Project measure / variable:   Schoonjans1   spleen_wt_CD

ID, description, units MPD:112857   spleen_wt_CD   spleen weight   [g]  CD  
high-fat diet study
Data set, strains Schoonjans1   BXD w/par   35 strains     sex: m     age: 29wks
Procedure organ weights
Ontology mappings

  •   Or, add this measure to your collection.
       
  •     no folder
  •     put it in new folder  

  STRAIN COMPARISON PLOT
Dimensions Width:   px    Height:   px
Download Plot   
Visualization Options

Schoonjans1 - spleen weight CD



  MEASURE SUMMARY
Measure Summary Male
Number of strains tested35 strains
Mean of the strain means0.08603   g
Median of the strain means0.08   g
SD of the strain means± 0.02949
Coefficient of variation (CV)0.3428
Min–max range of strain means0.04667   –   0.2213   g
Mean sample size per strain4.6   mice


  ANOVA, Q-Q NORMALITY ASSESSMENT
ANOVA summary      
FactorDFSum of squaresMean sum of squaresF valuep value (Pr>F)
strain 34 0.1255 0.0037 6.8251 < 0.0001
Residuals 125 0.0676 0.0005


Q-Q normality assessment based on residuals

  


  STRAIN MEANS (UNADJUSTED)
  
Select table page:
Strain Sex Mean SD N mice SEM CV Min, Max Z score
BXD1 m 0.08898 0.00922871   4 0.00461436 0.1037 0.0781, 0.1005 0.1
BXD100 m 0.08453 0.03125   6 0.01276 0.3696 0.03, 0.1171 -0.05
BXD11 m 0.075 0.01   4 0.005 0.1333 0.06, 0.08 -0.37
BXD12 m 0.09865 0.02564   4 0.01282 0.2599 0.067, 0.1285 0.43
BXD27 m 0.0825 0.005   4 0.0025 0.0606 0.08, 0.09 -0.12
BXD32 m 0.094 0.00894427   5 0.004 0.0952 0.08, 0.1 0.27
BXD34 m 0.06096 0.0030196   5 0.00135041 0.0495 0.0571, 0.0645 -0.85
BXD39 m 0.096 0.01673   5 0.00748331 0.1743 0.07, 0.11 0.34
BXD40 m 0.05616 0.00802141   5 0.00358728 0.1428 0.0486, 0.0673 -1.01
BXD43 m 0.07967 0.01106   3 0.00638575 0.1388 0.068, 0.09 -0.22
BXD45 m 0.0975 0.025   4 0.0125 0.2564 0.07, 0.13 0.39
BXD48 m 0.1 0.00707107   5 0.00316228 0.0707 0.09, 0.11 0.47
BXD48a m 0.085 0.0057735   4 0.00288675 0.0679 0.08, 0.09 -0.03
BXD49 m 0.2213 0.07812   4 0.03906 0.353 0.1704, 0.3376 4.59
BXD51 m 0.102 0.0083666   5 0.00374166 0.082 0.09, 0.11 0.54
BXD53 m 0.078 0.01304   5 0.00583095 0.1672 0.06, 0.09 -0.27
BXD55 m 0.10116 0.01338   5 0.00598211 0.1322 0.084, 0.115 0.51
BXD6 m 0.05596 0.00535285   5 0.00239387 0.0957 0.047, 0.0604 -1.02
BXD62 m 0.0625 0.00665958   5 0.00297825 0.1066 0.0554, 0.071 -0.8
BXD63 m 0.04667 0.0057735   3 0.00333333 0.1237 0.04, 0.05 -1.33
BXD64 m 0.08 0.01   3 0.0057735 0.125 0.07, 0.09 -0.2
BXD66 m 0.08325 0.02355   6 0.00961228 0.2828 0.06, 0.125 -0.09
BXD67 m 0.0775 0.01258   4 0.00629153 0.1624 0.06, 0.09 -0.29
BXD73 m 0.07516 0.00877514   5 0.00392436 0.1168 0.0675, 0.0883 -0.37
BXD75 m 0.1 0.02449   5 0.01095 0.2449 0.08, 0.14 0.47
BXD77 m 0.06668 0.00586319   5 0.0026221 0.0879 0.0573, 0.0735 -0.66
BXD79 m 0.05986 0.01534   5 0.00686124 0.2563 0.0338, 0.0715 -0.89
BXD8 m 0.07 0.01871   5 0.0083666 0.2673 0.05, 0.09 -0.54
BXD81 m 0.09112 0.01647   4 0.0082327 0.1807 0.0678, 0.1063 0.17
BXD84 m 0.076 0.01342   5 0.006 0.1765 0.06, 0.09 -0.34
BXD87 m 0.1392 0.07664   5 0.03427 0.5506 0.1, 0.276 1.8
BXD89 m 0.075 0.0057735   4 0.00288675 0.077 0.07, 0.08 -0.37
BXD90 m 0.0725 0.005   4 0.0025 0.069 0.07, 0.08 -0.46
C57BL/6J m 0.07614 0.01101   5 0.00492398 0.1446 0.0632, 0.0885 -0.34
DBA/2J m 0.102 0.01789   5 0.008 0.1754 0.08, 0.12 0.54


