Project measure / variable:   Schoonjans1   MDCA_feces_CD

ID, description, units MPD:112786   MDCA_feces_CD   bile acid murocholic acid amount in feces, at 24 wks   [ng/mL]  CD  
high-fat diet study
Data set, strains Schoonjans1   BXD w/par   36 strains     sex: m     age: 24wks
Procedure biomarker quantification
Ontology mappings

  •   Or, add this measure to your collection.
       
  •     no folder
  •     put it in new folder  

  STRAIN COMPARISON PLOT
Dimensions Width:   px    Height:   px
Download Plot   
Visualization Options

Schoonjans1 - bile acid murocholic acid amount in feces, at 24 wks CD



  MEASURE SUMMARY
Measure Summary Male
Number of strains tested36 strains
Mean of the strain means0.33762   ng/mL
Median of the strain means0.30051   ng/mL
SD of the strain means± 0.19373
Coefficient of variation (CV)0.5738
Min–max range of strain means0.09983   –   0.8412   ng/mL
Mean sample size per strain4.7   mice


  ANOVA, Q-Q NORMALITY ASSESSMENT
ANOVA summary      
FactorDFSum of squaresMean sum of squaresF valuep value (Pr>F)
strain 34 6.2767 0.1846 15.2868 < 0.0001
Residuals 134 1.6182 0.0121


Q-Q normality assessment based on residuals

  


  STRAIN MEANS (UNADJUSTED)
  
Select table page:
Strain Sex Mean SD N mice SEM CV Min, Max Z score
BXD1 m 0.15896 0.04749   5 0.02124 0.2988 0.08166, 0.19725 -0.92
BXD100 m 0.29209 0.04795   5 0.02144 0.1642 0.24575, 0.36646 -0.24
BXD11 m 0.1319 0.03245   4 0.01622 0.246 0.10162, 0.17307 -1.06
BXD12 m 0.40648 0.16698   4 0.08349 0.4108 0.17192, 0.54412 0.36
BXD27 m 0.11056 0.06535   4 0.03268 0.5911 0.0694, 0.20703 -1.17
BXD32 m 0.24401 0.1419   4 0.07095 0.5815 0.06867, 0.40445 -0.48
BXD34 m 0.2446 0.04039   4 0.02019 0.1651 0.21033, 0.29442 -0.48
BXD39 m 0.1023 0.04558   5 0.02038 0.4455 0.06185, 0.17539 -1.21
BXD40 m 0.14867 0.06319   5 0.02826 0.4251 0.09152, 0.24881 -0.98
BXD43 m 0.16927 0.06089   4 0.03045 0.3597 0.13263, 0.25976 -0.87
BXD45 m 0.3415 0.10386   3 0.05997 0.3041 0.27097, 0.46077 0.02
BXD48 m 0.6653 0.16195   5 0.07242 0.2434 0.4468, 0.85906 1.69
BXD48a m 0.37827 0.03318   4 0.01659 0.0877 0.34581, 0.41744 0.21
BXD49 m 0.35853 0.11078   5 0.04954 0.309 0.27362, 0.54291 0.11
BXD51 m 0.31387 0.1202   5 0.05375 0.3829 0.2088, 0.4975 -0.12
BXD53 m 0.15312 0.06313   5 0.02823 0.4123 0.05988, 0.22159 -0.95
BXD55 m 0.40142 0.12512   5 0.05595 0.3117 0.28381, 0.59988 0.33
BXD6 m 0.37818 0.0   1   0.0 0.0 0.37818, 0.37818 0.21
BXD62 m 0.14719 0.04182   5 0.0187 0.2842 0.10949, 0.21399 -0.98
BXD63 m 0.8412 0.23523   5 0.1052 0.2796 0.56049, 1.1682 2.6
BXD64 m 0.20864 0.06681   5 0.02988 0.3202 0.13517, 0.30871 -0.67
BXD66 m 0.17481 0.02424   5 0.01084 0.1386 0.14672, 0.19925 -0.84
BXD67 m 0.09983 0.03065   4 0.01532 0.307 0.06092, 0.13057 -1.23
BXD69 m 0.59077 0.15605   5 0.06979 0.2642 0.42453, 0.78591 1.31
BXD73 m 0.58567 0.1067   5 0.04772 0.1822 0.40712, 0.68723 1.28
BXD75 m 0.76404 0.0854   5 0.03819 0.1118 0.647, 0.87733 2.2
BXD77 m 0.48458 0.20134   5 0.09004 0.4155 0.28602, 0.81832 0.76
BXD79 m 0.23269 0.05637   5 0.02521 0.2423 0.13978, 0.28744 -0.54
BXD8 m 0.17444 0.13226   5 0.05915 0.7582 0.04847, 0.39698 -0.84
BXD81 m 0.62882 0.17332   4 0.08666 0.2756 0.41877, 0.77342 1.5
BXD84 m 0.48405 0.1515   5 0.06775 0.313 0.35051, 0.71422 0.76
BXD87 m 0.29854 0.0773   5 0.03457 0.2589 0.23392, 0.42712 -0.2
BXD89 m 0.4909 0.07267   5 0.0325 0.148 0.39498, 0.58364 0.79
BXD90 m 0.30247 0.10737   5 0.04802 0.355 0.19705, 0.44786 -0.18
C57BL/6J m 0.37423 0.07328   10 0.02317 0.1958 0.22962, 0.48066 0.19
DBA/2J m 0.27254 0.15393   5 0.06884 0.5648 0.12455, 0.53007 -0.34


