MPD: Project measure / variable: Auwerx1 heart_wt

Dimensions Width: px Height: px

Download Plot

Visualization Options Least squares means Alphabetical order Strains on X-axis Individual points

Auwerx1 - heart weight HFD

Measure Summary	Male
Number of strains tested	55 strains
Mean of the strain means	0.19858 g
Median of the strain means	0.19845 g
SD of the strain means	± 0.02657
Coefficient of variation (CV)	0.1338
Min–max range of strain means	0.14233 – 0.25015 g
Mean sample size per strain	4.3 mice

ANOVA, Q-Q NORMALITY ASSESSMENT

ANOVA summary

Factor	DF	Sum of squares	Mean sum of squares	F value	p value (Pr>F)
strain	54	0.1623	0.003	6.9305	< 0.0001
Residuals	179	0.0776	0.0004

Q-Q normality assessment based on residuals

STRAIN MEANS (UNADJUSTED)

Strain	Sex	Mean	SD	N mice	SEM	CV	Min, Max	Z score
BXD1	m	0.15648	0.02054	5	0.00918588	0.1313	0.1299, 0.1767	-1.58
BXD100	m	0.24656	0.0104	5	0.00465248	0.0422	0.2353, 0.2593	1.81
BXD101	m	0.19115	0.00701641	4	0.0035082	0.0367	0.182, 0.1968	-0.28
BXD11	m	0.2137	0.01013	4	0.00506738	0.0474	0.2037, 0.2255	0.57
BXD12	m	0.15118	0.0095962	5	0.00429155	0.0635	0.1396, 0.1657	-1.78
BXD16	m	0.24484	0.01864	5	0.00833454	0.0761	0.2273, 0.2706	1.74
BXD2	m	0.1838	0.03443	5	0.0154	0.1873	0.143, 0.2226	-0.56
BXD27	m	0.25015	0.02767	4	0.01383	0.1106	0.2126, 0.271	1.94
BXD32	m	0.19533	0.01305	3	0.0075351	0.0668	0.185, 0.21	-0.12
BXD34	m	0.19762	0.00879272	5	0.00393223	0.0445	0.1897, 0.2095	-0.04
BXD39	m	0.1754	0.01337	5	0.00597997	0.0762	0.156, 0.186	-0.87
BXD40	m	0.16837	0.01628	4	0.00813781	0.0967	0.1445, 0.181	-1.14
BXD43	m	0.14233	0.00061101	3	0.00035277	0.0043	0.1418, 0.143	-2.12
BXD44	m	0.19845	0.01321	4	0.00660688	0.0666	0.1834, 0.2117	0.0
BXD45	m	0.21825	0.01677	4	0.00838257	0.0768	0.199, 0.2397	0.74
BXD48	m	0.16798	0.01874	5	0.00838042	0.1116	0.1414, 0.1865	-1.15
BXD48a	m	0.20435	0.0186	2	0.01315	0.091	0.1912, 0.2175	0.22
BXD49	m	0.19148	0.02878	4	0.01439	0.1503	0.1545, 0.2242	-0.27
BXD50	m	0.17778	0.01025	5	0.00458229	0.0576	0.1673, 0.189	-0.78
BXD51	m	0.20485	0.03584	4	0.01792	0.175	0.1561, 0.2423	0.24
BXD53	m	0.2034	0.02484	4	0.01242	0.1221	0.1802, 0.234	0.18
