Project measure / variable:   Schoonjans1   UDCA_feces_CD

ID, description, units MPD:112804   UDCA_feces_CD   bile acid ursodeoxycholic acid amount in feces, at 24 wks   [ng/mL]  CD  
high-fat diet study
Data set, strains Schoonjans1   BXD w/par   36 strains     sex: m     age: 24wks
Procedure biomarker quantification
Ontology mappings

  •   Or, add this measure to your collection.
       
  •     no folder
  •     put it in new folder  

  STRAIN COMPARISON PLOT
Dimensions Width:   px    Height:   px
Download Plot   
Visualization Options

Schoonjans1 - bile acid ursodeoxycholic acid amount in feces, at 24 wks CD



  MEASURE SUMMARY
Measure Summary Male
Number of strains tested36 strains
Mean of the strain means0.23469   ng/mL
Median of the strain means0.17775   ng/mL
SD of the strain means± 0.13712
Coefficient of variation (CV)0.5843
Min–max range of strain means0.0458   –   0.56647   ng/mL
Mean sample size per strain4.9   mice


  ANOVA, Q-Q NORMALITY ASSESSMENT
ANOVA summary      
FactorDFSum of squaresMean sum of squaresF valuep value (Pr>F)
strain 35 3.2274 0.0922 7.0881 < 0.0001
Residuals 139 1.8083 0.013


Q-Q normality assessment based on residuals

  


  STRAIN MEANS (UNADJUSTED)
  
Select table page:
Strain Sex Mean SD N mice SEM CV Min, Max Z score
BXD1 m 0.13784 0.04523   5 0.02023 0.3281 0.08389, 0.20867 -0.71
BXD100 m 0.49666 0.0917   5 0.04101 0.1846 0.3635, 0.6069 1.91
BXD11 m 0.27616 0.14345   4 0.07172 0.5194 0.12764, 0.46328 0.3
BXD12 m 0.1222 0.01131   4 0.00565493 0.0925 0.11034, 0.13611 -0.82
BXD27 m 0.2169 0.10796   4 0.05398 0.4977 0.1069, 0.34613 -0.13
BXD32 m 0.24252 0.16209   4 0.08105 0.6684 0.14149, 0.48416 0.06
BXD34 m 0.07608 0.02138   4 0.01069 0.281 0.04955, 0.10084 -1.16
BXD39 m 0.09781 0.02772   5 0.0124 0.2834 0.06095, 0.13671 -1.0
BXD40 m 0.11168 0.02226   5 0.0099566 0.1994 0.08691, 0.13585 -0.9
BXD43 m 0.16713 0.07704   4 0.03852 0.461 0.08597, 0.2386 -0.49
BXD45 m 0.12465 0.07029   3 0.04058 0.5639 0.04388, 0.17195 -0.8
BXD48 m 0.16607 0.11642   5 0.05207 0.7011 0.08422, 0.36566 -0.5
BXD48a m 0.4285 0.14837   4 0.07418 0.3463 0.32915, 0.64714 1.41
BXD49 m 0.1417 0.04348   5 0.01944 0.3068 0.1091, 0.21758 -0.68
BXD51 m 0.45273 0.20398   5 0.09122 0.4505 0.24601, 0.79023 1.59
BXD53 m 0.0458 0.01449   5 0.00647872 0.3163 0.02884, 0.06569 -1.38
BXD55 m 0.16217 0.03409   5 0.01525 0.2102 0.12073, 0.21279 -0.53
BXD6 m 0.25837 0.05541   5 0.02478 0.2145 0.16967, 0.31023 0.17
BXD62 m 0.33273 0.11531   5 0.05157 0.3465 0.15124, 0.44922 0.72
BXD63 m 0.10613 0.03285   5 0.01469 0.3095 0.07753, 0.15697 -0.94
BXD64 m 0.30045 0.03999   5 0.01788 0.1331 0.23268, 0.33811 0.48
BXD66 m 0.49623 0.04695   5 0.021 0.0946 0.43797, 0.54762 1.91
BXD67 m 0.28075 0.04807   4 0.02404 0.1712 0.23785, 0.33406 0.34
BXD69 m 0.16031 0.0516   5 0.02308 0.3219 0.12101, 0.23972 -0.54
BXD73 m 0.11888 0.04591   5 0.02053 0.3862 0.06667, 0.19147 -0.84
BXD75 m 0.27416 0.1507   5 0.06739 0.5497 0.15211, 0.5311 0.29
BXD77 m 0.29368 0.11868   5 0.05307 0.4041 0.1738, 0.43359 0.43
BXD79 m 0.18838 0.03368   5 0.01506 0.1788 0.1499, 0.21873 -0.34
BXD8 m 0.13382 0.03667   5 0.0164 0.2741 0.10139, 0.18833 -0.74
BXD81 m 0.16053 0.049   5 0.02192 0.3053 0.11552, 0.24303 -0.54
BXD84 m 0.20006 0.07773   5 0.03476 0.3885 0.11149, 0.30075 -0.25
BXD87 m 0.12044 0.01974   5 0.00882962 0.1639 0.09914, 0.14547 -0.83
BXD89 m 0.4164 0.15713   5 0.07027 0.3774 0.26209, 0.67246 1.33
BXD90 m 0.56647 0.38813   5 0.17358 0.6852 0.29131, 1.2194 2.42
C57BL/6J m 0.13887 0.04897   10 0.01549 0.3526 0.07814, 0.21463 -0.7
DBA/2J m 0.43542 0.24   5 0.10733 0.5512 0.21209, 0.77148 1.46


