Project measure / variable:   Schoonjans1   TCDCA_feces_CD

ID, description, units MPD:112794   TCDCA_feces_CD   bile acid taurocholic acid amount in feces, at 24 wks   [ng/mL]  CD  
high-fat diet study
Data set, strains Schoonjans1   BXD w/par   36 strains     sex: m     age: 24wks
Procedure biomarker quantification
Ontology mappings

  •   Or, add this measure to your collection.
       
  •     no folder
  •     put it in new folder  

  STRAIN COMPARISON PLOT
Dimensions Width:   px    Height:   px
Download Plot   
Visualization Options

Schoonjans1 - bile acid taurocholic acid amount in feces, at 24 wks CD



  MEASURE SUMMARY
Measure Summary Male
Number of strains tested36 strains
Mean of the strain means0.15546   ng/mL
Median of the strain means0.12373   ng/mL
SD of the strain means± 0.11491
Coefficient of variation (CV)0.7392
Min–max range of strain means0.03311   –   0.5291   ng/mL
Mean sample size per strain4.8   mice


  ANOVA, Q-Q NORMALITY ASSESSMENT
ANOVA summary      
FactorDFSum of squaresMean sum of squaresF valuep value (Pr>F)
strain 35 2.2901 0.0654 4.0066 < 0.0001
Residuals 137 2.2374 0.0163


Q-Q normality assessment based on residuals

  


  STRAIN MEANS (UNADJUSTED)
  
Select table page:
Strain Sex Mean SD N mice SEM CV Min, Max Z score
BXD1 m 0.12576 0.04553   5 0.02036 0.362 0.06635, 0.1835 -0.26
BXD100 m 0.43333 0.20531   5 0.09182 0.4738 0.19846, 0.75115 2.42
BXD11 m 0.24099 0.04731   4 0.02365 0.1963 0.19623, 0.30306 0.74
BXD12 m 0.06507 0.00975389   4 0.00487695 0.1499 0.05098, 0.07309 -0.79
BXD27 m 0.24365 0.14033   4 0.07016 0.5759 0.07014, 0.40209 0.77
BXD32 m 0.14207 0.09405   4 0.04703 0.662 0.08424, 0.28205 -0.12
BXD34 m 0.12169 0.0568   4 0.0284 0.4667 0.05101, 0.18604 -0.29
BXD39 m 0.11971 0.0485   5 0.02169 0.4052 0.06913, 0.19434 -0.31
BXD40 m 0.06576 0.01512   5 0.00676353 0.23 0.0513, 0.09069 -0.78
BXD43 m 0.13917 0.08493   4 0.04247 0.6103 0.05062, 0.21731 -0.14
BXD45 m 0.24653 0.29904   3 0.17265 1.213 0.05255, 0.59091 0.79
BXD48 m 0.07501 0.01815   5 0.00811866 0.242 0.05372, 0.10311 -0.7
BXD48a m 0.16437 0.04393   4 0.02197 0.2673 0.1061, 0.21244 0.08
BXD49 m 0.05145 0.02321   5 0.01038 0.4511 0.01332, 0.07153 -0.91
BXD51 m 0.13949 0.02863   5 0.0128 0.2052 0.10424, 0.18283 -0.14
BXD53 m 0.08714 0.04787   5 0.02141 0.5493 0.03372, 0.16328 -0.59
BXD55 m 0.09183 0.03505   5 0.01568 0.3817 0.04951, 0.13439 -0.55
BXD6 m 0.05342 0.00188741   5 0.00084408 0.0353 0.05057, 0.05518 -0.89
BXD62 m 0.19136 0.0412   5 0.01842 0.2153 0.14808, 0.24322 0.31
BXD63 m 0.03311 0.00380106   5 0.00169989 0.1148 0.02772, 0.03744 -1.06
BXD64 m 0.1162 0.0295   5 0.01319 0.2539 0.08283, 0.16251 -0.34
BXD66 m 0.15046 0.08498   5 0.038 0.5648 0.06203, 0.28087 -0.04
BXD67 m 0.05157 0.00865449   4 0.00432725 0.1678 0.04115, 0.06002 -0.9
BXD69 m 0.09935 0.01701   5 0.00760547 0.1712 0.07888, 0.1145 -0.49
BXD73 m 0.09826 0.04639   5 0.02075 0.4721 0.03983, 0.16526 -0.5
BXD75 m 0.13266 0.07   5 0.0313 0.5277 0.0858, 0.24661 -0.2
BXD77 m 0.1101 0.02816   5 0.01259 0.2558 0.0687, 0.14355 -0.39
BXD79 m 0.17571 0.05931   5 0.02652 0.3376 0.09255, 0.25256 0.18
BXD8 m 0.19801 0.14628   5 0.06542 0.7388 0.04806, 0.37782 0.37
BXD81 m 0.08466 0.02687   5 0.01202 0.3174 0.05497, 0.12184 -0.62
BXD84 m 0.04908 0.00883427   5 0.00395081 0.18 0.04246, 0.06438 -0.93
BXD87 m 0.16587 0.04383   5 0.0196 0.2643 0.0913, 0.20373 0.09
BXD89 m 0.38014 0.26166   5 0.11702 0.6883 0.21312, 0.84254 1.96
BXD90 m 0.3735 0.47623   5 0.21298 1.275 0.12489, 1.2231 1.9
C57BL/6J m 0.05094 0.02566   8 0.00907225 0.5038 0.012, 0.0941 -0.91
DBA/2J m 0.5291 0.29688   5 0.13277 0.5611 0.1325, 0.84513 3.25


