Project measure / variable:   Schoonjans1   spleen_wt_HFD

ID, description, units MPD:112858   spleen_wt_HFD   spleen weight   [g]  HFD  
high-fat diet study
Data set, strains Schoonjans1   BXD w/par   35 strains     sex: m     age: 29wks
Procedure organ weights
Ontology mappings

  •   Or, add this measure to your collection.
       
  •     no folder
  •     put it in new folder  

  STRAIN COMPARISON PLOT
Dimensions Width:   px    Height:   px
Download Plot   
Visualization Options

Schoonjans1 - spleen weight HFD



  MEASURE SUMMARY
Measure Summary Male
Number of strains tested35 strains
Mean of the strain means0.1059   g
Median of the strain means0.1   g
SD of the strain means± 0.03459
Coefficient of variation (CV)0.3267
Min–max range of strain means0.05485   –   0.26112   g
Mean sample size per strain4.8   mice


  ANOVA, Q-Q NORMALITY ASSESSMENT
ANOVA summary      
FactorDFSum of squaresMean sum of squaresF valuep value (Pr>F)
strain 34 0.177 0.0052 11.619 < 0.0001
Residuals 132 0.0592 0.0004


Q-Q normality assessment based on residuals

  


  STRAIN MEANS (UNADJUSTED)
  
Select table page:
Strain Sex Mean SD N mice SEM CV Min, Max Z score
BXD1 m 0.122 0.02775   5 0.01241 0.2274 0.1, 0.17 0.47
BXD100 m 0.12904 0.02027   7 0.0076623 0.1571 0.0945, 0.1505 0.67
BXD11 m 0.10073 0.00261024   3 0.00150702 0.0259 0.098, 0.1032 -0.15
BXD12 m 0.07133 0.01343   3 0.00775314 0.1883 0.056, 0.081 -1.0
BXD27 m 0.14404 0.04088   5 0.01828 0.2838 0.1001, 0.2 1.1
BXD32 m 0.0975 0.005   4 0.0025 0.0513 0.09, 0.1 -0.24
BXD34 m 0.1 0.04082   4 0.02041 0.4082 0.07, 0.16 -0.17
BXD39 m 0.13948 0.05605   5 0.02507 0.4019 0.0712, 0.2012 0.97
BXD40 m 0.08422 0.01181   5 0.00528189 0.1402 0.0722, 0.0986 -0.63
BXD43 m 0.1276 0.05058   5 0.02262 0.3964 0.08, 0.21 0.63
BXD45 m 0.124 0.00547723   5 0.00244949 0.0442 0.12, 0.13 0.52
BXD48 m 0.07566 0.00766211   5 0.0034266 0.1013 0.0626, 0.0814 -0.87
BXD48a m 0.12514 0.01741   5 0.0077865 0.1391 0.105, 0.152 0.56
BXD49 m 0.26112 0.02874   4 0.01437 0.1101 0.2268, 0.2899 4.49
BXD51 m 0.124 0.02074   5 0.00927362 0.1672 0.11, 0.16 0.52
BXD53 m 0.10676 0.00868925   5 0.00388595 0.0814 0.0955, 0.1147 0.02
BXD55 m 0.10924 0.01323   5 0.00591461 0.1211 0.0975, 0.1277 0.1
BXD6 m 0.12 0.00816497   4 0.00408248 0.068 0.11, 0.13 0.41
BXD62 m 0.1238 0.03925   5 0.01755 0.317 0.0809, 0.1829 0.52
BXD63 m 0.08014 0.00345731   5 0.00154616 0.0431 0.0765, 0.0855 -0.74
BXD64 m 0.082 0.0083666   5 0.00374166 0.102 0.07, 0.09 -0.69
BXD66 m 0.07574 0.00728245   8 0.00257474 0.0962 0.06, 0.0817 -0.87
BXD67 m 0.1 0.00816497   4 0.00408248 0.0816 0.09, 0.11 -0.17
BXD73 m 0.086 0.00715087   5 0.00319797 0.0831 0.0743, 0.0916 -0.58
BXD75 m 0.09725 0.00381445   4 0.00190722 0.0392 0.0923, 0.1004 -0.25
BXD77 m 0.06706 0.00458726   5 0.00205149 0.0684 0.0619, 0.0728 -1.12
BXD79 m 0.11014 0.00861208   5 0.00385144 0.0782 0.0985, 0.1198 0.12
BXD8 m 0.05485 0.00661135   4 0.00330568 0.1205 0.0484, 0.0631 -1.48
BXD81 m 0.1087 0.01527   5 0.00682993 0.1405 0.0865, 0.1286 0.08
BXD84 m 0.096 0.0114   5 0.00509902 0.1188 0.08, 0.11 -0.29
BXD87 m 0.07578 0.00284377   5 0.00127177 0.0375 0.0715, 0.0792 -0.87
BXD89 m 0.0946 0.01452   5 0.00649307 0.1535 0.08, 0.11 -0.33
BXD90 m 0.08803 0.00402036   3 0.00232116 0.0457 0.0834, 0.0906 -0.52
C57BL/6J m 0.1124 0.01313   5 0.0058735 0.1168 0.1019, 0.1271 0.19
DBA/2J m 0.092 0.0083666   5 0.00374166 0.0909 0.08, 0.1 -0.4


