MPD: Project measure / variable: Auwerx1 heart_wt

Dimensions Width: px Height: px

Download Plot

Visualization Options Least squares means Alphabetical order Strains on X-axis Individual points

Auwerx1 - heart weight CD

Measure Summary	Male
Number of strains tested	56 strains
Mean of the strain means	0.18533 g
Median of the strain means	0.18134 g
SD of the strain means	± 0.02579
Coefficient of variation (CV)	0.1391
Min–max range of strain means	0.12448 – 0.23876 g
Mean sample size per strain	4.2 mice

ANOVA, Q-Q NORMALITY ASSESSMENT

ANOVA summary

Factor	DF	Sum of squares	Mean sum of squares	F value	p value (Pr>F)
strain	55	0.1564	0.0028	6.063	< 0.0001
Residuals	178	0.0835	0.0005

Q-Q normality assessment based on residuals

STRAIN MEANS (UNADJUSTED)

Strain	Sex	Mean	SD	N mice	SEM	CV	Min, Max	Z score
BXD1	m	0.1527	0.01679	5	0.00751053	0.11	0.1304, 0.1772	-1.27
BXD100	m	0.21367	0.0397	3	0.02292	0.1858	0.1742, 0.2536	1.1
BXD101	m	0.17245	0.01533	4	0.00766469	0.0889	0.1597, 0.1946	-0.5
BXD11	m	0.19325	0.00586899	2	0.00415	0.0304	0.1891, 0.1974	0.31
BXD12	m	0.16298	0.01635	5	0.00731317	0.1003	0.1497, 0.1907	-0.87
BXD16	m	0.22878	0.0253	4	0.01265	0.1106	0.199, 0.2539	1.69
BXD2	m	0.14267	0.02018	3	0.01165	0.1415	0.1295, 0.1659	-1.65
BXD27	m	0.22636	0.00512669	5	0.00229273	0.0226	0.2201, 0.233	1.59
BXD32	m	0.1689	0.01994	5	0.00891684	0.1181	0.1465, 0.194	-0.64
BXD34	m	0.20563	0.00908382	4	0.00454191	0.0442	0.1969, 0.2184	0.79
BXD39	m	0.1824	0.01369	5	0.00612038	0.075	0.162, 0.1983	-0.11
BXD40	m	0.1655	0.02051	2	0.0145	0.1239	0.151, 0.18	-0.77
BXD43	m	0.14223	0.00652253	3	0.00376578	0.0459	0.1348, 0.147	-1.67
BXD44	m	0.16478	0.01073	5	0.00479827	0.0651	0.1525, 0.1797	-0.8
BXD45	m	0.20388	0.02422	5	0.01083	0.1188	0.1709, 0.2336	0.72
BXD48	m	0.15796	0.01026	5	0.00459049	0.065	0.1468, 0.1705	-1.06
BXD48a	m	0.19088	0.02604	5	0.01164	0.1364	0.1585, 0.2296	0.22
BXD49	m	0.18	0.01416	4	0.00707825	0.0786	0.159, 0.189	-0.21
BXD50	m	0.16792	0.0070802	4	0.0035401	0.0422	0.1636, 0.1785	-0.68
BXD51	m	0.2101	0.02131	3	0.0123	0.1014	0.1912, 0.2332	0.96
BXD53	m	0.20096	0.02404	5	0.01075	0.1196	0.169, 0.23	0.61
BXD55	m	0.17794	0.01441	5	0.00644233	0.081	0.1646, 0.1993	-0.29
