.1664 0.1016
B6.A-Chr15 both 0.1695 0.0166 0.2022 0.1369
B6.A-Chr16 both 0.0691 0.0165 0.1015 0.0367
B6.A-Chr17 both 0.1579 0.0165 0.1903 0.1255
B6.A-Chr18 both 0.1422 0.0165 0.1746 0.1098
B6.A-Chr19 both 0.0856 0.017 0.1191 0.0521
B6.A-Chr2 both 0.2026 0.017 0.2362 0.1691
B6.A-Chr3 both 0.106 0.0165 0.1384 0.0737
B6.A-Chr4 both 0.0587 0.017 0.0923 0.0252
B6.A-Chr5 both 0.1365 0.0165 0.1689 0.1041
B6.A-Chr6 both 0.0995 0.0165 0.1318 0.0671
B6.A-Chr7 both 0.1139 0.0165 0.1463 0.0815
B6.A-Chr8 both 0.1218 0.015 0.1514 0.0923
B6.A-Chr9 both 0.185 0.0165 0.2174 0.1526
B6.A-ChrX both 0.1058 0.0165 0.1382 0.0735
B6.A-ChrY both 0.1591 0.017 0.1926 0.1256
C57BL/6J both 0.1054 0.0165 0.1378 0.073




GWAS analysis not available: Strain panel must be either Inbred, HMDP, BXD, BXH, CXB, or AXB/BXA