Phenotype measure:   Lake1   EOS

ID, description, units MPD:19983   EOS   eosinophil count (EOS; units per volume x 103)   [n/µL]
Data set, strains Lake1   B6.A consomic w/par   23 strains     sex: both     age: 7wks
Procedure complete blood count
Ontology mappings

  STRAIN COMPARISON PLOT
Dimensions Width:   px    Height:   px
Download Plot   
Visualization Options

Lake1 - eosinophil count (EOS; units per volume x 103)



  MEASURE SUMMARY
Measure Summary FemaleMale
Number of strains tested23 strains23 strains
Mean of the strain means0.148   n/µL 0.163   n/µL
Median of the strain means0.140   n/µL 0.160   n/µL
SD of the strain means± 0.0423 ± 0.0450
Coefficient of variation (CV)0.286 0.276
Min–max range of strain means0.0809   –   0.291   n/µL 0.0674   –   0.279   n/µL
Mean sample size per strain7.9   mice 7.9   mice


  ANOVA, Q-Q NORMALITY ASSESSMENT
ANOVA summary      
FactorDFSum of squaresMean sum of squaresF valuep value (Pr>F)
sex 1 0.0235 0.0235 7.8662 0.0053
strain 22 0.5756 0.0262 8.7483 < 0.0001
sex:strain 22 0.0928 0.0042 1.4109 0.1059
Residuals 321 0.96 0.003


Q-Q normality assessment based on residuals

  


  STRAIN MEANS (UNADJUSTED)
Strain Sex Mean SD N mice SEM CV Min, Max Z score
A/J f 0.0884 0.0224   8 0.00791 0.253 0.0548, 0.112 -1.41
A/J m 0.0674 0.0209   8 0.0074 0.31 0.0429, 0.0946 -2.13
B6.A-Chr1 f 0.291 0.0967   8 0.0342 0.332 0.196, 0.498 3.38
B6.A-Chr1 m 0.279 0.0558   8 0.0197 0.2 0.207, 0.392 2.58
B6.A-Chr10 f 0.181 0.0333   7 0.0126 0.184 0.119, 0.217 0.78
B6.A-Chr10 m 0.176 0.0448   8 0.0158 0.255 0.108, 0.245 0.29
B6.A-Chr11 f 0.14 0.0433   8 0.0153 0.31 0.103, 0.22 -0.19
B6.A-Chr11 m 0.118 0.0309   8 0.0109 0.261 0.0763, 0.158 -1.0
B6.A-Chr12 f 0.0809 0.0261   8 0.00923 0.323 0.0441, 0.122 -1.58
B6.A-Chr12 m 0.107 0.0589   8 0.0208 0.552 0.0515, 0.222 -1.25
B6.A-Chr13 f 0.131 0.0447   8 0.0158 0.342 0.0745, 0.2 -0.4
B6.A-Chr13 m 0.153 0.0305   8 0.0108 0.199 0.112, 0.182 -0.23
B6.A-Chr14 f 0.131 0.0359   8 0.0127 0.274 0.0631, 0.167 -0.4
B6.A-Chr14 m 0.152 0.0431   8 0.0152 0.284 0.0998, 0.242 -0.25
B6.A-Chr15 f 0.12 0.0349   9 0.0116 0.292 0.0536, 0.154 -0.66
B6.A-Chr15 m 0.131 0.0291   7 0.011 0.222 0.093, 0.189 -0.71
B6.A-Chr16 f 0.116 0.0191   8 0.00676 0.165 0.0955, 0.157 -0.75
B6.A-Chr16 m 0.183 0.0497   8 0.0176 0.272 0.124, 0.274 0.44
B6.A-Chr17 f 0.213 0.0619   8 0.0219 0.291 0.138, 0.292 1.54
B6.A-Chr17 m 0.213 0.0427   8 0.0151 0.2 0.166, 0.286 1.11
B6.A-Chr18 f 0.127 0.0418   8 0.0148 0.33 0.0598, 0.199 -0.49
B6.A-Chr18 m 0.145 0.0456   8 0.0161 0.313 0.104, 0.241 -0.4
B6.A-Chr19 f 0.131 0.0451   8 0.0159 0.344 0.0516, 0.197 -0.4
B6.A-Chr19 m 0.178 0.0414   7 0.0157 0.233 0.139, 0.255 0.33
B6.A-Chr2 f 0.164 0.0515   7 0.0195 0.314 0.103, 0.245 0.38
B6.A-Chr2 m 0.139 0.0359   8 0.0127 0.258 0.078, 0.194 -0.54
B6.A-Chr3 f 0.134 0.037   8 0.0131 0.275 0.0981, 0.2 -0.33
B6.A-Chr3 m 0.199 0.0758   8 0.0268 0.381 0.129, 0.327 0.8
B6.A-Chr4 f 0.171 0.0271   8 0.00957 0.158 0.132, 0.206 0.55
B6.A-Chr4 m 0.137 0.0567   7 0.0214 0.413 0.0849, 0.227 -0.58
B6.A-Chr5 f 0.132 0.112   8 0.0394 0.846 -0.38
B6.A-Chr5 m 0.135 0.0154   8 0.00545 0.114 0.112, 0.154 -0.63
B6.A-Chr6 f 0.142 0.0604   8 0.0214 0.425 0.063, 0.222 -0.14
B6.A-Chr6 m 0.124 0.0779   8 0.0275 0.631 0.0389, 0.288 -0.87
B6.A-Chr7 f 0.177 0.0485   8 0.0171 0.275 0.0905, 0.238 0.69
B6.A-Chr7 m 0.16 0.0713   8 0.0252 0.445 0.0453, 0.292 -0.07
B6.A-Chr8 f 0.135 0.0665   8 0.0235 0.492 0.0587, 0.283 -0.31
B6.A-Chr8 m 0.169 0.0344   12 0.00992 0.203 0.123, 0.244 0.13
B6.A-Chr9 f 0.151 0.0482   8 0.0171 0.319 0.0742, 0.207 0.07
B6.A-Chr9 m 0.162 0.093   8 0.0329 0.574 -0.03
B6.A-ChrX f 0.155 0.0846   8 0.0299 0.547 0.0751, 0.334 0.17
B6.A-ChrX m 0.203 0.0819   8 0.029 0.403 0.0966, 0.353 0.89
B6.A-ChrY f 0.14 0.0599   7 0.0226 0.427 0.0601, 0.211 -0.19
B6.A-ChrY m 0.191 0.0295   8 0.0104 0.155 0.161, 0.249 0.62
C57BL/6J f 0.151 0.0343   8 0.0121 0.227 0.106, 0.212 0.07
C57BL/6J m 0.231 0.0977   8 0.0346 0.423 0.122, 0.409 1.51