  LEAST SQUARES MEANS (MODEL-ADJUSTED)
Strain Sex Mean SEM UpperCL LowerCL
BXD1 m 0.125762 0.0571510396 0.2387742496 0.0127497504
BXD100 m 0.433328 0.0571510396 0.5463402496 0.3203157504
BXD11 m 0.240995 0.0638968048 0.3673465362 0.1146434638
BXD12 m 0.0650675 0.0638968048 0.1914190362 -0.0612840362
BXD27 m 0.24365 0.0638968048 0.3700015362 0.1172984638
BXD32 m 0.1420675 0.0638968048 0.2684190362 0.0157159638
BXD34 m 0.1216925 0.0638968048 0.2480440362 -0.0046590362
BXD39 m 0.11971 0.0571510396 0.2327222496 0.0066977504
BXD40 m 0.065762 0.0571510396 0.1787742496 -0.0472502496
BXD43 m 0.13917 0.0638968048 0.2655215362 0.0128184638
BXD45 m 0.2465266667 0.0737816749 0.3924248535 0.1006284798
BXD48 m 0.075008 0.0571510396 0.1880202496 -0.0380042496
BXD48a m 0.1643675 0.0638968048 0.2907190362 0.0380159638
BXD49 m 0.05145 0.0571510396 0.1644622496 -0.0615622496
BXD51 m 0.139492 0.0571510396 0.2525042496 0.0264797504
BXD53 m 0.087144 0.0571510396 0.2001562496 -0.0258682496
BXD55 m 0.091834 0.0571510396 0.2048462496 -0.0211782496
BXD6 m 0.053424 0.0571510396 0.1664362496 -0.0595882496
BXD62 m 0.191362 0.0571510396 0.3043742496 0.0783497504
BXD63 m 0.033114 0.0571510396 0.1461262496 -0.0798982496
BXD64 m 0.1162 0.0571510396 0.2292122496 0.0031877504
BXD66 m 0.150456 0.0571510396 0.2634682496 0.0374437504
BXD67 m 0.05157 0.0638968048 0.1779215362 -0.0747815362
BXD69 m 0.099352 0.0571510396 0.2123642496 -0.0136602496
BXD73 m 0.098258 0.0571510396 0.2112702496 -0.0147542496
BXD75 m 0.132656 0.0571510396 0.2456682496 0.0196437504
BXD77 m 0.110098 0.0571510396 0.2231102496 -0.0029142496
BXD79 m 0.175706 0.0571510396 0.2887182496 0.0626937504
BXD8 m 0.198008 0.0571510396 0.3110202496 0.0849957504
BXD81 m 0.08466 0.0571510396 0.1976722496 -0.0283522496
BXD84 m 0.04908 0.0571510396 0.1620922496 -0.0639322496
BXD87 m 0.165866 0.0571510396 0.2788782496 0.0528537504
BXD89 m 0.380136 0.0571510396 0.4931482496 0.2671237504
BXD90 m 0.373504 0.0571510396 0.4865162496 0.2604917504
C57BL/6J m 0.05093625 0.045181864 0.1402802781 -0.0384077781
DBA/2J m 0.5291 0.0571510396 0.6421122496 0.4160877504




  GWAS USING LINEAR MIXED MODELS