Project measure / variable:   Auwerx1   ldl_CD

ID, description, units MPD:111366   ldl_CD   blood LDL amount   [mmol/L]  CD  
high-fat diet study
Data set, strains Auwerx1   BXD w/par   54 strains     sex: m     age: 29wks
Procedure lipid profile
Ontology mappings

  •   Or, add this measure to your collection.
       
  •     no folder
  •     put it in new folder  

  STRAIN COMPARISON PLOT
Dimensions Width:   px    Height:   px
Download Plot   
Visualization Options

Auwerx1 - blood LDL amount CD



  MEASURE SUMMARY
Measure Summary Male
Number of strains tested54 strains
Mean of the strain means0.12642   mmol/L
Median of the strain means0.127   mmol/L
SD of the strain means± 0.05629
Coefficient of variation (CV)0.4453
Min–max range of strain means0.01   –   0.2425   mmol/L
Mean sample size per strain4.1   mice


  ANOVA, Q-Q NORMALITY ASSESSMENT
ANOVA summary      
FactorDFSum of squaresMean sum of squaresF valuep value (Pr>F)
strain 52 0.6271 0.0121 4.8167 < 0.0001
Residuals 170 0.4257 0.0025


Q-Q normality assessment based on residuals

  


  STRAIN MEANS (UNADJUSTED)
  
Select table page:
Strain Sex Mean SD N mice SEM CV Min, Max Z score
BXD1 m 0.156 0.05505   5 0.02462 0.3529 0.12, 0.25 0.53
BXD100 m 0.12333 0.05132   3 0.02963 0.4161 0.08, 0.18 -0.05
BXD101 m 0.135 0.02517   4 0.01258 0.1864 0.11, 0.17 0.15
BXD12 m 0.15 0.01871   5 0.0083666 0.1247 0.13, 0.17 0.42
BXD16 m 0.2325 0.02872   4 0.01436 0.1235 0.21, 0.27 1.88
BXD27 m 0.208 0.0455   5 0.02035 0.2187 0.16, 0.26 1.45
BXD32 m 0.158 0.02775   5 0.01241 0.1756 0.13, 0.19 0.56
BXD34 m 0.1375 0.025   4 0.0125 0.1818 0.11, 0.17 0.2
BXD39 m 0.174 0.0555   5 0.02482 0.319 0.1, 0.24 0.85
BXD40 m 0.1 0.06083   3 0.03512 0.6083 0.06, 0.17 -0.47
BXD43 m 0.01 0.0   1   0.0 0.0 0.01, 0.01 -2.07
BXD44 m 0.14667 0.15253   6 0.06227 1.04 0.01, 0.32 0.36
BXD45 m 0.1 0.01581   5 0.00707107 0.1581 0.08, 0.12 -0.47
BXD48 m 0.102 0.03768   5 0.01685 0.3694 0.04, 0.14 -0.43
BXD48a m 0.13 0.05244   5 0.02345 0.4034 0.07, 0.19 0.06
BXD49 m 0.095 0.01915   4 0.00957427 0.2016 0.07, 0.11 -0.56
BXD50 m 0.1175 0.00957427   4 0.00478714 0.0815 0.11, 0.13 -0.16
BXD51 m 0.035 0.00707107   2   0.005 0.202 0.03, 0.04 -1.62
BXD53 m 0.1675 0.04573   4 0.02287 0.273 0.12, 0.23 0.73
BXD55 m 0.054 0.02074   5 0.00927362 0.384 0.03, 0.08 -1.29
BXD56 m 0.14333 0.02517   3 0.01453 0.1756 0.12, 0.17 0.3
BXD6 m 0.1475 0.02754   4 0.01377 0.1867 0.12, 0.18 0.37
BXD60 m 0.2425 0.06185   4 0.03092 0.255 0.17, 0.32 2.06
BXD61 m 0.06 0.01732   3 0.01 0.2887 0.05, 0.08 -1.18
BXD62 m 0.135 0.08347   4 0.04173 0.6183 0.09, 0.26 0.15
BXD63 m 0.07 0.05   3 0.02887 0.7143 0.02, 0.12 -1.0
BXD64 m 0.045 0.0057735   4 0.00288675 0.1283 0.04, 0.05 -1.45
BXD65 m 0.1675 0.04924   4 0.02462 0.294 0.13, 0.24 0.73
BXD65a m 0.236 0.09607   5 0.04297 0.4071 0.14, 0.38 1.95
BXD65b m 0.2175 0.02062   4 0.01031 0.0948 0.19, 0.24 1.62
BXD66 m 0.046 0.0251   5 0.01122 0.5456 0.01, 0.07 -1.43
BXD67 m 0.155 0.03   4 0.015 0.1935 0.13, 0.19 0.51
BXD68 m 0.13 0.03   3 0.01732 0.2308 0.1, 0.16 0.06
BXD69 m 0.084 0.02074   5 0.00927362 0.2469 0.07, 0.12 -0.75
BXD70 m 0.23 0.04899   4 0.02449 0.213 0.19, 0.29 1.84
BXD71 m 0.1175 0.03775   4 0.01887 0.3213 0.07, 0.16 -0.16
BXD73 m 0.095 0.04041   4 0.02021 0.4254 0.06, 0.13 -0.56
BXD73a m 0.124 0.04159   5 0.0186 0.3354 0.08, 0.19 -0.04
BXD73b m 0.148 0.02588   5 0.01158 0.1749 0.12, 0.18 0.38
BXD75 m 0.138 0.05805   5 0.02596 0.4207 0.09, 0.23 0.21
BXD77 m 0.144 0.04879   5 0.02182 0.3388 0.08, 0.21 0.31
BXD79 m 0.136 0.0251   5 0.01122 0.1846 0.1, 0.17 0.17
BXD81 m 0.2325 0.095   4 0.0475 0.4086 0.16, 0.37 1.88
BXD83 m 0.07333 0.03055   3 0.01764 0.4166 0.04, 0.1 -0.94
BXD84 m 0.2 0.02   3 0.01155 0.1 0.18, 0.22 1.31
BXD85 m 0.112 0.03633   5 0.01625 0.3244 0.08, 0.16 -0.26
BXD87 m 0.054 0.02702   5 0.01208 0.5003 0.03, 0.1 -1.29
BXD89 m 0.075 0.01291   4 0.00645497 0.1721 0.06, 0.09 -0.91
BXD90 m 0.095 0.02082   4 0.01041 0.2191 0.07, 0.12 -0.56
BXD95 m 0.115 0.06245   4 0.03122 0.543 0.05, 0.2 -0.2
BXD98 m 0.10333 0.03512   3 0.02028 0.3399 0.07, 0.14 -0.41
BXD99 m 0.09 0.04062   5 0.01817 0.4513 0.05, 0.15 -0.65
C57BL/6J m 0.1025 0.07632   4 0.03816 0.7446 0.03, 0.21 -0.42
DBA/2J m 0.03 0.01633   4 0.00816497 0.5443 0.01, 0.05 -1.71