  LEAST SQUARES MEANS (MODEL-ADJUSTED)
Strain Sex Mean SEM UpperCL LowerCL
A/J f 0.0884 0.0193 0.1265 0.0504
A/J m 0.0674 0.0193 0.1054 0.0293
B6.A-Chr1 f 0.2909 0.0193 0.3289 0.2528
B6.A-Chr1 m 0.2788 0.0193 0.3168 0.2407
B6.A-Chr10 f 0.1809 0.0207 0.2215 0.1402
B6.A-Chr10 m 0.1759 0.0193 0.2139 0.1378
B6.A-Chr11 f 0.1398 0.0193 0.1778 0.1017
B6.A-Chr11 m 0.1184 0.0193 0.1564 0.0803
B6.A-Chr12 f 0.0809 0.0193 0.1189 0.0428
B6.A-Chr12 m 0.1066 0.0193 0.1446 0.0685
B6.A-Chr13 f 0.1307 0.0193 0.1687 0.0926
B6.A-Chr13 m 0.153 0.0193 0.191 0.115
B6.A-Chr14 f 0.131 0.0193 0.169 0.0929
B6.A-Chr14 m 0.1517 0.0193 0.1898 0.1137
B6.A-Chr15 f 0.1196 0.0182 0.1554 0.0837
B6.A-Chr15 m 0.1307 0.0207 0.1714 0.09
B6.A-Chr16 f 0.1157 0.0193 0.1537 0.0776
B6.A-Chr16 m 0.1831 0.0193 0.2212 0.1451
B6.A-Chr17 f 0.2129 0.0193 0.2509 0.1748
B6.A-Chr17 m 0.2131 0.0193 0.2512 0.1751
B6.A-Chr18 f 0.1267 0.0193 0.1648 0.0887
B6.A-Chr18 m 0.1455 0.0193 0.1835 0.1075
B6.A-Chr19 f 0.131 0.0193 0.1691 0.093
B6.A-Chr19 m 0.1777 0.0207 0.2184 0.137
B6.A-Chr2 f 0.1641 0.0207 0.2048 0.1235
B6.A-Chr2 m 0.1389 0.0193 0.1769 0.1008
B6.A-Chr3 f 0.1344 0.0193 0.1724 0.0963
B6.A-Chr3 m 0.1989 0.0193 0.2369 0.1608
B6.A-Chr4 f 0.171 0.0193 0.209 0.133
B6.A-Chr4 m 0.1373 0.0207 0.178 0.0967
B6.A-Chr5 f 0.1319 0.0193 0.1699 0.0938
B6.A-Chr5 m 0.1354 0.0193 0.1734 0.0973
B6.A-Chr6 f 0.1423 0.0193 0.1804 0.1043
B6.A-Chr6 m 0.1235 0.0193 0.1616 0.0855
B6.A-Chr7 f 0.1767 0.0193 0.2147 0.1386
B6.A-Chr7 m 0.1604 0.0193 0.1985 0.1224
B6.A-Chr8 f 0.1351 0.0193 0.1732 0.0971
B6.A-Chr8 m 0.1693 0.0158 0.2003 0.1382
B6.A-Chr9 f 0.1512 0.0193 0.1893 0.1132
B6.A-Chr9 m 0.162 0.0193 0.2 0.124
B6.A-ChrX f 0.1547 0.0193 0.1928 0.1167
B6.A-ChrX m 0.2031 0.0193 0.2411 0.165
B6.A-ChrY f 0.1402 0.0207 0.1809 0.0995
B6.A-ChrY m 0.1908 0.0193 0.2288 0.1527
C57BL/6J f 0.1513 0.0193 0.1893 0.1132
C57BL/6J m 0.2309 0.0193 0.2689 0.1928


