Phenotype measure:   HMDPpheno5   MONO

ID, description, units MPD:48919   MONO   monocyte count (MONO; units per volume x 103)   [n/µL]
Data set, strains HMDPpheno5   HMDP w/par   79 strains     sex: m     age: 16wks
Procedure complete blood count
Ontology mappings

  STRAIN COMPARISON PLOT
Dimensions Width:   px    Height:   px
Download Plot   
Visualization Options

HMDPpheno5 - monocyte count (MONO; units per volume x 103)



  MEASURE SUMMARY
Measure Summary Male
Number of strains tested79 strains
Mean of the strain means0.301   n/µL
Median of the strain means0.250   n/µL
SD of the strain means± 0.163
Coefficient of variation (CV)0.541
Min–max range of strain means0.0500   –   0.871   n/µL
Mean sample size per strain2.7   mice


  ANOVA, Q-Q NORMALITY ASSESSMENT
ANOVA summary      
FactorDFSum of squaresMean sum of squaresF valuep value (Pr>F)
strain 77 10.1691 0.1321 3.9394 < 0.0001
Residuals 142 4.7605 0.0335


Q-Q normality assessment based on residuals

  


  STRAIN MEANS (UNADJUSTED)
  
Select table page:
Strain Sex Mean SD N mice SEM CV Min, Max Z score
A/J m 0.15 0.0707   2   0.05 0.471 0.1, 0.2 -0.93
AXB10/PgnJ m 0.1 0.0   2   0.0 0.0 0.1, 0.1 -1.23
AXB12/PgnJ m 0.25 0.0707   2   0.05 0.283 0.2, 0.3 -0.31
AXB13/PgnJ m 0.2 0.0   2   0.0 0.0 0.2, 0.2 -0.62
AXB15/PgnJ m 0.1 0.0   2   0.0 0.0 0.1, 0.1 -1.23
AXB19b/PgnJ m 0.2 0.115   4 0.0577 0.577 0.1, 0.3 -0.62
AXB19/PgnJ m 0.15 0.0707   2   0.05 0.471 0.1, 0.2 -0.93
AXB23/PgnJ m 0.2 0.0   2   0.0 0.0 0.2, 0.2 -0.62
AXB2/PgnJ m 0.15 0.0707   2   0.05 0.471 0.1, 0.2 -0.93
AXB5/PgnJ m 0.3 0.141   2   0.1 0.471 0.2, 0.4 -0.01
AXB6/PgnJ m 0.4 0.141   2   0.1 0.354 0.3, 0.5 0.6
AXB8/PgnJ m 0.25 0.0707   2   0.05 0.283 0.2, 0.3 -0.31
BALB/cJ m 0.05 0.0707   2   0.05 1.41 -1.54
BTBR T+ Itpr3tf/J m 0.4 0.141   2   0.1 0.354 0.3, 0.5 0.6
BXA11/PgnJ m 0.2 0.0   2   0.0 0.0 0.2, 0.2 -0.62
BXA12/PgnJ m 0.4 0.283   2   0.2 0.707 0.2, 0.6 0.6
BXA13/PgnJ m 0.2 0.0   2   0.0 0.0 0.2, 0.2 -0.62
BXA14/PgnJ m 0.15 0.0707   2   0.05 0.471 0.1, 0.2 -0.93
BXA16/PgnJ m 0.2 0.1   3 0.0577 0.5 0.1, 0.3 -0.62
BXA24/PgnJ m 0.2 0.141   2   0.1 0.707 0.1, 0.3 -0.62
BXA25/PgnJ m 0.2 0.141   2   0.1 0.707 0.1, 0.3 -0.62
BXA26/PgnJ m 0.15 0.0707   2   0.05 0.471 0.1, 0.2 -0.93
BXA2/PgnJ m 0.2 0.0   2   0.0 0.0 0.2, 0.2 -0.62
BXA4/PgnJ m 0.05 0.0707   2   0.05 1.41 -1.54
BXA7/PgnJ m 0.2 0.0   2   0.0 0.0 0.2, 0.2 -0.62
BXA8/PgnJ m 0.2 0.0   2   0.0 0.0 0.2, 0.2 -0.62
BXD12/TyJ m 0.3 0.0   2   0.0 0.0 0.3, 0.3 -0.01
BXD13/TyJ m 0.25 0.212   2   0.15 0.849 0.1, 0.4 -0.31
BXD14/TyJ m 0.15 0.0707   2   0.05 0.471 0.1, 0.2 -0.93
