Phenotype measure:   Collins1   BASO_pct

ID, description, units MPD:45112   BASO_pct   basophil differential (BASO; percentage of total WBC)   [%]
Data set, strains Collins1   CC pre w/par   138 strains     sex: m     age: 10-14wks
Procedure complete blood count
Ontology mappings

  STRAIN COMPARISON PLOT
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Collins1 - basophil differential (BASO; percentage of total WBC)



  MEASURE SUMMARY
Measure Summary Male
Number of strains tested138 strains
Mean of the strain means0.341   %
Median of the strain means0.160   %
SD of the strain means± 0.523
Coefficient of variation (CV)1.53
Min–max range of strain means0   –   3.41   %
Mean sample size per strain1.3   mice


  STRAIN MEANS (UNADJUSTED)
Strain Sex Mean SD N mice SEM CV Min, Max Z score
129S1/SvImJ m 0.128 0.14   5 0.0627 1.1 -0.41
A/J m 0.295 0.27   6 0.11 0.915 0.13, 0.84 -0.09
C57BL/6J m 0.467 0.221   6 0.0902 0.474 0.18, 0.71 0.24
CAST/EiJ m 0.723 0.739   6 0.302 1.02 0.13, 1.82 0.73
NOD/ShiLtJ m 0.678 0.483   11 0.146 0.712 0.64
NZO/HlLtJ m 0.164 0.189   7 0.0713 1.15 -0.34
PreCC1009/Unc m 0.15 0.0   1   0.0 0.0 0.15, 0.15 -0.37
PreCC1057/Unc m 0.16 0.0   1   0.0 0.0 0.16, 0.16 -0.35
PreCC1114/Unc m 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.65
PreCC113/Unc m 0.15 0.0   1   0.0 0.0 0.15, 0.15 -0.37
PreCC1234/Unc m 0.14 0.0   1   0.0 0.0 0.14, 0.14 -0.38
PreCC1237/Unc m 2.12 0.0   1   0.0 0.0 2.12, 2.12 3.4
PreCC1246/Unc m 0.33 0.0   1   0.0 0.0 0.33, 0.33 -0.02
PreCC125/Unc m 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.65
PreCC1401/Unc m 0.11 0.0   1   0.0 0.0 0.11, 0.11 -0.44
PreCC1427/Unc m 0.14 0.0   1   0.0 0.0 0.14, 0.14 -0.38
PreCC1524/Unc m 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.65
PreCC1566/Unc m 0.23 0.0   1   0.0 0.0 0.23, 0.23 -0.21
PreCC1635/Unc m 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.65
PreCC1639/Unc m 3.41 0.0   1   0.0 0.0 3.41, 3.41 5.86
PreCC166/Unc m 0.24 0.0   1   0.0 0.0 0.24, 0.24 -0.19
PreCC2041/Unc m 0.21 0.0   1   0.0 0.0 0.21, 0.21 -0.25
PreCC2075/Unc m 0.78 0.0   1   0.0 0.0 0.78, 0.78 0.84
PreCC219/Unc m 0.92 0.0   1   0.0 0.0 0.92, 0.92 1.11
PreCC220/Unc m 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.65
PreCC2291/Unc m 0.2 0.0   1   0.0 0.0 0.2, 0.2 -0.27
PreCC232/Unc m 0.23 0.0   1   0.0 0.0 0.23, 0.23 -0.21
PreCC237/Unc m 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.65
PreCC2558/Unc m 0.15 0.0   1   0.0 0.0 0.15, 0.15 -0.37
PreCC291/Unc m 0.16 0.0   1   0.0 0.0 0.16, 0.16 -0.35
PreCC3009/Unc m 0.18 0.0   1   0.0 0.0 0.18, 0.18 -0.31
PreCC3011/Unc m 0.26 0.0   1   0.0 0.0 0.26, 0.26 -0.16
PreCC3018/Unc m 0.13 0.0   1   0.0 0.0 0.13, 0.13 -0.4
PreCC3019/Unc m 3.04 0.0   1   0.0 0.0 3.04, 3.04 5.16
PreCC3046/Unc m 0.2 0.0   1   0.0 0.0 0.2, 0.2 -0.27
PreCC3061/Unc m 0.31 0.0   1   0.0 0.0 0.31, 0.31 -0.06
PreCC3066/Unc m 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.65
PreCC3067/Unc m 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.65