  LEAST SQUARES MEANS (MODEL-ADJUSTED)
Strain Sex Mean SEM UpperCL LowerCL
BXD1 m 0.158956 0.0491453763 0.2561569911 0.0617550089
BXD100 m 0.292094 0.0491453763 0.3892949911 0.1948930089
BXD11 m 0.1319025 0.0549462011 0.2405765118 0.0232284882
BXD12 m 0.406485 0.0549462011 0.5151590118 0.2978109882
BXD27 m 0.1105625 0.0549462011 0.2192365118 0.0018884882
BXD32 m 0.2440125 0.0549462011 0.3526865118 0.1353384882
BXD34 m 0.2446 0.0549462011 0.3532740118 0.1359259882
BXD39 m 0.102304 0.0491453763 0.1995049911 0.0051030089
BXD40 m 0.148666 0.0491453763 0.2458669911 0.0514650089
BXD43 m 0.1692675 0.0549462011 0.2779415118 0.0605934882
BXD45 m 0.3415 0.063446408 0.46698594 0.21601406
BXD48 m 0.665296 0.0491453763 0.7624969911 0.5680950089
BXD48a m 0.378265 0.0549462011 0.4869390118 0.2695909882
BXD49 m 0.358532 0.0491453763 0.4557329911 0.2613310089
BXD51 m 0.31387 0.0491453763 0.4110709911 0.2166690089
BXD53 m 0.153124 0.0491453763 0.2503249911 0.0559230089
BXD55 m 0.401422 0.0491453763 0.4986229911 0.3042210089
BXD62 m 0.147188 0.0491453763 0.2443889911 0.0499870089
BXD63 m 0.841202 0.0491453763 0.9384029911 0.7440010089
BXD64 m 0.208636 0.0491453763 0.3058369911 0.1114350089
BXD66 m 0.174806 0.0491453763 0.2720069911 0.0776050089
BXD67 m 0.09983 0.0549462011 0.2085040118 -0.0088440118
BXD69 m 0.590768 0.0491453763 0.6879689911 0.4935670089
BXD73 m 0.58567 0.0491453763 0.6828709911 0.4884690089
BXD75 m 0.764038 0.0491453763 0.8612389911 0.6668370089
BXD77 m 0.484582 0.0491453763 0.5817829911 0.3873810089
BXD79 m 0.232692 0.0491453763 0.3298929911 0.1354910089
BXD8 m 0.174438 0.0491453763 0.2716389911 0.0772370089
BXD81 m 0.628825 0.0549462011 0.7374990118 0.5201509882
BXD84 m 0.48405 0.0491453763 0.5812509911 0.3868490089
BXD87 m 0.29854 0.0491453763 0.3957409911 0.2013390089
BXD89 m 0.490902 0.0491453763 0.5881029911 0.3937010089
BXD90 m 0.302468 0.0491453763 0.3996689911 0.2052670089
C57BL/6J m 0.374228 0.0347510288 0.44295948 0.30549652
DBA/2J m 0.272542 0.0491453763 0.3697429911 0.1753410089




  GWAS USING LINEAR MIXED MODELS