  LEAST SQUARES MEANS (MODEL-ADJUSTED), SEXES COMBINED
Strain Sex Mean SEM UpperCL LowerCL
A/J both 0.0779 0.0137 0.1048 0.051
B6.A-Chr1 both 0.2848 0.0137 0.3117 0.2579
B6.A-Chr10 both 0.1784 0.0142 0.2062 0.1505
B6.A-Chr11 both 0.1291 0.0137 0.156 0.1022
B6.A-Chr12 both 0.0937 0.0137 0.1206 0.0668
B6.A-Chr13 both 0.1418 0.0137 0.1687 0.1149
B6.A-Chr14 both 0.1414 0.0137 0.1683 0.1145
B6.A-Chr15 both 0.1251 0.0138 0.1522 0.098
B6.A-Chr16 both 0.1494 0.0137 0.1763 0.1225
B6.A-Chr17 both 0.213 0.0137 0.2399 0.1861
B6.A-Chr18 both 0.1361 0.0137 0.163 0.1092
B6.A-Chr19 both 0.1544 0.0142 0.1822 0.1265
B6.A-Chr2 both 0.1515 0.0142 0.1794 0.1237
B6.A-Chr3 both 0.1666 0.0137 0.1935 0.1397
B6.A-Chr4 both 0.1542 0.0142 0.182 0.1263
B6.A-Chr5 both 0.1336 0.0137 0.1605 0.1067
B6.A-Chr6 both 0.1329 0.0137 0.1598 0.106
B6.A-Chr7 both 0.1685 0.0137 0.1954 0.1417
B6.A-Chr8 both 0.1522 0.0125 0.1767 0.1276
B6.A-Chr9 both 0.1566 0.0137 0.1835 0.1297
B6.A-ChrX both 0.1789 0.0137 0.2058 0.152
B6.A-ChrY both 0.1655 0.0142 0.1933 0.1376
C57BL/6J both 0.1911 0.0137 0.218 0.1642




GWAS analysis not available: Strain panel must be either Inbred, HMDP, BXD, BXH, CXB, or AXB/BXA