Phenotype measure:   Lake1   MONO

ID, description, units MPD:19982   MONO   monocyte count (MONO; units per volume x 103)   [n/µL]
Data set, strains Lake1   B6.A consomic w/par   23 strains     sex: both     age: 7wks
Procedure complete blood count
Ontology mappings

  STRAIN COMPARISON PLOT
Dimensions Width:   px    Height:   px
Download Plot   
Visualization Options

Lake1 - monocyte count (MONO; units per volume x 103)



  MEASURE SUMMARY
Measure Summary FemaleMale
Number of strains tested23 strains23 strains
Mean of the strain means0.0770   n/µL 0.0907   n/µL
Median of the strain means0.0800   n/µL 0.0732   n/µL
SD of the strain means± 0.0346 ± 0.0469
Coefficient of variation (CV)0.449 0.517
Min–max range of strain means0.0320   –   0.173   n/µL 0.0294   –   0.195   n/µL
Mean sample size per strain7.9   mice 7.9   mice


  ANOVA, Q-Q NORMALITY ASSESSMENT
ANOVA summary      
FactorDFSum of squaresMean sum of squaresF valuep value (Pr>F)
sex 1 0.0154 0.0154 5.6112 0.0184
strain 22 0.2883 0.0131 4.7593 < 0.0001
sex:strain 22 0.3094 0.0141 5.1078 < 0.0001
Residuals 321 0.8839 0.0028


Q-Q normality assessment based on residuals

  


  STRAIN MEANS (UNADJUSTED)
Strain Sex Mean SD N mice SEM CV Min, Max Z score
A/J f 0.0802 0.0226   8 0.00799 0.282 0.0594, 0.116 0.09
A/J m 0.103 0.0421   8 0.0149 0.407 0.0616, 0.168 0.26
B6.A-Chr1 f 0.0707 0.0292   8 0.0103 0.413 0.031, 0.129 -0.18
B6.A-Chr1 m 0.0732 0.0135   8 0.00478 0.185 0.0555, 0.101 -0.37
B6.A-Chr10 f 0.0868 0.0258   7 0.00977 0.298 0.0478, 0.12 0.28
B6.A-Chr10 m 0.0358 0.0131   8 0.00465 0.367 0.0201, 0.0549 -1.17
B6.A-Chr11 f 0.0703 0.024   8 0.00849 0.342 0.0382, 0.113 -0.19
B6.A-Chr11 m 0.144 0.0832   8 0.0294 0.576 0.0237, 0.273 1.14
B6.A-Chr12 f 0.032 0.0123   8 0.00434 0.383 0.0122, 0.046 -1.3
B6.A-Chr12 m 0.0294 0.0135   8 0.00479 0.461 0.00936, 0.0442 -1.31
B6.A-Chr13 f 0.0698 0.0298   8 0.0105 0.426 0.0401, 0.13 -0.21
B6.A-Chr13 m 0.168 0.0657   8 0.0232 0.39 0.1, 0.31 1.65
B6.A-Chr14 f 0.0368 0.0394   8 0.0139 1.07 -1.16
B6.A-Chr14 m 0.0512 0.0428   8 0.0151 0.836 0.00768, 0.129 -0.84
B6.A-Chr15 f 0.0571 0.0162   9 0.0054 0.284 0.0332, 0.0787 -0.57
B6.A-Chr15 m 0.0681 0.0321   7 0.0121 0.472 0.04, 0.129 -0.48
B6.A-Chr16 f 0.135 0.05   8 0.0177 0.37 0.0605, 0.19 1.68
B6.A-Chr16 m 0.103 0.0566   8 0.02 0.547 0.052, 0.231 0.26
B6.A-Chr17 f 0.0502 0.018   8 0.00635 0.358 0.0295, 0.0702 -0.77
B6.A-Chr17 m 0.118 0.0696   8 0.0246 0.592 0.0369, 0.214 0.58
B6.A-Chr18 f 0.0893 0.0257   8 0.0091 0.288 0.0547, 0.137 0.36
B6.A-Chr18 m 0.043 0.0159   8 0.00562 0.37 0.0283, 0.071 -1.02
B6.A-Chr19 f 0.08 0.0313   8 0.0111 0.392 0.0188, 0.11 0.09
B6.A-Chr19 m 0.131 0.0389   7 0.0147 0.296 0.0763, 0.181 0.86
B6.A-Chr2 f 0.0577 0.0152   7 0.00575 0.264 0.0357, 0.0816 -0.56
B6.A-Chr2 m 0.0823 0.0209   8 0.00739 0.254 0.052, 0.125 -0.18
B6.A-Chr3 f 0.0421 0.016   8 0.00564 0.379 0.025, 0.0678 -1.01
B6.A-Chr3 m 0.17 0.0653   8 0.0231 0.383 0.11, 0.313 1.69
B6.A-Chr4 f 0.0824 0.0388   8 0.0137 0.471 0.0248, 0.138 0.16
B6.A-Chr4 m 0.0816 0.0129   7 0.00489 0.158 0.0637, 0.106 -0.19
B6.A-Chr5 f 0.173 0.231   8 0.0818 1.34 0.0258, 0.602 2.78
B6.A-Chr5 m 0.046 0.0267   8 0.00945 0.581 0.0245, 0.0911 -0.95
B6.A-Chr6 f 0.126 0.0449   8 0.0159 0.356 0.0582, 0.194 1.42
B6.A-Chr6 m 0.0564 0.0276   8 0.00977 0.49 0.0269, 0.111 -0.73
B6.A-Chr7 f 0.096 0.0481   8 0.017 0.501 0.0396, 0.147 0.55
B6.A-Chr7 m 0.195 0.096   8 0.0339 0.491 0.097, 0.398 2.22
B6.A-Chr8 f 0.0961 0.054   8 0.0191 0.562 0.0456, 0.205 0.55
B6.A-Chr8 m 0.064 0.0369   12 0.0106 0.576 0.0224, 0.138 -0.57
B6.A-Chr9 f 0.036 0.0196   8 0.00694 0.545 0.0053, 0.0622 -1.18
B6.A-Chr9 m 0.0586 0.0568   8 0.0201 0.969 0.0191, 0.195 -0.68
B6.A-ChrX f 0.0831 0.0328   8 0.0116 0.395 0.0421, 0.132 0.18
B6.A-ChrX m 0.0676 0.0242   8 0.00857 0.359 0.027, 0.0984 -0.49
B6.A-ChrY f 0.0321 0.0161   7 0.0061 0.503 0.0172, 0.0585 -1.3
B6.A-ChrY m 0.0622 0.0372   8 0.0132 0.599 0.0178, 0.113 -0.61
C57BL/6J f 0.0873 0.037   8 0.0131 0.424 0.0548, 0.171 0.3
C57BL/6J m 0.134 0.0433   8 0.0153 0.324 0.0783, 0.21 0.92


