Project measure / variable:   Schoonjans1   MCA_feces_CD

ID, description, units MPD:112784   MCA_feces_CD   bile acid γ-muricholic acid amount in feces, at 24 wks   [ng/mL]  CD  
high-fat diet study
Data set, strains Schoonjans1   BXD w/par   36 strains     sex: m     age: 24wks
Procedure biomarker quantification
Ontology mappings

  •   Or, add this measure to your collection.
       
  •     no folder
  •     put it in new folder  

  STRAIN COMPARISON PLOT
Dimensions Width:   px    Height:   px
Download Plot   
Visualization Options

Schoonjans1 - bile acid γ-muricholic acid amount in feces, at 24 wks CD



  MEASURE SUMMARY
Measure Summary Male
Number of strains tested36 strains
Mean of the strain means0.39705   ng/mL
Median of the strain means0.26936   ng/mL
SD of the strain means± 0.38577
Coefficient of variation (CV)0.9716
Min–max range of strain means0.09309   –   1.6803   ng/mL
Mean sample size per strain4.9   mice


  ANOVA, Q-Q NORMALITY ASSESSMENT
ANOVA summary      
FactorDFSum of squaresMean sum of squaresF valuep value (Pr>F)
strain 35 25.7448 0.7356 11.1404 < 0.0001
Residuals 139 9.1777 0.066


Q-Q normality assessment based on residuals

  


  STRAIN MEANS (UNADJUSTED)
  
Select table page:
Strain Sex Mean SD N mice SEM CV Min, Max Z score
BXD1 m 0.18925 0.05273   5 0.02358 0.2786 0.14346, 0.26309 -0.54
BXD100 m 1.0313 0.29874   5 0.1336 0.2897 0.7191, 1.4484 1.64
BXD11 m 0.28253 0.1234   4 0.0617 0.4368 0.18057, 0.43915 -0.3
BXD12 m 0.25615 0.08688   4 0.04344 0.3392 0.12709, 0.31568 -0.37
BXD27 m 0.11973 0.05183   4 0.02591 0.4329 0.07008, 0.18059 -0.72
BXD32 m 0.20359 0.05071   4 0.02536 0.2491 0.12892, 0.24169 -0.5
BXD34 m 0.29302 0.11723   4 0.05861 0.4001 0.16645, 0.44146 -0.27
BXD39 m 0.16245 0.06834   5 0.03056 0.4207 0.09245, 0.27385 -0.61
BXD40 m 0.30156 0.05762   5 0.02577 0.1911 0.2249, 0.36102 -0.25
BXD43 m 0.18739 0.09821   4 0.0491 0.5241 0.08956, 0.31149 -0.54
BXD45 m 0.25037 0.07289   3 0.04208 0.2911 0.16673, 0.3003 -0.38
BXD48 m 0.48062 0.21262   5 0.09509 0.4424 0.28708, 0.74077 0.22
BXD48a m 1.0984 0.48517   4 0.24259 0.4417 0.80388, 1.8212 1.82
BXD49 m 0.1522 0.02089   5 0.00934037 0.1372 0.13003, 0.18631 -0.63
BXD51 m 0.31936 0.05624   5 0.02515 0.1761 0.24301, 0.4018 -0.2
BXD53 m 0.10964 0.047   5 0.02102 0.4287 0.05154, 0.1597 -0.75
BXD55 m 0.28795 0.09646   5 0.04314 0.335 0.12838, 0.36665 -0.28
BXD6 m 0.26647 0.04542   5 0.02031 0.1704 0.21277, 0.33856 -0.34
BXD62 m 0.10228 0.04349   5 0.01945 0.4252 0.0402, 0.15325 -0.76
BXD63 m 0.16894 0.07572   5 0.03386 0.4482 0.10372, 0.28774 -0.59
BXD64 m 0.48062 0.09736   5 0.04354 0.2026 0.33741, 0.59267 0.22
BXD66 m 1.05 0.22377   5 0.10007 0.2131 0.82615, 1.3985 1.69
BXD67 m 0.25327 0.06932   4 0.03466 0.2737 0.17803, 0.31854 -0.37
BXD69 m 0.30558 0.16912   5 0.07563 0.5534 0.17568, 0.54231 -0.24
BXD73 m 0.12405 0.02474   5 0.01106 0.1994 0.09507, 0.15215 -0.71
BXD75 m 0.53568 0.32396   5 0.14488 0.6048 0.22305, 1.0152 0.36
BXD77 m 1.4471 0.5212   5 0.23309 0.3602 0.93635, 2.2249 2.72
BXD79 m 0.20302 0.03918   5 0.01752 0.193 0.15727, 0.26285 -0.5
BXD8 m 0.27226 0.17483   5 0.07819 0.6422 0.14639, 0.57977 -0.32
BXD81 m 0.27906 0.17434   5 0.07797 0.6247 0.09882, 0.55011 -0.31
BXD84 m 0.15921 0.06324   5 0.02828 0.3972 0.10153, 0.22882 -0.62
BXD87 m 0.09643 0.02825   5 0.01263 0.2929 0.05757, 0.13722 -0.78
BXD89 m 0.61266 0.2795   5 0.12499 0.4562 0.22954, 0.89812 0.56
BXD90 m 1.6803 1.1193   5 0.50059 0.6662 0.51681, 3.1877 3.33
C57BL/6J m 0.09309 0.03666   10 0.01159 0.3939 0.03709, 0.16472 -0.79
DBA/2J m 0.43838 0.19054   5 0.08521 0.4346 0.15284, 0.61934 0.11


