Project measure / variable:   Schoonjans1   bMCA_liver_HFD

ID, description, units MPD:112815   bMCA_liver_HFD   bile acid β-muricholic acid amount in liver, at 29 wks   [ng/mL]  HFD  
high-fat diet study
Data set, strains Schoonjans1   BXD w/par   36 strains     sex: m     age: 29wks
Procedure biomarker quantification
Ontology mappings

  •   Or, add this measure to your collection.
       
  •     no folder
  •     put it in new folder  

  STRAIN COMPARISON PLOT
Dimensions Width:   px    Height:   px
Download Plot   
Visualization Options

Schoonjans1 - bile acid β-muricholic acid amount in liver, at 29 wks HFD



  MEASURE SUMMARY
Measure Summary Male
Number of strains tested36 strains
Mean of the strain means0.28141   ng/mL
Median of the strain means0.20738   ng/mL
SD of the strain means± 0.2809
Coefficient of variation (CV)0.9982
Min–max range of strain means0.04864   –   1.5261   ng/mL
Mean sample size per strain4.9   mice


  ANOVA, Q-Q NORMALITY ASSESSMENT
ANOVA summary      
FactorDFSum of squaresMean sum of squaresF valuep value (Pr>F)
strain 35 11.7214 0.3349 2.4587 0.0001
Residuals 141 19.2051 0.1362


Q-Q normality assessment based on residuals

  


  STRAIN MEANS (UNADJUSTED)
  
Select table page:
Strain Sex Mean SD N mice SEM CV Min, Max Z score
BXD1 m 0.26722 0.16272   5 0.07277 0.6089 0.10506, 0.48788 -0.05
BXD100 m 0.14956 0.06197   7 0.02342 0.4143 0.07606, 0.23317 -0.47
BXD11 m 0.17182 0.13504   3 0.07797 0.7859 0.05202, 0.31816 -0.39
BXD12 m 0.46613 0.74425   4 0.37213 1.5967 0.05238, 1.5814 0.66
BXD27 m 0.34442 0.30637   5 0.13701 0.8895 0.10074, 0.85544 0.22
BXD32 m 0.97906 0.58666   4 0.29333 0.5992 0.34008, 1.719 2.48
BXD34 m 0.3711 0.13894   4 0.06947 0.3744 0.16551, 0.46888 0.32
BXD39 m 0.21699 0.20272   5 0.09066 0.9343 0.07417, 0.56188 -0.23
BXD40 m 0.21693 0.14209   5 0.06355 0.655 0.10703, 0.45652 -0.23
BXD43 m 0.35359 0.19687   5 0.08804 0.5568 0.15223, 0.60447 0.26
BXD45 m 0.47312 0.13181   5 0.05895 0.2786 0.33125, 0.68394 0.68
BXD48 m 0.06052 0.02048   5 0.00916018 0.3384 0.0371, 0.08853 -0.79
BXD48a m 0.08883 0.10578   5 0.0473 1.1907 0.02455, 0.27705 -0.69
BXD49 m 0.40718 0.37595   5 0.16813 0.9233 0.05149, 0.95285 0.45
BXD51 m 0.10002 0.02098   5 0.0093825 0.2098 0.07692, 0.1252 -0.65
BXD53 m 0.11298 0.03786   5 0.01693 0.3351 0.05402, 0.14795 -0.6
BXD55 m 0.13327 0.15105   5 0.06755 1.1334 0.02352, 0.39849 -0.53
BXD6 m 0.26878 0.12889   5 0.05764 0.4795 0.15374, 0.48073 -0.04
BXD62 m 0.1093 0.06295   5 0.02815 0.576 0.03601, 0.20529 -0.61
BXD63 m 0.19782 0.08486   5 0.03795 0.429 0.10124, 0.30672 -0.3
BXD64 m 0.25443 0.14293   5 0.06392 0.5618 0.10258, 0.47493 -0.1
BXD66 m 0.13032 0.11358   9 0.03786 0.8716 0.03622, 0.3933 -0.54
BXD67 m 0.17426 0.08121   5 0.03632 0.466 0.09757, 0.29781 -0.38
BXD69 m 0.14007 0.19517   5 0.08728 1.3934 0.02764, 0.48537 -0.5
BXD73 m 0.17139 0.11388   5 0.05093 0.6644 0.06256, 0.33038 -0.39
BXD75 m 0.28572 0.20138   4 0.10069 0.7048 0.12429, 0.55171 0.02
BXD77 m 0.27138 0.31867   5 0.14251 1.1742 0.07105, 0.83358 -0.04
BXD79 m 0.26799 0.28731   5 0.12849 1.0721 0.07374, 0.77657 -0.05
BXD8 m 1.5261 2.0206   4 1.0103 1.3241 0.18567, 4.5351 4.43
BXD81 m 0.04864 0.02369   5 0.01059 0.487 0.02645, 0.08866 -0.83
BXD84 m 0.13801 0.09532   5 0.04263 0.6907 0.06134, 0.30225 -0.51
BXD87 m 0.66427 0.39489   5 0.1766 0.5945 0.1791, 1.2563 1.36
BXD89 m 0.2321 0.30612   5 0.1369 1.3189 0.07021, 0.77817 -0.18
BXD90 m 0.08643 0.08399   3 0.04849 0.9718 0.02937, 0.18288 -0.69
C57BL/6J m 0.13581 0.06154   5 0.02752 0.4531 0.0679, 0.23525 -0.52
DBA/2J m 0.11508 0.08915   5 0.03987 0.7747 0.03895, 0.26898 -0.59