  LEAST SQUARES MEANS (MODEL-ADJUSTED)
Strain Sex Mean SEM UpperCL LowerCL
A/J f 0.0802 0.0186 0.1167 0.0437
A/J m 0.1035 0.0186 0.14 0.067
B6.A-Chr1 f 0.0707 0.0186 0.1072 0.0342
B6.A-Chr1 m 0.0732 0.0186 0.1097 0.0367
B6.A-Chr10 f 0.0868 0.0198 0.1258 0.0478
B6.A-Chr10 m 0.0358 0.0186 0.0723 0.0
B6.A-Chr11 f 0.0703 0.0186 0.1068 0.0338
B6.A-Chr11 m 0.1444 0.0186 0.1809 0.1079
B6.A-Chr12 f 0.032 0.0186 0.0685 0.0
B6.A-Chr12 m 0.0294 0.0186 0.0659 0.0
B6.A-Chr13 f 0.0698 0.0186 0.1063 0.0333
B6.A-Chr13 m 0.1682 0.0186 0.2047 0.1318
B6.A-Chr14 f 0.0368 0.0186 0.0733 0.0003
B6.A-Chr14 m 0.0512 0.0186 0.0877 0.0147
B6.A-Chr15 f 0.0571 0.0175 0.0915 0.0227
B6.A-Chr15 m 0.0681 0.0198 0.1071 0.029
B6.A-Chr16 f 0.1351 0.0186 0.1716 0.0986
B6.A-Chr16 m 0.1033 0.0186 0.1398 0.0668
B6.A-Chr17 f 0.0502 0.0186 0.0867 0.0137
B6.A-Chr17 m 0.1176 0.0186 0.1541 0.0811
B6.A-Chr18 f 0.0893 0.0186 0.1258 0.0528
B6.A-Chr18 m 0.043 0.0186 0.0795 0.0065
B6.A-Chr19 f 0.08 0.0186 0.1165 0.0435
B6.A-Chr19 m 0.1313 0.0198 0.1703 0.0923
B6.A-Chr2 f 0.0577 0.0198 0.0967 0.0187
B6.A-Chr2 m 0.0823 0.0186 0.1188 0.0458
B6.A-Chr3 f 0.0421 0.0186 0.0786 0.0056
B6.A-Chr3 m 0.1705 0.0186 0.207 0.134
B6.A-Chr4 f 0.0824 0.0186 0.1189 0.0459
B6.A-Chr4 m 0.0816 0.0198 0.1207 0.0426
B6.A-Chr5 f 0.1728 0.0186 0.2093 0.1363
B6.A-Chr5 m 0.046 0.0186 0.0825 0.0095
B6.A-Chr6 f 0.1261 0.0186 0.1626 0.0896
B6.A-Chr6 m 0.0564 0.0186 0.0929 0.0199
B6.A-Chr7 f 0.096 0.0186 0.1325 0.0595
B6.A-Chr7 m 0.1954 0.0186 0.2319 0.1589
B6.A-Chr8 f 0.0961 0.0186 0.1326 0.0596
B6.A-Chr8 m 0.064 0.0151 0.0938 0.0342
B6.A-Chr9 f 0.036 0.0186 0.0725 0.0
B6.A-Chr9 m 0.0586 0.0186 0.0951 0.0221
B6.A-ChrX f 0.0831 0.0186 0.1196 0.0466
B6.A-ChrX m 0.0676 0.0186 0.1041 0.0311
B6.A-ChrY f 0.0321 0.0198 0.0711 0.0
B6.A-ChrY m 0.0622 0.0186 0.0987 0.0257
C57BL/6J f 0.0873 0.0186 0.1238 0.0508
C57BL/6J m 0.1335 0.0186 0.17 0.097