BXD55	m	0.20098	0.02948	5	0.01318	0.1467	0.156, 0.234	0.09
BXD56	m	0.20255	0.00883883	2	0.00625	0.0436	0.1963, 0.2088	0.15
BXD6	m	0.19292	0.00942083	5	0.00421312	0.0488	0.1777, 0.2015	-0.21
BXD60	m	0.208	0.02819	4	0.01409	0.1355	0.174, 0.242	0.35
BXD61	m	0.1803	0.02392	5	0.0107	0.1327	0.1614, 0.2204	-0.69
BXD63	m	0.24645	0.03514	2	0.02485	0.1426	0.2216, 0.2713	1.8
BXD64	m	0.18502	0.01028	4	0.00514237	0.0556	0.1714, 0.1961	-0.51
BXD65	m	0.21502	0.00998778	4	0.00499389	0.0464	0.2069, 0.2296	0.62
BXD65a	m	0.23047	0.0414	4	0.0207	0.1796	0.2048, 0.2923	1.2
BXD66	m	0.21008	0.00419249	5	0.00187494	0.02	0.2058, 0.2148	0.43
BXD67	m	0.17984	0.02725	5	0.01219	0.1515	0.1473, 0.2222	-0.71
BXD68	m	0.17	0.01818	4	0.00908836	0.1069	0.1447, 0.1872	-1.08
BXD69	m	0.16632	0.00257235	5	0.00115039	0.0155	0.1628, 0.1699	-1.21
BXD70	m	0.24007	0.06244	3	0.03605	0.2601	0.168, 0.278	1.56
BXD71	m	0.22113	0.02106	3	0.01216	0.0952	0.1969, 0.235	0.85
BXD73	m	0.2231	0.01366	4	0.00683167	0.0612	0.2072, 0.2387	0.92
BXD73a	m	0.24192	0.03275	5	0.01465	0.1354	0.2232, 0.3002	1.63
BXD73b	m	0.20934	0.00589177	5	0.00263488	0.0281	0.2002, 0.2152	0.41
BXD75	m	0.16685	0.00871034	4	0.00435517	0.0522	0.1551, 0.1752	-1.19
BXD77	m	0.15164	0.01005	5	0.00449562	0.0663	0.135, 0.1611	-1.77
BXD79	m	0.20566	0.01988	5	0.00889278	0.0967	0.1762, 0.2284	0.27
BXD8	m	0.1848	0.02422	5	0.01083	0.1311	0.1645, 0.2253	-0.52
BXD81	m	0.192	0.01989	3	0.01149	0.1036	0.1693, 0.2064	-0.25
BXD83	m	0.19725	0.02472	4	0.01236	0.1253	0.162, 0.2194	-0.05
BXD84	m	0.20057	0.00446356	3	0.00257704	0.0223	0.1966, 0.2054	0.08
BXD85	m	0.21075	0.01355	4	0.00677415	0.0643	0.197, 0.225	0.46
BXD87	m	0.21484	0.01205	5	0.00538689	0.0561	0.2002, 0.2322	0.61
BXD89	m	0.1805	0.01442	4	0.00721203	0.0799	0.1647, 0.1939	-0.68
BXD90	m	0.1616	0.00980408	4	0.00490204	0.0607	0.1565, 0.1763	-1.39
BXD95	m	0.17912	0.01666	5	0.00744972	0.093	0.159, 0.2026	-0.73
BXD98	m	0.19166	0.01557	5	0.00696503	0.0813	0.1682, 0.2066	-0.26
BXD99	m	0.21178	0.02396	5	0.01072	0.1132	0.1717, 0.2358	0.5
C57BL/6J	m	0.23134	0.03302	5	0.01477	0.1427	0.189, 0.2697	1.23
DBA/2J	m	0.23438	0.01633	5	0.0073014	0.0697	0.2108, 0.249	1.35