PreCC3076/Unc m 0.16 0.0   1   0.0 0.0 0.16, 0.16 -0.35
PreCC3078/Unc m 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.65
PreCC3080/Unc m 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.65
PreCC3081/Unc m 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.65
PreCC3087/Unc m 0.37 0.0   1   0.0 0.0 0.37, 0.37 0.05
PreCC3091/Unc m 0.18 0.0   1   0.0 0.0 0.18, 0.18 -0.31
PreCC3118/Unc m 0.6 0.0   1   0.0 0.0 0.6, 0.6 0.49
PreCC3140/Unc m 0.12 0.0   1   0.0 0.0 0.12, 0.12 -0.42
PreCC3154/Unc m 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.65
PreCC3156/Unc m 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.65
PreCC3168/Unc m 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.65
PreCC3180/Unc m 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.65
PreCC3181/Unc m 0.29 0.0   1   0.0 0.0 0.29, 0.29 -0.1
PreCC3232/Unc m 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.65
PreCC3289/Unc m 0.16 0.0   1   0.0 0.0 0.16, 0.16 -0.35
PreCC3291/Unc m 0.83 0.0   1   0.0 0.0 0.83, 0.83 0.93
PreCC3327/Unc m 0.13 0.0   1   0.0 0.0 0.13, 0.13 -0.4
PreCC3344/Unc m 0.21 0.0   1   0.0 0.0 0.21, 0.21 -0.25
PreCC3358/Unc m 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.65
PreCC3370/Unc m 0.15 0.0   1   0.0 0.0 0.15, 0.15 -0.37
PreCC3389/Unc m 1.21 0.0   1   0.0 0.0 1.21, 1.21 1.66
PreCC3401/Unc m 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.65
PreCC3415/Unc m 0.27 0.0   1   0.0 0.0 0.27, 0.27 -0.14
PreCC3426/Unc m 0.21 0.0   1   0.0 0.0 0.21, 0.21 -0.25
PreCC3431/Unc m 0.77 0.0   1   0.0 0.0 0.77, 0.77 0.82
PreCC3443/Unc m 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.65
PreCC3467/Unc m 0.15 0.0   1   0.0 0.0 0.15, 0.15 -0.37
PreCC3489/Unc m 0.32 0.0   1   0.0 0.0 0.32, 0.32 -0.04
PreCC3513/Unc m 0.83 0.0   1   0.0 0.0 0.83, 0.83 0.93
PreCC3515/Unc m 1.43 0.0   1   0.0 0.0 1.43, 1.43 2.08
PreCC3528/Unc m 0.13 0.0   1   0.0 0.0 0.13, 0.13 -0.4
PreCC3546/Unc m 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.65
PreCC3548/Unc m 0.21 0.0   1   0.0 0.0 0.21, 0.21 -0.25
PreCC3549/Unc m 0.13 0.0   1   0.0 0.0 0.13, 0.13 -0.4
PreCC3564/Unc m 0.13 0.0   1   0.0 0.0 0.13, 0.13 -0.4
PreCC3584/Unc m 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.65
PreCC3594/Unc m 0.31 0.0   1   0.0 0.0 0.31, 0.31 -0.06
PreCC3612/Unc m 0.16 0.0   1   0.0 0.0 0.16, 0.16 -0.35
PreCC381/Unc m 0.24 0.0   1   0.0 0.0 0.24, 0.24 -0.19
PreCC4179/Unc m 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.65
PreCC41/Unc m 1.39 0.0   1   0.0 0.0 1.39, 1.39 2.0
PreCC4227/Unc m 0.14 0.0   1   0.0 0.0 0.14, 0.14 -0.38
PreCC4251/Unc m 0.46 0.0   1   0.0 0.0 0.46, 0.46 0.23
PreCC4390/Unc m 0.28 0.0   1   0.0 0.0 0.28, 0.28 -0.12
PreCC4410/Unc m 0.42 0.0   1   0.0 0.0 0.42, 0.42 0.15
PreCC4559/Unc m 0.1 0.0   1   0.0 0.0 0.1, 0.1 -0.46
PreCC4650/Unc m 1.32 0.0   1   0.0 0.0 1.32, 1.32 1.87
PreCC477/Unc m 0.1 0.0   1   0.0 0.0 0.1, 0.1 -0.46
PreCC489/Unc m 0.09 0.0   1   0.0 0.0 0.09, 0.09 -0.48
PreCC5019/Unc m 0.75 0.0   1   0.0 0.0 0.75, 0.75 0.78
