Project measure / variable:   Schoonjans1   caecum_wt_HFD

ID, description, units MPD:112870   caecum_wt_HFD   cecum weight   [g]  HFD  
high-fat diet study
Data set, strains Schoonjans1   BXD w/par   36 strains     sex: m     age: 29wks
Procedure organ weights
Ontology mappings

  •   Or, add this measure to your collection.
       
  •     no folder
  •     put it in new folder  

  STRAIN COMPARISON PLOT
Dimensions Width:   px    Height:   px
Download Plot   
Visualization Options

Schoonjans1 - cecum weight HFD



  MEASURE SUMMARY
Measure Summary Male
Number of strains tested36 strains
Mean of the strain means0.20672   g
Median of the strain means0.20825   g
SD of the strain means± 0.04264
Coefficient of variation (CV)0.2063
Min–max range of strain means0.12748   –   0.28533   g
Mean sample size per strain4.8   mice


  ANOVA, Q-Q NORMALITY ASSESSMENT
ANOVA summary      
FactorDFSum of squaresMean sum of squaresF valuep value (Pr>F)
strain 35 0.285 0.0081 5.5243 < 0.0001
Residuals 137 0.202 0.0015


Q-Q normality assessment based on residuals

  


  STRAIN MEANS (UNADJUSTED)
  
Select table page:
Strain Sex Mean SD N mice SEM CV Min, Max Z score
BXD1 m 0.192 0.01789   5 0.008 0.0932 0.17, 0.21 -0.35
BXD100 m 0.22161 0.06851   7 0.0259 0.3092 0.1508, 0.3266 0.35
BXD11 m 0.28533 0.09686   3 0.05592 0.3395 0.224, 0.397 1.84
BXD12 m 0.231 0.03322   4 0.01661 0.1438 0.184, 0.26 0.57
BXD27 m 0.24098 0.03114   5 0.01393 0.1292 0.1979, 0.2792 0.8
BXD32 m 0.1775 0.02872   4 0.01436 0.1618 0.14, 0.21 -0.69
BXD34 m 0.2375 0.00957427   4 0.00478714 0.0403 0.23, 0.25 0.72
BXD39 m 0.23582 0.0349   5 0.01561 0.148 0.2019, 0.2793 0.68
BXD40 m 0.25714 0.02417   5 0.01081 0.094 0.231, 0.2895 1.18
BXD43 m 0.172 0.04719   5 0.0211 0.2743 0.091, 0.213 -0.81
BXD45 m 0.202 0.02588   5 0.01158 0.1281 0.17, 0.24 -0.11
BXD48 m 0.1451 0.04097   5 0.01832 0.2824 0.0965, 0.2102 -1.44
BXD48a m 0.23496 0.04309   5 0.01927 0.1834 0.18, 0.289 0.66
BXD49 m 0.23955 0.05571   4 0.02785 0.2326 0.1644, 0.288 0.77
BXD51 m 0.184 0.0305   5 0.01364 0.1657 0.15, 0.22 -0.53
BXD53 m 0.21558 0.02577   5 0.01153 0.1196 0.182, 0.2474 0.21
BXD55 m 0.24272 0.02913   5 0.01303 0.12 0.2115, 0.2764 0.84
BXD6 m 0.27 0.02345   5 0.01049 0.0869 0.23, 0.29 1.48
BXD62 m 0.24182 0.0448   5 0.02003 0.1853 0.1742, 0.2996 0.82
BXD63 m 0.12936 0.01852   5 0.00828297 0.1432 0.1032, 0.1495 -1.81
BXD64 m 0.202 0.02775   5 0.01241 0.1374 0.16, 0.23 -0.11
BXD66 m 0.18014 0.04087   9 0.01362 0.2269 0.1334, 0.25 -0.62
BXD67 m 0.1875 0.02872   4 0.01436 0.1532 0.15, 0.21 -0.45
BXD69 m 0.268 0.03493   5 0.01562 0.1303 0.23, 0.31 1.44
BXD73 m 0.18704 0.03191   5 0.01427 0.1706 0.1385, 0.2239 -0.46
BXD75 m 0.16947 0.02811   4 0.01406 0.1659 0.1323, 0.1983 -0.87
BXD77 m 0.2145 0.02298   5 0.01027 0.1071 0.1914, 0.2455 0.18
BXD79 m 0.1809 0.04782   5 0.02138 0.2643 0.1079, 0.2396 -0.61
BXD8 m 0.15408 0.02746   4 0.01373 0.1782 0.1155, 0.1781 -1.23
BXD81 m 0.14624 0.01771   5 0.00791818 0.1211 0.1297, 0.1711 -1.42
BXD84 m 0.2825 0.06946   4 0.03473 0.2459 0.22, 0.38 1.78
BXD87 m 0.17032 0.03496   5 0.01563 0.2053 0.1319, 0.224 -0.85
BXD89 m 0.23362 0.04881   5 0.02183 0.2089 0.2041, 0.32 0.63
BXD90 m 0.16173 0.0329   3 0.01899 0.2034 0.124, 0.1844 -1.05
C57BL/6J m 0.2203 0.02533   5 0.01133 0.115 0.1832, 0.2408 0.32
DBA/2J m 0.12748 0.02272   4 0.01136 0.1782 0.1028, 0.1571 -1.86