BXD15/TyJ m 0.3 0.141   2   0.1 0.471 0.2, 0.4 -0.01
BXD19/TyJ m 0.25 0.1   4 0.05 0.4 0.1, 0.3 -0.31
BXD22/TyJ m 0.25 0.0707   2   0.05 0.283 0.2, 0.3 -0.31
BXD24/TyJ m 0.25 0.0707   2   0.05 0.283 0.2, 0.3 -0.31
BXD24/TyJ-Cep290rd16/J m 0.25 0.0707   2   0.05 0.283 0.2, 0.3 -0.31
BXD28/TyJ m 0.25 0.0707   2   0.05 0.283 0.2, 0.3 -0.31
BXD29-Tlr4lps-2J/J m 0.35 0.0707   2   0.05 0.202 0.3, 0.4 0.3
BXD2/TyJ m 0.2 0.0   2   0.0 0.0 0.2, 0.2 -0.62
BXD33/TyJ m 0.35 0.0707   2   0.05 0.202 0.3, 0.4 0.3
BXD34/TyJ m 0.25 0.0707   2   0.05 0.283 0.2, 0.3 -0.31
BXD40/TyJ m 0.2 0.141   2   0.1 0.707 0.1, 0.3 -0.62
BXD42/TyJ m 0.45 0.212   2   0.15 0.471 0.3, 0.6 0.91
BXD5/TyJ m 0.25 0.0707   2   0.05 0.283 0.2, 0.3 -0.31
BXD6/TyJ m 0.3 0.0   2   0.0 0.0 0.3, 0.3 -0.01
BXD9/TyJ m 0.4 0.141   2   0.1 0.354 0.3, 0.5 0.6
BXH19/TyJ m 0.2 0.0   2   0.0 0.0 0.2, 0.2 -0.62
BXH20/KccJ m 0.3 0.141   2   0.1 0.471 0.2, 0.4 -0.01
BXH2/TyJ m 0.3 0.283   2   0.2 0.943 0.1, 0.5 -0.01
BXH4/TyJ m 0.45 0.212   2   0.15 0.471 0.3, 0.6 0.91
BXH6/TyJ m 0.2 0.141   2   0.1 0.707 0.1, 0.3 -0.62
BXH7/TyJ m 0.1 0.0   2   0.0 0.0 0.1, 0.1 -1.23
BXH8/TyJ m 0.2 0.0   2   0.0 0.0 0.2, 0.2 -0.62
BXH9/TyJ m 0.3 0.141   2   0.1 0.471 0.2, 0.4 -0.01
C57BL/6J m 0.167 0.208   3 0.12 1.25 -0.82
C57L/J m 0.25 0.0707   2   0.05 0.283 0.2, 0.3 -0.31
C58/J m 0.3 0.141   2   0.1 0.471 0.2, 0.4 -0.01
CAST/EiJ m 0.45 0.354   2   0.25 0.786 0.2, 0.7 0.91
CE/J m 0.3 0.141   2   0.1 0.471 0.2, 0.4 -0.01
CXB11/HiAJ m 0.85 0.342   8 0.121 0.403 0.2, 1.2 3.36
CXB12/HiAJ m 0.825 0.249   8 0.0881 0.302 0.6, 1.3 3.21
CXB13/HiAJ m 0.625 0.369   8 0.131 0.591 0.1, 1.2 1.98
CXB1/ByJ m 0.55 0.207   8 0.0732 0.376 0.3, 0.9 1.52
CXB2/ByJ m 0.333 0.137   6 0.0558 0.41 0.1, 0.5 0.19
CXB3/ByJ m 0.389 0.0782   9 0.0261 0.201 0.3, 0.5 0.54
CXB4/ByJ m 0.662 0.141   8 0.0498 0.213 0.5, 0.9 2.21
CXB6/ByJ m 0.486 0.157   7 0.0595 0.324 0.3, 0.7 1.13
CXB7/ByJ m 0.871 0.229   7 0.0865 0.263 0.5, 1.1 3.49
CXB8/HiAJ m 0.5 0.224   5 0.1 0.447 0.2, 0.8 1.22
CXB9/HiAJ m 0.45 0.251   6 0.102 0.558 0.2, 0.8 0.91
DBA/2J m 0.35 0.0707   2   0.05 0.202 0.3, 0.4 0.3
FVB/NJ m 0.25 0.0707   2   0.05 0.283 0.2, 0.3 -0.31
KK/HlJ m 0.25 0.0707   2   0.05 0.283 0.2, 0.3 -0.31
LG/J m 0.45 0.0707   2   0.05 0.157 0.4, 0.5 0.91
LP/J m 0.4 0.0   2   0.0 0.0 0.4, 0.4 0.6
MA/MyJ m 0.25 0.0707   2   0.05 0.283 0.2, 0.3 -0.31
NZW/LacJ m 0.4 0.0   1   0.0 0.0 0.4, 0.4 0.6
PL/J m 0.35 0.0707   2   0.05 0.202 0.3, 0.4 0.3
RIIIS/J m 0.2 0.0   2   0.0 0.0 0.2, 0.2 -0.62
SEA/GnJ m 0.25 0.0707   2   0.05 0.283 0.2, 0.3 -0.31
SJL/J m 0.35 0.0707   2   0.05 0.202 0.3, 0.4 0.3