BXD56	m	0.18777	0.00534072	3	0.00308347	0.0284	0.1818, 0.1921	0.09
BXD6	m	0.1795	0.05218	5	0.02333	0.2907	0.141, 0.27	-0.23
BXD60	m	0.1773	0.00601276	4	0.00300638	0.0339	0.1712, 0.1835	-0.31
BXD61	m	0.16803	0.02701	3	0.0156	0.1608	0.147, 0.1985	-0.67
BXD63	m	0.194	0.00772075	3	0.00445758	0.0398	0.1851, 0.1989	0.34
BXD64	m	0.18027	0.01275	4	0.00637265	0.0707	0.1701, 0.1965	-0.2
BXD65	m	0.1875	0.01598	4	0.00798916	0.0852	0.1665, 0.2025	0.08
BXD65a	m	0.2237	0.03002	5	0.01342	0.1342	0.197, 0.2722	1.49
BXD65b	m	0.16907	0.01535	3	0.00886197	0.0908	0.1587, 0.1867	-0.63
BXD66	m	0.22306	0.01441	5	0.00644512	0.0646	0.1994, 0.2384	1.46
BXD67	m	0.19048	0.04629	5	0.0207	0.243	0.158, 0.2708	0.2
BXD68	m	0.20483	0.01348	3	0.00778039	0.0658	0.1909, 0.2178	0.76
BXD69	m	0.16926	0.02088	5	0.00933759	0.1234	0.1541, 0.2032	-0.62
BXD70	m	0.17385	0.04817	4	0.02408	0.2771	0.1381, 0.241	-0.45
BXD71	m	0.21613	0.00592192	4	0.00296096	0.0274	0.2075, 0.221	1.19
BXD73	m	0.20727	0.01633	4	0.00816684	0.0788	0.1871, 0.2253	0.85
BXD73a	m	0.23254	0.04624	5	0.02068	0.1988	0.1865, 0.2951	1.83
BXD73b	m	0.22026	0.00573219	5	0.00256351	0.026	0.2168, 0.2302	1.35
BXD75	m	0.17012	0.02633	5	0.01177	0.1547	0.1442, 0.2012	-0.59
BXD77	m	0.1398	0.00834865	5	0.00373363	0.0597	0.133, 0.152	-1.77
BXD79	m	0.18932	0.01471	5	0.0065765	0.0777	0.1739, 0.2112	0.15
BXD8	m	0.1802	0.02089	4	0.01045	0.1159	0.1631, 0.2106	-0.2
BXD81	m	0.12448	0.01234	4	0.0061719	0.0992	0.1067, 0.1336	-2.36
BXD83	m	0.1729	0.01419	3	0.00819024	0.082	0.1597, 0.1879	-0.48
BXD84	m	0.20513	0.02736	3	0.01579	0.1334	0.1781, 0.2328	0.77
BXD85	m	0.19694	0.01645	5	0.00735776	0.0835	0.1769, 0.2226	0.45
BXD87	m	0.20058	0.00943197	5	0.0042181	0.047	0.1908, 0.2113	0.59
BXD89	m	0.16245	0.02206	4	0.01103	0.1358	0.1499, 0.1955	-0.89
BXD90	m	0.1602	0.01365	4	0.00682605	0.0852	0.1413, 0.1739	-0.97
BXD95	m	0.14598	0.01771	4	0.00885291	0.1213	0.1295, 0.1644	-1.53
BXD98	m	0.16773	0.01144	4	0.00571888	0.0682	0.1528, 0.1786	-0.68
BXD99	m	0.20092	0.01086	5	0.00485524	0.054	0.1839, 0.2098	0.6
C57BL/6J	m	0.23876	0.01863	5	0.0083295	0.078	0.213, 0.2635	2.07
DBA/2J	m	0.20615	0.01242	4	0.00621001	0.0602	0.196, 0.2235	0.81