LEAST SQUARES MEANS (MODEL-ADJUSTED)

Strain	Sex	Mean	SEM	UpperCL	LowerCL
BXD1	m	0.15648	0.0093137693	0.1748589116	0.1381010884
BXD100	m	0.24656	0.0093137693	0.2649389116	0.2281810884
BXD101	m	0.19115	0.0104131107	0.2116982479	0.1706017521
BXD11	m	0.2137	0.0104131107	0.2342482479	0.1931517521
BXD12	m	0.15118	0.0093137693	0.1695589116	0.1328010884
BXD16	m	0.24484	0.0093137693	0.2632189116	0.2264610884
BXD2	m	0.1838	0.0093137693	0.2021789116	0.1654210884
BXD27	m	0.25015	0.0104131107	0.2706982479	0.2296017521
BXD32	m	0.1953333333	0.0120240245	0.2190604062	0.1716062604
BXD34	m	0.19762	0.0093137693	0.2159989116	0.1792410884
BXD39	m	0.1754	0.0093137693	0.1937789116	0.1570210884
BXD40	m	0.168375	0.0104131107	0.1889232479	0.1478267521
BXD43	m	0.1423333333	0.0120240245	0.1660604062	0.1186062604
BXD44	m	0.19845	0.0104131107	0.2189982479	0.1779017521
BXD45	m	0.21825	0.0104131107	0.2387982479	0.1977017521
BXD48	m	0.16798	0.0093137693	0.1863589116	0.1496010884
BXD48a	m	0.20435	0.0147263624	0.2334096109	0.1752903891
BXD49	m	0.191475	0.0104131107	0.2120232479	0.1709267521
BXD50	m	0.17778	0.0093137693	0.1961589116	0.1594010884
BXD51	m	0.20485	0.0104131107	0.2253982479	0.1843017521
BXD53	m	0.2034	0.0104131107	0.2239482479	0.1828517521
BXD55	m	0.20098	0.0093137693	0.2193589116	0.1826010884
BXD56	m	0.20255	0.0147263624	0.2316096109	0.1734903891
BXD6	m	0.19292	0.0093137693	0.2112989116	0.1745410884
BXD60	m	0.208	0.0104131107	0.2285482479	0.1874517521
BXD61	m	0.1803	0.0093137693	0.1986789116	0.1619210884
BXD63	m	0.24645	0.0147263624	0.2755096109	0.2173903891
BXD64	m	0.185025	0.0104131107	0.2055732479	0.1644767521
BXD65	m	0.215025	0.0104131107	0.2355732479	0.1944767521
BXD65a	m	0.230475	0.0104131107	0.2510232479	0.2099267521
BXD66	m	0.21008	0.0093137693	0.2284589116	0.1917010884
BXD67	m	0.17984	0.0093137693	0.1982189116	0.1614610884
BXD68	m	0.17	0.0104131107	0.1905482479	0.1494517521
BXD69	m	0.16632	0.0093137693	0.1846989116	0.1479410884
BXD70	m	0.2400666667	0.0120240245	0.2637937396	0.2163395938
BXD71	m	0.2211333333	0.0120240245	0.2448604062	0.1974062604
BXD73	m	0.2231	0.0104131107	0.2436482479	0.2025517521
BXD73a	m	0.24192	0.0093137693	0.2602989116	0.2235410884
BXD73b	m	0.20934	0.0093137693	0.2277189116	0.1909610884
BXD75	m	0.16685	0.0104131107	0.1873982479	0.1463017521
BXD77	m	0.15164	0.0093137693	0.1700189116	0.1332610884
BXD79	m	0.20566	0.0093137693	0.2240389116	0.1872810884
BXD8	m	0.1848	0.0093137693	0.2031789116	0.1664210884
BXD81	m	0.192	0.0120240245	0.2157270729	0.1682729271
BXD83	m	0.19725	0.0104131107	0.2177982479	0.1767017521
BXD84	m	0.2005666667	0.0120240245	0.2242937396	0.1768395938
BXD85	m	0.21075	0.0104131107	0.2312982479	0.1902017521
BXD87	m	0.21484	0.0093137693	0.2332189116	0.1964610884
BXD89	m	0.1805	0.0104131107	0.2010482479	0.1599517521
BXD90	m	0.1616	0.0104131107	0.1821482479	0.1410517521
BXD95	m	0.17912	0.0093137693	0.1974989116	0.1607410884
BXD98	m	0.19166	0.0093137693	0.2100389116	0.1732810884
BXD99	m	0.21178	0.0093137693	0.2301589116	0.1934010884
C57BL/6J	m	0.23134	0.0093137693	0.2497189116	0.2129610884
DBA/2J	m	0.23438	0.0093137693	0.2527589116	0.2160010884

INDIVIDUAL ANIMAL VALUES

Click here to view individual animal values

GWAS USING LINEAR MIXED MODELS

ID, description, units	MPD:111403 heart_wt_HFD heart weight [g] HFD high-fat diet study
Data set, strains	Auwerx1 BXD w/par 55 strains sex: m age: 29wks
Procedure	organ weights
Ontology mappings	MA:0000072 heart MP:0004857 abnormal heart weight VT:0007028 heart mass