  LEAST SQUARES MEANS (MODEL-ADJUSTED)
Strain Sex Mean SEM UpperCL LowerCL
A/J m 0.15 0.1295 0.4059 0.0
AXB10/PgnJ m 0.1 0.1295 0.3559 0.0
AXB12/PgnJ m 0.25 0.1295 0.5059 0.0
AXB13/PgnJ m 0.2 0.1295 0.4559 0.0
AXB15/PgnJ m 0.1 0.1295 0.3559 0.0
AXB19b/PgnJ m 0.2 0.0915 0.381 0.019
AXB19/PgnJ m 0.15 0.1295 0.4059 0.0
AXB23/PgnJ m 0.2 0.1295 0.4559 0.0
AXB2/PgnJ m 0.15 0.1295 0.4059 0.0
AXB5/PgnJ m 0.3 0.1295 0.5559 0.0441
AXB6/PgnJ m 0.4 0.1295 0.6559 0.1441
AXB8/PgnJ m 0.25 0.1295 0.5059 0.0
BALB/cJ m 0.05 0.1295 0.3059 0.0
BTBR T+ Itpr3tf/J m 0.4 0.1295 0.6559 0.1441
BXA11/PgnJ m 0.2 0.1295 0.4559 0.0
BXA12/PgnJ m 0.4 0.1295 0.6559 0.1441
BXA13/PgnJ m 0.2 0.1295 0.4559 0.0
BXA14/PgnJ m 0.15 0.1295 0.4059 0.0
BXA16/PgnJ m 0.2 0.1057 0.409 0.0
BXA24/PgnJ m 0.2 0.1295 0.4559 0.0
BXA25/PgnJ m 0.2 0.1295 0.4559 0.0
BXA26/PgnJ m 0.15 0.1295 0.4059 0.0
BXA2/PgnJ m 0.2 0.1295 0.4559 0.0
BXA4/PgnJ m 0.05 0.1295 0.3059 0.0
BXA7/PgnJ m 0.2 0.1295 0.4559 0.0
BXA8/PgnJ m 0.2 0.1295 0.4559 0.0
BXD12/TyJ m 0.3 0.1295 0.5559 0.0441
BXD13/TyJ m 0.25 0.1295 0.5059 0.0
BXD14/TyJ m 0.15 0.1295 0.4059 0.0
BXD15/TyJ m 0.3 0.1295 0.5559 0.0441
BXD19/TyJ m 0.25 0.0915 0.431 0.069
BXD22/TyJ m 0.25 0.1295 0.5059 0.0
BXD24/TyJ m 0.25 0.1295 0.5059 0.0
BXD24/TyJ-Cep290rd16/J m 0.25 0.1295 0.5059 0.0
BXD28/TyJ m 0.25 0.1295 0.5059 0.0
BXD29-Tlr4lps-2J/J m 0.35 0.1295 0.6059 0.0941
BXD2/TyJ m 0.2 0.1295 0.4559 0.0
BXD33/TyJ m 0.35 0.1295 0.6059 0.0941