  LEAST SQUARES MEANS (MODEL-ADJUSTED)
Strain Sex Mean SEM UpperCL LowerCL
BXD1 m 0.189254 0.1149147207 0.4164608259 -0.0379528259
BXD100 m 1.031344 0.1149147207 1.2585508259 0.8041371741
BXD11 m 0.2825275 0.1284785635 0.5365524538 0.0285025462
BXD12 m 0.25615 0.1284785635 0.5101749538 0.0021250462
BXD27 m 0.1197325 0.1284785635 0.3737574538 -0.1342924538
BXD32 m 0.20359 0.1284785635 0.4576149538 -0.0504349538
BXD34 m 0.29302 0.1284785635 0.5470449538 0.0389950462
BXD39 m 0.162452 0.1149147207 0.3896588259 -0.0647548259
BXD40 m 0.301564 0.1149147207 0.5287708259 0.0743571741
BXD43 m 0.1873875 0.1284785635 0.4414124538 -0.0666374538
BXD45 m 0.25037 0.1483542665 0.543692751 -0.042952751
BXD48 m 0.480624 0.1149147207 0.7078308259 0.2534171741
BXD48a m 1.0983925 0.1284785635 1.3524174538 0.8443675462
BXD49 m 0.152196 0.1149147207 0.3794028259 -0.0750108259
BXD51 m 0.319362 0.1149147207 0.5465688259 0.0921551741
BXD53 m 0.109636 0.1149147207 0.3368428259 -0.1175708259
BXD55 m 0.287952 0.1149147207 0.5151588259 0.0607451741
BXD6 m 0.266472 0.1149147207 0.4936788259 0.0392651741
BXD62 m 0.102282 0.1149147207 0.3294888259 -0.1249248259
BXD63 m 0.168936 0.1149147207 0.3961428259 -0.0582708259
BXD64 m 0.48062 0.1149147207 0.7078268259 0.2534131741
BXD66 m 1.050034 0.1149147207 1.2772408259 0.8228271741
BXD67 m 0.253275 0.1284785635 0.5072999538 -0.0007499538
BXD69 m 0.305584 0.1149147207 0.5327908259 0.0783771741
BXD73 m 0.124048 0.1149147207 0.3512548259 -0.1031588259
BXD75 m 0.53568 0.1149147207 0.7628868259 0.3084731741
BXD77 m 1.44713 0.1149147207 1.6743368259 1.2199231741
BXD79 m 0.20302 0.1149147207 0.4302268259 -0.0241868259
BXD8 m 0.272258 0.1149147207 0.4994648259 0.0450511741
BXD81 m 0.279058 0.1149147207 0.5062648259 0.0518511741
BXD84 m 0.159212 0.1149147207 0.3864188259 -0.0679948259
BXD87 m 0.096434 0.1149147207 0.3236408259 -0.1307728259
BXD89 m 0.612664 0.1149147207 0.8398708259 0.3854571741
BXD90 m 1.680262 0.1149147207 1.9074688259 1.4530551741
C57BL/6J m 0.093087 0.0812569782 0.2537464873 -0.0675724873
DBA/2J m 0.438378 0.1149147207 0.6655848259 0.2111711741




  GWAS USING LINEAR MIXED MODELS