  LEAST SQUARES MEANS (MODEL-ADJUSTED), SEXES COMBINED
Strain Sex Mean SEM UpperCL LowerCL
A/J both 0.0918 0.0131 0.1176 0.066
B6.A-Chr1 both 0.072 0.0131 0.0978 0.0462
B6.A-Chr10 both 0.0613 0.0136 0.088 0.0346
B6.A-Chr11 both 0.1074 0.0131 0.1332 0.0816
B6.A-Chr12 both 0.0307 0.0131 0.0565 0.0049
B6.A-Chr13 both 0.119 0.0131 0.1448 0.0932
B6.A-Chr14 both 0.044 0.0131 0.0698 0.0182
B6.A-Chr15 both 0.0626 0.0132 0.0886 0.0365
B6.A-Chr16 both 0.1192 0.0131 0.145 0.0934
B6.A-Chr17 both 0.0839 0.0131 0.1097 0.0581
B6.A-Chr18 both 0.0661 0.0131 0.0919 0.0403
B6.A-Chr19 both 0.1057 0.0136 0.1324 0.0789
B6.A-Chr2 both 0.07 0.0136 0.0967 0.0433
B6.A-Chr3 both 0.1063 0.0131 0.1321 0.0805
B6.A-Chr4 both 0.082 0.0136 0.1088 0.0553
B6.A-Chr5 both 0.1094 0.0131 0.1352 0.0836
B6.A-Chr6 both 0.0913 0.0131 0.1171 0.0654
B6.A-Chr7 both 0.1457 0.0131 0.1715 0.1199
B6.A-Chr8 both 0.0801 0.012 0.1036 0.0565
B6.A-Chr9 both 0.0473 0.0131 0.0731 0.0215
B6.A-ChrX both 0.0753 0.0131 0.1011 0.0495
B6.A-ChrY both 0.0471 0.0136 0.0738 0.0204
C57BL/6J both 0.1104 0.0131 0.1362 0.0846




GWAS analysis not available: Strain panel must be either Inbred, HMDP, BXD, BXH, CXB, or AXB/BXA