  LEAST SQUARES MEANS (MODEL-ADJUSTED)
Strain Sex Mean SEM UpperCL LowerCL
BXD1 m 0.088975 0.0116257816 0.1119838646 0.0659661354
BXD100 m 0.0845333333 0.0094924109 0.1033199926 0.065746674
BXD11 m 0.075 0.0116257816 0.0980088646 0.0519911354
BXD12 m 0.09865 0.0116257816 0.1216588646 0.0756411354
BXD27 m 0.0825 0.0116257816 0.1055088646 0.0594911354
BXD32 m 0.094 0.0103984152 0.1145797541 0.0734202459
BXD34 m 0.06096 0.0103984152 0.0815397541 0.0403802459
BXD39 m 0.096 0.0103984152 0.1165797541 0.0754202459
BXD40 m 0.05616 0.0103984152 0.0767397541 0.0355802459
BXD43 m 0.0796666667 0.0134242962 0.106235015 0.0530983183
BXD45 m 0.0975 0.0116257816 0.1205088646 0.0744911354
BXD48 m 0.1 0.0103984152 0.1205797541 0.0794202459
BXD48a m 0.085 0.0116257816 0.1080088646 0.0619911354
BXD49 m 0.2213 0.0116257816 0.2443088646 0.1982911354
BXD51 m 0.102 0.0103984152 0.1225797541 0.0814202459
BXD53 m 0.078 0.0103984152 0.0985797541 0.0574202459
BXD55 m 0.10116 0.0103984152 0.1217397541 0.0805802459
BXD6 m 0.05596 0.0103984152 0.0765397541 0.0353802459
BXD62 m 0.0625 0.0103984152 0.0830797541 0.0419202459
BXD63 m 0.0466666667 0.0134242962 0.073235015 0.0200983183
BXD64 m 0.08 0.0134242962 0.1065683484 0.0534316516
BXD66 m 0.08325 0.0094924109 0.1020366593 0.0644633407
BXD67 m 0.0775 0.0116257816 0.1005088646 0.0544911354
BXD73 m 0.07516 0.0103984152 0.0957397541 0.0545802459
BXD75 m 0.1 0.0103984152 0.1205797541 0.0794202459
BXD77 m 0.06668 0.0103984152 0.0872597541 0.0461002459
BXD79 m 0.05986 0.0103984152 0.0804397541 0.0392802459
BXD8 m 0.07 0.0103984152 0.0905797541 0.0494202459
BXD81 m 0.091125 0.0116257816 0.1141338646 0.0681161354
BXD84 m 0.076 0.0103984152 0.0965797541 0.0554202459
BXD87 m 0.1392 0.0103984152 0.1597797541 0.1186202459
BXD89 m 0.075 0.0116257816 0.0980088646 0.0519911354
BXD90 m 0.0725 0.0116257816 0.0955088646 0.0494911354
C57BL/6J m 0.07614 0.0103984152 0.0967197541 0.0555602459
DBA/2J m 0.102 0.0103984152 0.1225797541 0.0814202459




  GWAS USING LINEAR MIXED MODELS