  LEAST SQUARES MEANS (MODEL-ADJUSTED)
Strain Sex Mean SEM UpperCL LowerCL
BXD1 m 0.192 0.0171706707 0.2259538201 0.1580461799
BXD100 m 0.2216142857 0.0145118654 0.2503105012 0.1929180702
BXD11 m 0.2853333333 0.0221672405 0.3291675266 0.2414991401
BXD12 m 0.231 0.0191973934 0.2689615249 0.1930384751
BXD27 m 0.24098 0.0171706707 0.2749338201 0.2070261799
BXD32 m 0.1775 0.0191973934 0.2154615249 0.1395384751
BXD34 m 0.2375 0.0191973934 0.2754615249 0.1995384751
BXD39 m 0.23582 0.0171706707 0.2697738201 0.2018661799
BXD40 m 0.25714 0.0171706707 0.2910938201 0.2231861799
BXD43 m 0.172 0.0171706707 0.2059538201 0.1380461799
BXD45 m 0.202 0.0171706707 0.2359538201 0.1680461799
BXD48 m 0.1451 0.0171706707 0.1790538201 0.1111461799
BXD48a m 0.23496 0.0171706707 0.2689138201 0.2010061799
BXD49 m 0.23955 0.0191973934 0.2775115249 0.2015884751
BXD51 m 0.184 0.0171706707 0.2179538201 0.1500461799
BXD53 m 0.21558 0.0171706707 0.2495338201 0.1816261799
BXD55 m 0.24272 0.0171706707 0.2766738201 0.2087661799
BXD6 m 0.27 0.0171706707 0.3039538201 0.2360461799
BXD62 m 0.24182 0.0171706707 0.2757738201 0.2078661799
BXD63 m 0.12936 0.0171706707 0.1633138201 0.0954061799
BXD64 m 0.202 0.0171706707 0.2359538201 0.1680461799
BXD66 m 0.1801444444 0.0127982623 0.2054521277 0.1548367612
BXD67 m 0.1875 0.0191973934 0.2254615249 0.1495384751
BXD69 m 0.268 0.0171706707 0.3019538201 0.2340461799
BXD73 m 0.18704 0.0171706707 0.2209938201 0.1530861799
BXD75 m 0.169475 0.0191973934 0.2074365249 0.1315134751
BXD77 m 0.2145 0.0171706707 0.2484538201 0.1805461799
BXD79 m 0.1809 0.0171706707 0.2148538201 0.1469461799
BXD8 m 0.154075 0.0191973934 0.1920365249 0.1161134751
BXD81 m 0.14624 0.0171706707 0.1801938201 0.1122861799
BXD84 m 0.2825 0.0191973934 0.3204615249 0.2445384751
BXD87 m 0.17032 0.0171706707 0.2042738201 0.1363661799
BXD89 m 0.23362 0.0171706707 0.2675738201 0.1996661799
BXD90 m 0.1617333333 0.0221672405 0.2055675266 0.1178991401
C57BL/6J m 0.2203 0.0171706707 0.2542538201 0.1863461799
DBA/2J m 0.127475 0.0191973934 0.1654365249 0.0895134751




  GWAS USING LINEAR MIXED MODELS