  LEAST SQUARES MEANS (MODEL-ADJUSTED)
Strain Sex Mean SEM UpperCL LowerCL
BXD1 m 0.137844 0.0510088067 0.2386974764 0.0369905236
BXD100 m 0.496656 0.0510088067 0.5975094764 0.3958025236
BXD11 m 0.2761625 0.0570295797 0.3889201146 0.1634048854
BXD12 m 0.122205 0.0570295797 0.2349626146 0.0094473854
BXD27 m 0.2168975 0.0570295797 0.3296551146 0.1041398854
BXD32 m 0.2425175 0.0570295797 0.3552751146 0.1297598854
BXD34 m 0.076085 0.0570295797 0.1888426146 -0.0366726146
BXD39 m 0.09781 0.0510088067 0.1986634764 -0.0030434764
BXD40 m 0.111676 0.0510088067 0.2125294764 0.0108225236
BXD43 m 0.1671325 0.0570295797 0.2798901146 0.0543748854
BXD45 m 0.1246466667 0.0658520863 0.2548479449 -0.0055546116
BXD48 m 0.166066 0.0510088067 0.2669194764 0.0652125236
BXD48a m 0.4285 0.0570295797 0.5412576146 0.3157423854
BXD49 m 0.141698 0.0510088067 0.2425514764 0.0408445236
BXD51 m 0.452728 0.0510088067 0.5535814764 0.3518745236
BXD53 m 0.045804 0.0510088067 0.1466574764 -0.0550494764
BXD55 m 0.162174 0.0510088067 0.2630274764 0.0613205236
BXD6 m 0.258372 0.0510088067 0.3592254764 0.1575185236
BXD62 m 0.33273 0.0510088067 0.4335834764 0.2318765236
BXD63 m 0.10613 0.0510088067 0.2069834764 0.0052765236
BXD64 m 0.30045 0.0510088067 0.4013034764 0.1995965236
BXD66 m 0.496234 0.0510088067 0.5970874764 0.3953805236
BXD67 m 0.2807525 0.0570295797 0.3935101146 0.1679948854
BXD69 m 0.160306 0.0510088067 0.2611594764 0.0594525236
BXD73 m 0.11888 0.0510088067 0.2197334764 0.0180265236
BXD75 m 0.274164 0.0510088067 0.3750174764 0.1733105236
BXD77 m 0.293682 0.0510088067 0.3945354764 0.1928285236
BXD79 m 0.18838 0.0510088067 0.2892334764 0.0875265236
BXD8 m 0.133818 0.0510088067 0.2346714764 0.0329645236
BXD81 m 0.160526 0.0510088067 0.2613794764 0.0596725236
BXD84 m 0.200062 0.0510088067 0.3009154764 0.0992085236
BXD87 m 0.120436 0.0510088067 0.2212894764 0.0195825236
BXD89 m 0.416402 0.0510088067 0.5172554764 0.3155485236
BXD90 m 0.566466 0.0510088067 0.6673194764 0.4656125236
C57BL/6J m 0.138873 0.0360686731 0.2101871771 0.0675588229
DBA/2J m 0.435416 0.0510088067 0.5362694764 0.3345625236




  GWAS USING LINEAR MIXED MODELS