  LEAST SQUARES MEANS (MODEL-ADJUSTED)
Strain Sex Mean SEM UpperCL LowerCL
BXD1 m 0.26722 0.1650491278 0.5935108179 -0.0590708179
BXD100 m 0.1495585714 0.1394919726 0.4253246445 -0.1262075016
BXD11 m 0.1718233333 0.2130775078 0.5930629679 -0.2494163013
BXD12 m 0.4661325 0.1845305347 0.8309367246 0.1013282754
BXD27 m 0.344418 0.1650491278 0.6707088179 0.0181271821
BXD32 m 0.9790575 0.1845305347 1.3438617246 0.6142532754
BXD34 m 0.3711 0.1845305347 0.7359042246 0.0062957754
BXD39 m 0.216986 0.1650491278 0.5432768179 -0.1093048179
BXD40 m 0.21693 0.1650491278 0.5432208179 -0.1093608179
BXD43 m 0.35359 0.1650491278 0.6798808179 0.0272991821
BXD45 m 0.473116 0.1650491278 0.7994068179 0.1468251821
BXD48 m 0.060524 0.1650491278 0.3868148179 -0.2657668179
BXD48a m 0.088832 0.1650491278 0.4151228179 -0.2374588179
BXD49 m 0.40718 0.1650491278 0.7334708179 0.0808891821
BXD51 m 0.100018 0.1650491278 0.4263088179 -0.2262728179
BXD53 m 0.112978 0.1650491278 0.4392688179 -0.2133128179
BXD55 m 0.13327 0.1650491278 0.4595608179 -0.1930208179
BXD6 m 0.268776 0.1650491278 0.5950668179 -0.0575148179
BXD62 m 0.1093 0.1650491278 0.4355908179 -0.2169908179
BXD63 m 0.197816 0.1650491278 0.5241068179 -0.1284748179
BXD64 m 0.25443 0.1650491278 0.5807208179 -0.0718608179
BXD66 m 0.1303211111 0.1230203565 0.3735239275 -0.1128817053
BXD67 m 0.174258 0.1650491278 0.5005488179 -0.1520328179
BXD69 m 0.140068 0.1650491278 0.4663588179 -0.1862228179
BXD73 m 0.171394 0.1650491278 0.4976848179 -0.1548968179
BXD75 m 0.285715 0.1845305347 0.6505192246 -0.0790892246
BXD77 m 0.271384 0.1650491278 0.5976748179 -0.0549068179
BXD79 m 0.267986 0.1650491278 0.5942768179 -0.0583048179
BXD8 m 1.5260725 0.1845305347 1.8908767246 1.1612682754
BXD81 m 0.048644 0.1650491278 0.3749348179 -0.2776468179
BXD84 m 0.13801 0.1650491278 0.4643008179 -0.1882808179
BXD87 m 0.664268 0.1650491278 0.9905588179 0.3379771821
BXD89 m 0.232098 0.1650491278 0.5583888179 -0.0941928179
BXD90 m 0.08643 0.2130775078 0.5076696346 -0.3348096346
C57BL/6J m 0.135814 0.1650491278 0.4621048179 -0.1904768179
DBA/2J m 0.11508 0.1650491278 0.4413708179 -0.2112108179




  GWAS USING LINEAR MIXED MODELS