PreCC5046/Unc m 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.65
PreCC5049/Unc m 0.41 0.0   1   0.0 0.0 0.41, 0.41 0.13
PreCC5066/Unc m 0.15 0.0   1   0.0 0.0 0.15, 0.15 -0.37
PreCC5067/Unc m 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.65
PreCC5076/Unc m 0.07 0.0   1   0.0 0.0 0.07, 0.07 -0.52
PreCC5087/Unc m 0.13 0.0   1   0.0 0.0 0.13, 0.13 -0.4
PreCC5091/Unc m 1.63 0.0   1   0.0 0.0 1.63, 1.63 2.46
PreCC5118/Unc m 0.13 0.0   1   0.0 0.0 0.13, 0.13 -0.4
PreCC5130/Unc m 0.18 0.0   1   0.0 0.0 0.18, 0.18 -0.31
PreCC5140/Unc m 0.21 0.0   1   0.0 0.0 0.21, 0.21 -0.25
PreCC5154/Unc m 0.19 0.0   1   0.0 0.0 0.19, 0.19 -0.29
PreCC5156/Unc m 0.5 0.0   1   0.0 0.0 0.5, 0.5 0.3
PreCC5164/Unc m 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.65
PreCC5232/Unc m 0.12 0.0   1   0.0 0.0 0.12, 0.12 -0.42
PreCC5252/Unc m 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.65
PreCC5291/Unc m 0.37 0.0   1   0.0 0.0 0.37, 0.37 0.05
PreCC5308/Unc m 0.09 0.0   1   0.0 0.0 0.09, 0.09 -0.48
PreCC5344/Unc m 0.09 0.0   1   0.0 0.0 0.09, 0.09 -0.48
PreCC5370/Unc m 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.65
PreCC5389/Unc m 0.12 0.0   1   0.0 0.0 0.12, 0.12 -0.42
PreCC538/Unc m 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.65
PreCC5401/Unc m 0.26 0.0   1   0.0 0.0 0.26, 0.26 -0.16
PreCC5410/Unc m 0.22 0.0   1   0.0 0.0 0.22, 0.22 -0.23
PreCC5454/Unc m 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.65
PreCC5480/Unc m 0.33 0.0   1   0.0 0.0 0.33, 0.33 -0.02
PreCC5489/Unc m 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.65
PreCC5513/Unc m 0.16 0.0   1   0.0 0.0 0.16, 0.16 -0.35
PreCC5515/Unc m 0.26 0.0   1   0.0 0.0 0.26, 0.26 -0.16
PreCC5516/Unc m 0.08 0.0   1   0.0 0.0 0.08, 0.08 -0.5
PreCC5528/Unc m 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.65
PreCC5546/Unc m 0.33 0.0   1   0.0 0.0 0.33, 0.33 -0.02
PreCC5549/Unc m 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.65
PreCC555/Unc m 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.65
PreCC5560/Unc m 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.65
PreCC559/Unc m 0.18 0.0   1   0.0 0.0 0.18, 0.18 -0.31
PreCC5612/Unc m 0.09 0.0   1   0.0 0.0 0.09, 0.09 -0.48
PreCC692/Unc m 0.76 0.0   1   0.0 0.0 0.76, 0.76 0.8
PreCC712/Unc m 0.12 0.0   1   0.0 0.0 0.12, 0.12 -0.42
PreCC739/Unc m 0.96 0.0   1   0.0 0.0 0.96, 0.96 1.18
PreCC779/Unc m 0.25 0.0   1   0.0 0.0 0.25, 0.25 -0.17
PreCC799/Unc m 0.57 0.0   1   0.0 0.0 0.57, 0.57 0.44
PreCC801/Unc m 0.0 0.0   1   0.0 0.0 -0.65
PreCC820/Unc m 0.82 0.0   1   0.0 0.0 0.82, 0.82 0.91
PreCC821/Unc m 0.35 0.0   1   0.0 0.0 0.35, 0.35 0.02
PreCC867/Unc m 1.48 0.0   1   0.0 0.0 1.48, 1.48 2.18
PreCC896/Unc m 1.14 0.0   1   0.0 0.0 1.14, 1.14 1.53
PreCC900/Unc m 0.2 0.0   1   0.0 0.0 0.2, 0.2 -0.27
PreCC940/Unc m 1.14 0.0   1   0.0 0.0 1.14, 1.14 1.53
PWK/PhJ m 0.998 0.32   5 0.143 0.32 0.57, 1.25 1.25
WSB/EiJ m 0.873 0.624   8 0.221 0.715 0.26, 2.17 1.02




GWAS analysis not available: Strain panel must be either Inbred, HMDP, BXD, BXH, CXB, or AXB/BXA