LEAST SQUARES MEANS (MODEL-ADJUSTED)

Strain	Sex	Mean	SEM	UpperCL	LowerCL
BXD1	m	0.1527	0.0096847997	0.1718117987	0.1335882013
BXD100	m	0.2136666667	0.0125030227	0.2383398927	0.1889934406
BXD101	m	0.17245	0.0108279353	0.1938176405	0.1510823595
BXD11	m	0.19325	0.0153130129	0.223468407	0.163031593
BXD12	m	0.16298	0.0096847997	0.1820917987	0.1438682013
BXD16	m	0.228775	0.0108279353	0.2501426405	0.2074073595
BXD2	m	0.1426666667	0.0125030227	0.1673398927	0.1179934406
BXD27	m	0.22636	0.0096847997	0.2454717987	0.2072482013
BXD32	m	0.1689	0.0096847997	0.1880117987	0.1497882013
BXD34	m	0.205625	0.0108279353	0.2269926405	0.1842573595
BXD39	m	0.1824	0.0096847997	0.2015117987	0.1632882013
BXD40	m	0.1655	0.0153130129	0.195718407	0.135281593
BXD43	m	0.1422333333	0.0125030227	0.1669065594	0.1175601073
BXD44	m	0.16478	0.0096847997	0.1838917987	0.1456682013
BXD45	m	0.20388	0.0096847997	0.2229917987	0.1847682013
BXD48	m	0.15796	0.0096847997	0.1770717987	0.1388482013
BXD48a	m	0.19088	0.0096847997	0.2099917987	0.1717682013
BXD49	m	0.18	0.0108279353	0.2013676405	0.1586323595
BXD50	m	0.167925	0.0108279353	0.1892926405	0.1465573595
BXD51	m	0.2101	0.0125030227	0.234773226	0.185426774
BXD53	m	0.20096	0.0096847997	0.2200717987	0.1818482013
BXD55	m	0.17794	0.0096847997	0.1970517987	0.1588282013
BXD56	m	0.1877666667	0.0125030227	0.2124398927	0.1630934406
BXD6	m	0.1795	0.0096847997	0.1986117987	0.1603882013
BXD60	m	0.1773	0.0108279353	0.1986676405	0.1559323595
BXD61	m	0.1680333333	0.0125030227	0.1927065594	0.1433601073
BXD63	m	0.194	0.0125030227	0.218673226	0.169326774
BXD64	m	0.180275	0.0108279353	0.2016426405	0.1589073595
BXD65	m	0.1875	0.0108279353	0.2088676405	0.1661323595
BXD65a	m	0.2237	0.0096847997	0.2428117987	0.2045882013
BXD65b	m	0.1690666667	0.0125030227	0.1937398927	0.1443934406
BXD66	m	0.22306	0.0096847997	0.2421717987	0.2039482013
BXD67	m	0.19048	0.0096847997	0.2095917987	0.1713682013
BXD68	m	0.2048333333	0.0125030227	0.2295065594	0.1801601073
BXD69	m	0.16926	0.0096847997	0.1883717987	0.1501482013
BXD70	m	0.17385	0.0108279353	0.1952176405	0.1524823595
BXD71	m	0.216125	0.0108279353	0.2374926405	0.1947573595
BXD73	m	0.207275	0.0108279353	0.2286426405	0.1859073595
BXD73a	m	0.23254	0.0096847997	0.2516517987	0.2134282013
BXD73b	m	0.22026	0.0096847997	0.2393717987	0.2011482013
BXD75	m	0.17012	0.0096847997	0.1892317987	0.1510082013
BXD77	m	0.1398	0.0096847997	0.1589117987	0.1206882013
BXD79	m	0.18932	0.0096847997	0.2084317987	0.1702082013
BXD8	m	0.1802	0.0108279353	0.2015676405	0.1588323595
BXD81	m	0.124475	0.0108279353	0.1458426405	0.1031073595
BXD83	m	0.1729	0.0125030227	0.197573226	0.148226774
BXD84	m	0.2051333333	0.0125030227	0.2298065594	0.1804601073
BXD85	m	0.19694	0.0096847997	0.2160517987	0.1778282013
BXD87	m	0.20058	0.0096847997	0.2196917987	0.1814682013
BXD89	m	0.16245	0.0108279353	0.1838176405	0.1410823595
BXD90	m	0.1602	0.0108279353	0.1815676405	0.1388323595
BXD95	m	0.145975	0.0108279353	0.1673426405	0.1246073595
BXD98	m	0.167725	0.0108279353	0.1890926405	0.1463573595
BXD99	m	0.20092	0.0096847997	0.2200317987	0.1818082013
C57BL/6J	m	0.23876	0.0096847997	0.2578717987	0.2196482013
DBA/2J	m	0.20615	0.0108279353	0.2275176405	0.1847823595

INDIVIDUAL ANIMAL VALUES

Click here to view individual animal values

GWAS USING LINEAR MIXED MODELS

ID, description, units	MPD:111402 heart_wt_CD heart weight [g] CD high-fat diet study
Data set, strains	Auwerx1 BXD w/par 56 strains sex: m age: 29wks
Procedure	organ weights
Ontology mappings	MA:0000072 heart MP:0004857 abnormal heart weight VT:0007028 heart mass