  LEAST SQUARES MEANS (MODEL-ADJUSTED)
Strain Sex Mean SEM UpperCL LowerCL
BXD1 m 0.122 0.0094675061 0.1407276629 0.1032723371
BXD100 m 0.1290428571 0.0080015031 0.1448706211 0.1132150932
BXD11 m 0.1007333333 0.0122224978 0.1249106421 0.0765560245
BXD12 m 0.0713333333 0.0122224978 0.0955106421 0.0471560245
BXD27 m 0.14404 0.0094675061 0.1627676629 0.1253123371
BXD32 m 0.0975 0.0105849936 0.1184381636 0.0765618364
BXD34 m 0.1 0.0105849936 0.1209381636 0.0790618364
BXD39 m 0.13948 0.0094675061 0.1582076629 0.1207523371
BXD40 m 0.08422 0.0094675061 0.1029476629 0.0654923371
BXD43 m 0.1276 0.0094675061 0.1463276629 0.1088723371
BXD45 m 0.124 0.0094675061 0.1427276629 0.1052723371
BXD48 m 0.07566 0.0094675061 0.0943876629 0.0569323371
BXD48a m 0.12514 0.0094675061 0.1438676629 0.1064123371
BXD49 m 0.261125 0.0105849936 0.2820631636 0.2401868364
BXD51 m 0.124 0.0094675061 0.1427276629 0.1052723371
BXD53 m 0.10676 0.0094675061 0.1254876629 0.0880323371
BXD55 m 0.10924 0.0094675061 0.1279676629 0.0905123371
BXD6 m 0.12 0.0105849936 0.1409381636 0.0990618364
BXD62 m 0.1238 0.0094675061 0.1425276629 0.1050723371
BXD63 m 0.08014 0.0094675061 0.0988676629 0.0614123371
BXD64 m 0.082 0.0094675061 0.1007276629 0.0632723371
BXD66 m 0.0757375 0.0074847208 0.0905430175 0.0609319825
BXD67 m 0.1 0.0105849936 0.1209381636 0.0790618364
BXD73 m 0.086 0.0094675061 0.1047276629 0.0672723371
BXD75 m 0.09725 0.0105849936 0.1181881636 0.0763118364
BXD77 m 0.06706 0.0094675061 0.0857876629 0.0483323371
BXD79 m 0.11014 0.0094675061 0.1288676629 0.0914123371
BXD8 m 0.05485 0.0105849936 0.0757881636 0.0339118364
BXD81 m 0.1087 0.0094675061 0.1274276629 0.0899723371
BXD84 m 0.096 0.0094675061 0.1147276629 0.0772723371
BXD87 m 0.07578 0.0094675061 0.0945076629 0.0570523371
BXD89 m 0.0946 0.0094675061 0.1133276629 0.0758723371
BXD90 m 0.0880333333 0.0122224978 0.1122106421 0.0638560245
C57BL/6J m 0.1124 0.0094675061 0.1311276629 0.0936723371
DBA/2J m 0.092 0.0094675061 0.1107276629 0.0732723371




  GWAS USING LINEAR MIXED MODELS