Project measure / variable:   Harrill2   urine_CREA_ctrl

ID, description, units MPD:44131   urine_CREA_ctrl   creatinine (urine CREA)   [mg/mL]  control  
DB289 study
Data set, strains Harrill2   inbred   31 strains     sex: f     age: 6-8wks
Procedure urinalysis
Ontology mappings

  •   Or, add this measure to your collection.
       
  •     no folder
  •     put it in new folder  

  STRAIN COMPARISON PLOT
Dimensions Width:   px    Height:   px
Download Plot   
Visualization Options

Harrill2 - creatinine (urine CREA) control



  MEASURE SUMMARY
Measure Summary Female
Number of strains tested31 strains
Mean of the strain means0.223   mg/mL
Median of the strain means0.208   mg/mL
SD of the strain means± 0.0969
Coefficient of variation (CV)0.434
Min–max range of strain means0.0780   –   0.530   mg/mL
Mean sample size per strain4.9   mice


  ANOVA, Q-Q NORMALITY ASSESSMENT
ANOVA summary      
FactorDFSum of squaresMean sum of squaresF valuep value (Pr>F)
strain 30 1.3772 0.0459 6.1303 < 0.0001
Residuals 119 0.8911 0.0075


Q-Q normality assessment based on residuals

  


  STRAIN MEANS (UNADJUSTED)
  
Select table page:
Strain Sex Mean SD N mice SEM CV Min, Max Z score
129S1/SvImJ f 0.246 0.0598   5 0.0268 0.243 0.18, 0.34 0.24
A/J f 0.31 0.149   5 0.0666 0.48 0.15, 0.48 0.9
AKR/J f 0.217 0.00957   4 0.00479 0.044 0.21, 0.23 -0.06
BALB/cByJ f 0.31 0.0707   5 0.0316 0.228 0.21, 0.39 0.9
BTBR T+ Itpr3tf/J f 0.368 0.0492   5 0.022 0.134 0.33, 0.45 1.5
BUB/BnJ f 0.266 0.0559   5 0.025 0.21 0.18, 0.33 0.44
C3H/HeJ f 0.2 0.112   5 0.0503 0.562 0.09, 0.38 -0.24
C57BL/6J f 0.38 0.0592   5 0.0265 0.156 0.31, 0.45 1.62
C57BLKS/J f 0.318 0.107   5 0.0477 0.335 0.17, 0.45 0.98
C57BR/cdJ f 0.117 0.0602   4 0.0301 0.512 0.06, 0.2 -1.1
C58/J f 0.174 0.108   5 0.0484 0.622 0.03, 0.33 -0.51
CBA/J f 0.272 0.0476   5 0.0213 0.175 0.2, 0.32 0.51
CE/J f 0.142 0.039   5 0.0174 0.275 0.08, 0.18 -0.84
DBA/2J f 0.142 0.013   5 0.00583 0.0918 0.13, 0.16 -0.84
FVB/NJ f 0.08 0.0292   5 0.013 0.364 0.05, 0.12 -1.48
KK/HlJ f 0.078 0.0268   5 0.012 0.344 0.04, 0.1 -1.5
LG/J f 0.13 0.0255   5 0.0114 0.196 0.1, 0.16 -0.96
LP/J f 0.208 0.066   4 0.033 0.318 0.13, 0.28 -0.16
MA/MyJ f 0.264 0.0619   5 0.0277 0.234 0.22, 0.35 0.42
MRL/MpJ f 0.174 0.0844   5 0.0378 0.485 0.09, 0.27 -0.51
NOD/ShiLtJ f 0.0975 0.0479   4 0.0239 0.491 0.04, 0.15 -1.3
NON/ShiLtJ f 0.246 0.129   5 0.0578 0.526 0.15, 0.47 0.24
NOR/LtJ f 0.204 0.111   5 0.0499 0.547 0.03, 0.34 -0.2
NZW/LacJ f 0.182 0.0904   5 0.0404 0.497 0.07, 0.32 -0.42
PL/J f 0.178 0.0866   4 0.0433 0.488 0.1, 0.3 -0.47
PWK/PhJ f 0.234 0.129   5 0.0578 0.552 0.13, 0.45 0.11
RIIIS/J f 0.264 0.106   5 0.0476 0.403 0.15, 0.42 0.42
SEA/GnJ f 0.146 0.0684   5 0.0306 0.469 0.05, 0.23 -0.8
SJL/J f 0.182 0.092   5 0.0412 0.506 0.09, 0.3 -0.42
SM/J f 0.53 0.182   5 0.0814 0.343 0.33, 0.7 3.17
SWR/J f 0.256 0.0716   5 0.032 0.28 0.15, 0.33 0.34


  LEAST SQUARES MEANS (MODEL-ADJUSTED)
Strain Sex Mean SEM UpperCL LowerCL
129S1/SvImJ f 0.246 0.0387 0.3226 0.1694
A/J f 0.31 0.0387 0.3866 0.2334
AKR/J f 0.2175 0.0433 0.3032 0.1318
BALB/cByJ f 0.31 0.0387 0.3866 0.2334
BTBR T+ Itpr3tf/J f 0.368 0.0387 0.4446 0.2914
BUB/BnJ f 0.266 0.0387 0.3426 0.1894
C3H/HeJ f 0.2 0.0387 0.2766 0.1234
C57BL/6J f 0.38 0.0387 0.4566 0.3034
C57BLKS/J f 0.318 0.0387 0.3946 0.2414
C57BR/cdJ f 0.1175 0.0433 0.2032 0.0318
C58/J f 0.174 0.0387 0.2506 0.0974
CBA/J f 0.272 0.0387 0.3486 0.1954
CE/J f 0.142 0.0387 0.2186 0.0654
DBA/2J f 0.142 0.0387 0.2186 0.0654
FVB/NJ f 0.08 0.0387 0.1566 0.0034
KK/HlJ f 0.078 0.0387 0.1546 0.0014
LG/J f 0.13 0.0387 0.2066 0.0534
LP/J f 0.2075 0.0433 0.2932 0.1218
MA/MyJ f 0.264 0.0387 0.3406 0.1874
MRL/MpJ f 0.174 0.0387 0.2506 0.0974
NOD/ShiLtJ f 0.0975 0.0433 0.1832 0.0118
NON/ShiLtJ f 0.246 0.0387 0.3226 0.1694
NOR/LtJ f 0.204 0.0387 0.2806 0.1274
NZW/LacJ f 0.182 0.0387 0.2586 0.1054
PL/J f 0.1775 0.0433 0.2632 0.0918
PWK/PhJ f 0.234 0.0387 0.3106 0.1574
RIIIS/J f 0.264 0.0387 0.3406 0.1874
SEA/GnJ f 0.146 0.0387 0.2226 0.0694
SJL/J f 0.182 0.0387 0.2586 0.1054
SM/J f 0.53 0.0387 0.6066 0.4534
SWR/J f 0.256 0.0387 0.3326 0.1794




  GWAS USING LINEAR MIXED MODELS