  LEAST SQUARES MEANS (MODEL-ADJUSTED)
Strain Sex Mean SEM UpperCL LowerCL
BXD1 m 0.156 0.022377904 0.2001743564 0.1118256436
BXD100 m 0.1233333333 0.0288897499 0.1803621822 0.0663044844
BXD101 m 0.135 0.0250192573 0.1843884319 0.0856115681
BXD12 m 0.15 0.022377904 0.1941743564 0.1058256436
BXD16 m 0.2325 0.0250192573 0.2818884319 0.1831115681
BXD27 m 0.208 0.022377904 0.2521743564 0.1638256436
BXD32 m 0.158 0.022377904 0.2021743564 0.1138256436
BXD34 m 0.1375 0.0250192573 0.1868884319 0.0881115681
BXD39 m 0.174 0.022377904 0.2181743564 0.1298256436
BXD40 m 0.1 0.0288897499 0.1570288489 0.0429711511
BXD44 m 0.1466666667 0.020428138 0.1869921525 0.1063411809
BXD45 m 0.1 0.022377904 0.1441743564 0.0558256436
BXD48 m 0.102 0.022377904 0.1461743564 0.0578256436
BXD48a m 0.13 0.022377904 0.1741743564 0.0858256436
BXD49 m 0.095 0.0250192573 0.1443884319 0.0456115681
BXD50 m 0.1175 0.0250192573 0.1668884319 0.0681115681
BXD51 m 0.035 0.035382573 0.1048457902 -0.0348457902
BXD53 m 0.1675 0.0250192573 0.2168884319 0.1181115681
BXD55 m 0.054 0.022377904 0.0981743564 0.0098256436
BXD56 m 0.1433333333 0.0288897499 0.2003621822 0.0863044844
BXD6 m 0.1475 0.0250192573 0.1968884319 0.0981115681
BXD60 m 0.2425 0.0250192573 0.2918884319 0.1931115681
BXD61 m 0.06 0.0288897499 0.1170288489 0.0029711511
BXD62 m 0.135 0.0250192573 0.1843884319 0.0856115681
BXD63 m 0.07 0.0288897499 0.1270288489 0.0129711511
BXD64 m 0.045 0.0250192573 0.0943884319 -0.0043884319
BXD65 m 0.1675 0.0250192573 0.2168884319 0.1181115681
BXD65a m 0.236 0.022377904 0.2801743564 0.1918256436
BXD65b m 0.2175 0.0250192573 0.2668884319 0.1681115681
BXD66 m 0.046 0.022377904 0.0901743564 0.0018256436
BXD67 m 0.155 0.0250192573 0.2043884319 0.1056115681
BXD68 m 0.13 0.0288897499 0.1870288489 0.0729711511
BXD69 m 0.084 0.022377904 0.1281743564 0.0398256436
BXD70 m 0.23 0.0250192573 0.2793884319 0.1806115681
BXD71 m 0.1175 0.0250192573 0.1668884319 0.0681115681
BXD73 m 0.095 0.0250192573 0.1443884319 0.0456115681
BXD73a m 0.124 0.022377904 0.1681743564 0.0798256436
BXD73b m 0.148 0.022377904 0.1921743564 0.1038256436
BXD75 m 0.138 0.022377904 0.1821743564 0.0938256436
BXD77 m 0.144 0.022377904 0.1881743564 0.0998256436
BXD79 m 0.136 0.022377904 0.1801743564 0.0918256436
BXD81 m 0.2325 0.0250192573 0.2818884319 0.1831115681
BXD83 m 0.0733333333 0.0288897499 0.1303621822 0.0163044844
BXD84 m 0.2 0.0288897499 0.2570288489 0.1429711511
BXD85 m 0.112 0.022377904 0.1561743564 0.0678256436
BXD87 m 0.054 0.022377904 0.0981743564 0.0098256436
BXD89 m 0.075 0.0250192573 0.1243884319 0.0256115681
BXD90 m 0.095 0.0250192573 0.1443884319 0.0456115681
BXD95 m 0.115 0.0250192573 0.1643884319 0.0656115681
BXD98 m 0.1033333333 0.0288897499 0.1603621822 0.0463044844
BXD99 m 0.09 0.022377904 0.1341743564 0.0458256436
C57BL/6J m 0.1025 0.0250192573 0.1518884319 0.0531115681
DBA/2J m 0.03 0.0250192573 0.0793884319 -0.0193884319




  GWAS USING LINEAR MIXED MODELS