BXD34/TyJ m 0.25 0.1295 0.5059 0.0
BXD40/TyJ m 0.2 0.1295 0.4559 0.0
BXD42/TyJ m 0.45 0.1295 0.7059 0.1941
BXD5/TyJ m 0.25 0.1295 0.5059 0.0
BXD6/TyJ m 0.3 0.1295 0.5559 0.0441
BXD9/TyJ m 0.4 0.1295 0.6559 0.1441
BXH19/TyJ m 0.2 0.1295 0.4559 0.0
BXH20/KccJ m 0.3 0.1295 0.5559 0.0441
BXH2/TyJ m 0.3 0.1295 0.5559 0.0441
BXH4/TyJ m 0.45 0.1295 0.7059 0.1941
BXH6/TyJ m 0.2 0.1295 0.4559 0.0
BXH7/TyJ m 0.1 0.1295 0.3559 0.0
BXH8/TyJ m 0.2 0.1295 0.4559 0.0
BXH9/TyJ m 0.3 0.1295 0.5559 0.0441
C57BL/6J m 0.1667 0.1057 0.3756 0.0
C57L/J m 0.25 0.1295 0.5059 0.0
C58/J m 0.3 0.1295 0.5559 0.0441
CAST/EiJ m 0.45 0.1295 0.7059 0.1941
CE/J m 0.3 0.1295 0.5559 0.0441
CXB11/HiAJ m 0.85 0.0647 0.978 0.722
CXB12/HiAJ m 0.825 0.0647 0.953 0.697
CXB13/HiAJ m 0.625 0.0647 0.753 0.497
CXB1/ByJ m 0.55 0.0647 0.678 0.422
CXB2/ByJ m 0.3333 0.0747 0.4811 0.1856
CXB3/ByJ m 0.3889 0.061 0.5095 0.2682
CXB4/ByJ m 0.6625 0.0647 0.7905 0.5345
CXB6/ByJ m 0.4857 0.0692 0.6225 0.3489
CXB7/ByJ m 0.8714 0.0692 1.0082 0.7346
CXB8/HiAJ m 0.5 0.0819 0.6619 0.3381
CXB9/HiAJ m 0.45 0.0747 0.5978 0.3022
DBA/2J m 0.35 0.1295 0.6059 0.0941
FVB/NJ m 0.25 0.1295 0.5059 0.0
KK/HlJ m 0.25 0.1295 0.5059 0.0
LG/J m 0.45 0.1295 0.7059 0.1941
LP/J m 0.4 0.1295 0.6559 0.1441
MA/MyJ m 0.25 0.1295 0.5059 0.0
PL/J m 0.35 0.1295 0.6059 0.0941
RIIIS/J m 0.2 0.1295 0.4559 0.0
SEA/GnJ m 0.25 0.1295 0.5059 0.0
SJL/J m 0.35 0.1295 0.6059 0.0941




  GWAS USING LINEAR MIXED MODELS